Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,753,888 | G→T | 6.6% | A72S (GCG→TCG) | czcA‑II → | cation efflux system protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,753,888 | 0 | G | T | 6.6% | 234.5 / 3.8 | 74 | A72S (GCG→TCG) | czcA‑II | cation efflux system protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (36/33); new base T (3/2); total (39/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.66e-01 |
ATGGCCGCGGTGGGTATCCACAGCTACCAGAAACTGCCGATCGATGCTGTGCCGGACATCACTAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAGGTGGCCCGCGAGCAATT > NC_002947/2753741‑2754036 | aTGGCCGCGGTGGGTATCCACAGCTACCAGAAACTGCCGATCGATGCTGTGCCGGACATCACTAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACcg < 2:58469/148‑1 (MQ=255) gcgGTGGGTATCCACAGCTACCAGAAACTGCCGATCGATGCTGTGCCGGACATCACTAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGAtggc < 5:66300/149‑1 (MQ=255) ggTGGGTATCCACAGCTACCAGAAACTGCCGATCGATGCTGTGCCGGACATCACTAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGAtggctg < 4:164313/149‑1 (MQ=255) tGGGTATCCACAGCTACCAGAAACTGCCGATCGATGCTGTGCCGGACATCACTAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGCGGTCTCGAtggcaaag < 4:102794/149‑5 (MQ=37) ggTATCCACAGCTACCAGAAACTGCCGATCGATGCTGTGCCGGACATCACTAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCt > 4:37932/1‑149 (MQ=255) cacaGCTACCAGAAACTGCCGATCGATGCTGTGCCGGACATCACTAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAgg > 3:3057/1‑149 (MQ=255) acaGCTACCAGAAACTGCCGATCGATGCTGTGCCGGACATCACTAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAggg < 8:285641/149‑1 (MQ=255) ccAGAAACTGCCGATCGATGCTGTGCCGGACATCACTAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGCGGTCTCGAtggcaaagg < 1:341216/134‑6 (MQ=38) ccAGAAACTGCCGATCGATGCTGTGCCGGACATCACTAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGCGGTCTCGAtggcaaagg > 2:341216/1‑129 (MQ=38) ccAGAAACTGCCGATCGATGCTGTGCCGGACATCACTAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAg < 4:3057/148‑1 (MQ=255) cAGAAACTGCCGATCGATGCTGTGCTGGACATCACTAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAg > 6:291746/1‑147 (MQ=255) cAGAAACTGCCGATCGATGCTGTGCCGGACATCACTAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAg > 3:153471/1‑147 (MQ=255) aGAAACTGCCGATCGATGCTGTGCCGGACATCACTAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAg > 8:85713/1‑146 (MQ=255) aGAAACTGCCGATCGATGCTGTGCCGGACATCACTAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAg > 4:176324/1‑146 (MQ=255) aGAAACTGCCGATCGATGCTGTGCCGGACATCACTAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAg > 7:194324/1‑146 (MQ=255) aaaCTGCCGATCGATGCTGTGCCGGACATCACTAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGAc < 3:155159/149‑1 (MQ=255) gCCGATCGATGCTGTGCCGGACATCACTAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCcgct > 2:252512/1‑149 (MQ=255) ccGATCGATGCTGTGCTGGACATCACTAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCcgctc < 5:291746/149‑1 (MQ=255) ccGATCGATGCTGTGCCGGACATCACTAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCcgctc < 5:231396/149‑1 (MQ=255) cgatcgatGCTGTGCCGGACATCACTAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCcgctcg < 1:252512/149‑1 (MQ=255) gatcgatGCTGTGCCGGACATCACTAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCcgctcgc > 1:343176/1‑149 (MQ=255) gatGCTGTGCCGGACATCACTAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTc < 8:194324/149‑1 (MQ=255) gatGCTGTGCCGGACATCACTAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTc < 3:176324/149‑1 (MQ=255) tGCTGTGCCGGACATCACTAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTcgc > 6:307978/1‑149 (MQ=255) gCCGGACATCACTAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCgg > 5:121701/1‑149 (MQ=255) cGGACATCACTAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGa > 2:31549/1‑126 (MQ=255) cGGACATCACTAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGa < 1:31549/126‑1 (MQ=255) gACATCACTAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCt > 6:226218/1‑149 (MQ=255) cTAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTAATCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCACACCCGCTCGCGCTCGCGCTCGGACCTGTCGc > 2:168981/1‑147 (MQ=39) tAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAg > 5:179266/1‑149 (MQ=255) tAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGATCGGGCCTTTCGCAAg > 6:266512/1‑149 (MQ=255) gCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGATATTCGCCGCTCGAGACCGAGCAGCGCATCCCCTTTGCCATCGAGACCGCGAACGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTAGCCCTCGGGCCTGTCGCGAGTCACGGTCAgtt > 8:246957/1‑149 (MQ=255) cAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCAttt > 2:239111/1‑148 (MQ=255) gATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTc > 5:42376/1‑129 (MQ=255) gATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTc < 6:42376/129‑1 (MQ=255) aaCACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGc < 7:310515/120‑1 (MQ=255) aaCACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGc > 8:310515/1‑120 (MQ=255) aaCACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCgatga < 1:239111/149‑1 (MQ=255) aaCACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCgatga < 7:85713/149‑1 (MQ=255) acacCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGGAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGACCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCgatgat < 1:168981/149‑1 (MQ=255) acacCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCgatgat < 6:179266/149‑1 (MQ=255) ctccgccgCCCCCCGCCACTCGCCGCGGGCGACCGAGCAGCGCATCACCCTTGCCCTCGAGCCCGCGCTGGCTGGCCCGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCCCGCGGCCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGCCACGGGCACTTTCGatgatg < 4:218581/147‑1 (MQ=255) cacCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGatgatg > 8:624/1‑149 (MQ=255) ccgccCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTc < 1:190434/137‑1 (MQ=255) ccgccCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTc > 2:190434/1‑137 (MQ=255) ccgccCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGatgatg > 3:218581/1‑144 (MQ=255) cccGGCTATTCGCCGCTCGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGatat > 6:257939/1‑149 (MQ=255) ccGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCaa > 1:20368/1‑116 (MQ=255) ccGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCaa < 2:20368/116‑1 (MQ=255) ggCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATAtctt < 2:343176/149‑1 (MQ=255) gCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATAtcttc < 7:101408/149‑1 (MQ=255) gCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATAtcttc > 5:109482/1‑149 (MQ=255) ttCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATAtcttct > 6:207672/1‑146 (MQ=255) ttCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATAtcttct < 5:207672/146‑1 (MQ=255) gccgcTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTcgccc < 5:226218/149‑1 (MQ=255) gccgcTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTcgccc > 4:304549/1‑149 (MQ=255) aCCGATCAGCGAATGACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGTGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGt < 5:266512/149‑1 (MQ=255) aCCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGt > 1:196597/1‑104 (MQ=255) aCCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGt < 2:196597/104‑1 (MQ=255) 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aTCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCt > 3:12534/1‑149 (MQ=255) tCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTg > 7:57055/1‑149 (MQ=255) ccTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAg > 6:305290/1‑149 (MQ=255) gccagCCATCGCGGTCTCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAgg > 7:145370/5‑149 (MQ=255) gccagCCATCGCGGTCTCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAgg > 6:22215/5‑149 (MQ=255) aTCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAGGTGGCCcg > 2:184698/1‑149 (MQ=255) cGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTcgcccgc < 5:207221/115‑1 (MQ=255) cGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTcgcccgc > 6:207221/1‑115 (MQ=255) gagaCCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCGGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGACAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAGGGGGCCCGCGa < 7:246957/149‑1 (MQ=255) agaCCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAGGTGGCCCGCGAg < 8:57055/149‑1 (MQ=255) acaCCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAGGTGGCCCGCGAg < 4:203707/147‑1 (MQ=255) gcgATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTTGTCAACGAGCGCCTGCAGGTGGCCCGCGAGCAAtt < 5:257939/149‑1 (MQ=255) | ATGGCCGCGGTGGGTATCCACAGCTACCAGAAACTGCCGATCGATGCTGTGCCGGACATCACTAACGTCCAGGTGCAGATCAACACCGCCGCCCCCGGCTATTCGCCGCTGGAGACCGAGCAGCGCATCACCTTTGCCATCGAGACCGCGATGGCTGGCCTGCCAGGGCTCAAGCAGACCCGCTCGCTGTCGCGCTCGGGCCTGTCGCAAGTCACGGTCATTTTCGATGATGGCACCGATATCTTCTTCGCCCGCCAACTGGTCAACGAGCGCCTGCAGGTGGCCCGCGAGCAATT > NC_002947/2753741‑2754036 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |