Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,949,795 | A→T | 7.4% | intergenic (+60/+53) | PP_2583 → / ← oguA | acetyltransferase/8‑oxoguanine deaminase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,949,795 | 0 | A | T | 7.4% | 155.4 / 2.6 | 54 | intergenic (+60/+53) | PP_2583/oguA | acetyltransferase/8‑oxoguanine deaminase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (24/26); new base T (2/2); total (26/28) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.59e-01 |
CAGAAACTGGGCTACCGATACGTGAAACCGTCGCCGTCGGACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTACGCGCGGCAGGTCGACGGTGGCCAGCTGGCCGTCTTTCACCACGA > NC_002947/2949652‑2949942 | cAGAAACTGGGCTACCGATACGTGAAACCGTCGCCGTCGGACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGc > 1:239479/1‑149 (MQ=255) gAAACTGGGCTACGGATACGTGAAACCGTCGCCGTCGGACCATGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAg < 8:129026/144‑1 (MQ=255) gAAACTGGGCTACCGATACGTGAAACCGTCGCCGTCGGACAACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTAATGGACATTTGAGTGGACATGACATCTTAGAGTGCGCTACACGCAGCTTGAC‑TAGGTGGCAGCGAAGCCCAAAgtaga > 7:129026/1‑144 (MQ=255) cTGGGCTACCGATACGTGAAACCGTCGCCGTCGGACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCa > 5:117581/1‑149 (MQ=255) tGGGCTACCGATACGTGAAACCGTCGCCGTCGGACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGGCATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCAt > 8:320700/1‑149 (MQ=255) tGGGCTACCGATACGTGAAACCGTCGCCGTCGGACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCAt > 7:208561/1‑149 (MQ=255) ggCTACCGATACGTGAAACCGTCGCCGTCGGACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATg < 5:192694/148‑1 (MQ=255) ccGATACGTGAAACCGTCGCCGTCGGACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGTGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCt < 8:122709/147‑1 (MQ=255) ccGATACGTGAAACCGTCGCCGTCGGACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCtt < 8:208561/148‑1 (MQ=255) cGATACGTGAAACCGTCGCCGTCGGACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCttca < 3:35299/149‑1 (MQ=255) gAAACCGTCGCCGTCGGACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGc > 8:97116/1‑135 (MQ=255) gAAACCGTCGCCGTCGGACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGc < 7:97116/135‑1 (MQ=255) gAAACCGTCGCCGTCGGACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCACCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCg > 7:83343/1‑149 (MQ=255) aaaCCGTCGCCGTCGGACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCgg > 4:280533/1‑149 (MQ=255) cgtcgccgtcgGACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGGCATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGAt < 7:320700/149‑1 (MQ=255) cgtcgccgtcgGACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGAt < 6:262337/149‑1 (MQ=255) cgtcgGACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGGGCGCTACCCGCAGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAg < 3:246789/149‑1 (MQ=255) cgGACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCt > 4:276779/1‑148 (MQ=255) gACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGAt < 2:239479/149‑1 (MQ=255) ccTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGt < 1:328696/147‑1 (MQ=255) ccTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTAATTAAACCGGCGAAGCCGAGCAGATGACAGGCCTCAAGTg > 2:328696/1‑148 (MQ=255) gTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTg < 3:276779/148‑1 (MQ=255) tCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGAt > 4:134639/1‑149 (MQ=255) aTGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATgg > 5:29204/1‑149 (MQ=255) aTGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATgg > 3:132925/1‑149 (MQ=255) tGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCGTCATTCACCCGGCGATGGCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCAATGACCAGCTGATggg > 5:53579/1‑149 (MQ=255) gACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGc < 3:280533/148‑1 (MQ=255) aCCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTTAGTTGGAACCGAACCCAAAAGGGATGCGCATGCCCTTAATAAACCCGCCGATGCCGACATGATGCCAGGCAACAATTGCCAATGACAACATCATGGGcc > 1:81803/1‑149 (MQ=255) tGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCt < 8:231308/147‑1 (MQ=255) aGTGGACATGAGATCGTAGTGTGCGCTACCGGCTGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGCTGCGAATGGCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGtt < 8:83343/149‑1 (MQ=255) tGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGc < 4:51900/142‑1 (MQ=255) tGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGc > 3:51900/1‑142 (MQ=255) atCGTAGTGTGCGCTACCCGCGGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAg > 7:226991/1‑149 (MQ=255) atCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTtgt < 4:86094/139‑1 (MQ=255) atCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTtgt > 3:86094/1‑139 (MQ=255) gtgtGCGCTACCCGCAGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTtg < 2:318800/132‑1 (MQ=255) gtgtGCGCTACCCGCAGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTtg > 1:318800/1‑132 (MQ=255) cTACCCGCAGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTACGCGCGGCAgg < 3:134639/149‑1 (MQ=255) ccGCAGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCCGCCCAAAGGGCTGCGCAAGCCCATCATTAACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTACGCGCGGCAGGTCGa > 2:302771/1‑149 (MQ=255) cAGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTACGCGCGGCAGGTCGACgg > 7:211380/1‑149 (MQ=255) aGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTACGCGCGGCAGGTCGACGGt < 4:132925/149‑1 (MQ=255) ggttGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTACGCGCGGCAGGTCGACGGTg < 8:226991/147‑1 (MQ=255) ttGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTACGCGCGGCAGGTCGACGGTGGc > 5:6884/1‑149 (MQ=255) agggcatgcgcagcCCTTTGGGCTGCGCTTGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTACGCGCGGCAGGTCGACGGTGGc < 2:281760/135‑1 (MQ=255) agggcatgcgcagcCCTTTGGGCTGCGCTTGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGCCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTACGCGCGGCAGGTCGACGGTGGc > 1:281760/8‑142 (MQ=255) gTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGCTGGGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGACCTCAAGTTCCACTGACCAGCTGTAGGGCCAGCTGGGTGTGGCGTTGCAGTACGCGCGGGCGGTCGACGGTGGGCAGCTggg > 8:160166/1‑148 (MQ=255) gcatgcgcagcCCTTTGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTAcgcgc < 1:217915/118‑1 (MQ=255) gcatgcgcagcCCTTTGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTAcgcgc > 2:217915/5‑122 (MQ=255) agcgcagcCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGACCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTACGCGCGGCAGGTCGACGGTGGCCAGCTGGCCGTCt < 7:160166/149‑1 (MQ=255) atccgcCCAAAGGGCTGCGCATGTCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTACGCGCGGCAGGTCGACGGTGGCCAGCTGGCCGTCt < 3:105982/143‑1 (MQ=255) gcagcCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTGCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTACGCGCGGCAGGTCGACGGTGGCCAGCTGGCCGTCTTTc < 6:117581/149‑1 (MQ=255) cagcCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTACGCGCGGCAGGTCGACGGTGGCCAGCTGGCCGTCTTTca < 8:211380/149‑1 (MQ=255) ccAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTAc > 6:3154/1‑107 (MQ=255) ccAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTAc < 5:3154/107‑1 (MQ=255) aaaGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTACGCGCGGCAGGTCGACGGTGGCCAGCTGGCCGTCTTTCACCacga < 8:134466/149‑1 (MQ=255) | CAGAAACTGGGCTACCGATACGTGAAACCGTCGCCGTCGGACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCC‑TAGGTGGCAGCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTACGCGCGGCAGGTCGACGGTGGCCAGCTGGCCGTCTTTCACCACGA > NC_002947/2949652‑2949942 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |