| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,216,563 | C→G | 7.5% | A826A (GCC→GCG) | mexD → | multidrug RND transporter MexD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,216,563 | 0 | C | G | 7.5% | 208.8 / 6.4 | 67 | A826A (GCC→GCG) | mexD | multidrug RND transporter MexD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (33/29); new base G (2/3); total (35/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.64e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.50e-01 | |||||||||||
CCCCGAAAGCGTGCTGCGCCTCTATGCTCCCAATGCCAACGGCGAGCAGGTGCCGTTCAGCGCCTTCGTCACCACCCAGTGGGAGGAGGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCAGGTATCGGCTACGCCTGGACGGGCCTTTCCTACCAGGAGAAGGTCTCCAGCGGCCAGGCTGCCAGCCTGTTCGCCCT > NC_002947/3216416‑3216706 | ccccGAAAGCGTGCTGCGCCTCTATGCTCCCAATGCCAACGGCGAGCAGGTGCCGTTCAGCGCCTTCGTCACCACCCAGTGGGAGGAGGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCt > 6:177522/1‑149 (MQ=255) ccGAAAGCGTGCTGCGCCTCTATGCTCCCAATGCCAACGGCGAGCAGGTGCCGTTCAGCGCCTTCGTCACCACCCAGTGGGAGGAGGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCg > 8:230530/1‑149 (MQ=255) cGTGCTGCGCCTCTATGCTCCCAATGCCAACGGCGAGCAGGTGCCGTTCAGCGCCTTCGTCACCACCCAGTGGGAGGAGGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGAGGCGTCGCCggcga < 7:43342/149‑4 (MQ=255) ctgcGCCTCTATGCTCCCAATGCCAACGGCGAGCAGATGCCGTTCAGCGCCTTCGTCACCACCCAGTGGGAGGAGGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGAGGCGTCGCCggcgatgcg < 8:258596/149‑8 (MQ=255) gcgcCTCTATGCTCCCAATGCCAACGGCGAGCAGGTGCCGTTCAGCGCCTTCGTCACCACCCAGTGGGAGGAGGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTa > 2:318985/1‑149 (MQ=255) ctctATGCTCCCAATGCCAACGGCGAGCAGGTGCCGTTCAGCGCCTTCGTCACCACCCAGTGGGAGGAGGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCgg < 6:35908/149‑1 (MQ=255) ctctATGCTCCCAATGCCAACGGCGAGCAGGTGCCGTTCAGCGCCTTCGTCACCACCCAGTGGGAGGAGGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCgg > 8:223388/1‑149 (MQ=255) tctATGCTCCCAATGCCAACGGCGAGCAGGTGCCGTTCAGCGCCTTCGTCACCACCCAGTGGGAGGAGGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCggg > 7:67754/1‑149 (MQ=255) tGCTCCCAATGCCAACGGCGAGCAGGTGCCGTTCAGCGCCTTCGTCACCACCCAGTGGGAGGAGGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGggcag < 5:201073/148‑1 (MQ=255) tGCTCCCAATGCCAACGGCGAGCAGGTGCCGTTCAGCGCCTTCGTCACCACCCAGTGGGAGGAGGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGggcag < 6:157228/148‑1 (MQ=255) tCCCAATGCCAACGGCGAGCAGGTGCCGTTCAGCGCCTTCGTCACCACCCAGTGGGAGGAGGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCaa > 3:28264/1‑149 (MQ=255) ccAATGCCAACGGCGAGCAGGTGCCGTTCAGCGCCTTCGTCACCACCCAGTGGGAGGAGGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAAt < 1:217220/148‑1 (MQ=255) ccAATGCCAACGGCGAGCAGGTGCCGTTCAGCGCCTTCGTCACCACCCAGTGGGAGGAGGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATg < 8:67754/149‑1 (MQ=255) aaTGCCAACGGCGAGCAGGTGCCGTTCAGCGCCTTCGTCACCACCCAGTGGGAGGAGGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGc < 4:28264/149‑1 (MQ=255) aTGCCAACGGCGAGCAGGTGCCGTTCAGCGCCTTCGTCACCACCCAGTGGGAGGAGGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGcc < 7:230530/149‑1 (MQ=255) ccAACGGCGAGCAGGTGCCGTTCAGCGCCTTCGTCACCACCCAGTGGGAGGAGGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTAc < 1:309663/130‑1 (MQ=255) ccAACGGCGAGCAGGTGCCGTTCAGCGCCTTCGTCACCACCCAGTGGGAGGAGGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTAc > 2:309663/1‑130 (MQ=255) ccAACGGCGAGCAGGTGCCGTTCAGCGCCTTCGTCACCACCCAGTGGGAGGAGGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCga < 4:183271/148‑1 (MQ=255) cAACGGCGAGCAGGTGCCGTTCAGCGCCTTCGTCACCACCCAGTGGGAGGAGGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGcc > 3:325431/1‑145 (MQ=255) aCGGCGAGCAGGTGCCGTTCAGCGCCTTCGTCACCACCCAGTGGGAGGAGGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGAGGCGTCGCCggcgatgc < 2:285167/123‑7 (MQ=255) aCGGCGAGCAGGTGCCGTTCAGCGCCTTCGTCACCACCCAGTGGGAGGAGGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGAGGCGTCGCCggcgatgc > 1:285167/1‑117 (MQ=255) gAGCAGGTGCCGTTCAGCGCCTTCGTCACCACCCAGTGGGAGGAGGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAgcg > 2:322418/1‑149 (MQ=255) gCCGTTCAGCGCCTTCGTCACCACCCAGTGGGAGGAGGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGt > 7:151175/1‑147 (MQ=255) cGTTCAGCGCCTTCGTCACCACCCAGTGGGAGGAGGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGc < 5:177522/149‑1 (MQ=255) cGTCACCACCCAGTGGGAGGAGGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCa < 8:151175/148‑1 (MQ=255) cGTCACCACCCAGTGGGAGGAGGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAAGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCa < 7:223388/148‑1 (MQ=255) gTCACCACCCAGTGGGAGGAGGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCAg < 4:325431/148‑1 (MQ=255) accaccCAGTGGGAGGAGGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCAGGTAt > 5:133803/1‑149 (MQ=255) ccaccCAGTGGGAGGAGGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCAGGTATc > 6:350008/1‑149 (MQ=255) caccCAGTGGGAGGAGGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCa > 7:318633/1‑142 (MQ=255) caccCAGTGGGAGGAGGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCa < 8:318633/142‑1 (MQ=255) cccAGTGGGAGGAGGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTg < 4:330063/122‑1 (MQ=255) cccAGTGGGAGGAGGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTg > 3:330063/1‑122 (MQ=255) ccAGTGGGAGGAGGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCAGGTATCGGc > 7:19275/1‑148 (MQ=255) cAGTGGGAGGAGGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCAGGTATCGGCTa > 1:13191/1‑149 (MQ=255) cAGTGGGAGGAGGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCAGGTATCGGCTa < 1:322418/149‑1 (MQ=255) gaggagGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCAGGTATCGGCTACGCCTg > 8:220955/1‑149 (MQ=255) gaggagGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCAGGTATCGGCTACGCCTg > 3:121324/1‑149 (MQ=255) gaggagGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCAGGTATCGGCTACGCCTg < 1:318985/149‑1 (MQ=255) cccGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCAGGTATCGGCTACGCCTGGACGGGcc > 5:117741/1‑149 (MQ=255) cccGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCAGGTATCGGCTACGCCTGGACGGGcc > 3:224144/1‑149 (MQ=255) gTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCAGGTATCGGCTACGCCTGGACGGGCCTTTc < 8:84353/149‑1 (MQ=255) cAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCAGGTATCGGCTACGCCTGGACGGGCCTTTCCTa > 1:257880/1‑149 (MQ=255) cTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCAGGTATCGGCTACGCCTGGACGGGCCTTTCCTACCa < 6:117741/149‑1 (MQ=255) cTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCAGGTATCGGCTACGCCTGGACGGGCCTTTCCTACCa < 4:121324/149‑1 (MQ=255) cgcTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCAGGTATCGGCTACGCCTGGACGGGCCTTTCCTACCAGgaga < 4:224144/148‑1 (MQ=255) tACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCAGGTATCGGCTACGCCTGGACGGGCCTTTCCTACCAGGAGAAGGt > 1:174111/1‑149 (MQ=255) tACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCAGGTATCGGCTACGCCTGGACGGGCCTTTCCTACCAGGAGAAGGt > 4:73096/1‑149 (MQ=255) cAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCAGGTATCGGCTACGCCTGGACGGGCCTTTCCTACCAGGAGAAGGt < 6:133803/147‑1 (MQ=255) aaCGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCAGGTATCGGCTACGCCTGGACGGGc > 5:209260/1‑126 (MQ=255) aaCGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCAGGTATCGGCTACGCCTGGACGGGc < 6:209260/126‑1 (MQ=255) gTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCAGGTATCGGCTACGCCTGGACGGGCCTTTCCTACCAGGAGAAGGTCTCCAGc > 5:302723/1‑149 (MQ=255) cccGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGTGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCAGGTATCGGCTACGCCTGGACGGGCCTTTCCTACCAGGAGAAGGTCTCCAGCgtc < 7:220955/148‑3 (MQ=255) ccGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCAGGTATCGGCTACGCCTGGACGGGCCTTTCCTACCAGGAGAAGGTCTCCAGCGGc > 1:206068/1‑147 (MQ=255) cGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCAGGTATCGGCTACGCCTGGACGGGCCTTTCCTACCAGGAGAAGGTCTCCAGCGGCCAg < 2:206068/149‑1 (MQ=255) aTCCGCATCGCCGGCGACGCCTGGAAGGGGCACAGTACAGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGATGCCGCCAGGTATCGGCTACGCCTGGCCGGGCCTTTCCTACCAg > 7:216192/1‑123 (MQ=255) aTCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCAGGTATCGGCTACGCCTGGACGGGCCTTTCCTACCAg < 8:216192/123‑1 (MQ=255) aTCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCAGGTATCGGCTACGCCTGGACGGGCCTTTCCTACCAg > 5:352115/1‑123 (MQ=255) aTCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCAGGTATCGGCTACGCCTGGACGGGCCTTTCCTACCAg < 6:352115/123‑1 (MQ=255) cGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCAGGTATCGGCTACGCCTGGACGGGCCTTTCCTACCAGGAGAAGGTCTCCAGCGGCCAGGCTGCCAg > 1:234606/1‑149 (MQ=255) gCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCAGGTATCGGCTACGCCTGGACGGGCCTTTCCTACCAGGAGAAGGTCTCCAGCGGCCAGGCTGCCAGc > 8:287564/1‑149 (MQ=255) cATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCAGGTATCGGCTACGCCTGGACGGGCCTTTCCTACCAGGAGAAGGTCTCCAGCGGCCAGGCTGCCAGcc > 4:203636/1‑149 (MQ=255) tgccccGGCGAGGCGTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCAGGTATCGGCTACGCCTGGACGGGCCTTTCCTACCAGGAGAAGGTCTCCAGCGGCCAGGCTGCCAGCCt > 8:268486/5‑149 (MQ=255) ccGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCAGGTATCGGCTACGCCTGGACGGGCCTTTCCTACCAGGAGAAGGTCTCCAGCGGCCAGGCTGCCAGCCTGTTc > 4:143671/1‑149 (MQ=255) ccGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCAGGTATCGGCTACGCCTGGACGGGCCTTTCCTACCAGGAGAAGGTCTCCAGCGGCCAGGCTGCCAGCCTGTTc < 8:19275/149‑1 (MQ=255) gACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCAGGTATCGGCTACGCCTGGACGGGCCTTTCCTACCAGGAGAAGGTCTCCAGCGGCCAGGCTGCCAGCCTGTTCGCCCt > 4:297793/1‑149 (MQ=255) gACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCAGGTATCGGCTACGCCTGGACGGGCCTTTCCTACCAGGAGAAGGTCTCCAGCGGCCAGGCTGCCAGCCTGTTCGCCCt < 2:174111/149‑1 (MQ=255) | CCCCGAAAGCGTGCTGCGCCTCTATGCTCCCAATGCCAACGGCGAGCAGGTGCCGTTCAGCGCCTTCGTCACCACCCAGTGGGAGGAGGGCCCGGTGCAACTGGTGCGCTACAACGGTTACCCGTCGATCCGCATCGCCGGCGACGCCTCGCCGGGGCACAGTACCGGGCAGGCAATGGCCGAGATGGAGCGCCTGGTCAGCGAGCTGCCGCCAGGTATCGGCTACGCCTGGACGGGCCTTTCCTACCAGGAGAAGGTCTCCAGCGGCCAGGCTGCCAGCCTGTTCGCCCT > NC_002947/3216416‑3216706 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |