| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,552,678 | C→T | 6.5% | A112V (GCC→GTC) | PP_3137 → | group 2 family glycosyl transferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,552,678 | 0 | C | T | 6.5% | 227.2 / 3.6 | 77 | A112V (GCC→GTC) | PP_3137 | group 2 family glycosyl transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (37/35); new base T (3/2); total (40/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.10e-01 | |||||||||||
ACGCGCCCGCAATGAAGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCGGGCAGACGCCTTTGCTGCC > NC_002947/3552541‑3552826 | aCGCGCCCGCAATGAAGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAgtgg > 8:89045/1‑149 (MQ=255) ccGCAATGAAGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGtgtgtg > 7:257927/1‑149 (MQ=255) ccGCAATGAAGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGtgtgtg > 4:275412/1‑149 (MQ=255) aaGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGtgtgtg > 8:62706/1‑141 (MQ=255) aaGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGtgtgtg < 7:62706/141‑1 (MQ=255) gTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGt < 3:184064/149‑1 (MQ=255) tttGCCGCCTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGt > 7:79435/1‑147 (MQ=255) gccgccTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAgc < 5:85926/148‑1 (MQ=255) ccgccTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAgcgc > 5:315673/1‑149 (MQ=255) ccgccTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAgcgc > 7:165177/1‑149 (MQ=255) cgccTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCt > 3:326720/1‑149 (MQ=255) cTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTcc < 8:76145/149‑1 (MQ=255) ttGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGTCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTccc > 2:214168/1‑149 (MQ=255) gCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGATGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCg < 8:165177/148‑1 (MQ=255) gCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTccc < 5:193971/147‑1 (MQ=255) cAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAgtgg > 7:271921/1‑118 (MQ=255) cAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAgtgg < 8:271921/118‑1 (MQ=255) cAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCg > 8:227192/1‑147 (MQ=255) cAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCa < 6:315673/149‑1 (MQ=255) gcgcCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGc > 8:87464/1‑149 (MQ=255) aTCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTAc > 6:89365/1‑148 (MQ=255) aTCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTAGATGGCGACTGAGAGGTGAATGACAGCTGGCTGGCCACTGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACACAGCAGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCTGCGTGAGCGCTTACAGCAGCGTTAGGTTTAc > 7:261520/1‑148 (MQ=255) gATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAAc < 5:89365/148‑1 (MQ=255) gATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAAc < 4:271288/148‑1 (MQ=255) aTGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACtt > 1:177073/1‑149 (MQ=255) tGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACtt > 3:24481/1‑148 (MQ=255) gCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGc > 4:275428/1‑149 (MQ=255) cAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCt < 3:217517/149‑1 (MQ=255) gCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCtgt < 4:326720/149‑1 (MQ=255) gCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCtgt < 8:257927/149‑1 (MQ=255) cTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCtgtg > 7:58442/1‑149 (MQ=255) gTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTTAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGa < 8:244822/149‑1 (MQ=255) gTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGc < 7:87464/147‑1 (MQ=255) gTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGc < 2:200338/147‑1 (MQ=255) gTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGa > 7:244822/1‑149 (MQ=255) gTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGa > 1:316186/1‑149 (MQ=255) gTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGa > 4:54810/1‑149 (MQ=255) taaaGTTCCTCGATGGCGACTTCGAGGTGAATGCCAGCTGTCTTGCCACGTCTCAGGCTTTTCTTGAGCATCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCTCAGGAGTGAGATCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTTCGAc < 8:261520/146‑1 (MQ=255) ttCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTg > 6:128112/1‑147 (MQ=255) gtcgATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTg < 7:89045/149‑1 (MQ=255) tcgATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGGGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTgg < 7:227192/149‑1 (MQ=255) gATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTggg < 8:151037/148‑1 (MQ=255) gATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGa < 3:275412/149‑1 (MQ=255) gATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCACCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGc > 7:69523/1‑109 (MQ=255) gATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCACCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGc < 8:69523/109‑1 (MQ=255) gATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAACACCCCGTCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGa > 2:44516/1‑149 (MQ=255) gATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAACACCCCGTCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGa > 2:39303/1‑149 (MQ=255) ggCGACTGCGAGGTGAATGGCAGCTGGCTGGCCACGGCGGAGGCTGGTCTTGAGCAGCGCACCGCCGGGGGAGGGGGGGGGGGGCGGGGGCGTGGGGGCGTCCGGCGGCGTGCGGTGGGCTAGTTGCTGGGCGTGCTGGCGTggggggg > 6:350176/1‑145 (MQ=255) cGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCcggt < 7:57018/147‑1 (MQ=255) ggTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCcggtcggt > 2:75947/1‑148 (MQ=255) gTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCt < 1:34361/116‑1 (MQ=255) gTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCt > 2:34361/1‑116 (MQ=255) gTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGa < 8:79435/149‑1 (MQ=255) gTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGa < 3:275428/149‑1 (MQ=255) gTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGCTGTACAACTTGCTGTGAGACCTGGAGTGGGATACCCcggtcggt > 5:63702/1‑147 (MQ=255) tGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAg < 4:24481/149‑1 (MQ=255) tGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAg < 3:54810/149‑1 (MQ=255) tGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTg < 5:181631/121‑1 (MQ=255) tGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTg > 6:181631/1‑121 (MQ=255) ccAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAg > 1:301416/1‑149 (MQ=255) gctggcCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGa < 8:212067/120‑1 (MQ=255) gctggcCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGa > 7:212067/1‑120 (MQ=255) gctggcCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCtgt < 2:301416/148‑1 (MQ=255) gcCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTggcgg < 5:128112/149‑1 (MQ=255) ccACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCAGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACACCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTggcggc > 1:243083/1‑149 (MQ=255) gcgcAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATgc > 4:92120/1‑149 (MQ=255) gcAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCtgtg < 8:32906/137‑1 (MQ=255) gcAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCtgtg > 7:32906/1‑137 (MQ=255) aGGCTTTTCTTGAGCAACACCCCGTCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTg < 1:39303/149‑1 (MQ=255) aGGCTTTTCTTGAGCAACACCCCGTCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTg < 1:44516/149‑1 (MQ=255) ttttCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGc > 1:35528/1‑149 (MQ=255) tttCTTGAGCAGCACCACGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGAAGCGTTCGGTGTACAACTAGATGTGCGCCCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGCCGGCGATGCGCTGATGCg > 5:186707/1‑149 (MQ=255) cTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCggg > 1:139936/1‑148 (MQ=255) gtGAGCAGCACGCCGCGGTGGCAGTGGGGTGTGGTCGCCGTCGTGAGCGCGTCCCGCAGCGTTCGGTGTATAACTTTCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCGGGc < 6:186707/147‑1 (MQ=255) gcagcaCCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCt < 8:40695/135‑1 (MQ=255) gcagcaCCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCt > 7:40695/1‑135 (MQ=255) aCCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCGGGCAGACGCCttt > 4:248355/1‑149 (MQ=255) ccgccgTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGCCCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCGGGCAGACGCCTTtgct > 4:27804/1‑149 (MQ=255) cgccgTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCGGGCAGACGCCTTtgctg > 7:39445/1‑149 (MQ=255) ccgTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCGGGCAGACGCCTTTGCTGcc > 4:55938/1‑149 (MQ=255) | ACGCGCCCGCAATGAAGGTTTTGCCGCCTTGCAGCGCCTGTTGCCATCGATGCAGCTGGTACAGTTCGTCGATGGCGACTGCGAGGTGAATGCCAGCTGGCTGGCCACGGCGCAGGCTTTTCTTGAGCAGCACCCCGCCGTGGCAGTGGTGTGTGGTCGCCGGCGTGAGCGCTTCCCGCAGCGTTCGGTGTACAACTTGCTGTGCGACCTGGAGTGGGATACCCCGGTCGGTGAGGCCAAGGCCTGTGGCGGCGATGCGCTGATGCGGGCAGACGCCTTTGCTGCC > NC_002947/3552541‑3552826 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |