Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,579,072 | T→A | 6.0% | F142L (TTT→TTA) | PP_5589 → | rhs repeat‑associated core domain‑containing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,579,072 | 0 | T | A | 6.0% | 190.3 / 2.6 | 67 | F142L (TTT→TTA) | PP_5589 | rhs repeat‑associated core domain‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (29/34); new base A (2/2); total (31/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.61e-01 |
TACCGCCGCAGGATATAATTCAGTCCAGCCCTGAGTTAAGGCCTTTTGTAGAACGTAATTCGAAGTTGACTGTGCTTGCTCGCTTGAGGGGGTCGCCTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGATTGTTTGTTTGCTGCTTATGCTAGTAATATTGCCTCTGGCAGCGCTAGAATTCCTGAGTTGATGAAAGTTACTGCTTGGATTAGGGCTGAACG > NC_002947/3578927‑3579212 | tACCGCCGCAGGATATAATTCAGTCCAGCCCTGAGTTAAGGCCTTTTGTAGAACGTAATTCGAAGTTGACTGTGCTTGCTCGCTTGAGGGGGTCGCCTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATc < 7:248224/149‑1 (MQ=255) gccgcAGGATATAATTCAGTCCAGCCCTGAGTTAAGGCCTTTTGTAGAACGTAATTCGAAGTTGACTGTGCTTGCTCGCTTGAGGGGGTCGCCTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGc < 3:313147/149‑1 (MQ=255) cgcAGGATATAATTCAGTCCAGCCCTGAGTTAAGGCCTTTTGTAGAACGTAATTCGAAGTTGACTGTGCTTGCTCGCTTGAGGGGGTCGCCTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATAAAATCAAGcac < 4:139265/149‑3 (MQ=255) cgcAGGATATAATTCAGTCCAGCCCTGAGTTAAGGCCTTTTGTAGAACGTAATTCGAAGTTGACTGTGCTTGCTCGCTTGAGGGGGTCGCCTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATAAAATCAAGcac < 5:165342/149‑3 (MQ=255) aGGATATAATTCAGTCCAGCCCTGAGTTAAGGCCTTTTGTAGAACGTAATTCGAAGTTGACTGTGCTTGCTCGCTTGAGGGGGTCGCCTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGtgtt < 4:137870/149‑1 (MQ=255) taATTCAGTCCAGCCCTGAGTTAAGGCCTTTTGTGGAACGTAATTCGAAGTTGACTGTGCTTGCTCGCTTGAGGGGGTCGCCTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGc < 8:74737/148‑1 (MQ=255) aaTTCAGTCCAGCCCTGAGTTAAGGCCTTTTGTAGAACGTAATTCGAAGTTGACTGTGCTTGCTCGCTTGAGGGGGTCGCCTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGccc > 2:185225/1‑149 (MQ=255) aTTCAGTCCAGCCCTGAGTTAAGGCCTTTTGTAGAACGTAATTCGAAGTTGACTGTGCTTGCTCGCTTGAGGGGGTCGCCTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGcccc > 2:37711/1‑149 (MQ=255) aTTCAGTCCAGCCCTGAGTTAAGGCCTTTTGTAGAACGTAATTCGAAGTTGACTGTGCTTGCTCGCTTGAGGGGGTCGCCTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGccc < 7:135339/148‑1 (MQ=255) aTTCAGTCCAGCCCTGAGTTAAGGCCTTTTGTAGAACGTAATTCGAAGTTGACTGTGCTTGCTCGCTTGAGGGGGTCGCCTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGccc < 7:322134/148‑1 (MQ=255) tCCAGCCCTGAGTTAAGGCCTTTTGTAGAACGTAATTCGAAGTTGACTGTGCTTGCTCGCTTGAGGGGGTCGCCTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGt > 3:147269/1‑149 (MQ=255) cAGCCCTGAGTTAAGGCCTTTTGTAGAACGTAATTCGAAGTTGACTGTGCTTGCTCGCTTGAGGGGGTCGCCTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTc < 1:37711/148‑1 (MQ=255) ccTGAGTTAAGGCCTTTTGTAGAACGTAATTCGAAGTTGACTGTGCTTGCTCGCTTGAGGGGGTCGCCTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACgg < 1:185225/149‑1 (MQ=255) aGTTAAGGCCTTTTGTAGAACGTAATTCGAAGTTGACTGTGCTTGCTCGCTTGAGGGGGTCGCCTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACgggg < 8:204035/147‑1 (MQ=255) ggtAAGGCCTTTTGTAGAACGTAATTCGAAGTTGCCTGTGCTTGCTCGCTTGAGGGGGTCGCCTTCATCTCGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGggtg < 6:255629/147‑1 (MQ=255) gTTAAGGCCTTTTGTAGAACGTAATTCGAAGTTGACTGTTCTTGCTCGCTTGAGGGGGTCGCCTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGggtg < 7:163747/149‑1 (MQ=255) gTTAAGGCCTTTTGTAGAACGTAATTCGAAGTTGACTGTGCTTGCTCGCTTGAGGGGGTCGCCTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGggtg < 5:111502/149‑1 (MQ=255) ttAAGGCCTTTTGTAGAACGTAATTCGAAGTTGACTGTGCTTGCTCGCTTGAGGGGGTCGCCTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGggtgg > 2:12843/1‑149 (MQ=255) aaGGCCTTTTGTAGAACGTAATTCGAAGTTGACTGTGCTTGCTCGCTTGAGGGGGTCGCCTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGgtggtg > 4:273644/1‑149 (MQ=255) aGGCCTTTTGTAGAACGTAATTCGAAGTTGACTGTGCTTGCTCGCTTGAGGGGGTCGCCTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGgtgt < 8:124875/149‑1 (MQ=255) ttttGTAGAACGTAATTCGAAGTTGACTGTGCTTGCTCGCTTGAGGGGGTCGCCTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGt < 6:223096/129‑1 (MQ=255) ttttGTAGAACGTAATTCGAAGTTGACTGTGCTTGCTCGCTTGAGGGGGTCGCCTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGt > 5:223096/1‑129 (MQ=255) ttGTAGAACGTAATTCGAAGTTGAATGTGCTTGCTCGCTTGAGGGGGTCGCCTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAgatga < 7:218707/148‑1 (MQ=255) gTAGAACGTAATTCGAAGTTGACTGTGCTTGCTCGCTTGAGGGGGTCGCCTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAgatga > 8:218707/1‑146 (MQ=255) tAGAACGTAATTCGAAGTTGACTGTGCTTGCTCGCTTGAGGGGGTCGCCTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGAttgt > 7:83011/1‑149 (MQ=255) gTAATTCGAAGTTGACTGTGCTTGCTCGCTTGAGGGGGTCGCCTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGGTGATTgtttgttt > 4:288624/1‑149 (MQ=255) aTTCGAAGTTGACTGTGCTTGCTCGCTTGAGGGGGTCGCCTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGATTGTTTGTTtgct > 7:303251/1‑149 (MQ=255) cGAAGTTGACTGTGCTTGCTCGCTTGAGGGGGTCGCCTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGATTGTTTGTTtgctgt < 6:349102/148‑2 (MQ=255) gTTGACTGTGCTTGCTCGCTTGAGGGGGTCGCCTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGATTGTTTGTTTGCTGCTTAt > 7:140641/1‑148 (MQ=255) gcttgctCGCTTGAGGGGGTCGCCTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGATTGTTTGTTTGCTGCTTATGCTAGTAat < 1:12843/148‑1 (MQ=255) ttgctCGCTTGAGGGGGTCGCCTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGATTGTTTGTTTGCTGCTTATGCTAGTAat > 5:135388/1‑146 (MQ=255) ttgctCGCTTGAGGGGGTCGCCTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGATTGTTTGTTTGCTGCTTATGCTAGTAat < 6:135388/146‑1 (MQ=255) gctCGCTTGAGGGGGTCGCCTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGATTGTTTGTTTGCTGCTTATGCTAGTAATAtt < 4:147269/147‑1 (MQ=255) tCGCTTGAGGGGGTCGCCTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGATTGTTTGTTTGCTGCTTATGCTAGTTATATTGCct > 8:162293/1‑149 (MQ=255) tCGCTTGAGGGGGTCGCCTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGATTGTTTGTTTGCTGCTTATGCTAGTAATATTGCct > 3:47813/1‑149 (MQ=255) gCTTGAGGGGGTCGCCTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGATTGTTTGTTTGCTGCTTATGCTAGTAATATTGCctct > 7:170432/1‑149 (MQ=255) ggggTCGCCTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGATTGTTTGTTTGCTGCTTATGCTAGTAATATTGCCTCTGGCAgcg > 6:347736/1‑149 (MQ=255) gTCGCCTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGATTGTTTGTTTGCTGCTTATGCTAGTAATATTGCCTCTGGCAgcgc > 6:56596/1‑147 (MQ=255) ccTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGgtggtg < 2:186159/91‑1 (MQ=255) ccTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGgtggtg > 1:186159/1‑91 (MQ=255) ccTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGATTGTTTGTTTGCTGCTTATGc > 5:287617/1‑119 (MQ=255) ccTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGATTGTTTGTTTGCTGCTTATGc < 6:287617/119‑1 (MQ=255) aTCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGATTGTTTGTTTGCTGCTTATGCTAGTAATATTGCCTCTGGCAGCGCTAGAATTCCt < 4:47813/148‑1 (MQ=255) tCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGATTGTTTGTTTGCTGCTTATGCTAGTAATATTGCCTCTGGCAGCGCTAGAATTCCTGa > 3:20782/1‑149 (MQ=255) tAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGATTGTTTGTTTGCTGCTTATGCTAGTAATATTGCCTCTGGCAGCGCTAGAATTCCTGAGt < 8:83011/149‑1 (MQ=255) gCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGGTGATTGTTTGTTTGCTGCTTATGCTAGTAATATTGCCTCTGGCAGCGCTAGAATTCCTGa < 3:288624/145‑1 (MQ=255) cAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGATTGTTTGTTTGCTGCTTATGCTAGTAATATTGCCTCTGGCAGCGCTAGAATTCCTGAGTtga > 6:281651/1‑149 (MQ=255) gAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGATTGTTTGTTTGCTGCTTATGCTAGTAATATTGCCTCTGGCAGCGCTAGAATTCCTGAGTtgat > 6:91709/1‑148 (MQ=255) tatTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGATTGTTTGTTTGCTGCTTATGCTAGTAATATTGCCTCTGGCAGCGCTAGAATTCCTGAGTTGATGAAAGt > 4:276585/1‑148 (MQ=255) ccGTAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGATTGTTTGTTTGCTGCTTATGCTAGTAATATTGCCTCTGGCAGCGCTAGAATTCCTGAGTTGATGAAAGTTACTGc < 8:140641/149‑1 (MQ=255) cGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGATTGTTTGTTTGCTGCTTa > 5:255660/1‑91 (MQ=255) cGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGATTGTTTGTTTGCTGCTTa < 6:255660/91‑1 (MQ=255) gaggaTCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGATTGTTTGTTTGCTGCTTATGCTAGTAATATTGCCTCTGGCAGCGCTAGAATTCCTTAGTTGATGAAATTTACTGCTTg > 3:96452/1‑149 (MQ=255) gaggaTCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGATTGTTTGTTTGCTGCTTATGCTAGTAATATTGCCTCTGGCAGCGCTAGAATTCCTGa < 4:83574/128‑1 (MQ=255) gaggaTCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGATTGTTTGTTTGCTGCTTATGCTAGTAATATTGCCTCTGGCAGCGCTAGAATTCCTGa > 3:83574/1‑128 (MQ=255) gaTCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGATTGTTTGTTTGCTGCTTATGCTAGTAATATTGCCTCTGGCAGCGCTAGAATTCCTGAGTTGATGaaa > 5:24752/1‑135 (MQ=255) gaTCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGATTGTTTGTTTGCTGCTTATGCTAGTAATATTGCCTCTGGCAGCGCTAGAATTCCTGAGTTGATGaaa < 6:24752/135‑1 (MQ=255) aTCTGGAAGTGGTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGATTGTTTGTTTGCTGCTTATGCTAGTAATATTGCCTCTGGCAGCGCTAGAATTCCTGAGTTGATGAAAGTTACTGCTTGGAt < 8:170432/148‑1 (MQ=255) aTCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGATTGTTTGTTTGCTGCTTATGCTAGTAATATTGCCTCTGGCAGCGCTAGAATTCCTGAGTTGATGAAAGTTACTGCTTGGAt < 3:276585/148‑1 (MQ=255) gAAGTGCTTGATTTTATCATGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGATTGTTTGTTTGCTGCTTATGCTAGTAATATTGCCTCTGGCAGCGCTAGAATTCCTGAGTTGATGAAAGTTACTGCTTGGATTAgg < 4:20782/147‑1 (MQ=255) gAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGATTGTTTGTTTGCTGCTTATGCTAGTAATATTGCCTCTGGCAGCGCTAGAATTCCTGAGTTGATGAAAGTTACTGCTTGGATTAGGGc < 7:162293/149‑1 (MQ=255) aaGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGATTGTTTGTTTGCTGCTTATGCTAGTAATATTGCCTCTGGCAGCGCTAGAATTCCTGAGTTGATGAAAGTTACTGCTTGGATTAGGGCt < 5:56596/149‑1 (MQ=255) acgCTTGATAAAATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGATTGTTTGTTTGCTGCTTATGCTAGTAATATTGCCTCTGGCAGCGCTAGAATTCCTGAGTTGATGAAAGTTACTGCTTGGATTAGGGCTg > 7:289164/3‑148 (MQ=255) gCTTGATAAAATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGATTGTTTGTTTGCTGCTTATGCTAGTAATATTGCCTCTGGCAGCGCTAGATTTCCTGAGTTGATGAAAGTTTCTGCGTGGATTAGGGCTGAAc > 4:11364/1‑149 (MQ=255) cTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGATTGTTTGTTTGCTGCTTATGCTAGTAATATTGCCTCTGGCAgcgc > 7:115743/1‑101 (MQ=255) cTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGATTGTTTGTTTGCTGCTTATGCTAGTAATATTGCCTCTGGCAgcgc < 8:115743/101‑1 (MQ=255) cTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGATTGTTTGTTTGCTGCTTATGCTAGTAATATTGCCTCTGGCAGCGCTAGAATTCCTGAGTTGATGAAAGTTACTGCTTGGATTAGGGCTGAACg > 2:183610/1‑149 (MQ=255) | TACCGCCGCAGGATATAATTCAGTCCAGCCCTGAGTTAAGGCCTTTTGTAGAACGTAATTCGAAGTTGACTGTGCTTGCTCGCTTGAGGGGGTCGCCTTCATCTAGCAGAAATATATTACCGGAGGATCTGGAAGTGCTTGATTTTATCAAGCGTGTTGTCGCCCCTCCTGTCGACGGGGGTGGTGTAGATGATTGTTTGTTTGCTGCTTATGCTAGTAATATTGCCTCTGGCAGCGCTAGAATTCCTGAGTTGATGAAAGTTACTGCTTGGATTAGGGCTGAACG > NC_002947/3578927‑3579212 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |