| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
GCTGGCTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGGCGCGGTTGCCAGGGGTGGGTGAAGGTGAAGCCGCTGTCGCTCGACAGCGCCCAGGCGCGGATCGACGCGTTGCCCAGGTGGCCGGTCTGCCCGACGAGGTTCCAGCTCCAGTCCAGTGCCTGATGGCGGCCGAACAGCCGCGTGCCGAAAGTGTAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGG > NC_002947/3787570‑3787865 | gctggctTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCAGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGGCGCGGTTGCCAGGGGTGGGTGAAGGTGAAGCCGCTGTCGc > 7:181306/1‑149 (MQ=255) ctTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGGCGCGGTTGCCAGGGGTGGGTGAAGGTGAAGCCGCTGTCGCTCGa < 5:119122/148‑1 (MQ=255) catcggtgacgtagtcgtccaggcactccggcagcaatgtaacctgcgttcgagcctcaccttcgatgaatcgcttcatgattgtccccacggtcacgacgaccagaaggttagacaaccgcgggcgttttcacacagtctggCTAGa > 8:168817‑M2/144‑148 (MQ=255) 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aTAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTTGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTGACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATAGCCAGGCGCGGTTGCCAGGGGTGTGTGAAGGTGAAGCCGCTGTCGCTccaggctgtgt > 2:114743‑M2/1‑138 (MQ=255) acgtagtcgtccaggcactccggcagcaatgtaacctgcgttcgagcctcaccttcgatgaatcgcttcatgattgtccccacggtcacgacgaccagaaggttagacaaccgcgggcgttttcacacagtctggCTCGACAgcgc > 3:238605‑M2/136‑146 (MQ=255) aGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTAGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGGCGCGCTTGCCAGGGGTGGGTGAAGGAGAAGCCGCTGTCGCTccaggctgtgtg < 2:142135‑M2/148‑13 (MQ=255) gtagtcgtccaggcactccggcagcaatgtaacctgcgttcgagcctcaccttcgatgaatcgcttcatgattgtccccacggtcacgacgaccagaaggttagacaaccgcgggcgttttcacacagtctggCTCGACAGCGCCCAgg > 7:335645‑M2/134‑149 (MQ=255) acacCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGGCGCGGTTGCCAGGGGTGGGTGAAGGTGAAGCCGCTGTCGCTccaggctgtgtgaa < 1:4185‑M2/148‑15 (MQ=255) acacCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGGCGCGGTTGCCAGGGGTGGGTGAAGGTGAAGCCGCTGTCGCTccaggctgtgtga < 6:78832‑M2/147‑14 (MQ=255) cATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGGCGCGGTTGCCAGGGGTGGGTGAAGGTGAAGCCGCTGTCGCTCGACAGCGCCCAGgcgc > 4:15511/1‑147 (MQ=255) ttGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGGCGCGGTTGCCAGGGGTGGGTGAAGGTGAAGCCGCTGTCGCTccaggctgtgtgaaaacacgc < 7:324916‑M2/149‑22 (MQ=255) ttGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGGCGCGGTTGCCAGGGGTGGGTGAAGGTGAAGCCGCTGTCGCTccaggctgtgtgaaaacacg > 3:158142‑M2/1‑128 (MQ=255) tccaggcactccggcagcaatgtaacctgcgttcgagcctcaccttcgatgaatcgcttcatgattgtccccacggtcacgacgaccagaaggttagacaaccgcgggcgttttcacacagtctggCTCGACAGCGCCCAGGCGCgg < 5:33341‑M2/21‑1 (MQ=255) 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gTCGCTccaggctgtgtgaaaacacgcgaaatgcgttgaagggcgcagggatctagagaggcttgccaaactggcaagaaattgcgtggtttagctcaaatcgccgtgctggggcgcatgtggcgatgtgagtcgttcttgaggtctt < 3:125905‑M2/148‑143 (MQ=255) tCGCTccaggctgtgtgaaaacacgcgaaatgcgttgaagggcgcagggatctagagaggcttgccaaactggcaagaaattgcgtggtttagctcaaatcgccgtgctggggcgcatgtggcgatgtgagtcgttcttgaggtctttt < 8:95307‑M2/149‑145 (MQ=255) gCTccaggctgtgtgaaaacacgcgaaatgcgttgaagggcgcagggatctagagaggcttgccaaactggcaagaaattgcgtggtttagctcaaatcgccgtgctggggcgcatgtggcgatgtgagtcgttcttgaggtctttt < 8:197586‑M2/147‑145 (MQ=255) gCTccaggctgtgtgaaaacacgcgaaatgcgttgaagggcgcagggatctagagaggcttgccaaactggcaagaaattgcgtggtttagctcaaatcgccgtgctggggcgcatgtggcgatgtgagtcgttcttgaggtctttt > 7:197586‑M2/1‑3 (MQ=255) | GCTGGCTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGGCGCGGTTGCCAGGGGTGGGTGAAGGTGAAGCCGCTGTCGCTCGACAGCGCCCAGGCGCGGATCGACGCGTTGCCCAGGTGGCCGGTCTGCCCGACGAGGTTCCAGCTCCAGTCCAGTGCCTGATGGCGGCCGAACAGCCGCGTGCCGAAAGTGTAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGG > NC_002947/3787570‑3787865 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |