| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | = 3787719 | 5 (0.070) | coding (916/1392 nt) | PP_3350 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
CTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGGCGCGGTTGCCAGGGGTGGGTGAAGGTGAAGCCGCTGTCGCTCGACAGCGCCCAGGCGCGGATCGACGCGTTGCCCAGGTGGCCGGTCTGCCCGACGAGGTTCCAGCTCCAGTCCAGTGCCTGATGGCGGCCGAACAGCCGCGTGCCGAAAGTGTAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTG > NC_002947/3787575‑3787867 | ctTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGGCGCGGTTGCCAGGGGTGGGTGAAGGTGAAGCCGCTGTCGCTCGa < 5:119122/148‑1 (MQ=255)cTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGGCGCGGTTGCCAGGGGTGGGTGAAGGTGAAGCCGCTGTCGCTcc > 6:148878‑M2/1‑145 (MQ=255) cggtgacgtagtcgtccaggcactccggcagcaatgtaacctgcgttcgagcctcaccttcgatgaatcgcttcatgattgtccccacggtcacgacgaccagaaggttagacaaccgcgggcgttttcacacagtctggCTCGACAgc > 1:369638‑M2/141‑149 (MQ=255) ccATAGACACCATTGCGTGGGTAACGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCGAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGTCATCGATGCGCATGGCCAGGCGCGGTTGCCAGGGGTGGGTGAAGGTGAAGCCGCTGTCGCTccaggctgt > 8:262240‑M2/1‑140 (MQ=255) ccATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGGCGCGGTTGCCAGGGGTGGGTGAAGGTGAAGCCGCTGTCGCTcaggctgtg < 8:51271‑M2/149‑10 (MQ=255) tgacgtagtcgtccaggcactccggcagcaaggtaacctgcgttcgagcctcaccttcgatgaatcgcttcatgattgtccccacggtcacgacgaccagaaggttagacaaccgcgggcgttttcacacagtctggCTCGACAgcgc < 6:290587‑M2/11‑1 (MQ=255) aTAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTTGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTGACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATAGCCAGGCGCGGTTGCCAGGGGTGTGTGAAGGTGAAGCCGCTGTCGCTccaggctgtgt > 2:114743‑M2/1‑138 (MQ=255) acgtagtcgtccaggcactccggcagcaatgtaacctgcgttcgagcctcaccttcgatgaatcgcttcatgattgtccccacggtcacgacgaccagaaggttagacaaccgcgggcgttttcacacagtctggCTCGACAgcgc > 3:238605‑M2/136‑146 (MQ=255) acacCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGGCGCGGTTGCCAGGGGTGGGTGAAGGTGAAGCCGCTGTCGCTccaggctgtgtgaa < 1:4185‑M2/148‑15 (MQ=255) acacCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGGCGCGGTTGCCAGGGGTGGGTGAAGGTGAAGCCGCTGTCGCTccaggctgtgtga < 6:78832‑M2/147‑14 (MQ=255) cATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGGCGCGGTTGCCAGGGGTGGGTGAAGGTGAAGCCGCTGTCGCTCGACAGCGCCCAGgcgc > 4:15511/1‑147 (MQ=255) ttGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGGCGCGGTTGCCAGGGGTGGGTGAAGGTGAAGCCGCTGTCGCTccaggctgtgtgaaaacacgc < 7:324916‑M2/149‑22 (MQ=255) ttGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGGCGCGGTTGCCAGGGGTGGGTGAAGGTGAAGCCGCTGTCGCTccaggctgtgtgaaaacacg > 3:158142‑M2/1‑128 (MQ=255) tccaggcactccggcagcaatgtaacctgcgttcgagcctcaccttcgatgaatcgcttcatgattgtccccacggtcacgacgaccagaaggttagacaaccgcgggcgttttcacacagtctggCTCGACAGCGCCCAGGCGCgg < 5:33341‑M2/21‑1 (MQ=255) tGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGGCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGGCGCGGTTGCCAGGGGTGGGTGAAGGTGAAGCCGCTGTCGCTccaggctgtgtgaaaacacgc > 3:237857‑M2/1‑127 (MQ=255) cGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGGCGCGGTTGCCAGGGGTGGGTGAAGGTGAAGCCGCTGTCGCTccaggctgtgtgaaaacacgcga < 8:237610‑M2/148‑24 (MQ=255) tGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGGCGCGGTTGCCAGGGGTGGGTGAAGGTGAAGCCGCTGTCGCTccaggctgtgtgaaaacacgcgaaat > 2:102455‑M2/1‑123 (MQ=255) gcactccggcagcaatgtaacctgcgttcgagcctcaccttcgatgaatcgcttcatgattgtccccacggtcacgacgaccagaaggttagacaaccgcgggcgttttcacacagtctggCTCGACAGCGCCCAGGCGCGGATCGAc < 5:393044‑M2/27‑1 (MQ=255) 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gACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGGCGCGGTTGCCAGGGGTGGGTGAAGGTGAAGCCGCTGTCGCTccaggctgtgtgaaaacacgcgaaatgc < 8:185277‑M2/127‑29 (MQ=255) gACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGGCGCGGTTGCCAGGGGTGGGTGAAGGTGAAGCCGCTGTCGCTccaggctgtgtgaaaacacgcgaaatgc > 7:185277‑M2/1‑99 (MQ=255) cgttcgagcctcaccttcgatgaatcgcttcatgattgtccccacggtcacgacgaccagaaggttagacaaccgcgggcgttttcacacagtctggCTCGACAGCGCCCAGGCGCGGATCGACGCGTTGCCCAGGTGGCCGGTCTGc < 4:238605‑M2/51‑1 (MQ=255) gttcgagcctcaccttcgatgaatcgcttcatgattgtccccacggtcacgacgaccagaaggttagacaaccgcgggcgttttcacacagtctggCTCGACAGCGCCCAGGCGCGGATCGACGCGTTGCCCAGGTGGCCGGTCTGc < 3:109539‑M2/51‑1 (MQ=255) cctcaccttcgatgaatcgcttcatgattgtccccacggtcacgacgaccagaaggttagacaaccgcgggcgttttcacacagtctggCTCGACAGCGCCCAGGCGCGGATCGACGCGTTGCCCAGGTGGCCGGTCTGCCCGACGAgg < 2:336186‑M2/60‑1 (MQ=255) cctcaccttcgatgaatcgcttcatgattgtccccacggtcacgacgaccagaaggttagacaaccgcgggcgttttcacacagtctggCTCGACAGCGCCCAGGCGCGGATCGACGCGTTGCCCAGGTGGCCGGTCTGCCCGACGAgg < 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ccAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGGCGCGGTTGCCAGGGGTGGGTGAAGGTGAAGCCGCTGTCGCTccaggctgtgtgaaaacacgcgaaatgcgttgaagggcgcagggatctagagaggcttgccaa < 4:100161‑M2/148‑64 (MQ=255) gatgaatcgcttcatgattgtccccacggtcacgacgaccagaaggttagacaaccgcgggcgttttcacacagtctggCTCGACAGCGCCCAGGCGCGGATCGACGCGTTGCCCAGGTGGCCGGTCTGCCCGACGAGGTTCCAGCt > 3:331087‑M2/80‑147 (MQ=255) gTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGGCGCGGTTGCCAGGGGTGGGTGAAGGTGAAGCCGCTGTCGCTccaggctgtgtgaaaacacgcgaaatgcgttgaagggcgcagggatctagagaggcttgccaaact < 4:393251‑M2/147‑67 (MQ=255) tCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGGCGCGGTTGCCAGGGGTGGGTGAAGGTGAAGCCGCTGTCGCTccaggctgtgtgaaaacacgcgaaatgcgttgaagggcgcagggatctagagaggcttgccaaactg > 3:393251‑M2/1‑80 (MQ=255) atgaatcgcttcatgattgtccccacggtcacgacgaccagaaggttagacaaccgcgggcgttttcacacagtctggCTCGACAGCGCCCAGGCGCGGATCGACGCGTTGCCCAGGTGGCCGGTCTGCCCGACGAGGTTCCAGCtc < 4:331087‑M2/69‑1 (MQ=255) 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acaaccgcgggcgttttcacacagtctggCTCGACAGCGCCCAGGCGCGGATCGACGCGTTGCCCAGGTGGCCGGTCTGCCCGACGAGGTTCCAGCTCCAGTCCAGTGCCTGATGGCGGCCGAACAGCCGCGTGCCGAAAGTGTAgcg > 5:344606‑M2/30‑148 (MQ=255) ccgcgggcgttttcacacagtctggCTCGACAGCGCCCAGGCGCGGATCGACGCGTTGCCCAGGTGGCCGGTCTGCCCGACGAGGTTCCAGCTCCAGTCCAGTGCCTGATGGCGGCCGAACAGCCGCGTGCCGAAAGTGTAGCgctgct > 1:219136‑M2/26‑149 (MQ=255) gggtgAAGGTGAAGCCGCTGTCGCTccaggctgtttgaaaaaacgcgaaatgcgttgaagggcgcagggatatagagaggcttgcaaaactggcaagaaattgcgtggtttagctcaaatcgccgtgctggggcgcatgtggcgatgt > 6:321555‑M2/1‑25 (MQ=255) gggtgAAGGTGAAGCCGCTGTCGCTccaggctgtgtgaaaacacgcgaaatgcgttgaagggcgcagggatctagagaggcttgccaaactggcaagaaattgcgtggtttagctcaaatcgccgtgctggggcgcatgtggcgatgt > 3:195887‑M2/1‑25 (MQ=255) cgggcgttttcacacagtctggCTCGACAGCGCCCAGGCGCGGATCGACGCGTTGCCCAGGTGGCCGGTCTGCCCGACGAGGTTCCAGCTCCAGTCCAGTGCCTGATGGCGGCCGAACAGCCGCGTGCCGAAAGTGTAGCGCTGCTCg > 6:141025‑M2/23‑148 (MQ=255) aggtgaagCCGCTGTCGCTccaggctgtgtgaaaacacgcgaaatgcgttgaagggcgcagggatctagagaggcttgccaaactggcaagaaattgcgtggtttagctcaaatcgccgtgctggggcgcatgtggcgatgtgagtc > 5:186084‑M2/1‑19 (MQ=255) gaagCCGCTGTCGCTccaggctgtgtgaaaacacgcgaaatgcgttgaagggcgcagggatctagagaggcttgccaaactggcaagaaattgcgtggtttagctcaaatcgccgtgctggggcgcatgtggcgatgtgagtcgttctt > 2:333306‑M2/1‑15 (MQ=255) acacagtctggCTCGACAGCGCCCAGGCGCGGATCGACGCGTTGCCCAGGTGGCCGGTCTGCCCGACGAGGTTCCAGCTCCAGTCCAGTGCCTGATGGCGGCCGAACAGCCGCGTGCCGAAAg > 6:44397‑M2/12‑123 (MQ=255) acacagtctggCTCGACAGCGCCCAGGCGCGGATCGACGCGTTGCCCAGGTGGCCGGTCTGCCCGACGAGGTTCCAGCTCCAGTCCAGTGCCTGATGGCGGCCGAACAGCCGCGTGCCGAAAGTGTAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCg > 7:332698‑M2/12‑149 (MQ=255) gCCGCTGTCGCTccaggctgtgtgaaaacacgcgaaatgcgttgaagggcgcagggatctagagaggcttgccaaactggcaagaaattgcgtggtttagctcaaatcgccgtgctggggcgcatgtggcgatgtgagtcgttcttgag > 8:86009‑M2/1‑12 (MQ=255) cacagtctggCTCGACAGCGCCCAGGCGCGGATCGACGCGTTGCCCAGGTGGCCGGTCTGCCCGACGAGGTTCCAGCTCCAGTCCAGTGCCTGATGGCGGCCGAACAGCCGCGTGCCGAAAgt < 5:44397‑M2/113‑1 (MQ=255) acagtctggCTCGACAGCGCCCAGGCGCGGATCGACGCGTTGCCCAGGTGGCCGGTCTGCCCGCCGAGGTTCCAGCTCCAGTCCAGTGCCTGATGGCGGCCGAACAGCCGCGTGCCGAAAGTGTAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCGcc > 8:62669‑M2/10‑149 (MQ=255) cagtctggCTCGACAGCGCCCAGGCGCGGATCGACGCGTTGCCCAGGTGGCCGGTCTGCCCGACGAGGTTCCAGCTCCAGTCCAGTGCCTGATGGCGGCCGAACAGCCGCGTGCCGAAAGTGTAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCGcc < 6:344606‑M2/140‑1 (MQ=255) tctggCTCGACAGCGCCCAGGCGCGGATCGACGCGTTGCCCAGGTGGCCGGTCTGCCCGACGAGGTTCCAGCTCCAGTCCAGTGCCTGATGGCGGCCGAACAGCCGCGTGCCGAAAGTGTAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGc > 2:300381‑M2/6‑148 (MQ=255) tctggCTCGACAGCGCCCAGGCGCGGATCGACGCGTTGCCCAGGTGGCCGGTCTGCCCGACGAGGTTCCAGCTCCAGTCCAGTGCCTGATGGCGGCCGAACAGCCGCGTGCCGAAAGTGTAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGc > 6:44690‑M2/6‑148 (MQ=255) tCGCTccaggctgtgtgaaaacacgcgaaatgcgttgaagggcgcagggatctagagaggcttgccaaactggcaagaaattgcgtggtttagctcaaatcgccgtgctggggcgcatgtggcgatgtgagtcgttcttgaggtctttt < 8:95307‑M2/149‑145 (MQ=255) gCTCGACAGCGCCCAGGCGCGGATCGACGCGTTGCCCAGGTGGCCGGTCTGCCCGACGAGGTTCCAGCTCCAGTCCAGTGCCTGATGGCGGTCGAACAGCCGCGTGCCGAAAGTGTAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAggg > 8:143044‑M2/2‑149 (MQ=255) tCGACAGCGCCCAGGCGCGGATCGACGCGTTGCCCAGGTGGCCGGTCTGCCCGACGAGGTTCCAGCTCCAGTCCAGTGCCTGATGGCGGCCGAACAGCCGCGTGCCGAAAGTGTAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTg > 1:390214/1‑149 (MQ=255) tCGACAGCGCCCAGGCGCGGATCGACGCGTTGCCCAGGTGGCCGGTCTGCCCGACGAGGTTCCAGCTCCAGTCCAGTGCCTGATGGCGGCCGAACAGCCGCGTGCCGAAAGTGTAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTg < 8:332698/149‑1 (MQ=255) | CTTCGCCATAGACACCATTGCGTGGGTAAAGCGGGTCGAAGGTGCCGACTTTTCCGTCGCCCAGGTCACTGTCGCCGCTTGCGGCATCGATGCGCATGGCCAGGCGCGGTTGCCAGGGGTGGGTGAAGGTGAAGCCGCTGTCGCTCGACAGCGCCCAGGCGCGGATCGACGCGTTGCCCAGGTGGCCGGTCTGCCCGACGAGGTTCCAGCTCCAGTCCAGTGCCTGATGGCGGCCGAACAGCCGCGTGCCGAAAGTGTAGCGCTGCTCGTCACCCGACTCGCCGGCCAGGGTG > NC_002947/3787575‑3787867 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |