Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,029,411 | 0 | G | T | 25.4% | 105.2 / 39.3 | 59 | G384V (GGG→GTG) | wbpM | polysaccharide biosynthesis protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (21/23); new base T (5/10); total (26/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.81e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.26e-02 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
CCGAGCTTTGCCGCCAGATCATAGGGCTTGGGCCAACGACATTGCTGCTGTTCGACCACAGCGAGTACAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGGGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAGCACAACATGGCGGAGGGTATACTCAACAATGTGTTCGGCACGCTTTG > NC_002947/2029264‑2029558 | ccGAGCTTTGCCGCCAGATCATAGGGCTTGGGCCAACGACATTGCTGCTGTTCGACCACAGCGAGTACAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTgggg > 5:44167/1‑149 (MQ=255) aGCTTTGCCGCCAGATCATAGGGCTTGGGCCAACGACATTGCTGCTGTTCGACCACAGCGAGTACAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCg < 2:10180/149‑1 (MQ=255) ccgccAGATCATAGGGCTTGGGCCAACGACTTTGCTGCTGTTCGACCACAGCGAGTACAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCCACTGCTGCCCATTCTGGGGTCGGTACGc < 1:207908/148‑1 (MQ=255) ccgccAGATCATAGGGCTTGGGCCAACGACATTGCTGCTGTTCGACCACAGCGAGTACAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGC‑a < 1:352024/149‑1 (MQ=255) aGATCATAGGGCTTGGGCCAACGACATTGCTGCTGTTCGACCACAGCGAGTACAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGC‑AATcag < 5:120577/149‑1 (MQ=255) aGATCATAGGGCTTGGGCCAACGACATTGCTGCTGTTCGACCACAGCGAGTACAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGGGTCGGTACGC‑AATcag > 2:294147/1‑149 (MQ=255) aTCATAGGGCTTGGGCCAACGACATTGCTGCTGTTCGACCACAGCGAGTACAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGGGTCGGTACGC‑AATcagca < 6:44167/149‑1 (MQ=255) aTCATAGGGCTTGGGCCAACGACATTGCTGCTGTTCGACCACAGCGAGTACAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGGGTCGGTACGC‑AATcagca < 2:169338/149‑1 (MQ=255) cATAGGGCTTGGGCCAACGACATTGCTGCTGTTCGACCACAGCGAGTACAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGGGTCGGTACGC‑AATcagcag > 1:371001/1‑148 (MQ=255) aTAGGGCTTGGGCCAACGACATTGCTGCTGTTCGACCACAGCGAGTACAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGC‑AATCAgcagca > 1:358958/1‑149 (MQ=255) aGGGCTTGGGCCAACGACATTGCTGCTGTTCGACCACAGCGAGTACAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTggg > 8:289181/1‑126 (MQ=255) aGGGCTTGGGCCAACGACATTGCTGCTGTTCGACCACAGCGAGTACAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTggg < 7:289181/126‑1 (MQ=255) ggCTTGGGCCAACGACATTGCTGCTGTTCGACCACAGCGAGTACAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGGGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCtt < 3:113534/149‑1 (MQ=255) ccAACGACATTGCTGCTGTTCGACCACAGCGAGTACAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGGGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGt < 2:371001/149‑1 (MQ=255) aCGACATTGCTGCTGTTCGACCACAGCGAGTACAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCACCGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGGGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTAt < 5:101487/149‑1 (MQ=255) gctgTTCGACCACAGCGAGTACAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGGGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGc > 1:79001/1‑149 (MQ=255) cGACCACAGCGAGTACAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGGGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTa < 5:180792/148‑1 (MQ=255) aCCACAGCGAGTACAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGAGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGGGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGc > 7:138312/1‑148 (MQ=255) ccACAGCGAGTACAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGACGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCa < 4:184082/149‑1 (MQ=255) cacaGCGAGTACAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCAc > 5:93609/1‑149 (MQ=255) caGCGAGTACAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTCCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGGGTCTGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATg < 1:118914/127‑1 (MQ=255) aGCGAGTACAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGGGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGt > 8:43963/1‑149 (MQ=255) gCGAGTACAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGGGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTc > 4:123840/1‑149 (MQ=255) gAGTACAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGGGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTa < 7:43963/149‑1 (MQ=255) cAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGGGTCGGTACGc > 7:120338/1‑91 (MQ=255) cAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGGGTCGGTACGc < 8:120338/91‑1 (MQ=255) cAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGGGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCAcg > 7:167963/1‑149 (MQ=255) aaCCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGGGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTg < 2:284006/106‑1 (MQ=255) aaCCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGGGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTg > 1:284006/1‑106 (MQ=255) ctctACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGGGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACgcggc > 4:352943/1‑149 (MQ=255) ctctACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGGGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACgcggc > 4:253012/1‑149 (MQ=255) tACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGGGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACgcggcg < 3:253012/147‑1 (MQ=255) cGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGGGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCtt < 8:167963/149‑1 (MQ=255) cTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGGGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACt < 8:14126/108‑1 (MQ=255) cTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGGGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACt > 7:14126/1‑108 (MQ=255) cTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGGGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACa > 6:190173/1‑149 (MQ=255) gTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGGGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACAtgtg < 5:190173/149‑1 (MQ=255) aGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGccc < 6:93609/149‑1 (MQ=255) aGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGGGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCACACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGtt > 5:124469/1‑149 (MQ=255) gcgTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAGcac < 5:70669/149‑1 (MQ=255) gcgTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGGGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAGcac < 7:44821/149‑1 (MQ=255) gTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAGCacaa > 2:43556/1‑149 (MQ=255) gcgcgcGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAGCacaaca < 1:43556/148‑1 (MQ=255) gcgcgAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGGGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGa < 5:295661/138‑1 (MQ=255) gcgcgAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGGGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGa > 6:295661/1‑138 (MQ=255) gAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGGGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAGc > 3:349553/1‑136 (MQ=255) gAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGGGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAGc < 4:349553/136‑1 (MQ=255) gTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAGCACAACATGGCGGAgg < 5:24372/149‑1 (MQ=255) ccGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGa > 2:370882/1‑125 (MQ=255) ccGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGTGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGa < 1:370882/125‑1 (MQ=255) tGCGACTGCTGCCCATTCTGGGGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAGCACAACATGGCGGAGGGTATACTcaac < 2:79001/149‑1 (MQ=255) tgctgcCCATTCTGGTGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAGCACAACATGGCGGAGGGTATACTCAACAAtgtg > 5:84498/1‑149 (MQ=255) tgctgcCCATTCTGGGGTCGGTACGCGAATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCAACGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAGCACAACATGGCGGAGGGTATACTCAACAAtgt > 1:4735/1‑149 (MQ=255) gctgcCCATTCTGGGGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAGCACAACATGGCGGAGGGTATACTCAACAATgtgt > 4:179233/1‑149 (MQ=255) ctgcCCATTCTGGTGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAGCACAACATGGCGGTGGGTATACTCAACAATGTGtt < 2:358958/149‑1 (MQ=255) gcCCATTCTGGGGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAGCACAACATGGCGGAgg < 2:280161/128‑1 (MQ=255) gcCCATTCTGGGGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAGCACAACATGGCGGAgg > 1:280161/1‑128 (MQ=255) gcCCATTCTGGGGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAGCACAACATGGCGGAGGGTATACTCAACAATGTGTTCg > 7:52355/1‑149 (MQ=255) cccATTCTGGGGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAGCACAACATGGCGGAGGGTATACTCAACAATGTGTTCg < 2:4735/148‑1 (MQ=255) cccATTCTGGGGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAGCACAACATGGCGGAGGGTATACTCAACAATGTGTTCg < 3:123840/148‑1 (MQ=255) cccATTCTGGGGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAGCACAACATGGCGGAGGGTATACTCAACAATGTGTTCg < 3:352943/148‑1 (MQ=255) tGGGGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAGCACAACATGGCGGAGGGTATACTCAACAATGTGTTCGGCACGCtt > 4:185015/1‑149 (MQ=255) ggggTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAGCACAACATGGCGGAGGGTATACTCAACAATGTGTTCGGCACGCttt > 8:70303/1‑149 (MQ=255) gggTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCAAGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAGCACAACATGGCGGAGGGTATACTCAACAATGTGTTCGGCACGCTTTg > 2:123080/1‑149 (MQ=255) | CCGAGCTTTGCCGCCAGATCATAGGGCTTGGGCCAACGACATTGCTGCTGTTCGACCACAGCGAGTACAACCTCTACGCTATCCTCAGTGAGCTGGAGCAACGCGTTGCGCGCGAGTCGCTGCCGGTGCGACTGCTGCCCATTCTGGGGTCGGTACGC‑AATCAGCAGCATCTTGCCCACGTTATGTCCACTTGGCGGGTAGCCACCGTCTACCACGCGGCGGCTTACAAACATGTGCCCATGGTTGAGCACAACATGGCGGAGGGTATACTCAACAATGTGTTCGGCACGCTTTG > NC_002947/2029264‑2029558 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |