| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,013,885 | T→C | intergenic (+90/+20) | xpt → / ← PP_5266 | xanthine phosphoribosyltransferase/acetyl‑CoA hydrolase family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,013,885 | 0 | T | C | 98.3% | 191.5 / NA | 59 | intergenic (+90/+20) | xpt/PP_5266 | xanthine phosphoribosyltransferase/acetyl‑CoA hydrolase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (26/32); minor base A (0/1); total (26/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGT‑GCCTGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCA > NC_002947/6013740‑6014025 | aaTCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTACATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTGCAGAACACGTCTCGAACGCTGTGCCGGACCTTTAGGAGCGGGCGT‑GCCCGc > 6:352182/1‑148 (MQ=38) cGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGCGTTCGAGACCTGTGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGT‑GCCCGCGaa < 4:286704/148‑1 (MQ=21) gCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCg > 7:238859/1‑149 (MQ=255) gCCCGGGTGAAGGCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCCAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGGCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCg < 1:331026/149‑1 (MQ=255) gAAGTCGGTGCAAGGTGGTGTGGGCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACCGGGGCAGCACAGGTCTCGACCGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCtt < 4:125874/149‑1 (MQ=37) tGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTgg < 8:238859/149‑1 (MQ=255) gAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGG‑GCCCGCGAAAGGCCGCAACCCGTTTATCTGGtt > 3:123864/1‑149 (MQ=255) gAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACCCCCCCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCAGTGGCGTACCAGTGGGAGCGGGCGT‑GCCCGCGAAAGGCCGCAACCCTGTTAAGTGGtt > 1:302608/1‑149 (MQ=37) aGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTgc < 3:43965/149‑1 (MQ=255) ggtggtGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTgcc > 2:230827/1‑149 (MQ=255) gtggggtCAGCTTCATCGAATAACCGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCAGAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGGGGGAGCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCa < 2:284608/149‑1 (MQ=38) aGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGtt < 1:6913/134‑1 (MQ=255) tCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCCCAACCACAACTGCAGCACACGTGACGAAACCGGGGCCCTAACAGTGGGAGCGGGCGG‑GCCCGCGCAAGGCCGCACACCGTTTATAATGTTGCCGCCAGCCCCGCccaaaac > 6:311464/1‑148 (MQ=255) tccattCCCGGGCACGCCCGCTCCCACAGTTACGGAACTGCGTGCGATACCTGTGCTGCACCTGTGGGAGGGGGCGTCGCCCGCTAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCcaacaac < 1:97773/128‑1 (MQ=9) cTGCTTCGCGGGCACGCCCGCT‑CCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTTTATGGTTGCCGCCCGCCCCGCCCACAACAAGCGCTGGTAAAGttctt > 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gggCACGCCCGCACCACCTGGGCCACCACCGGCCCCCAACGCTGTCCCTTACCTGGGGTAGCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGc < 2:182040/149‑1 (MQ=255) aCGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCt > 4:39474/1‑149 (MQ=255) gCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGc > 2:332811/1‑149 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCgg > 4:97858/1‑149 (MQ=255) cccACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGcc > 1:198071/1‑149 (MQ=255) ccACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGttct < 7:239484/126‑1 (MQ=255) ccACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGttct > 8:239484/1‑126 (MQ=255) ccACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGccc > 4:68751/1‑149 (MQ=255) ccACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGccc > 1:42647/1‑149 (MQ=255) ccACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGccc > 1:90605/1‑149 (MQ=255) ccACAGGTACGGCACAGCGTTCGAGACCTGTGCTGCACCTGTGGGAGCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCATCAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCTCCTGccg > 7:306653/1‑148 (MQ=18) acaGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGcccc > 1:4826/1‑148 (MQ=255) caGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCaa < 3:39474/149‑1 (MQ=255) aGGTGCAGCACAGGTCTCGAAGGGTGTGCCGTACCGGTGGGAGCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAAc < 2:302608/149‑1 (MQ=255) aGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAAc > 2:271259/1‑149 (MQ=255) cagcaCAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCa < 3:97858/148‑1 (MQ=255) acaGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGc > 5:8661/1‑149 (MQ=255) aGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGccc > 7:125622/1‑149 (MQ=255) tcGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCt > 8:187387/1‑125 (MQ=255) tcGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCt < 7:187387/125‑1 (MQ=255) gAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAg > 1:321748/1‑145 (MQ=255) gAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAg < 2:321748/145‑1 (MQ=255) gCTGTGCCGTACCTGGGGGAGCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCttt < 5:35041/149‑1 (MQ=255) tgCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATa < 4:123864/149‑1 (MQ=255) ctgcaCCTGTGGGAGCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATAc < 5:298274/144‑1 (MQ=255) ccGTACCTGTGGGAGCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATAcc > 6:291016/1‑149 (MQ=255) ccGTACCTGTGGGAGCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATAc < 8:125622/148‑1 (MQ=255) cggtgGGAGCGGGCGG‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGGTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACACGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCg < 3:152629/147‑1 (MQ=255) cTGTGGGAGCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCg > 3:334994/1‑149 (MQ=255) tgtgGGAGCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCgg > 5:25540/1‑149 (MQ=255) gAGCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCg < 2:198071/149‑1 (MQ=255) gAGCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCg < 1:332811/149‑1 (MQ=255) gCGGGCGT‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGt > 8:177928/1‑149 (MQ=255) ggCGT‑GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCa < 2:4826/149‑1 (MQ=255) | AATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGT‑GCCTGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCA > NC_002947/6013740‑6014025 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |