| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 713,088 | Δ1 bp | 8.5% | coding (77/531 nt) | lspA → | lipoprotein signal peptidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 713,088 | 0 | T | . | 8.5% | 209.6 / 14.5 | 71 | coding (77/531 nt) | lspA | lipoprotein signal peptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (27/36); new base . (3/3); total (30/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.90e-01 | |||||||||||
GCGCCGACGTCGGCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGG > NC_002947/712940‑713236 | gcgcCGACGTCGGCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑Gctggt > 4:57317/1‑149 (MQ=255) cgcCGACGTCGGCAGCCATCCGGAGCACCCGGATATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑Gctggtc < 8:90374/149‑1 (MQ=255) gcCGACGTCGGCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑Gctggtcc < 4:63658/149‑1 (MQ=255) ccGACGTCGGCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑Gctggtcct > 4:279643/1‑149 (MQ=255) cGACGTCGGCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑Gctggtcctg < 4:290825/149‑1 (MQ=255) cGTCGGCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑Gctggtcctggtc < 5:72220/149‑1 (MQ=255) ggCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑Gctgggcctggtcgat > 8:14206/1‑145 (MQ=255) ggCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATc < 2:378152/148‑1 (MQ=255) tCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑cc > 6:292270/1‑149 (MQ=255) cGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGGCCTGGTCGATGACCAggacca < 7:14206/149‑5 (MQ=255) cGGAGCACCCGGAAATCTGCAGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCGATGACCAggacca < 2:77053/149‑5 (MQ=255) aGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCaa < 2:135661/149‑1 (MQ=255) gCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAg < 5:292270/149‑1 (MQ=255) gCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAg < 3:141240/149‑1 (MQ=255) cccGGAAATCTGGCGCCGTTGCGTCGACTACCTGTCCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTg < 6:168349/149‑1 (MQ=255) cccGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGTTGTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTg < 1:328761/149‑1 (MQ=255) ccGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑Gctggtcctg > 1:171406/1‑124 (MQ=255) ccGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑Gctggtcctg < 2:171406/124‑1 (MQ=255) ccGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑Gctggtc > 6:183824/1‑121 (MQ=255) ccGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑Gctggtc < 5:183824/121‑1 (MQ=255) ccGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GGTGG‑CCTGGTCGATGACCAGGACCAGCAAGCtca < 1:64005/149‑3 (MQ=38) ccGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTg > 7:83455/1‑148 (MQ=255) ccGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTg > 2:41708/1‑148 (MQ=255) ggAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTAc > 2:253426/1‑149 (MQ=255) ggAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTAc < 5:113764/149‑1 (MQ=255) gCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTcaacaa > 1:77600/1‑149 (MQ=255) ggCCGTTGCGTCGACAACCTGTCCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACg < 8:382797/149‑1 (MQ=255) ccGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGcc < 1:253426/149‑1 (MQ=255) gTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCGATGACCAggac < 3:408267/118‑3 (MQ=255) gTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCGATGACCAggac > 4:408267/1‑116 (MQ=255) gTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCa > 3:22746/1‑149 (MQ=255) tCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCAt > 3:30817/1‑149 (MQ=255) gACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACAATg > 6:126312/1‑148 (MQ=255) aaCCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTAc > 3:41312/1‑148 (MQ=255) aaCCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTAc > 2:134218/1‑148 (MQ=255) aaCCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTAc > 7:327281/1‑148 (MQ=255) ccTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACcag > 2:176876/1‑149 (MQ=255) cTGACCGGCTCGGGTGCTGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACcagc < 7:305319/149‑1 (MQ=255) cTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGAcc > 2:235180/1‑139 (MQ=255) cTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGAcc < 1:235180/139‑1 (MQ=255) cTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACcagc < 1:134218/149‑1 (MQ=255) ccGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGAt < 3:57317/149‑1 (MQ=255) ggCTCGGGTGAGGTGCGCCACTTTGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAg > 7:260589/1‑109 (MQ=255) ggCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAg < 8:260589/109‑1 (MQ=255) cTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTg < 6:382469/149‑1 (MQ=255) cTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTg > 2:260429/1‑149 (MQ=255) tCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTgg < 1:176876/149‑1 (MQ=255) cGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGt < 4:30817/149‑1 (MQ=255) aGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTc < 2:77600/148‑1 (MQ=255) aGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTc < 8:327281/148‑1 (MQ=255) aCTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GGTGG‑CCTGGTCGATGACCAGGACCAGCAAGCtca < 5:170681/94‑3 (MQ=18) aCTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GGTGG‑CCTGGTCGATGACCAGGACCAGCAAGCtca > 6:170681/1‑92 (MQ=18) tAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCt > 3:20459/1‑133 (MQ=255) tAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCt < 4:20459/133‑1 (MQ=255) aaCCATGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGAc > 3:62200/1‑149 (MQ=255) aCCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGAcc > 3:42268/1‑149 (MQ=255) aCCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGAcc < 1:41708/149‑1 (MQ=255) aCCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGAcc > 4:20939/1‑149 (MQ=255) ccTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCAt > 6:8511/1‑62 (MQ=255) ccTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCAt < 5:8511/62‑1 (MQ=255) cTGCAGGGGGGCGCTTCGGGCGCCGTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTg < 4:62200/149‑1 (MQ=255) cTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCTTGACTACTTCAGCTGGACCCTg < 7:62464/149‑1 (MQ=255) cTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTg > 8:91933/1‑149 (MQ=255) cAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCt < 3:279643/149‑1 (MQ=255) gggCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACtt > 4:380822/1‑77 (MQ=255) gggCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACtt < 3:380822/77‑1 (MQ=255) gggCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTacaa < 7:91933/149‑1 (MQ=255) cgcTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAacac < 3:20939/149‑1 (MQ=255) gcTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACAcc < 8:83455/149‑1 (MQ=255) ttCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGGTTACAACACCg > 1:256806/1‑149 (MQ=255) cGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGt < 5:126312/148‑1 (MQ=255) ggCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGcc < 2:256806/149‑1 (MQ=255) gcgcCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCcg > 3:125681/1‑149 (MQ=255) gCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTc < 4:22746/147‑1 (MQ=255) gctgAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGcc > 4:318918/1‑130 (MQ=255) gctgAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGcc < 3:318918/130‑1 (MQ=255) gcggAGCTC‑GCTGGGCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAAGAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCt < 6:126696/145‑1 (MQ=255) ctgAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGAc < 2:345108/62‑1 (MQ=255) caGCTT‑GGTGG‑CCTGGTCGATGACCAGGACCAGCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACg > 4:167003/2‑149 (MQ=38) aGCTT‑GGTGG‑CCTGGTCGATGACCAGGACCAGCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGtt < 5:15327/131‑1 (MQ=37) aGCTT‑GGTGG‑CCTGGTCGATGACCAGGACCAGCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGtt > 6:15327/1‑131 (MQ=37) gCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTAACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGATGACGGAGCgg > 8:182962/1‑149 (MQ=255) ctggtcctggtcATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCgg < 6:398677/148‑1 (MQ=255) tggtcctggtcATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGt > 6:11166/1‑149 (MQ=255) tcctggtcATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTgg < 4:41312/149‑1 (MQ=255) | GCGCCGACGTCGGCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTT‑GCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGG > NC_002947/712940‑713236 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |