| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 239,163 | Δ1 bp | 6.2% | coding (244/768 nt) | hemD → | uroporphyrinogen‑III synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 239,163 | 0 | C | . | 6.2% | 259.8 / 9.9 | 80 | coding (244/768 nt) | hemD | uroporphyrinogen‑III synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (38/37); new base . (2/3); total (40/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.53e-01 | |||||||||||
GCCCCTGCTGGAGATTGAACCCATTACCGTGCAAGCCCCACAGCGGCTGTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAA‑GGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGCTGGCACTGCCGGCCCTGCGCCAGGCACTTACCGAGCCGGCAC > NC_002947/239015‑239310 | gccCCTGCTGGAGATTGAACCCATTACCGTGCAAGCCCCACAGCGGCTGTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTc > 6:172643/1‑149 (MQ=255) ccccTGCTGGAGATTGAACCCATTACCGTGCAAGCCCCACAGCGGCTGTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAACCTcc < 5:240873/149‑1 (MQ=255) ctgctgGAGATTGAACCCATTACCGTGCAAGCCCCACAGCGGCTGTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCa < 7:14806/149‑1 (MQ=255) ctgGAGATTGAACCCATTACCGTGCAAGCCCCACAGCGGCTGTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGc > 2:328297/1‑148 (MQ=255) agaTTGAACCCATTACCGTGCAAGCCCCACAGCGGCTGTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGc > 2:330140/1‑149 (MQ=255) aaCCCATTACCGTGCAAGCCCCACAGCGGCTGTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGtt > 8:195074/1‑148 (MQ=255) aaCCCATTACCGTGCAAGCCCCACAGCGGCTGTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTc < 5:211080/149‑1 (MQ=255) aaCCCATTACCGTGCAAGCCCCACAGCGGCTGTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCT‑CGCTGCGGAGGCTggat < 4:270477/148‑3 (MQ=255) ccATTACCGTGCAAGCCCCACACAGGCTGTCGCTTGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGCCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCAcc < 5:321237/149‑1 (MQ=255) ccGTGCAAGCCCCACAGCGGCTGTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTgg > 5:29474/1‑137 (MQ=255) ccGTGCAAGCCCCACAGCGGCTGTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTgg < 6:29474/137‑1 (MQ=255) ccGTGCAAGCCCCACAGCGGCTGTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTggg < 7:195074/148‑1 (MQ=255) ccGTGCAAGCCCCACAGCGGCTGTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGt < 7:140474/149‑1 (MQ=255) cGTGCAAGCCCCACAGCGGCTGTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTg < 6:408786/149‑1 (MQ=255) gTGCAAGCCCCACAGCGGCTGTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGa < 6:245219/149‑1 (MQ=255) cAAGCCCCACAGCGGCTGTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAgg < 6:107447/148‑1 (MQ=255) aaGCCCCACAGCGGCTGTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGc > 4:350131/1‑148 (MQ=255) acaGCGGCTGTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTg > 2:94356/1‑149 (MQ=255) caGCGGCTGTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTgg < 5:172643/149‑1 (MQ=255) aGCGGCTGTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGgt > 8:159184/1‑149 (MQ=255) gTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGtgctg > 2:408037/1‑148 (MQ=255) gCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGtgct < 3:15176/144‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGtgct > 4:15176/1‑144 (MQ=255) cTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGc < 4:296057/134‑1 (MQ=255) cTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGc > 3:296057/1‑134 (MQ=255) tGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGt > 2:56852/1‑149 (MQ=255) aGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGTCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTg < 3:149342/149‑1 (MQ=255) ggCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTgg < 3:350131/149‑1 (MQ=255) cTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGc < 7:245697/149‑1 (MQ=255) ttGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCt > 3:334219/1‑149 (MQ=255) cATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAAc > 7:233259/1‑119 (MQ=255) cATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAAc < 8:233259/119‑1 (MQ=255) aTGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAgg < 6:194303/135‑1 (MQ=255) aTGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAgg > 5:194303/1‑135 (MQ=255) aTGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAA‑g > 8:265979/1‑149 (MQ=255) gACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAA‑GGt > 4:158487/1‑149 (MQ=255) aCTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAA‑GGtt < 1:330140/149‑1 (MQ=255) cTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAA‑GGttt < 1:408037/149‑1 (MQ=255) ttCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCT‑CGCTGCGGAGGCTgga < 3:328791/94‑2 (MQ=255) ttCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCT‑CGCTGCGGAGGCTgga > 4:328791/1‑93 (MQ=255) ccAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAA‑GGTTTg < 4:267898/147‑1 (MQ=255) ccAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAA‑GGTTTg > 3:267898/1‑147 (MQ=255) gCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAA‑GGTTTGCTTTcc > 1:384317/1‑149 (MQ=255) ttGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAA‑GGTTTGCTTTCCGCCGCGt > 6:306740/1‑149 (MQ=255) ttGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGGGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAA‑GGTTTGCTTTCCGCCGCGt > 7:91162/1‑149 (MQ=255) tgGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGc < 6:55967/74‑1 (MQ=255) tgGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGc > 5:55967/1‑74 (MQ=255) ggTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAA‑GGTTTGCTTTc < 7:302898/137‑1 (MQ=255) ggTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAA‑GGTTTGCTTTc > 8:302898/1‑137 (MQ=255) tCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAA‑GGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGAt < 2:384317/149‑1 (MQ=255) aGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAA‑GGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGa > 8:52400/1‑149 (MQ=255) aGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAA‑GGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGa < 3:158487/149‑1 (MQ=255) gCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAgg < 8:161491/108‑1 (MQ=255) gCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAgg > 7:161491/1‑108 (MQ=255) cAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAA‑GGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGa > 2:21306/1‑147 (MQ=255) cAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAA‑GGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACa < 1:94356/149‑1 (MQ=255) aaGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAA‑GGTTTGCTTTccgcc < 1:123037/134‑1 (MQ=255) aaGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAA‑GGTTTGCTTTccgcc > 2:123037/1‑134 (MQ=255) ggccgCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGtgtg > 1:345835/1‑94 (MQ=255) ggccgCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGtgtg < 2:345835/94‑1 (MQ=255) cccGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAA‑GGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTg > 7:222602/1‑149 (MQ=255) cGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAA‑GGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGCt < 7:265979/149‑1 (MQ=255) ggCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAA‑GGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGCTg < 7:52400/149‑1 (MQ=255) ggCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAA‑GGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGCTg < 8:222602/149‑1 (MQ=255) ttGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAA‑GGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGCTGGCACt > 3:352659/1‑149 (MQ=255) tGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAA‑GGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGCTGGCACTGCCgg > 3:394893/1‑149 (MQ=255) ggCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAA‑GGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGCTGGCACTGCCGGCCCTgcgc > 2:362389/1‑148 (MQ=255) cGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAA‑GGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGCTGGCACTGCCGGCCCTGCGCCAgg > 5:336272/1‑149 (MQ=255) cGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAA‑GGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGCTGGCACTGCCGGCCCTGCGCCAgg > 5:266824/1‑149 (MQ=255) gagaCCCGCATCCCGCCTCCCCAGC‑CAGGCGGGTTCACCGGGGGTTAGGCAACCGCTGGGGTGCTGCAGGGGGCTGGGCTTAATCGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGCTGGCACTGCCGGCCCTGCGCCAgg < 1:328297/149‑1 (MQ=255) aCCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAA‑GGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGCTGGCACTGCCGGCCCTGCGCCAGGCACt > 5:357099/1‑149 (MQ=255) cAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAA‑GGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGCTGGCACTGCCGGCCCTGCGCCAGGCa > 2:334987/1‑145 (MQ=255) cAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAA‑GGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGCTGGCACTGCCGGCCCTGCGCCAGGCa < 1:334987/145‑1 (MQ=255) aGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAA‑GGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGCTGGCACTGCCGGCCCTGCGCCAGGCACTTAc < 7:159184/149‑1 (MQ=255) aGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAA‑GGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGCTGGCACTGCCGGCCCTGCGCCAGGCACTTAc < 4:352659/149‑1 (MQ=255) tCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAA‑GGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGCTGGCACTGCCGGCCCTGCGCCAGGCACTTAcc > 1:296469/1‑146 (MQ=255) tCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAA‑GGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGCTGGCACTGCCGGCCCTGCGCCAGGCACTTACCGa < 2:296469/148‑1 (MQ=255) tCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGGGCTGGGCTGAA‑GGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGCTGGCACTGCCGGCCCTGCGCCAGGCACTTACCGAg < 8:91162/149‑1 (MQ=255) ccAGCCT‑CGCTGCGGAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAgg < 6:31551/59‑1 (MQ=25) ccAGCCT‑CGCTGCGGAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAgg > 5:31551/1‑59 (MQ=25) gCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAA‑GGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGCTGGCACTGCCGGCCCTGCGCCAGGCACTTACCGAGCCgg > 5:36284/1‑149 (MQ=255) tCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAA‑GGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGCTGGCACTGCCGGCCCTGCGCCAGGCACTTACCGAGCCGGCAc > 7:187966/1‑149 (MQ=255) | GCCCCTGCTGGAGATTGAACCCATTACCGTGCAAGCCCCACAGCGGCTGTCGCTGGAAGGCTTGCATGACTTCCAGGCGATCATTGTGGTCAGCAAGCCGGCCGCCCGGCTGTTGCTTGAGCATCTGGCCGAGACCAGCATCCAGCCTCCGCAGC‑GAGGCTGGTTCACCGTGGGTGAGGCAACCGCTGGTGTGCTGCAGGGTGCTGGGCTGAA‑GGTTTGCTTTCCGCCGCGTGGCGATGACAGCGAAGCCTTGCTGGCACTGCCGGCCCTGCGCCAGGCACTTACCGAGCCGGCAC > NC_002947/239015‑239310 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |