| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,490,340 | Δ1 bp | 5.1% | coding (1337/1578 nt) | PP_2184 → | formate dehydrogenase subunit beta |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,490,340 | 0 | G | . | 5.1% | 256.9 / 6.6 | 78 | coding (1337/1578 nt) | PP_2184 | formate dehydrogenase subunit beta |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (37/37); new base . (2/2); total (39/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.42e-01 | |||||||||||
CCAGCCATTTCGACACCCCATTGGACTATGAAGCGTTTGCTGCCGTGGGCGCGATGCTCGGCCACGGCGGTGTGGTGGTGGCCGACGATACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGCGACATCACCGAGCGCCATGACCAGGCGCTGTTGCTGCGCGACCTGTGCGACACCCTGCAGTACGGTTCGCTGT > NC_002947/2490193‑2490486 | ccAGCCATTTCGACACCCCATTGGACTATGAAGCGTTTGCTGCCGTGGGCGCGATGCTCGGCCACGGCGGTGTGGTGGTGGCCGACGATACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGc < 1:251009/149‑1 (MQ=255) aTTTCGACACCCCATTGGACTATGAAGCGTTTGCTGCCGTGGGCGCGATGCTCGGCCACGGCGGTGTGGTGGTGGCCGACGATACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAg > 7:55104/1‑149 (MQ=255) aTTTCGACACCCCATTGGACTATGAAGCGTTTGCTGCCGTGGGCGCGATGCTCGGCCACGGCGGTGTGGTGGTGGCCGACGATACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAg > 6:166300/1‑149 (MQ=255) tttCGACACCCCATTGGACTATGAAGCGTTTGCTGCCGTGGGCGCGATGCTCGGCCACGGCGGTGTGGTGGTGGCCGACGATACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGt < 2:217697/149‑1 (MQ=255) cGACACCCCATTGGACTATGAAGCGGTGGCTGCCGGGGGCGCGATGCGCGGCCACGGCGGTGTGGTGGGGGCCGACGATACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCGCAGGACTCCT‑CGGCacagaa < 5:381412/148‑6 (MQ=255) acCCCATTGGACTATGAAGCGTTTGCTGCCGTGGGCGCGATGCTCGGCCACGGCGGTGTGGTGGTGGCCGACGATACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCAcccc > 3:309543/1‑149 (MQ=255) ccccATTGGACTATGAAGCGTTTGCTGCCGTGGGCGCGATGCTCGGCCACGGCGGTGTGGTGGTGGCCGACGATACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCg > 6:43622/1‑149 (MQ=255) cccATTGGACTATGAAGCGTTTGCTGCCGTGGGCGCGATGCTCGGCCACGGCGGTGTGGTGGTGGCCGACGATACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGt > 8:70026/1‑149 (MQ=255) ccATTGGACTATGAAGCGTTTGCTGCCGTGGGCGCGATGCTCGGCCACGGCGGTGTGGTGGTGGCCGACGATACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTg < 2:182946/149‑1 (MQ=255) cATTGGACTATGAAGCGTTTGCTGCCGTGGGCGCGATGCTCGGCCACGGCGGTGTGGTGGTGGCCGACGATACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGc > 8:123561/1‑149 (MQ=255) aTTGGACTATGAAGCGTTTGCTGCCGTGGGCGCGATGCTCGGCCACGGCGGTGTGGTGGTGGCCGACGATACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGcc < 2:48486/149‑1 (MQ=255) aTTGGACTATGAAGCGTTTGCTGCCGTGGGCGCGATGCTCGGCCACGGCGGTGTGGTGGTGGCCGACGATACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGcc < 5:43622/149‑1 (MQ=255) tATGAAGCGTTTGCTGCCGTGGGCGCGATGCTCGGCCACGGCGGTGTGGTGGTGGCCGACGATACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCGCAGGACTCCT‑CGGCacaga < 6:146930/131‑5 (MQ=255) tATGAAGCGTTTGCTGCCGTGGGCGCGATGCTCGGCCACGGCGGTGTGGTGGTGGCCGACGATACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCGCAGGACTCCT‑CGGCacaga > 5:146930/1‑127 (MQ=255) tGAAGCGTTTGCTGCCGTGGGCGCGATGCTCGGCCACGGCGGTGTGGAGGTGGCCGACGATACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGtt > 1:91657/1‑149 (MQ=255) gAAGCGTTTGCTGCCGTGGGCGCGATGCTCGGCCACGGCGGTGTGGTGGTGGCCGACGATACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTGTCGGTTc > 6:120795/1‑149 (MQ=255) gaGCGTTTGCTGCCCTGGGCGCGATGCACGGCCACGGCGGGGTGGTGGTGGCCGCCGAAACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGGTTCGCCCGGGAGTTCTTTGGCG‑AGGGGTGCAGCGGCAAGTTCACCCCCTGCCGTATCGGttgc > 8:145987/2‑147 (MQ=255) gctgcCGTGGGCGCGATGCTCGGCCACGGCGGTGTGGTGGTGGCCGACGATACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCgggg > 5:225435/1‑149 (MQ=255) gctgcCGTGGGCGCGATGCTCGGCCACGGCGGTGTGGTGGTGGCCGACGATACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCggg < 7:123561/148‑1 (MQ=255) ccGTGGGCGCGATGCTCGGCCACGGCGGTGTGGTGGTGGCCGACGATACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTTTCGGTTCCACCCGGGGCATg < 5:120795/149‑1 (MQ=255) gcgcGATGCTCGGCCACGGCGGTGTGGTGGTGGCCGACGATACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTg < 4:309543/149‑1 (MQ=255) cgcgATGCTCGGCCACGGCGGTGTGGTGGTGGCCGACGATACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTgg < 2:91657/149‑1 (MQ=255) cgATGCTCGGCCACGGCGGTGTGGTGGTGGCCGACGATACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTc < 5:417295/149‑1 (MQ=255) gATGCTCGGCCACGGCGGTGTGGTGGTGGCCGACGATACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCg < 5:376965/149‑1 (MQ=255) tCGGCCACGGCGGTGTGGTGGTGGCCGACGATACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGcc > 1:157855/1‑111 (MQ=255) tCGGCCACGGCGGTGTGGTGGTGGCCGACGATACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGcc < 2:157855/111‑1 (MQ=255) tCGGCCACGGCGGTGTGGTGGTGGCCGACGATACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCgg > 1:175652/1‑149 (MQ=255) tCGGCCACGGCGGTGTGGTGGTGGCCGACGATACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCgg > 3:215421/1‑149 (MQ=255) cACGGCGGTGTGGTGGTGGCCGACGATACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGCGGCATGGAAGTGGTCGACAGGCTGAt > 6:128720/1‑149 (MQ=255) ggcggTGTGGTGGTGGCCGACGATACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGc > 2:37103/1‑149 (MQ=255) cggTGTGGTGGTGGCCGACGATACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCca < 4:215421/149‑1 (MQ=255) tggtggtggCCGACGATACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGc < 6:291944/135‑1 (MQ=255) tggtggtggCCGACGATACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGc > 5:291944/1‑135 (MQ=255) tggtggtggCCGACGATACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCagcagc < 1:37103/149‑1 (MQ=255) tggtggtggCCGACGATACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCagcagc < 8:243659/149‑1 (MQ=255) gtggtggCCGACGATACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGCGa > 2:173954/1‑149 (MQ=255) ggtggCCGACGATACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGCGACa > 7:289511/1‑149 (MQ=255) ccGACGATACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTTCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGCGACATCAcc < 5:128720/149‑1 (MQ=255) gacgaTACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGCGACATCAcc > 2:224375/1‑147 (MQ=255) gTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCgg < 3:73715/84‑1 (MQ=255) gTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCgg > 4:73715/1‑84 (MQ=255) gTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGCGACATCACCGAGCGCCAt > 5:406411/1‑148 (MQ=255) ttGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGCGACATCACCGAGCGCCATGa < 7:145987/149‑1 (MQ=255) gAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGCGACATCACCGAGCGCCATGAc < 3:3133/148‑1 (MQ=255) aaCATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGCGACATCACCGAGCGCCATGAc > 7:304966/1‑147 (MQ=255) aCATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGCGACATCACCGAGCGCCATGACCAg < 2:175652/149‑1 (MQ=255) aTGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATgg > 2:252525/1‑94 (MQ=255) aTGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATgg < 1:252525/94‑1 (MQ=255) ggCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGCGACATCACCGAGCGCCATGACCAGgcgc > 8:302288/1‑149 (MQ=255) gCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGCGACATCACCGAGCGCCATGACCAGGCGCt < 3:144585/149‑1 (MQ=255) cAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGCGa > 6:92579/1‑120 (MQ=255) cAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGCGa < 5:92579/120‑1 (MQ=255) cAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGCGACATCACCGAGCGCCATGACCAGGCGCTGt > 2:382174/1‑149 (MQ=255) aGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGCGACATCACCGAGCGACATGACCAGGCGCTGtt > 6:380739/1‑149 (MQ=255) tGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGCGACATCACCGAGCGCCATGACCAGGCGCTGTtgctg < 5:166300/149‑1 (MQ=255) cgcgTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGCGACATCACCGAGCGCCATGACCAGGCGCTGTTGCTgcgc < 8:55104/149‑1 (MQ=255) cgcgTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGCGACATCACCGAGCGCCATGACCAGGCGCTGTTGCTgcgc < 8:289511/149‑1 (MQ=255) tttCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGGGACATCACCGAGCGCCATGACCAGgcgc < 1:228931/134‑1 (MQ=255) tttCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGCGACATCACCGAGCGCCATGACCAGgcgc > 2:228931/1‑134 (MQ=255) cGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGCGACATCACCGAGCGCCATGACCAGGCGCTGTTGCTGCGCGACCtgt > 8:253707/1‑149 (MQ=255) cccTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGCGACATCACCGAGCGCCATGACCAGGCGCTGTTGCTGCGCGACCTGTGc < 1:173954/149‑1 (MQ=255) cccTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGCGACATCACCGAGCGCCATGACCAGGCGCTGTTGCTGCGCGACCTGTGc > 8:238279/1‑149 (MQ=255) cccTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGCGACATCACCGAGCGCCATGACCAGGCGCTGTTGCTGCGCGACCTGTGc < 1:382174/149‑1 (MQ=255) cTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGCGACATCACCGAGCGCCATGAGCAGGCGCTGTTGCTGCGCGACCTGTGCGa < 6:406411/149‑1 (MQ=255) cTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGCGACATCACCGAGCGCCATGACCAGGCGCTGTTGCTGCGCGACCTGTGCGACACCCTg < 7:238279/148‑1 (MQ=255) ttgccgcaggacTCCT‑CGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGCGACATCACCGAGCGCCATGACCAGGCGCTGTTGCTGCGCGACCTGTGCGACACCCTGCAg > 8:150495/8‑149 (MQ=255) tgCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGCGACATCACCGAGCGCCATGACCAGGCGCTGTTGCTGCGCGACCTGTGCGACACCCTGCAg > 8:8735/1‑148 (MQ=255) ccG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGCGACATCACCGAGCGCCATGACCAGGCGCTGTTGCTGCGCGACCTGTGCGACACTCTGCAGTAc < 7:70026/149‑1 (MQ=255) aggagTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGCGACATCACCGAGCGCCATGACCAGGCGCTGTTGCTGCGCGACCTGTGCGACACCCTGCAGTACGGt > 2:48035/1‑149 (MQ=255) aggagTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGCGACATCACCGAGCGCCATGACCAGGCGCTGTTGCTGCGCGACCTGTGCGACACCCTGCAGTACGGt < 8:304966/149‑1 (MQ=255) agTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGCGACATCACCGAGCGCCATGACCAGGCGCTGTTGCTGCGCGACCTGTGCGACACCCTGCAGTACGGTTCg < 6:225435/149‑1 (MQ=255) ccTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGCGACATCACCGAGCGCCATGACCAGGCGCTGTTGCTGCGCGACCTGTGCGACACCCTGCAGTACgg > 6:84277/1‑142 (MQ=255) ccTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGCGACATCACCGAGCGCCATGACCAGGCGCTGTTGCTGCGCGACCTGTGCGACACCCTGCAGTACgg < 5:84277/142‑1 (MQ=255) cTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGCGACATCACCGAGCGCCATGACCAGGCGCt > 7:123754/1‑105 (MQ=255) cTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGCGACATCACCGAGCGCCATGACCAGGCGCt < 8:123754/105‑1 (MQ=255) cTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGCGACATCACCGAGCGCCATGACCAGGCGCTGTTGCTGCGCGACCTGTGCGACACCCTGCAGTACGGTTCGCtgt > 4:151620/1‑149 (MQ=255) cTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGCGACATCACCGAGCGCCATGACCAGGCGCTGTTGCTGCGCGACCTGTGCGACACCCTGCAGTACGGTTCGCtgt > 2:251398/1‑149 (MQ=255) cTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGCGACATCACCGAGCGCCATGACCAGGCGCTGTTGCTGCGCGACCTGTGCGACACCCTGCAGTACGGTTCGCtgt > 2:24617/1‑149 (MQ=255) | CCAGCCATTTCGACACCCCATTGGACTATGAAGCGTTTGCTGCCGTGGGCGCGATGCTCGGCCACGGCGGTGTGGTGGTGGCCGACGATACGTTGAACATGGCCAGCATGGCGCGTTTCGCCCTGCAGTTCTGTGCCG‑AGGAGTCCTGCGGCAAGTGCACCCCGTGCCGTATCGGTTCCACCCGGGGCATGGAAGTGGTCGACCGGCTGATCGCCAGCAGCGACATCACCGAGCGCCATGACCAGGCGCTGTTGCTGCGCGACCTGTGCGACACCCTGCAGTACGGTTCGCTGT > NC_002947/2490193‑2490486 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |