| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,755,091 | Δ1 bp | 5.6% | coding (1417/3147 nt) | czcA‑II → | cation efflux system protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,755,091 | 0 | G | . | 5.6% | 227.5 / 6.7 | 71 | coding (1417/3147 nt) | czcA‑II | cation efflux system protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (30/37); new base . (2/2); total (32/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.20e-01 | |||||||||||
CAGCAGCGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAAGGAAGAGGAAGGCCTGGTGATGCG > NC_002947/2754947‑2755233 | ggcatgggcCAGGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAgg < 6:132353/141‑1 (MQ=255) agcagcGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAggg > 7:74623/1‑148 (MQ=255) agcagcGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGc < 7:17325/149‑1 (MQ=255) gcagcGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGc > 7:380889/1‑148 (MQ=255) cgcCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGAt < 8:74623/149‑1 (MQ=255) gcCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCTCGACCCCGGTC‑AGGGCaaagat < 8:261346/149‑5 (MQ=25) aCGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTc < 1:210056/149‑1 (MQ=255) cGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTcc < 3:115440/149‑1 (MQ=255) gCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCAccc > 5:334876/1‑148 (MQ=255) gCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCt < 4:405381/149‑1 (MQ=255) aTGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGACCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTAt > 5:263334/1‑149 (MQ=255) gCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATgg > 2:51074/1‑149 (MQ=255) gcggcgAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCAT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCATTTAc‑c > 8:256260/1‑149 (MQ=255) gcgAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTg < 7:37569/149‑1 (MQ=255) gcgAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTg < 5:182741/149‑1 (MQ=255) cgAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTgg < 7:112190/149‑1 (MQ=255) gAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCATGAc‑cacgg > 8:294488/1‑144 (MQ=255) ggTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATg < 6:334876/149‑1 (MQ=255) ttCCATGTGTTTTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGc < 8:380889/149‑1 (MQ=255) tGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCTCGACCCCGGTC‑AGGGCaaagat > 8:388499/1‑108 (MQ=18) tGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGt > 6:278363/1‑149 (MQ=255) tGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCATGAC‑CACGGTAAAGGccatag < 7:294488/149‑5 (MQ=21) tGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGCCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCTCGACCCCGGTC‑AGGGCaaagat < 7:388499/112‑5 (MQ=18) gtgtTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATGATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTgg < 6:177595/148‑1 (MQ=255) gtgtTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGT‑GTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGgc > 8:29819/1‑149 (MQ=255) tttGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGgcgc > 5:187431/1‑149 (MQ=255) gCCGCGGCCCGCGAACCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTAGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCGTTGCCCT‑GACCGGGGGCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCga < 6:204334/148‑1 (MQ=21) cGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAgg > 1:128183/1‑92 (MQ=255) cGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAgg < 2:128183/92‑1 (MQ=255) cGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCgatga > 5:205990/1‑149 (MQ=255) gCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCgatgat > 5:100592/1‑149 (MQ=255) cgcgAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTc > 5:143613/1‑149 (MQ=255) cgcgAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTc > 3:280563/1‑149 (MQ=255) gcgAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCg > 8:297785/1‑149 (MQ=255) gcgAAGCACGCCGACCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCg < 6:263334/149‑1 (MQ=255) cACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCAcg < 6:143613/149‑1 (MQ=255) aCGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCAcg < 4:280563/148‑1 (MQ=255) ccgCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTcc < 7:256260/149‑1 (MQ=255) cgCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCg < 6:100592/149‑1 (MQ=255) gCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCgg > 6:344950/1‑149 (MQ=255) tGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTcc < 7:163507/145‑1 (MQ=255) tGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTcc > 8:163507/1‑145 (MQ=255) aTCTATGGGCAGGTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAg < 6:205990/148‑1 (MQ=255) aGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCa < 7:201278/123‑1 (MQ=255) aGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCa > 8:201278/1‑123 (MQ=255) gTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGt > 3:301424/1‑149 (MQ=255) gTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGt < 7:297785/149‑1 (MQ=255) catcatGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAg > 8:356721/1‑131 (MQ=255) catcatGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAg < 7:356721/131‑1 (MQ=255) tcatGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCAcc > 8:183564/1‑149 (MQ=255) gtgtACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTACGGGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAgg > 1:122169/1‑149 (MQ=255) tgtACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTc < 4:301424/149‑1 (MQ=255) gtACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCAcgttc > 7:276708/1‑109 (MQ=255) gtACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCAcgttc < 8:276708/109‑1 (MQ=255) tACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCaa < 7:183564/149‑1 (MQ=255) aCCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAag > 8:161558/1‑149 (MQ=255) aCCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAag > 5:52937/1‑149 (MQ=255) ccTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAag > 7:320136/1‑148 (MQ=255) gCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACAGGCAAGTTCAagg > 1:22595/1‑146 (MQ=255) ccGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAaggaag < 8:320136/148‑1 (MQ=255) gATGTTTGGCCT‑GACAGTGGTCGAGGGAAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAG‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCGTTTCGGTCACGTTCGTTCCGTCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAaggaagagg < 2:22595/149‑1 (MQ=255) tcttGCCCTCGACCCCGGTC‑AGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAaggaagaggaag > 1:147228/3‑149 (MQ=255) tggccT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATTGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAaggaagaggaag < 5:87771/143‑1 (MQ=255) tGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAaggaagagga < 7:161558/144‑1 (MQ=255) tGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAaggaagag < 7:29819/142‑1 (MQ=255) tGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAAGGAAGAGGAAGGc < 5:278363/148‑1 (MQ=255) cccT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAg < 2:54324/102‑1 (MQ=255) cccT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAg > 1:54324/1‑102 (MQ=255) aCCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAAGGAAGAGGAAGGCCTGGTg < 2:122169/147‑1 (MQ=255) cGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAAGGAAGAGGAAGGCCTGGGGATGc < 5:344950/149‑1 (MQ=255) gggTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAAGGAAGAGGAAGGCCTGGTGATGCg > 7:197126/1‑148 (MQ=255) | CAGCAGCGCCACGGTCGCATGCTGACCCGCGGCGAACGGTTCCATGAGGTGTTTGCCGCTGCCCGCGAAGCACGCCGGCCGCTGATCTATGGGCAGTTGATCATCATGGTGGTGTACCTGCCGATCTTTGCCCT‑GACCGGGGTCGAGGGCAAGATGTTCCACCCTATGGCCTTTAC‑CGTGGTCATGGCCCTGTTGGGCGCGATGATCCTTTCGGTCACGTTCGTTCCGGCAGCCATTGCCCTGTTCGTCACCGGCAAGGTCAAGGAAGAGGAAGGCCTGGTGATGCG > NC_002947/2754947‑2755233 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |