| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,552,394 | Δ1 bp | 6.5% | coding (51/978 nt) | PP_3137 → | group 2 family glycosyl transferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,552,394 | 0 | C | . | 6.5% | 247.6 / 10.3 | 77 | coding (51/978 nt) | PP_3137 | group 2 family glycosyl transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (36/36); new base . (3/2); total (39/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.10e-01 | |||||||||||
GGTAGATGTGCCTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCACCGC > NC_002947/3552251‑3552537 | ggTAGATGTGCCTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTc < 4:268057/147‑1 (MQ=255)ggTAGATGTGCCTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTc > 3:268057/1‑147 (MQ=255) gTAGATGTGCCTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGa < 5:416660/148‑1 (MQ=255) gTAGATGTGCCTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑g > 8:346099/1‑149 (MQ=255) gTAGATGTGCCTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑g > 2:131325/1‑149 (MQ=255) tgtgCCTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑g > 5:418942/1‑149 (MQ=255) tgCCTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑Gcc < 6:418942/149‑1 (MQ=255) cTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTg > 1:205048/1‑149 (MQ=255) gACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGAGCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCt < 5:273562/133‑1 (MQ=255) gACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGACATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCt > 6:273562/1‑133 (MQ=255) aaTTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCg > 6:125425/1‑149 (MQ=255) tttCACTGGCAGTGGGGGTGCCTGCCATCATCAAGGCCCGTCATCCGGCCGCCGTTGCATCGGTCGAGTTAGTCCTATGGCAACTTTGATCGTGGTGGTTGTA‑ATC‑‑GGACGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑TCGCT‑GCCTTGTTTCGc < 2:208279/148‑1 (MQ=255) ttCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCt > 3:164507/1‑149 (MQ=255) ttCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCt > 2:171136/1‑149 (MQ=255) ttCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCACt > 5:320899/1‑149 (MQ=255) ttCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCAGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTc < 5:34721/129‑1 (MQ=255) ttCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGACGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCAGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTc > 6:34721/1‑129 (MQ=255) cACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTg < 5:336993/148‑1 (MQ=255) cACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATACGGCCTCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTg < 6:332275/148‑1 (MQ=255) aCTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGgc > 7:126481/1‑149 (MQ=255) tGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGGCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACgggg < 8:265310/149‑1 (MQ=255) gggggTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGG‑CAGCG‑CTCGAGGCGCT‑ggcctt < 7:229359/129‑6 (MQ=255) gggggTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGG‑CAGCG‑CTCGAGGCGCT‑ggcctt > 8:229359/1‑124 (MQ=255) gggTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCg < 2:205048/149‑1 (MQ=255) ggTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGa > 5:216038/1‑149 (MQ=255) ccGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACaaa < 6:32285/149‑1 (MQ=255) ggCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGatccag > 2:131770/1‑143 (MQ=255) catcatCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCAt > 7:19845/1‑149 (MQ=255) catcatCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCAt < 7:256275/149‑1 (MQ=255) tcatcaAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGt < 7:346099/149‑1 (MQ=255) tcatcaAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGt < 4:164507/149‑1 (MQ=255) atcaAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTAc > 6:299584/1‑149 (MQ=255) atcaAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTAc > 3:15058/1‑149 (MQ=255) gCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGa < 5:149882/130‑1 (MQ=255) gCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGa < 5:156302/130‑1 (MQ=255) gCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGa > 6:156302/1‑130 (MQ=255) gCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGa > 6:149882/1‑130 (MQ=255) ccGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGTGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTc < 6:19973/149‑1 (MQ=255) ccGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTc > 8:335825/1‑149 (MQ=255) cGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCg > 7:267672/1‑149 (MQ=255) cGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCg > 8:89900/1‑149 (MQ=255) aTCCGGCCGCCGTTTCATGGGTCGTTTGAGGCCTTTTGCAACGGTTTTTGGGGTGTAAGTACATCTAAATCATAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCgg < 1:131325/149‑1 (MQ=255) ccGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTc > 6:73503/1‑148 (MQ=255) ggCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCAc < 5:299584/149‑1 (MQ=255) ggCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCAc < 5:125425/149‑1 (MQ=255) cgccgTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGa < 3:336892/149‑1 (MQ=255) gccgTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGAt < 8:126481/149‑1 (MQ=255) ccgTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATg < 5:73503/149‑1 (MQ=255) tCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGt > 1:254918/1‑149 (MQ=255) tGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGgcc < 6:216038/149‑1 (MQ=255) tGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCACTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGATCGCTGCAGTTGgc < 6:320899/148‑1 (MQ=255) gAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGgccg > 1:125067/1‑149 (MQ=255) cTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAAc < 2:125067/149‑1 (MQ=255) cTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCAAGGGGCCGAAAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAAc > 6:86856/1‑149 (MQ=255) tATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAAcc > 8:15106/1‑149 (MQ=255) ggCAACGGTAATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACATTg > 5:36012/1‑149 (MQ=255) gCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTgg < 1:142914/149‑1 (MQ=255) ggTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACTTTGGCGTgg < 2:336540/149‑1 (MQ=255) ggTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTgg < 8:267672/149‑1 (MQ=255) tGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGAGGCGCT‑GCCTTGt > 1:91174/1‑59 (MQ=255) gtggtA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGAc < 3:271754/87‑1 (MQ=255) gtggtA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGAc > 4:271754/1‑87 (MQ=255) ggtA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTg > 7:17182/1‑148 (MQ=255) gtA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTgg < 7:18823/128‑1 (MQ=255) gtA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTgg > 8:18823/1‑128 (MQ=255) a‑aTC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACa > 8:329897/1‑149 (MQ=255) aTC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCGGTACTGGCGCTGGACAt < 2:254918/149‑1 (MQ=255) aTC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACAt < 7:329897/149‑1 (MQ=255) aTC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACAt < 4:15058/149‑1 (MQ=255) ggCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGa < 7:15106/148‑1 (MQ=255) ggCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAg > 5:13263/1‑149 (MQ=255) aaggcAGCG‑CTCGAGGCGCTGGCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGtt > 8:225278/5‑148 (MQ=255) ggCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTATGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGa < 1:398541/136‑1 (MQ=255) ggCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTATGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGa > 2:398541/1‑136 (MQ=255) cAGCGCCTCGA‑GCACT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGTCTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCAccgc > 4:175390/1‑149 (MQ=255) cAGCG‑CTCGAGGCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCAc < 2:196939/74‑1 (MQ=255) cAGCG‑CTCGAGGCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCAc > 1:196939/1‑74 (MQ=255) | GGTAGATGTGCCTGACAATTCACTGGCAGTGGGGGTGCCGGCCATCATCAAGGCCCGGCATCCGGCCGCCGTGGCATCGGTCGAGTGAGGCCTATGGCAACGGTGATCGGGGTGGTGGTA‑ATC‑‑GGCCGCAATGAAGGCCAGCGCCTCGA‑GCGCT‑GCCTTGTTTCGCTGGCGCACGGGGCCGACAAAGTCATGTACGTCGACTCGGGTTCCACCGATGGTTCGCTGCAGTTGGCCGCCAACCTTGGCGTGGCAGTACTGGCGCTGGACATGAGTATCCCGTTCACCGC > NC_002947/3552251‑3552537 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |