| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,973,885:1 | +T | 6.0% | coding (1719/2043 nt) | flgK ← | flagellar hook‑associated protein FlgK |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,973,885 | 1 | . | T | 6.0% | 273.5 / 10.2 | 67 | coding (1719/2043 nt) | flgK | flagellar hook‑associated protein FlgK |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (32/31); new base T (2/2); total (34/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.67e-01 | |||||||||||
AATGGTGGCCTGGCTGGCCTTGGCCCCTACCCGCTCGACCAGCGAGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATG > NC_002947/4973741‑4974029 | aaTGGTGGCCTGGCTGGCCTTGGCCCCTACCCGCTCGACCAGCGAGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCCAAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑tt < 1:42341/148‑1 (MQ=255)aaTGGTGGCCTGGCTGGCCTTGGCCCCTACCCGCTCGACCAGCGAGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGc > 3:403405/1‑149 (MQ=255) tggtggCCTGGCTGGCCTTGGCCCCTACCCGCTCGACCAGCGAGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCg > 3:104269/1‑149 (MQ=255) gCCTGGCTGGCCTTGGCCCCTACCCGCTCGACCAGCGAGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCgg > 5:28456/1‑148 (MQ=255) cTTGGCCCCTACCCTCTCGACCAGCGAGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACa < 4:310430/149‑1 (MQ=255) cTTGGCCCCTACCCGCTCGACCAGCGAGGCGTAGGCCTAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACa < 7:248842/149‑1 (MQ=255) ggCCCCTACCCGCTCGCCCCGCGAGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAg < 4:316616/147‑1 (MQ=255) ggCCCCTACCCGCTCGACCAGCGAGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAgg < 8:196509/148‑1 (MQ=255) gCCCCTACCCGCTCGACCAGCGAGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGt < 6:28456/149‑1 (MQ=255) cccTACCCGCTCGACCAGCGAGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTa > 4:53209/1‑148 (MQ=255) cccTACCCGCTCGACCAGCGAGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTa > 3:56090/1‑148 (MQ=255) cccTACCCGCTCGACCAGCGAGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGACCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTa > 8:108298/1‑148 (MQ=255) ccTACCCGCTCGACCAGCGAGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTa > 5:406970/1‑147 (MQ=255) cTACCGGCTCGACCCGCGAGGAGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAg < 8:310764/149‑1 (MQ=255) tACCCGCTCGACCAGCGAGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGc > 3:298273/1‑149 (MQ=255) ccGCTCGACCAGCGAGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCATGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGt > 6:348621/1‑149 (MQ=255) ccGCTCGACCAGCGAGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGt > 7:319451/1‑149 (MQ=255) gACCAGCGAGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTgg < 6:406970/149‑1 (MQ=255) gCGAGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑CGCCGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGCCAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCg > 6:263701/1‑147 (MQ=255) gCGAGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCa > 7:20725/1‑140 (MQ=255) gCGAGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCa < 8:20725/140‑1 (MQ=255) gCGAGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCa < 3:53209/149‑1 (MQ=255) aGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAg < 1:123394/131‑1 (MQ=255) aGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAg > 2:123394/1‑131 (MQ=255) ggCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCATGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCa < 5:348621/148‑1 (MQ=255) gAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGcc > 4:189922/1‑132 (MQ=255) gAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGcc < 3:189922/132‑1 (MQ=255) gAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGAt < 8:319451/149‑1 (MQ=255) gTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATtg < 4:403405/148‑1 (MQ=255) tGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATtgtg < 5:260816/149‑1 (MQ=255) tGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGACCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGTCACCGATtgt < 7:108298/148‑1 (MQ=255) tACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAggt > 5:356243/1‑107 (MQ=255) tACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCt < 6:356243/109‑1 (MQ=255) gTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATtgt < 4:73864/134‑1 (MQ=255) gTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATtgt > 3:73864/1‑134 (MQ=255) ttGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTGCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCgg < 7:127684/149‑1 (MQ=255) gTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGt > 2:268727/1‑149 (MQ=255) gTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGt > 4:193672/1‑149 (MQ=255) tGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑ATCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCgg < 2:57666/145‑1 (MQ=255) tGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCgg > 1:57666/1‑145 (MQ=255) ccACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCg > 5:379325/1‑149 (MQ=255) cACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGc > 3:236643/1‑149 (MQ=255) cACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGc > 6:251703/1‑149 (MQ=255) tCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCa > 6:368008/1‑149 (MQ=255) aCTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATc < 1:268727/149‑1 (MQ=255) aCTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATc < 3:193672/149‑1 (MQ=255) cTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGGAAAGGTACGCGGGTTACCGCTAcc > 5:371311/1‑144 (MQ=255) cTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTAcc < 6:371311/144‑1 (MQ=255) ttGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATc > 7:175526/1‑146 (MQ=255) cAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGt > 5:36172/1‑149 (MQ=255) gTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAg < 3:124401/112‑1 (MQ=255) gTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAg > 4:124401/1‑112 (MQ=255) agcagcGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCgccggc < 5:251703/149‑1 (MQ=255) gcgTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATc > 7:218778/1‑149 (MQ=255) cgTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATcc < 6:36172/149‑1 (MQ=255) gTTGGTATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATc > 2:88781/1‑147 (MQ=255) gTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATc > 8:134661/1‑147 (MQ=255) gCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTATAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCgg > 1:288555/1‑128 (MQ=255) gCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCgg < 2:288555/128‑1 (MQ=255) cATTGCTGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATc < 4:298273/149‑1 (MQ=255) aTTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCg > 4:196198/1‑149 (MQ=255) ttGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCgg < 8:175526/149‑1 (MQ=255) cGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCAc < 4:236643/149‑1 (MQ=255) ggTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACg < 1:88781/149‑1 (MQ=255) ggTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTATCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACg > 1:79969/1‑149 (MQ=255) gTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACgg < 8:218778/149‑1 (MQ=255) tCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGAt < 1:57815/149‑1 (MQ=255) ccGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATg > 7:77236/1‑149 (MQ=255) | AATGGTGGCCTGGCTGGCCTTGGCCCCTACCCGCTCGACCAGCGAGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCC‑AGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCC‑TTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATG > NC_002947/4973741‑4974029 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |