| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,186,047:1 | +C | 5.4% | coding (413/1716 nt) | aceK ← | isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,186,047 | 1 | . | C | 5.4% | 301.7 / 10.8 | 74 | coding (413/1716 nt) | aceK | isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (33/37); new base C (2/2); total (35/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.62e-01 | |||||||||||
TCGGGCAGGCATTCGCGCAGTTGTTCTTCCAGCCGCGCCAGGTCGCCTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGTCTCTGCCAACTCGTCGTCCAGGCGGGGGTCGATCAGGT > NC_002947/5185900‑5186191 | tCGGGCAGGCATTCGCGCAGTTGTTCTTCCAGCCGCGCCAGGTCGCCTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTgcgcgg‑c < 2:245245/149‑1 (MQ=255) gcaTTCGCGCAGTTGTTCTTCCAGCCGCGCCAGGTCGCCTTCAAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTcgc > 6:270386/1‑149 (MQ=255) gcaTTCGCCAACTTGTTCTTCCAGCCGCGCCAGCTCGCCTTCCAGGTCGCCATACGGCATGTCGAACGGGTAATAGGCGAACACCGCTCGAAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTAAGGCTTTCAGCGG‑CGCACTcgc > 4:95359/1‑149 (MQ=255) cgcAGTTGTTCTTCCAGCCGCGCCAGGTCGCCTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑AGCGCTCGCG‑GCcgcg > 5:424758/1‑149 (MQ=255) ttgttCTTCCAGCCGCGCCAGGTCGCCTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATg > 3:247950/1‑148 (MQ=255) ttgttCTTCCAGCCGCGCCAGGTCGCCTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATg > 2:278566/1‑148 (MQ=255) ttgttCTTCCAGCCGCGCCAGGTCGCCTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑C‑CGCGAGCGCGCCGCGCaaac < 8:384596/149‑4 (MQ=255) ttcttcCAGCCGCGCCAGGTCGCCTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGaa < 7:182952/148‑1 (MQ=255) tcCAGCCGCACCAGGTCGCCTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCg > 1:265398/1‑149 (MQ=255) ccAGCCGCGCCAGGTCGCCTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCgg > 3:15456/1‑149 (MQ=255) ccAGACGCGCCAGGTCGCCTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGCTAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCgg > 5:292108/1‑149 (MQ=255) cAGCCGCGCCAGGTCGCCTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCggg > 8:286167/1‑149 (MQ=255) gcgcCAGGTCGCCTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTcgc > 4:47731/1‑123 (MQ=255) cAGGTCGCCTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGa < 2:265398/149‑1 (MQ=255) aGGTCGCCTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGAt < 1:278566/149‑1 (MQ=255) gTCGCCTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGa < 4:177132/149‑1 (MQ=255) tCGCCTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGaa < 7:65741/149‑1 (MQ=255) cTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATg < 7:87592/149‑1 (MQ=255) ccAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCa < 4:336700/148‑1 (MQ=255) cAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGc > 3:189806/1‑149 (MQ=255) aGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGcc < 4:247950/149‑1 (MQ=255) gTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGt > 3:258254/1‑149 (MQ=255) aGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGAt > 2:141715/1‑148 (MQ=255) gCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAgg > 8:52337/1‑149 (MQ=255) aTGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCgg < 7:205240/111‑1 (MQ=255) aTGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCgg > 8:205240/1‑111 (MQ=255) ggTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGa > 4:319797/1‑114 (MQ=255) ggTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGa < 3:319797/114‑1 (MQ=255) ggTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATg < 7:187350/119‑1 (MQ=255) ggTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCCATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTAGCG‑GCCCCGCATGGAACGCCCGCTATTCAGTATGAACATg > 8:187350/1‑119 (MQ=255) aaTCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATc > 6:11274/1‑131 (MQ=255) aaTCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATc < 5:11274/131‑1 (MQ=255) tCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGGTCAGGTCATGGCTGAAGAGGCt > 3:223908/1‑149 (MQ=255) tCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCt < 4:258254/149‑1 (MQ=255) gAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCaa > 4:303358/1‑148 (MQ=255) gAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCaa > 3:81098/1‑148 (MQ=255) cgcgcAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGGTCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAg < 4:223908/149‑1 (MQ=255) cgcgcAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAg < 4:15456/149‑1 (MQ=255) cgcgcAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAg < 4:141470/149‑1 (MQ=255) cgcAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGtt < 7:286167/149‑1 (MQ=255) cgcAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGtt < 4:351117/149‑1 (MQ=255) cagcaAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGt < 7:194383/149‑1 (MQ=255) caAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTAc > 8:275493/1‑148 (MQ=255) gTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAgg > 3:14284/1‑149 (MQ=255) ttCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGt < 1:141715/149‑1 (MQ=255) cTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGtctc > 5:188548/1‑149 (MQ=255) tGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCa > 1:181678/1‑142 (MQ=255) tGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCa < 2:181678/142‑1 (MQ=255) agaCTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATTAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATTGCTGAAGAGTCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGTctct < 8:247730/147‑1 (MQ=255) agaCTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTAAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGTCTCTg < 7:52337/148‑1 (MQ=255) gaCTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGTCTCTGc < 3:95359/148‑1 (MQ=255) cagCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGACGGCTACTGTGGATTAACATCCAGCCGTCGCTGATCAGGTCAAGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGACTCTGCCa > 1:115546/3‑148 (MQ=255) cgtgatgCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGTATGGAATGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCTGCCGTCGCTGATCAGGTCATGTCTGAAGAGTCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGTCTCTGCCAACtcg < 2:115546/143‑1 (MQ=255) gTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGTCTCTGCCAACtcgt > 5:111642/1‑149 (MQ=255) aGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGGATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAAGATGCAGCCGTCGCTGAGCAGGGCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGTCTCTGCCAACTCgtcgtc < 7:360032/149‑1 (MQ=255) gCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGTCTCTGCCAACTCgtcgtc > 6:324356/1‑148 (MQ=255) gCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGTCTCTGCCAACTCGTCGTcc < 4:349209/149‑1 (MQ=255) ggTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGTCTCTGCCAACTCGTCGTCCAGGCgg < 4:189806/148‑1 (MQ=255) gTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTAc < 6:208478/117‑1 (MQ=255) gTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTAc > 5:208478/1‑117 (MQ=255) gTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGTCTCTGCCAACtcgtc > 3:118936/1‑137 (MQ=255) gTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGTCTCTGCCAACtcgtc < 4:118936/137‑1 (MQ=255) gTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGTCTCTGCCAACTCGTCGTCCAGGCgggg > 6:184105/1‑149 (MQ=255) gTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGTCTCTGCCAACTCGTCGTCCAGGCgggg < 6:424758/149‑1 (MQ=255) gTACGGGGTTGCGCGT‑CGCGCTCGAG‑GCCGCGAATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGTCTCTGCCAACTCGTCGTCCAGGCgggg < 6:292108/149‑1 (MQ=255) tACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGTCTCTGCCAACTCGTCGTCCAGGCggggg < 6:188548/149‑1 (MQ=255) cGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATgg < 3:272567/84‑1 (MQ=255) cGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATgg > 4:272567/1‑84 (MQ=255) tttGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGTCTCTGCCAACTCGTCGTCCAGGCGGGGGTCGATc < 5:324356/149‑1 (MQ=255) tctGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATTGAAGGTCGTGTAGTGTGGATGAACATGCAGCTGTCGCTGATCAGGTCATGTCTTAAGAGGCTGCAAAACTGCGAGTTGTACCAGGTCTCTGCGAACTCGTCGTCCAGGCGGTGGTCGAt < 1:56025/146‑1 (MQ=255) catGCGCGGCCGCGAGCGC‑‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTAc < 4:377925/108‑1 (MQ=255) catGCGCGGCCGCGAGCGC‑‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTAc > 3:377925/3‑110 (MQ=255) catGCGCGGCCGCGAGCGC‑‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGTCTCTGCCAACTCGTCGTCCAGGCgg > 4:77555/3‑140 (MQ=255) catGCGCGGCCGCGAGCGC‑‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGTCTCTGCCAACTCGTCGTCCAGGCgg < 3:77555/138‑1 (MQ=255) tGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGTCTCTGCCAACTCGTCGTCCAGGCGGGGGTCGATCAg > 6:9183/1‑149 (MQ=255) gcgcgg‑cgcgCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGTCTCTGCCAACTCGTCGTCCAGGCGGGGGTCGATCAgg > 3:394692/1‑149 (MQ=255) cgcgg‑cgcgCTCTCG‑TCCGCGCATGGAAGGAAGCGTAGTGTCCATGAACATGCAGCCCACCATGATCATGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGCTCTCTGCCAACACGTCGTCCAGGCGGGGGTCTAt > 2:56025/1‑144 (MQ=255) cgcgg‑cgcgCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGTCTCTGCCAACTCGTCGTCCAGGCGGGGGTCGATCAGGt < 7:275493/149‑1 (MQ=255) cgcgg‑cgcgCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGTCTCTGCCAACTCGTCGTCCAGGCGGGGGTCGATCAGGt < 3:303358/149‑1 (MQ=255) | TCGGGCAGGCATTCGCGCAGTTGTTCTTCCAGCCGCGCCAGGTCGCCTTCCAGGTCGCCATAGGGCATGTCGAACGGGTAATCGGCGAACACCGCGCGCAGCAAGTTCCTGAGACTGCCGTCAAGCCGATAGGTACGGGTTTGCGCGG‑CGCGCTCGCG‑GCCGCGCATGGAAGGCCGGGTAGTGTGGATGAACATGCAGCCGTCGCTGATCAGGTCATGGCTGAAGAGGCTGCAAAACAGCGAGTTGTACCAGGTCTCTGCCAACTCGTCGTCCAGGCGGGGGTCGATCAGGT > NC_002947/5185900‑5186191 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |