Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 644,641:1 | +G | 5.6% | coding (376/978 nt) | acoA ← | acetoin:2,6‑dichlorophenolindophenol oxidoreductase subunit alpha |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 644,641 | 1 | . | G | 5.6% | 291.5 / 11.1 | 72 | coding (376/978 nt) | acoA | acetoin:2,6‑dichlorophenolindophenol oxidoreductase subunit alpha |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (37/31); new base G (2/2); total (39/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.23e-01 |
CTCGGCCACGAAGATGCAGGGCAGGTTCATGATCGACGCCATGTTCATGGCCTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGTCTTCTTGCCGTAGATCTCGGCCATCATGCCGTACAC > NC_002947/644495‑644779 | ctcGGCCACGAAGATGCAGGGCAGGTTCATGATCGACGCCATGTTCATGGCCTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCAAGCGCCGCCCCGGc‑ca > 3:58531/1‑149 (MQ=255) cACGAAGATGCAGGGCTGGTTCATGATCGACGCCAGGTTCATGGCCTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCGTAAGAAGGCTACGGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAgtg < 1:102810/149‑1 (MQ=255) cACGAAGATGCAGGGCAGGTTCATGATCGACGCCATGTTCATGGCCTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAgtg < 3:74975/149‑1 (MQ=255) aCGAAGATGCAGGGCAGGTTCATGATCGACGCCATGTTCATGGCCTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGCGCACCActg > 8:122669/1‑149 (MQ=255) cGAAGATGCAGGGCAGGTTCATGATCGACGCCATGTTCATGGCCTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAgtggt < 4:163963/149‑1 (MQ=255) gAAGATGCAGGGCAGGTTCATGATCGACGCCATGTTCATGGCCTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAgtggtg > 3:2691/1‑149 (MQ=255) aaGATGCAGGGCAGGTTCATGATCGACGCCATGTTCATGGCCTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCAAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTgc < 4:58531/149‑1 (MQ=255) agggcaggTTCATGATCGACGCCATGTTCATGGCCTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGCGCACCACTGGtg‑gccgggg < 7:122669/149‑3 (MQ=255) agggcaggTTCATGATCGACGCCATGTTCATGGCCTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTgcgccggcg > 8:330009/1‑149 (MQ=255) agggcaggTTCATGATCGACGCCATGTTCATGGCCTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTgcgccggcg > 1:48848/1‑149 (MQ=255) caggTTCATGATCGACGCCATGTTCATGGCCTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAgtg > 1:231087/1‑134 (MQ=255) caggTTCATGATCGACGCCATGTTCATGGCCTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAgtg < 2:231087/134‑1 (MQ=255) gTTCATGATCGACGCCATGTTCATGGCCTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCcgacga > 6:164712/1‑149 (MQ=255) gTTCATGATCGACGCCATGTTCATGGCCTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCcgacga < 7:163961/149‑1 (MQ=255) gATCGACGCCATGTTCATGGCCTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGt > 2:20895/1‑149 (MQ=255) gATCGACGCCATGTTCATGGCCTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGt > 2:14599/1‑149 (MQ=255) aTCGACGCCATGTTCATGGCCTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGtt < 7:330009/149‑1 (MQ=255) aCGCCATGTTCATGGCCTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAgtggt < 1:152763/122‑1 (MQ=255) aCGCCATGTTCATGGCCTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAgtggt > 2:152763/1‑122 (MQ=255) ccATGTTCATGGCCTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCAcc > 7:225890/1‑148 (MQ=255) cATGTTCATGGCCTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCAcc > 1:385826/1‑147 (MQ=255) aTGTTCATGGCCTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGATTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAg > 7:304695/1‑149 (MQ=255) cTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCtttt > 7:16777/1‑149 (MQ=255) tCGAATACGGCGACCTCGTTTGATGCCACATCGACGAAGAAGGCTACCGAAACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGACGCCACGGC‑CCCCAgtg > 5:228933/1‑103 (MQ=255) tCGAATACGGCGACCTCGTTGTATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCATTGAGCTTGGCAGCCAGCTCCGCCCCGGC‑CACCAgtg < 6:228933/103‑1 (MQ=255) gAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCCCCGAGCATGCCCGTTTCCa > 4:168668/1‑149 (MQ=255) gAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTc > 2:347081/1‑147 (MQ=255) aaTACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATAcc < 1:344585/122‑1 (MQ=255) aaTACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATAcc > 2:344585/1‑122 (MQ=255) aaTACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAg < 8:21034/149‑1 (MQ=255) ggCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCgg > 7:286123/1‑149 (MQ=255) gcgcCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCgg > 6:121724/1‑148 (MQ=255) ccTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGCGCACCACTGGtg‑gccggggc > 7:114216/1‑102 (MQ=255) ccTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGCGCACCACTGGtg‑gccggggc < 8:114216/102‑1 (MQ=255) ccTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAAtg > 6:190415/1‑149 (MQ=255) cTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAAtgt < 5:190415/149‑1 (MQ=255) ggATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATc < 3:359147/148‑1 (MQ=255) gATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGAAATGTGCATCGa > 4:132408/1‑149 (MQ=255) ccccATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAgccg < 8:225890/149‑1 (MQ=255) cccATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCg < 5:22161/100‑1 (MQ=255) cccATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCg > 6:22161/1‑100 (MQ=255) tCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCttt > 6:396993/1‑149 (MQ=255) gCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGTAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGc < 3:132408/149‑1 (MQ=255) ccGAAGAAGGCTACCGACACGTCATTGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCtt < 1:154675/113‑1 (MQ=255) ccGAAGAAGGCTACCGACACGTCATTGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCtt > 2:154675/1‑113 (MQ=255) ccGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGcc < 1:14599/149‑1 (MQ=255) ccGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGcc < 1:20895/149‑1 (MQ=255) aagGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCcgacga > 5:257733/1‑82 (MQ=255) aagGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCcgacga < 6:257733/82‑1 (MQ=255) acacGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGtc < 1:347081/149‑1 (MQ=255) acGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGtctt > 4:42901/1‑149 (MQ=255) gTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGtcttct > 7:253483/1‑149 (MQ=255) tCATCGCGGCCCTTGAGCGTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGTcttctt < 8:102004/149‑1 (MQ=255) tCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGTCTTCTTGcc > 8:142004/1‑149 (MQ=255) gcgGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGTCTTCTTGCCGt < 8:16777/149‑1 (MQ=255) cgGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGTCTTCTTGCCg > 2:324136/1‑147 (MQ=255) ggCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAgcc > 4:84708/1‑112 (MQ=255) ggCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAgcc < 3:84708/112‑1 (MQ=255) cTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCGTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGTCTTCTTGCCGTAGAtct > 7:362657/1‑149 (MQ=255) aGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGTCTTCTTGCCGTAGATCTCgg < 5:164712/148‑1 (MQ=255) gCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGTCTTCTTGCCGTAGATCTCGGc < 2:385826/148‑1 (MQ=255) cTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGtc > 1:34398/1‑127 (MQ=255) cTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGtc < 2:34398/127‑1 (MQ=255) ggCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGTCTTCTTGCCGTAGATCTCGGCcatca > 8:342407/1‑149 (MQ=255) gccgccAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGTCTTCTTGCCGTAGATCTCGGCcatcat > 4:376783/1‑149 (MQ=255) ccgccAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGTCTTCTTGCCGTAGATCTCGGCCATCATg > 5:249854/1‑149 (MQ=255) cgccAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGTCTTCTTGCCGTAg < 3:155696/133‑1 (MQ=255) cgccAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGTCTTCTTGCCGTAg > 4:155696/1‑133 (MQ=255) aGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCg > 7:27849/1‑114 (MQ=255) aGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCg < 8:27849/114‑1 (MQ=255) aGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGTCTTCTTGCCGTAGATCTCGGCCATCATGCCGTa < 8:286123/149‑1 (MQ=255) gccCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGTCTTCTTGCCGTAGATCTCGGCCATCATGCCGTacac > 2:224964/1‑146 (MQ=255) gccCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGTCTTCTTGCCGTAGATCTCGGCCATCATGCCGTacac < 1:224964/146‑1 (MQ=255) | CTCGGCCACGAAGATGCAGGGCAGGTTCATGATCGACGCCATGTTCATGGCCTCGAATACGGCGCCCTCGTTGGATGCCCCATCGCCGAAGAAGGCTACCGACACGTCATCGCGGCCCTTGAGCTTGGCCGCCAGCGCCGCCCCGGC‑CACCAGTGGTGCGCCGGCGCCGACGATACCGTTGGCACCGAGCATGCCCTTTTCCAGGTCGGCAATGTGCATCGAGCCGCCTTTGCCACCGCACACGCCGGTCTTCTTGCCGTAGATCTCGGCCATCATGCCGTACAC > NC_002947/644495‑644779 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |