| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,794,652:1 | +G | 5.8% | coding (1802/1884 nt) | fcs ← | feruloyl‑CoA‑synthetase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,794,652 | 1 | . | G | 5.8% | 284.4 / 11.2 | 69 | coding (1802/1884 nt) | fcs | feruloyl‑CoA‑synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (32/33); new base G (2/2); total (34/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.56e-01 | |||||||||||
CCCAGGGCGTGCGCACCATCTGGACGATGGCCGTGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGC‑ACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGCCAGCAGCGACAGCCATTCGATACGGCTGGCGTTGCCTTGGGCATCGCGGTTCAAGCGCTCCAGCCAGTCAGCGAACCAACTGC > NC_002947/3794504‑3794799 | cccAGGGCGTGCGCACCATCTGTACGATGGCCGTGTCCTCGAAGACCGTGCACAGCCCGGCCGC‑ACTCAACGCCGCACCTTGGCGTGAAATGAGTCGGTGTCTTCTCCACGGTACATCGCCTCTACCTGAGCGGCGCGCCGCTccagca > 6:374679/1‑149 (MQ=255)cccAGGGCGTGCGCACCATCTGGACGATGGCCGTGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGC‑ACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTgcagca > 4:116866/1‑149 (MQ=255) ccAGGGCGTGCGCACCATCTGGACGATGGCCGTGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGC‑ACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑c > 5:227416/1‑149 (MQ=255) cAGGGCGTGCGCACCATCTGGACGATGGCCGTGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGC‑ACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑Cg < 3:116866/149‑1 (MQ=255) gTGCGCACCATCTGGACGATGGCCGTGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGC‑ACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGgcgcgc < 6:365998/149‑1 (MQ=255) tGCGCACCATCTGGACGATGGCCGTGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGC‑ACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCt < 5:149592/149‑1 (MQ=255) tGGACGATGGCCGTGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGC‑ACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAg > 6:231632/1‑149 (MQ=255) cGATGGCCGTGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGC‑ACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCt > 3:148739/1‑149 (MQ=255) gATGGCCGTGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGC‑ACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCtt > 5:123729/1‑149 (MQ=255) tGGCCGTGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGC‑ACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGt < 6:123729/149‑1 (MQ=255) gCCGTGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGC‑ACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCg > 4:24711/1‑149 (MQ=255) tgtCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGC‑ACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGa < 3:24711/149‑1 (MQ=255) tgtCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGC‑ACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGa < 6:227416/149‑1 (MQ=255) ccTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGC‑ACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGAttt > 7:378852/1‑149 (MQ=255) cTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGC‑ACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑Cgg < 8:258297/115‑1 (MQ=255) cTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGC‑ACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑Cgg > 7:258297/1‑115 (MQ=255) cTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGC‑ACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATc > 4:292080/1‑129 (MQ=255) cTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGC‑ACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATc < 3:292080/129‑1 (MQ=255) tCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGCGACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGt > 1:213628/1‑143 (MQ=255) tCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGC‑ACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGt < 2:213628/142‑1 (MQ=255) tCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGC‑ACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCa > 6:95493/1‑149 (MQ=255) gAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGC‑ACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCAc < 4:149298/148‑1 (MQ=255) aaGACGGTGCACAGCCCGGCCGC‑ACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCg < 6:407583/149‑1 (MQ=255) gCACAGCCCGGCCGC‑ACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGtcgat > 1:64311/1‑149 (MQ=255) cacaGCCCGGCCGC‑ACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGtcgatc < 2:64311/149‑1 (MQ=255) acaGCCCGGCCGC‑ACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGCCCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGtcgatc > 6:91043/1‑148 (MQ=255) acaGCCCGGCCGC‑ACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGtcgat > 6:311653/1‑147 (MQ=255) acaGCCCGGCCGC‑ACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGtcgat < 5:311653/147‑1 (MQ=255) cccGGCCGC‑ACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGgcgcgc < 2:392849/102‑1 (MQ=255) cccGGCCGC‑ACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGgcgcgc > 1:392849/1‑102 (MQ=255) cccGGCCGC‑ACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGa > 6:321406/1‑127 (MQ=255) cccGGCCGC‑ACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGa < 5:321406/127‑1 (MQ=255) cGC‑ACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTc < 3:30006/149‑1 (MQ=255) c‑ACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCgg > 6:191805/1‑149 (MQ=255) tCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGc > 7:316409/1‑147 (MQ=255) tCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGc > 4:250740/1‑147 (MQ=255) tCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGCca > 8:73107/1‑149 (MQ=255) ccGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGCCAGCAGCg > 4:121507/1‑149 (MQ=255) gCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGCCAGCAGCGa > 3:374688/1‑148 (MQ=255) aCCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCTGCGtcgatc < 6:84328/123‑1 (MQ=255) aCCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGCCAGCAGCGACAg > 8:110732/1‑149 (MQ=255) aCCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGAGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGtcgatc > 5:84328/1‑123 (MQ=255) cTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGCCAGCAGCGACAGc > 6:236368/1‑148 (MQ=255) gCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGCCAGCAGCGACAGCCATTc < 5:95493/149‑1 (MQ=255) cGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGCCAGCAGCGACAGCCATTCGATACGGCTg < 6:61095/149‑1 (MQ=255) gTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGCCAGCAGCGACAGCCATTCGATACGGCTgg < 7:42667/149‑1 (MQ=255) tCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGCCAGCAGCGACAGCCATTCGATACGGCTGGc > 5:286390/1‑149 (MQ=255) tCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGCCAGCAGCGACAGCCATTCGATACGGCTGGc < 3:121507/149‑1 (MQ=255) gggTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGCCAGCAGCGACAGCCATTCGATACGGCTGGCGtt < 6:286390/149‑1 (MQ=255) ggTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGCCAGCAGCGACAGCCATTCGATACGGCTGGCGTTg < 5:91043/149‑1 (MQ=255) tCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGCCAGCAGCGACAGCCATTCGATACGGCTGGCGTTGcc > 5:300390/1‑149 (MQ=255) ttCGCCACGGTGCAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGCCAGCAGCGACAGCCATTCGATACGGCTGGCGTTGCCtt > 7:238718/1‑149 (MQ=255) cGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTTATAGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATAGACGGCGGCTCGGCCAGCAGCCACAGCCATTCGATACTGCTGGCGTTGCATTg > 4:86878/1‑148 (MQ=255) cGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGCCAGCAGCGACAGCCATTCGATACGGCTGGCGTTGCCtt < 3:86878/147‑1 (MQ=255) ggTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGCCAGCAGCGACAGCCATTCGATACGGCTGGCGTTGCCTTGGGCATcg < 1:160716/149‑1 (MQ=255) cAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGCCAGCAGCGACAGCCATTCGATACGGCTGGCGTTGCCTTGGGCATCGCGGt < 8:238718/149‑1 (MQ=255) gcgcCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGCCAGCAGCGACAGCCATTCGATACGGCTGGCGTTGCCTTGGGCATCGCGGtt > 1:164337/1‑148 (MQ=255) gcgcCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGCCAGCAGCGACAGCCATTCGATACGGCTGGCGTTGCCTTGGGCATCGCGGtt > 5:2341/1‑148 (MQ=255) gcCTCGCCCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGCCAGCAGCGACAGCCATTCGATACGGCTGGCGTTGCCTTGGGCATCGCGGTTCaa < 5:192986/149‑1 (MQ=255) gcCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGCCAGCAGCGACAGCCATTCGATACGGCTGGCGTTGCCTTGGGCATCGCGGTTCaa < 5:236368/149‑1 (MQ=255) ccTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGc > 4:90330/1‑94 (MQ=255) ccTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGc < 3:90330/94‑1 (MQ=255) aCCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGCCAGCAGCGACAGCCATTCGATACGGCTGGCGTTGCCTTGGGCATCGCGGTTCAAGCGCTc < 5:183510/149‑1 (MQ=255) aCCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGCCAGCAGCGACAGCCATTCGATACGGCTGGCGTTGCCTTGGGCATCGCGGTTCAAGCGCTc < 4:148739/149‑1 (MQ=255) ccTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGCCAGCAGCGACAGCCATTCGATACGGCTGGCGTTGCCTTGGGCATCGCGGTTCAAGCGCTc > 2:46098/1‑148 (MQ=255) atcagcgcgcCG‑TGCTGCAGCGGCGCGCCGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGCCAGCAGCGACAGCCATTCGATACGGCTGGCGTTGCCTTGGGCATCGCgg < 8:347430/129‑1 (MQ=255) tcagcgcgcCG‑TGCTGCAGCGGCGCGCCGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGAc > 7:316168/4‑72 (MQ=21) tcagcgcgcCG‑TGCTGCAGCGGCGCGCCGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGAc < 8:316168/69‑1 (MQ=21) tcagcgcgcCG‑TGCTGCAGCGGCGCGCCGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGCCAGCAGCGACAGCCATTCGATACGGCTGGCGTTGCCTTGGGCATCGCGGTTCAAGCGCTccagc > 8:343967/4‑147 (MQ=255) gcggcgCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGCCAGCAGCGACAGCCATTCGATACGGCTGGCGTTGCCTTGGGCATCGCGGTTCAAGCGCTccagcca < 8:378852/149‑1 (MQ=255) gcgcCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGCCAGCAGCGACAGCCATTCGATACGGCTGGCGTTGCCTTGGGCATCGCGGTTCAAGCGCTCCAGCCAGTCAg > 8:123958/1‑149 (MQ=255) cgccgcTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGCCAGCAGCGACAGCCATTCGATACGGCTGGCGTTGCCTTGGGCATCGCGGTTCAAGCGCTCCAGCCAGTCAGc < 4:374688/149‑1 (MQ=255) ca‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTGGATCGTCGGCGGCTCGGCCAGCAGCGACAGCCATTCGATACGGCTGGCGTTGCCTTGGGCATCGCGGTTCAAGCGCTCCAGCCAGTCAGCTAACCAACTgc < 5:374679/149‑1 (MQ=255) | CCCAGGGCGTGCGCACCATCTGGACGATGGCCGTGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGC‑ACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCA‑CGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGCCAGCAGCGACAGCCATTCGATACGGCTGGCGTTGCCTTGGGCATCGCGGTTCAAGCGCTCCAGCCAGTCAGCGAACCAACTGC > NC_002947/3794504‑3794799 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |