New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1032824 | 57 (0.890) | 4 (0.070) | 3/240 | NT | 5.8% | coding (918/1137 nt) | PP_0889 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 1032893 | 75 (1.240) | coding (987/1137 nt) | PP_0889 | hypothetical protein |
GTGCCCGCGATTTGGCCCGTATTGGCCTGCTGATGCAGCGCGACGGGCGC‑TGGCAGGGCCGACAATTGCTGCCCAAAGCCTGGGTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGTGCACCGGCAGACACCTTCGCCGCCCTTGGCCACTGGGGGCAGGCTTTATATGTGCTGCCTGAGCAAAAGCTGGTGATCGTGCGCTACGCCGATGAC > NC_002947/1032676‑1032971 | gTGCCCGCGATTTGGCCCGTATTGGCCTGCTGATGCAGCGCGACGGGCGC‑TGGCAGGGCCGACAATTGCTGCCCAAAGCCTGGGTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGC < 4:101812‑M1/149‑1 (MQ=255) ccGCGATTTGGCCCGTATTGGCCTGCTGATGCAGCGCGACGGGCGC‑TGGCAGGGCCGACAATTGCTGCCCAAAGCCTGGGTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACt > 4:31655/1‑149 (MQ=255) ccGCGATTTGGCCCGTATTGGCCTGCTGATGCAGCGCGACGGGCGC‑TGGCAGGGCCGACAATTGCTGCCCAAAGCCTGGGTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACt > 4:26086/1‑149 (MQ=255) cgcgATTTGGCCCGTATTGGCCTGCCGATGCAGCGCGACGGGCGCATGGCAGGGCCGACAATTGCTGCCCAAAGCCTGGGTAGGTTTCAA‑CCGCCCCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACt > 1:83719/1‑149 (MQ=255) gcgATTTGGCCCGTATTGGCCTGCTGATGCAGCGCGACGGGCGC‑TGGCAGGGCCGACAATTGCTGCCCAAAGCCTGGGTAGCTTTCAATTCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACtg < 1:322710/149‑1 (MQ=255) cgATTTGGCCCGTATTGGCCTGCTGATGCAGCGCGACGGGCGC‑TGGCAGGGCCGACAATTGCTGCCCAAAGCCTGGGTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACtggt < 3:386965/149‑1 (MQ=255) aTTTGGCCCGTATTGGCCTGCTGATGCAGCGCGACGGGCGC‑TGGCAGGGCCGACAATTGCTGCCCAAAGCCTGGGTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACtggtgg > 7:387445/1‑149 (MQ=255) gCCCGTATTGGCCTGCTGATGCAGCGCGACGGGCGC‑TGGCAGGGCCGACAATTGCTGCCCAAAGCCTGGGTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCaa > 3:181608/1‑149 (MQ=255) ccGTATTGGCCTGCTGATGCAGCGCGACGGGCGC‑TGGCAGGGCCGACAATTGCTGCCCAAAGCCTGGGTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAAc > 5:389471/1‑148 (MQ=255) ctgctgATGCAGCGCGACGGGCGC‑TGGCAGGGCCGACAATTGCTGCCCAAAGCCTGGGTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCgctggc > 6:384607/1‑149 (MQ=255) ccgATGCAGCGCGACGGGCGC‑TGGCAGGGCCGACAATTGCTGCCCAAAGCCTGGGTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCgctggctg < 2:83719/146‑1 (MQ=255) tgATGCAGCGCGACGGGCGC‑TGGCAGGGCCGACAATTGCTGCCCAAAGCCTGGGTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCtggctggc < 4:181608/149‑1 (MQ=255) gCAGCGCGACGGGCGC‑TGGCAGGGCCGACAATTGCTGCCCAAAGCCTGGGTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGcc > 7:27241/1‑148 (MQ=255) gCAGCGCGACGGGCGC‑TGGCAGGGCCGACAATTGCTGCCCAAAGCCTGGGTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCg > 8:246758/1‑149 (MQ=255) gcgcGACGGGCGC‑TGGCAGGGCCGACAATTGCTGCCCAAAGCCTGGGTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAAc > 6:398921/1‑149 (MQ=255) cgACGGGCGC‑TGGCAGGGCCGACAATTGCTGCCCAAAGCCTGGGTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGc > 2:340663/1‑149 (MQ=255) gACGGGCGC‑TGGCAGGGCCGACAATTGCTGCCCAAAGCCTGGGTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGcc > 1:26489/1‑149 (MQ=255) gggCGC‑TGGCAGGGCCGACAATTGCTGCCCAAAGCCTGGGTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTg > 2:390869/1‑149 (MQ=255) ggCGC‑TGGCAGGGCCGACAATTGCTGCCCAAAGCCTGGGTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTgg < 5:375746/149‑1 (MQ=255) cgc‑TGGCAGGGCCGACAATTGCTGCCCAAAGCCTGGGTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGcc < 8:24008/149‑1 (MQ=255) cgc‑TGGCAGGGCCAACAATTGCTGCCCAAAGCCTGGGTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTGAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGcc < 5:321701/149‑1 (MQ=255) tGGCAGGGCCGACAATTGCTGCCCAAAGCCTGGGTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCAgcggctggtt > 2:340461/1‑128 (MQ=255) tGGCAGGGCCGACAATTGCTGCCCAAAGCCTGGGTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCAgcggctggtt < 1:340461/130‑3 (MQ=255) gCAGGGCCGACAATTGCTGCCCAAAGCCTGGGTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGt < 1:390869/148‑1 (MQ=255) aGGGCCGACAATTGCTGCCCAAAGCCTGGGTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGCCGGCCACTGGTGGCTCAACCCGCCGCTGGATGGCGCCGAACGGCATTGGCCCAGAGCa > 6:275863/1‑149 (MQ=255) ccGACAATTGCTGCCCAAAGCCTGGGTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCgaaggtgtctgccggtgcactcggccaaggccgttcggcgccagccagcggctggttg > 6:253984‑M1/1‑91 (MQ=255) gACAATTGCTGCCCAAAGCCTGGGTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCgc > 8:85795/1‑111 (MQ=255) gACAATTGCTGCCCAAAGCCTGGGTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCgc < 7:85795/111‑1 (MQ=255) gACAATTGCTGCCCAAAGCCTGGGTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGTGCACCGGCa < 7:246758/149‑1 (MQ=255) aaTTGCTGCCCAAAGCCTGGGTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCgaaggtgtctgccggtgcactgggccaaggccgttcggcgccagccagcggctggttgagcca > 2:194538‑M1/1‑86 (MQ=255) cccAAAGCCTGGGTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGTGCACCGGCAGACACCTTCgc < 7:243583‑M2/149‑3 (MQ=255) cccAAAGCCTGGGTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGTGCACCGGCAGACACCTTCgc < 4:37298‑M2/149‑3 (MQ=255) cAAAGCCTGGGTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGc > 6:200951/1‑95 (MQ=255) cAAAGCCTGGGTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGc < 5:200951/95‑1 (MQ=255) cAAAGCCTGGGTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGTGCACCGGCAGACACCTTCgccg < 4:173929‑M2/149‑5 (MQ=255) aaGCCTGGGTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGTGCACCGGCAGACACCTTCgccgcc < 1:208376‑M2/149‑7 (MQ=255) aGCCTGGGTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGTGCACCGGCAGACACCTTCgccgccc < 2:28112‑M2/149‑8 (MQ=255) gCCTGGGTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCgaaggtgtctgccggtgcactgggccaaggccgttcggcgccagccagcggctggttgagccaccagtggccgcccg < 1:194538‑M1/149‑78 (MQ=255) gCCTGGGTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCgaaggtgtctgccggtgcactcggccaaggccgttcggcgccagccagcggctggttgagccaccagtggccgcccg < 5:253984‑M1/149‑78 (MQ=255) cTGGGTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGTGCACCGGCAGACACCTTCGCCGCCCTTg < 6:203082/149‑1 (MQ=255) gTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGTGCACCGGCAGACACCTTCGCCGCCCTTGGCCa > 7:318237/1‑149 (MQ=255) tttCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGTGCACCGGCAGACACCTTCGCCGCCCTTGGCCACTggg > 3:99732/1‑149 (MQ=255) tttCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGTGCACCGGCACACACCTTCGCCGCCCTTGGCCACTggg > 5:231209/1‑149 (MQ=255) ccGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGTGCACCGGCAGACACCTTCGCCGCCCTTGGCCACTGGGGGCAgg < 6:389471/149‑1 (MQ=255) cGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGTGCACCGGCAGACACCTTCGCCGCCCTTGGCCACTGGGGGCAGGc < 8:318237/149‑1 (MQ=255) ccccGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGTGCACCGGCAGACACCTTCGCCGCCCTTGGCCACTGGGGGCAGGCTTta < 8:387445/149‑1 (MQ=255) cccGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGTGCACCGGCAGACACCTTCGCCGCCCTTGGCCACTGGGGGCAGGCTTtat < 4:77654/149‑1 (MQ=255) ccGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGTGCACCGGCAGACACCTTCGCCGCCCTTGGCCACTGGGGGCAGGCTTtata > 7:251975/1‑149 (MQ=255) ccGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGTGCACCGGCAGACACCTTCGCCGCCCTTGGCCACTGGGGGCAGGCTTtata > 7:245571/1‑149 (MQ=255) cGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGTGCACCGGCAGACACCTTCGCCGCCCTTGGCCACTGGGGGCAGGCTTTatat < 1:340663/149‑1 (MQ=255) cGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGTGCACCGGCAGACACCTTCGCCGCCCTTGGCCACTGGGGGCAGGCTTTatat > 3:12750/1‑149 (MQ=255) cGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGTGCACCGGCAGACACCTTCGCCGCCCTTGGCCACTGGGGGCAGGCTTTatat > 6:350758/1‑149 (MQ=255) tttGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGTGCACCGGCAGACACCTTCGCCGCCCTTGGCCACTGGGGGCAGGCTTTATAtgt < 3:31655/149‑1 (MQ=255) tttGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGTGCACCGGCAGACACCTTCGCCGCCCTTGGCCACTGGGGGCAGGCTTTATAtgt < 3:26086/149‑1 (MQ=255) tCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGTGCACCGGCAGACACCTTCGCCGCCCTTGGCCACTGGGGGCAGGCtt > 8:29191/1‑138 (MQ=255) tCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGTGCACCGGCAGACACCTTCGCCGCCCTTGGCCACTGGGGGCAGGCtt < 7:145393/138‑1 (MQ=255) tCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGTGCACCGGCAGACACCTTCGCCGCCCTTGGCCACTGGGGGCAGGCtt > 8:145393/1‑138 (MQ=255) tCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGTGCACCGGCAGACACCTTCGCCGCCCTTGGCCACTGGGGGCAGGCtt < 7:29191/138‑1 (MQ=255) caggcccaggcGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGt > 5:311286/1‑90 (MQ=255) caggcccaggcGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGt < 6:311286/90‑1 (MQ=255) aggcccaggcGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGTGCACCGGCAGACACCTTCGCCGCCCTTGGCCACTGGGGGCAGGCTTTATATGTGCTGCCt < 5:350758/149‑1 (MQ=255) gcccaggcGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGTGCACCGGCAGACACCTTCGCCGCCCTTGGCCACTGGGGGCAGGCTTTATATGTGCTGCCTGa < 2:26489/149‑1 (MQ=255) gcccaggcGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGTGCACCGGCAGACACCTTCGCCGCCCTTGGCCACTGGGGGCAGGCTTTATATGTGCTGCCTGa < 5:384607/149‑1 (MQ=255) ccaggcGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGTGCACCGGCAGACACCTTCGCCGCCCTTGGCCACTGGGGGCAGGCTTTATATGTGCTGCCTGAGc < 3:37298/149‑1 (MQ=255) aGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGTGCACCGGCAGACACCTTCGCCGCCCTTGGCCACTGGGGGCAGGCTTTATATGTGCTGCCTGAGCAAAAGCTgg < 6:128688/141‑1 (MQ=255) aGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGTGCACCGGCAGACACCTTCGCCGCCCTTGGCCACTGGGGGCAGGCTTTATATGTGCTGCCTGAGCAAAAGCTgg > 5:128688/1‑141 (MQ=255) aGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGTGCACCGGCAGACACCTTCGCCGCCCTTGGCCACTGGGGGCAGGCTTTATATGTGCTGCCTGAGCAAAAGCTGGTGATCGTg < 8:243583/149‑1 (MQ=255) cATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGTGCACCGGCAGACACCTTCGCCGCCCTTGGCCACTGGGGGCAGGCTTTATATGTGCTGCCTGAGCAAAAGCTGGTGATCGTgc > 3:377832/1‑146 (MQ=255) cATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGTGCACCGGCAGACACCTTCGCCGCCCTTGGCCACTGGGGGCAGGCTTTATATGTGCTGCCTGAGCAAAAGCTGGTGATCGTgc < 4:377832/146‑1 (MQ=255) tCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGTGCACCGGCAGACACCTTCGCCGCCCTTGGCCACTGGGGGCAGGCTTTATATGTGCTGCCTGAGCAAAAGCTGGTGATCGTGCGCTAc > 3:337452/1‑149 (MQ=255) ccGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGTGCACCGGCAGACACCTTCGCCGCCCTTGGCCACTGGGGGCAGGCTTTATATGTGCTGCCTGAGCAAAAGCTGGTGATCGTGCGCTAcac < 5:275863/149‑3 (MQ=255) cGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCGAGTGCACCGGCAGACACCTTCgccgcccgggatggcctcgccaggcagcgcctgggcctggacaaacggggtgcggttgaaagctacccaggc < 5:253984‑M2/149‑73 (MQ=255) cGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGTGCACCGGCAGACACCTTCgccgcccgggatggcctcgccaggcagcgcctgggcctggacaaacggggtgcggttgaaagctacccaggc < 1:194538‑M2/149‑73 (MQ=255) gggCGGCgaaggtgtctgccggtgcactgggccaaggccgttcggcgccagccagcggctggttgagccaccagtggccgcccgggatggcctcgccaggcagcgcctgggcctggacaaacggggtgcggttgaaagctacccaggct < 2:28112‑M1/149‑143 (MQ=255) ggcggcgaaggtgtctgccggtgcactgggccaaggccgttcggcgccagccagcggctggttgagccaccagtggccgcccgggatggcctcgccaggcagcgcctgggcctggacaaacggggtgcggttgaaagctacccaggctt < 1:208376‑M1/149‑144 (MQ=255) cggcgaaggtgtctgccggtgcactgggccaaggccgttcggcgccagccagcggctggttgagccaccagtggccgcccgggatggcctcgccaggcagcgcctgggcctggacaaacggggtgcggttgaaagctacccaggctttg < 4:173929‑M1/149‑146 (MQ=255) gcgaaggtgtctgccggtgcactgggccaaggccgttcggcgccagccagcggctggttgagccaccagtggccgcccgggatggcctcgccaggcagcgcctgggcctggacaaacggggtgcggttgaaagctacccaggctttggg < 7:243583‑M1/149‑148 (MQ=255) gcgaaggtgtctgccggtgcactgggccaaggccgttcggcgccagccagcggctggttgagccaccagtggccgcccgggatggcctcgccaggcagcgcctgggcctggacaaacggggtgcggttgaaagctacccaggctttggg < 4:37298‑M1/149‑148 (MQ=255) | GTGCCCGCGATTTGGCCCGTATTGGCCTGCTGATGCAGCGCGACGGGCGC‑TGGCAGGGCCGACAATTGCTGCCCAAAGCCTGGGTAGCTTTCAA‑CCGCACCCCGTTTGTCCAGGCCCAGGCGCTGCCTGGCGAGGCCATCCCGGGCGGCCACTGGTGGCTCAACCAGCCGCTGGCTGGCGCCGAACGGCCTTGGCCCAGTGCACCGGCAGACACCTTCGCCGCCCTTGGCCACTGGGGGCAGGCTTTATATGTGCTGCCTGAGCAAAAGCTGGTGATCGTGCGCTACGCCGATGAC > NC_002947/1032676‑1032971 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |