New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1675701 = | 44 (0.690) | 3 (0.050) | 3/240 | NT | 7.0% | coding (868/1305 nt) | hom | homoserine dehydrogenase |
? | NC_002947 | 1675742 = | 38 (0.630) | coding (909/1305 nt) | hom | homoserine dehydrogenase |
GGTTACCGCATCAAGCACCTGGGCGTGGCGCGTCGCACCGCCGAAGGTATCGAGTTGCGCGTGCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTCCGTGCCATGACCTCCGACCCGGAGAACCGTGTGCCGCACCTGGCATTCCAGCCAGACTCG > NC_002947/1675554‑1675841 | tgTTACCGCATCAATCACCTGGGCTTGGCGCGTCGCACCGCCGAAGGTATCGAGTTGCGAGTGCACCCGAAGCTTATCCCTGCCGACCGTCTGATCTCCAACGTCAACGGCGTGATTAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCgg < 4:328202/148‑1 (MQ=255) ggTTACCGCATCAAGCACCTGGGCGTGGCGCGTCGCACCGCCGAAGGTATCGAGTTGCGCGTGCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCgg > 5:280042/1‑149 (MQ=255) ttACCTCATCAAGCACCTGGGCGTGGAGCGTCGCACCGCCGAAGGTATCGAGTTGCGCGTTCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCgg > 3:328202/1‑147 (MQ=255) gctttcgcaggcttcgatcggcaggatcgggtgggccgacagcgagtctggctggaatgccaggtgcggcacacggttctccgggtcggaggtcatggcacggaccacgtcgaccaggtcgccgaccactgacgaagcggtaGGCTCCa < 5:18487‑M1/7‑1 (MQ=255) cATCAAGCACCTGGGCGTGGCGCGTCGCACCGCCGAAGGTATCGAGTTGCGCGTGCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCAccc > 4:186499/1‑149 (MQ=255) aGCACCTGGGCGTGGCGCGTCGCACCGCCGTAGGTATCGAGTTGCGCGTGCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGtac > 1:34580/1‑149 (MQ=255) ccTGGGCGTGGCGCGTCGCACCGCCGAAGGTATCGAGTTGCGCGTGCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACg < 6:280042/149‑1 (MQ=255) gggCGTGGCGCGTCGCACCGCCGAAGGTATCGAGTTGCGCGTGCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTg > 3:228894/1‑149 (MQ=255) cgTCGCACCGCCGAAGGTATCGAGTTGCGCGTGCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCggg < 3:186499/149‑1 (MQ=255) aCCGCCGAAGGTATCGAGTTGCGCGTGCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGa < 4:194062/149‑1 (MQ=255) ccgccgAAGGTATCGAGTTGCGCGTGCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAg < 4:203178/149‑1 (MQ=255) gccgacagcgagtctggctggaatgccaggtgcggcacacggttctccgggtcggaggtcatggcacggaccacgtcgaccaggtcgccgaccactgacgaagcggtaGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGcc > 7:108454‑M1/109‑149 (MQ=255) agcgagtctggctggaatgccaggtgcggcacacggttctccgggtcggaggtcatggcacggaccacgtcgaccaggtcgccgaccactgacgaagcggtaGGCTCCa > 4:168162‑M1/103‑109 (MQ=255) tCGAGTTGCGCGTGCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGc > 6:32759/1‑121 (MQ=255) tCGAGTTGCGCGTGCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTc < 2:34580/148‑1 (MQ=255) gAGTTGCGCGTGCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTc > 7:368222/1‑149 (MQ=255) tggctggaatgccaggtgcggcgcacggttctccgggtcggaggtcatggcacggaccacgtcgaccaggtcgccgaccactgacgaagcggtaGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTAcc < 6:250498‑M1/45‑1 (MQ=255) tggctggaatgccaggtgcggcgcacggttctccgggtcggaggtcatggcacggaccacgtcgaccaggtcgccgaccactgacgaagcggtaGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTAcc > 5:250498‑M1/95‑139 (MQ=255) gTTGCGCGTGCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAg < 4:228894/149‑1 (MQ=255) aCCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGAc > 2:104418/1‑149 (MQ=255) cccGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGa < 8:255270/120‑1 (MQ=255) cccGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGAcc < 3:198596/149‑1 (MQ=255) cccGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGAAGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGa > 7:255270/1‑120 (MQ=255) gCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTc > 5:61986/1‑148 (MQ=255) aTCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGt > 5:287941/1‑149 (MQ=255) cGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGc < 5:129062/108‑1 (MQ=255) cGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGc > 6:129062/1‑108 (MQ=255) gCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTCCg > 8:77593/1‑149 (MQ=255) aCCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTCCGTGcc < 7:77593/149‑1 (MQ=255) aCCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTCCGTGcc < 1:104418/149‑1 (MQ=255) gATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTg < 4:406207/133‑1 (MQ=255) gATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTg > 3:406207/1‑133 (MQ=255) gCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGgcgc > 1:252506/1‑80 (MQ=255) gCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGgcgc < 2:252506/80‑1 (MQ=255) ccAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTg > 8:241175/1‑119 (MQ=255) ccAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTg < 7:241175/119‑1 (MQ=255) gTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTCCGTGCCATGACCTCCGACCCg > 7:259887/1‑147 (MQ=255) cAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTCCGTGCCATGACCTCCGACCCGgag > 5:350972/1‑148 (MQ=255) cGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTCCGTGCCATGACCTCCGACCCGGAGAAcc < 6:61986/149‑1 (MQ=255) tgatgaACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTCCGTGCCATGACCTCCGACCCGGAGAACCGtgtg < 6:287941/149‑1 (MQ=255) gatgaACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTCCGTGCCATGACCTCCGACCCGGAGAACCGTGTGc > 8:89573/1‑149 (MQ=255) aggaACGGTGTCATGGTCACCGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTCCGTGCCATGACCTCCGACCCGGAGAACCGTGTGcc < 8:368222/147‑1 (MQ=255) gaACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTCCGTGCCATGACCTCCGACCCGGAGAACCGTGTGCCg > 6:207949/1‑148 (MQ=255) cTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTCCGTGCCATGACCTCCGACCCGGAGAACCGTGTGCCGCACCTg < 6:350972/149‑1 (MQ=255) tGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTCCGTGCCATGACCTCCGACCCGGAGAACCGTGTGCCGCACCTgg > 3:288367/1‑149 (MQ=255) tCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTCCGTGCCATGACCTCCGACCCGGAGAACCGTGTGCCGCACCTgg < 5:207949/147‑1 (MQ=255) cATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTCCGTGCCATGACCTCCGACCCGGAGAACCGTGTGCCg > 5:171613/1‑139 (MQ=255) cATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTCCGTGCCATGACCTCCGACCCGGAGAACCGTGTGCCg < 6:171613/139‑1 (MQ=255) tCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTCCGTGCCATGACCTCCGACCCGGAGAAcc < 8:219214/126‑1 (MQ=255) tCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTCCGTGCCATGACCTCCGACCCGGAGAAcc > 7:219214/1‑126 (MQ=255) cAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTCCGTGCCATGACCTCCGACCCGGAGAACCGTGTGCCGCACCTGGCATTccagc > 8:272253/1‑149 (MQ=255) ttgctgcCGGCTCCACCTTGTTTTTGTGTGCTTGCGCGTGTTTGGTGCCTACCTTTTCGTCTGTGGTCTGCTACCTGGTCGACGTGTTCAGGGCCATGACCTCCGACCCGGAGAATTGTGTGCCTCACCTGGTATTTCAGCCAGACTCg < 8:259887/148‑1 (MQ=255) tgcCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGa > 8:168280/1‑42 (MQ=255) tgcCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGa < 7:168280/42‑1 (MQ=255) | GGTTACCGCATCAAGCACCTGGGCGTGGCGCGTCGCACCGCCGAAGGTATCGAGTTGCGCGTGCACCCGACGCTGATCCCGGCCGACCGTCTGATCGCCAACGTCAACGGCGTGATGAACGCTGTCATGGTCAACGGTGATGCTGCCGGCTCCACCCTGTACTACGGTGCTGGCGCGGGTATGGAGCCTACCGCTTCGTCAGTGGTCGGCGACCTGGTCGACGTGGTCCGTGCCATGACCTCCGACCCGGAGAACCGTGTGCCGCACCTGGCATTCCAGCCAGACTCG > NC_002947/1675554‑1675841 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |