New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4956389 | 52 (0.810) | 4 (0.070) | 4/244 | NT | 7.5% | coding (366/1374 nt) | fliI | flagellum‑specific ATP synthase |
? | NC_002947 | = 4956435 | 49 (0.800) | coding (320/1374 nt) | fliI | flagellum‑specific ATP synthase |
CGACGGTAAGCAGGCCGTTGATACTGCGAATGCCCACATCCAACGGCTTGCTGATAGGGTCGCGGTTGAGCGGGTTGATCACCGGGCCGTCCATCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCCGCCGTCATCCAGCGGCACGACCCGGGCCCCCGGCGCGATGCCGACGATACTGCCCACCGGCATCAGAAACACCTTGGGCCCGGCAAAGCCCATGACTTCGG > NC_002947/4956241‑4956537 | cGACGGTAAGCAGGCCGTTGATACTGCGAATGCCCACATCCAACGGCTTGCTGATAGGGTCGCGGTTGAGCGGGTTGATCACCGGGCCGTCCATCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCG > 5:234753‑M1/1‑149 (MQ=255) cGGTAAGCAGGCCGTTGATACTGCGAATGCCCACATCCAACGGCTTGCTGATAGGGTCGCGGTTGAGCGGGTTGATCACCGGGCCGTCCATCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCg < 5:182280/149‑1 (MQ=255) ggTAAGCAGGCCGTTGATACTGCGAATGCCCACATCCAACGGCTTGCTGATAGGGTCGCGGTTGAGCGGGTTGATCACCGGGCCGTCCATCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGt < 7:202050/149‑1 (MQ=255) tAAGCAGGCCGTTGATACTGCGAATGCCCACATCCAACGGCTTGCTGATAGGGTCGCGGTTGAGCGGGGTGATCACCGGGCCGTCCATCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCg < 8:170355/149‑1 (MQ=255) gTTGATACTGCGAATGCCCACATCCAACGGCTTGCTGATAGGGTCGCGGTTGAGCGGGTTGATCACCGGGCCGTCCATCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGc > 4:33472/1‑149 (MQ=255) gTTGATACTGCGAATGCCCACATCCAACGGCTTGCTGATAGGGTCGCGGTTGAGCGGGTTGATCACCGGGCCGTCCATCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGc > 8:225396/1‑149 (MQ=255) aTGCCCACATCCAACGGCTTGCTGATAGGGTCGCGGTTGAGCGGGTTGATCACCGGGCCGTCCATCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCAt > 3:11243/1‑149 (MQ=255) ccACATCCAACGGCTTGCTGATAGGGTCGCGGTTGAGCGGGTTGATCACCGGGCCGTCCATCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCCCCCGGCCCAGCATGCTCATGcc > 4:26886/1‑148 (MQ=255) ccACATCCAACGGCTTGCTGATAGGGTCGCGGTTGAGCGGGTTGATCACCGGGCCGTCCATCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCAcc > 8:248926/1‑128 (MQ=255) ccACATCCAACGGCTTGCTGATAGGGTCGCGGTTGAGCGGGTTGATCACCGGGCCGTCCATCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCAcc < 7:248926/128‑1 (MQ=255) ccACATCCAACGGCTTGCTGATAGGGTCGCGGTTGAGCGGGTTGATCACCGGGCCGTCCATCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGcc > 5:326271/1‑148 (MQ=255) cacaTCCAACGGCTTGCTGATAGGGTCGCGGTTGAGCGGGTTGATCACCGGGCCGTCCATCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCa < 3:193852/149‑1 (MQ=255) acaTCCAACGGCTTGCTGATAGGGTCGCGGTTGAGCGGGTTGATCACCGGGCCGTCCATCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCCTCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCAt < 5:243571/149‑1 (MQ=255) acaTCCAACGGCTTGCTGATAGGGTCGCGGTTGAGCGGGTTGATCACCGGGCCGTCCATCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCAt < 7:225396/149‑1 (MQ=255) atgcAACGGCTTGCTGATAGGGTCGCGGTTGAGCGGGTTGATCACCGGGCCGTCCATCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATgg < 6:93533/146‑1 (MQ=255) ccAACGGCTTGCTGATAGGGTCGCGGTTGAGCGGGTTGATCACCGGGCCGTCCATCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATggg > 5:251246/1‑148 (MQ=255) ccAACGGCTTGCTGATAGGGTCGCGGTTGAGCGGGTTGATCACCGGGCCGTCCATCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATggg > 6:168583/1‑148 (MQ=255) cAACGGCTTGCTGATAGGGTCGCGGTTGAGCGGGTTGATCACCGGGCCGTCCATCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCCTCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCa < 4:11243/149‑1 (MQ=255) cAACGGCTTGCTGATAGGGTCGCGGTTGAGCGGGTTGATCACCGGGCCGTCCATCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGct > 2:213443/1‑148 (MQ=255) ttGCTGATAGGGTCGCGGTTGAGCGGGTTGATCACCGGGCTGTCCATCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCc < 1:51844‑M2/149‑2 (MQ=255) tGATAGGGTCGCGGTTGAGCGGGTTGATCACCGGGCCGTCCATCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCcgccg < 3:340681‑M2/149‑6 (MQ=255) aTAGGGTCGCGGTTGAGCGGGTTGATCACCGGGCCGTCCATCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCCGCCGt > 7:9494/1‑148 (MQ=255) aTAGGGTCGCGGTTGAGCGGGTTGATCACCGGGCCGTCCATCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCCGCCGt > 8:137487/1‑148 (MQ=255) gcgGTTGAGCGGGTTGATCACCGGGCCGTCCATCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCCGCCGTCATCCAGCg < 6:104023/149‑1 (MQ=255) gTTGAGCGGGTTGATCACCGGGCCATCCATCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCCGCCGTCATCCAGCGGCa < 6:235210/149‑1 (MQ=255) ggTTGTTCTCCGGGCCGTCCATCGGCAACCTGTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCCGCCGTCATCCAGCGGCACGACCCgg < 8:256740/149‑1 (MQ=255) ggTTGATCACCGGGCCGTCCATCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATg < 5:91041/107‑1 (MQ=255) ggTTGATCACCGGGCCGTCCATCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATg > 6:91041/1‑107 (MQ=255) ggTTGATCACCGGGCCGTCCATCGGCACCCACTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCCGCCGTCATCCAGCGGCACGACCCgg > 1:251693/1‑149 (MQ=255) tCACCGGGCCGTCCATCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCCGCCGTCATCCAGCGGCACGACCCGGGccccc > 2:292386/1‑149 (MQ=255) tCACCGGGCCGTCCATCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCAGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGACGTCGAGCACCCGGCCCAGCAAGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCCGCCGTCATCCAGCGGCACGACCCGGGccccc > 2:213305/1‑149 (MQ=255) aCCGGGCCGTCCATCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCCGCCGTCATCCAGCGGCACGACCCGGGCCCCCg < 6:251246/148‑1 (MQ=255) cGGGCCGTCCATCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCCGCCGTCATCCAGCGGCACGACCCGGGCCCCCGgcg > 1:87825/1‑149 (MQ=255) gggCCGTCCATCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCCGCCGTCATCCAGCGGCACGACCCGGGCCCCCGgcgc < 8:9494/149‑1 (MQ=255) gggCCGTCCATCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCCGCCGTCATCCAGCGGCACGACCCGGGCCCCCGgcgc < 3:26886/149‑1 (MQ=255) cGTCCATCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGgccgtctgcccatgggcatgagcatgctgggccgggtgctcgacggcgccggccgtgc > 3:149420‑M1/1‑62 (MQ=255) cGTCCATCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGgccgtctgcccatgggcatgagcatgctgggccgggtgctcgacggcgccggccgtgc < 4:149420‑M1/120‑59 (MQ=255) ccATCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCCGCCGTCATCCAGCGGCACGACCCGGGCCCCCGGCGCGATGcc > 6:62441/1‑148 (MQ=255) ccATCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCCGCCGTCATCCAGCGGCACGACCCGGGCCCCCGGCGCGATGCcg < 7:137487/149‑1 (MQ=255) aTCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCCGCCGTCATCCAGCGGCACGACCCGGGCCCCCGGCGCGATGCcgac > 2:216626/1‑149 (MQ=255) aTCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCCGCCGTCATCCAGCGGCACGACCCGGGCCCCCGGCGCGATGCcgac > 2:22522/1‑149 (MQ=255) ccAGTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCCGCCGTCATCCAGCGGCACGACCCGGGCCCCCGGCGCGATGCCGACGATACTGc > 8:319421/1‑149 (MQ=255) tCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCCGCCGTCATCCAGCGGCACGACCCGGGCCCCCGGCGCGATGCCGACGATACTGccccc > 2:338287/1‑147 (MQ=255) cTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCCGCCGTCATCCAGCGGCACGACCCGGGCCCCCGGCGCTATGCCGACGATACTGCCCAcc < 6:326271/148‑1 (MQ=255) cTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCCGCCGTCATCCAGCGGCACGACCCGGGCCCCCGGCGCGATGCCGACGATACTGCCCACCg > 3:250339/1‑149 (MQ=255) tCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGgccgtctgcccatgggcatgagcatgctgggccgggtgctcgacggcgccggccg > 5:143224‑M1/1‑42 (MQ=255) tCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGgccgtctgcccatgggcatgagcatgctgggccgggtgctcgacggcgccggccg < 6:143224‑M1/97‑56 (MQ=255) ccTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCCGCCGTCATCCAGCGGCACGACCCGGGCCCCCGGCGCGATGCCGACGATACTGCCCACCGGCATc < 4:340681/149‑1 (MQ=255) cATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGGGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCCGCCGTCATCCAGCGGCACGACCCGGGCCCCCGGCGCGATGCCGACGATACTGCCCACCg < 5:355476/140‑1 (MQ=255) cATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCCGCCGTCATCCAGCGGCACGACCCGGGCCCCCGGCGCGATGCCGACGATACTGCCCACCg > 6:355476/1‑140 (MQ=255) cATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCCGCCGTCATCCAGCGGCACGACCCGGGCCCCCGGCGCGATGCCGACGATACTGCCCACCGGCATCAGa < 1:216626/148‑1 (MQ=255) aTCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCCGCCGTCATCCAGCGGCACGACCCGGGCCCCCGGCGCGATGCCGACGATACTGCCCACCGGCATCAGaaa < 5:62441/149‑1 (MQ=255) aTCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCCGCCGTCATCCAGCGGCACGACCCGGGCCCCCGGCGCGATGCCGACGATACTGCCCACCGGCATCAGaa < 8:353749/148‑1 (MQ=255) tCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCCGCCGTCATCCAGCGGCACGACCCGGGCCCCCGGCGCGATGCCGACGATACTGCCCACCGGCATCAGAAac < 7:319421/149‑1 (MQ=255) ccGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCCGCCGTCATCCAGCGGCACGACCCGGGCCCCCGGCGCGATGCCGACGATACTGCCCACCGGCATCAGAAacac > 1:173742/1‑149 (MQ=255) ccTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCCGCCGTCATCCAGCGGCACGACCCGGGCCCCCGGCGCGATGCCGACGATACTGCCCACCGGCATCAGAAACACCTTg > 5:380921/1‑149 (MQ=255) cTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCCGCCGTCATCCAGCGGCACGACCCGGGCCCCCGGCGCGATGCCGACGATACTGCCCACCGGCATCAGAAACACCTTgg < 2:173742/149‑1 (MQ=255) ccATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCCGCCGTCATCCAGCGGCACGACCCGGGCCCCCGGCGCGATGCCGACGATACTGCCCACCGGCATCAGAAACACCTTGGGcc < 3:33472/148‑1 (MQ=255) gcACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCcgccggccgtgcgctggatggcaagggcgggatgaaggccgaggactgggtgccgatggacg > 3:149420‑M2/1‑58 (MQ=255) gcACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCcgccggccgtgcgctggatggcaagggcgggatgaaggccgaggactgggtgccgatggacg < 4:149420‑M2/120‑63 (MQ=255) cggccggcGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCcgccggccgtgcgctggatggcaagggcgggatgaaggccga > 5:143224‑M2/1‑55 (MQ=255) cggccggcGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCcgccggccgtgcgctggatggcaagggcgggatgaaggccga < 6:143224‑M2/97‑43 (MQ=255) cggccggcGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCCGCCGTCATCCAGCGGCACGACCCGGGCCCCCGGCGCGATGCCGACGATACTGCCCACCGGCATCAGAAACACCTTGGGCCCGGCAAAGCCCAt < 2:87825/149‑1 (MQ=255) cggccggcGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCCGCCGTCATCCAGCGGCACGACCCGGGCCCCCGGCGCGATGCCGACGATACTGCCCACCGGCATCAGAAACACCTTGGGCCCGGCAAAGCCCAt < 4:250339/149‑1 (MQ=255) gccggcGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCCGCCGTCATCCAGCGGCACGACCCGGGCCCCCGGCGCGATGCCGACGATACTGCCCACCGGCATCAGAAACACCTTGGGCCCGGCAAAGCCCATg > 4:150279/1‑148 (MQ=255) cggcggccgtctgcccatgggcatgagcatgctgggccgggtgctcgacggcgccggccgtgcgctggatggcaagggcgggatgaaggccgaggactgggtgccgatggacggcccggtgatcaacccgctcaaccgcgaccctatca < 3:340681‑M1/149‑145 (MQ=255) ggccgtctgcccatgggcatgagcatgctgggccgggtgctcgacggcgccggccgtgcgctggatggcaagggcgggatgaaggccgaggactgggtgccgatggacagcccggtgatcaacccgctcaaccgcgaccctatcagcaa < 1:51844‑M1/149‑149 (MQ=255) | CGACGGTAAGCAGGCCGTTGATACTGCGAATGCCCACATCCAACGGCTTGCTGATAGGGTCGCGGTTGAGCGGGTTGATCACCGGGCCGTCCATCGGCACCCAGTCCTCGGCCTTCATCCCGCCCTTGCCATCCAGCGCACGGCCGGCGCCGTCGAGCACCCGGCCCAGCATGCTCATGCCCATGGGCAGACGGCCGCCGTCATCCAGCGGCACGACCCGGGCCCCCGGCGCGATGCCGACGATACTGCCCACCGGCATCAGAAACACCTTGGGCCCGGCAAAGCCCATGACTTCGG > NC_002947/4956241‑4956537 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |