New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5864720 = | 77 (1.200) | 4 (0.070) | 4/238 | NT | 5.7% | coding (1431/2253 nt) | cadA‑III | cadmium translocating P‑type ATPase |
? | NC_002947 | 5864769 = | 59 (0.980) | coding (1382/2253 nt) | cadA‑III | cadmium translocating P‑type ATPase |
GTAGACCTCACCGGCAATGACGCCACGCACGCCACGCCCGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTC‑AAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCA > NC_002947/5864573‑5864868 | gTAGACCTCACCGGCAATGACGCCACGCACGCCACGCCCGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTC‑AAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGgccg > 8:189142/1‑149 (MQ=255) gTAGACCTCACCGGCAATGACGCCACGCACGCCACGCCCGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTC‑AAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGgccg > 6:394668/1‑149 (MQ=255) gTAGACCTCACCGGCAATGACGCCACGCACGCCACGCCCGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTC‑AAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGgccg > 4:191294/1‑149 (MQ=255) tAGACCTCACCGGCAATGACGCCACGCACGCCACGCCCGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTC‑AAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGgccgc > 3:106228/1‑149 (MQ=255) gACCTCACCGGCAATGACGCCACGCACGCCACGCCCGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTC‑AAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCa < 4:106228/149‑1 (MQ=255) gACCTCACCGGCAATGACGCCACGCACGCCACGCCCGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTC‑AAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCa < 4:127045/149‑1 (MQ=255) aCCTCACCGGCAATGACGCCACGCACGCCACGCCCGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTC‑AAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCaa < 4:235755/149‑1 (MQ=255) cTCACCGGCAATGACGCCACGCACGCCACGCCCGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTC‑AAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAgg < 7:189142/149‑1 (MQ=255) cTCACCGGCAATGACGCCACGCACGCCACGCCCGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTC‑AAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAgg < 6:119951/149‑1 (MQ=255) tCACCGGCAATGACGCCACGCACGCCACGCCCGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTC‑AAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGc > 1:235955/1‑149 (MQ=255) catcgtcagtggcctggccgccgccgcgcgcaaaggcatcctgatcaagggtggcgtgtacctggagggtggccgccaccttgatttcctggccctggacaagaccggcaccatcacccatggcaagccggtgcagaccgaCGcc > 3:205378‑M1/142‑145 (MQ=255) catcgtcagtggcctggccgccgccgcgcgcaaaggcatcctgatcaagggtggcgtgtacctggagggtggccgccaccttgatttcctggccctggacaagaccggcaccatcacccatggcaagccggtgcagaccgaCGcc < 4:205378‑M1/4‑1 (MQ=255) catcgtcagtggcctggccgccgccgcgcgcaaaggcatcctgatcaagggtggcgtgtacctggagggtggccgccaccttgatttcctggccctggacaacaccggcaccatcacccatggcaagccggtgcagaccgaCGCCAAgg < 8:89469‑M1/8‑1 (MQ=255) aCCGGCAATGACGCCACGCACGCCACGCCCGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTCGAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCt > 1:323551/1‑149 (MQ=255) aCCGGCAATGACGCCACGCACGCCACGCCCGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTC‑AAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCtt < 1:374738/149‑1 (MQ=255) aCCGGCAATGACGCCACGCACGCCACGCCCGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTC‑AAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCtt > 2:374738/1‑149 (MQ=255) ccGGCAATGACGCCACGCACGCCACGCCCGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTC‑AAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTg > 7:364248/1‑149 (MQ=255) ccGGCAATGACGCCACGCACGCCACGCCCGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTC‑AAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTg < 5:174443/149‑1 (MQ=255) 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cacgcacgccacgcCCGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTC‑AAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTc > 4:203462/1‑148 (MQ=255) cgcacgccacgcCCGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTC‑AAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGaa < 6:85550/149‑1 (MQ=255) gccacgccCGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTC‑AAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAgcg < 1:368556/149‑1 (MQ=255) cccGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTC‑AAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCa < 2:323551/149‑1 (MQ=255) cccGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTC‑AAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCa > 5:128084/1‑149 (MQ=255) cccGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTC‑AAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGACTGgccgcc < 4:268279/115‑1 (MQ=255) cccGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTC‑AAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGACTGgccgcc > 3:268279/1‑115 (MQ=255) aGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTC‑AAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCtt < 3:203462/149‑1 (MQ=255) gcgcAACGAAGTCACTGACCTCGCTC‑AAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTg < 3:191294/149‑1 (MQ=255) gcAACGAAGTCACTGACCTCGCTC‑AAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCTAGCACCTTGGc < 1:15737/149‑1 (MQ=255) ctgatcaagggtggcgtgtacctggagggtggccgccaccttgatttcctggccctggacaagaccggcaccatcacccatggcaagccggtgcagaccgaCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTgg > 6:332936‑M1/102‑148 (MQ=255) 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acCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTggcg > 6:289313/1‑149 (MQ=255) ccGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTggcgg > 4:348903/1‑149 (MQ=255) cGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTggcggc > 7:324493/1‑149 (MQ=255) ccGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTcc < 7:136718/149‑1 (MQ=255) cGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCa < 6:128084/149‑1 (MQ=255) gCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCCCCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCACGGTGGCGGCCCCCCTCCAGGTac > 8:103115/1‑149 (MQ=255) cTCGCCCAGGCTGGCCGCCACGGCTTGCGCCCGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGGCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGGGATGGGGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGACATCACGGTGGCGGCCACCCTCCCGGGacc > 7:43263/1‑148 (MQ=255) tCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTTGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTacac > 7:304776/1‑149 (MQ=255) tCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTacac > 6:55531/1‑149 (MQ=255) gCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCACGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGc > 4:105634/1‑149 (MQ=255) gCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCAcc < 5:83324/135‑1 (MQ=255) gCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCAcc > 6:83324/1‑135 (MQ=255) gCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTacac < 4:19613/147‑1 (MQ=255) aGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGGAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCAcc < 3:360009/149‑1 (MQ=255) gCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCt < 2:301886/149‑1 (MQ=255) tGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCaa < 6:238332/114‑1 (MQ=255) tGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCaa > 5:238332/1‑114 (MQ=255) tGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCtt > 1:175442/1‑148 (MQ=255) ccgccAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATc < 6:134569/149‑1 (MQ=255) ccgccAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATc < 2:235955/149‑1 (MQ=255) CGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCa > 7:151795‑M1/1‑149 (MQ=255) | GTAGACCTCACCGGCAATGACGCCACGCACGCCACGCCCGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTC‑AAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTACACGCCACCCTTGATCA > NC_002947/5864573‑5864868 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |