New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 6121243 | 40 (0.630) | 3 (0.050) | 3/242 | NT | 6.2% | coding (907/1386 nt) | PP_5371 | rubredoxin/rubredoxin reductase |
? | NC_002947 | = 6121266 | 52 (0.850) | coding (884/1386 nt) | PP_5371 | rubredoxin/rubredoxin reductase |
GCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGTCTGTAGTTGTGCGTCGACCTTGATCCCGCGGCCACAGTCCAGGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCAAGGTTGGGGCGCAAGCCCACTGCACTGAGCACCAGGTCTGCACCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAGTCGGTAGCCTTCGCCGTCCGGCTCGATGCACTGCAAGGTCGTGCGCAGGCTCCATTGCACCCCCAACCCCGATAGCGCTTGCTGCAAGTGCTGGCCTGCCGCCTCGGGCAGCAGGCGTTCCATG > NC_002947/6121103‑6121391 | gCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGTCTGTAGTTGTGCGTCGACCTTGATCCCGCGGCCACAGTCCAGGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCAAGGTTGGGGCGCAAGCCCACTGCACTGAGCACCAGGTCTGCACCGACGACCTGa < 2:60659/148‑1 (MQ=255) ccAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGTCTGTAGTTGTGCGTCGACCTTGATCCCGCGGCCACAGTCCAGGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCAAGGTTGGGGCGCAAGCCCACTGCACTGAGCACCAGGTCTGCACCGACGACCTGACCg > 1:216715/1‑149 (MQ=255) aGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGTCTGTAGTTGTGCGTCGACCTTGATCCCGCGGCCACAGTCCAGGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCAAGGTTGGGGCGCAAGCCCACTGCACTGAGCACCAGGTCTGCACCGACGACCTGACCGTCg < 5:74038/149‑1 (MQ=255) cccGGTTGTGAGGTCTGTAGTTGTGCGTCGACCTTGATCCCGCGGCCACAGTCCAGGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCAAGGTTGGGGCGCAAGCCCACTGCACTGAGCACCAGGTCTGCACCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAg < 8:262240‑M2/149‑2 (MQ=255) gtgAGGTCTGTAGTTGTGCGTCGACCTTGATCCCGCGGCCACAGTCCAGGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCAAGGGTGGGGCGCAAGCCCACTGCACTGAGCACCAGGTCTGCACCGACtgacccttgccgacggtcaggtcgtcggtg < 3:224000‑M1/148‑31 (MQ=255) cTGTAGTTGTGCGTCGACCTTGATCCCGCGGCCACAGTCCAGGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCAAGGTTGGGGCGCAAGCCCACTGCACTGAGCACCAGGTCTGCACCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAGTCGGTAGCCTTCGc > 5:243572/1‑149 (MQ=255) tAGTTGTGCGTCGACCTTGATCCCGCGGCCACAGTCCAGGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCAAGGTTGGGGCGCAAGCCCACTGCACTGAGCACCAGGTCTGCACCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAGTCGGTAGCCTTCGCCGt > 7:246749/1‑149 (MQ=255) gTTGTGCGTCGACCTTGATCCCGCGGCCACAGTCCAGGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCAAGGTTGGGGCGCAAGCCCACTGCACTGAGCACCAGGTCTGCACCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAGTCGGTAGCCTTCGCCGTcc > 8:358132/1‑149 (MQ=255) gTCGACCTTGATCCCGCGGCCACAGTCCAGGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCAAGGTTGGGGCGCAAGCCCACTGCACTGAGCACCAGGTCTGCACCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAGTCGGTAGCCTTCGCCGTCCGGCTCGa > 4:33440/1‑149 (MQ=255) gTCGACCTTGATCCCGCGGCCACAGTCCAGGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCAAGGTTGGGGCGCAAGCCCACTGCACTGAGCACCAGGTCTGCACCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAGTCGGTAGCCTTCGCCGTCCGGCTCGa > 7:334753/1‑149 (MQ=255) tCCCGCGGCCACAGTCCAGGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCAAGGTTGGGGCGCAAGCCCACTGCACTGAGCACCAGGTCTGCACCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAGTCGGTAGCCTTCGCCGTCCGGCTCGATGCACTGCAAg > 4:367441/1‑149 (MQ=255) ccGCGGCCACAGTCCAGGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCAAGGTTGGGGCGCAAGCCCACTGCACTGAGCACCAGGTCTGCACCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAGTCGGTAGCCTTCGCCGTCCGGCTCGa < 8:77974/136‑1 (MQ=255) ccGCGGCCACAGTCCAGGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCAAGGTTGGGGCGCAAGCCCACTGCAATGAGCACCAGGTCTGCACCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAGTCGGTAGCCTTCGCCGTCCGGCTCGa > 7:77974/1‑136 (MQ=255) gCCACAGTCCAGGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCAAGGTTGGGGCGCAAGCCCACTGCACTGAGCACCAGGTCTGCACCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAGTCGGTAGCCTTCGCCGTCCGGCTCGATGCACTGCAAGGTCGTgc < 3:367441/149‑1 (MQ=255) ccACAGTCCAGGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCAAGGTTGGGGCGCAAGCCCACTGCACTGAGCACCAGGTCTGCACCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAGTCGGTAGCCTTCGCCGTCCGGCTCGATGCACTGCAAGGTCGTgcg > 6:361385/1‑149 (MQ=255) cacaGTCCAGGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCAAGGTTGGGGCGCAAGCCCACTGCACTGAGCACCAGGTCTGCACCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAGTCGGTAGCCTTCGCCGTCCGGCTCGATGCACTGCAAGGTCGTgcg > 6:207785/1‑148 (MQ=255) aGTCCAGGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCAAGGTTGGGGCGCAAGCCCACTGCACTGAGCACCAGGTCTGCACCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAGTCGGTAGCCTTCGCCGTCCGGCTCGATGCACTGCAAGGTCGTGCGCAgg < 8:246749/149‑1 (MQ=255) tCCAGGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCAAGGTTGGGGCGCAAGCCCACTGCACTGAGCACCAGGTCTGCACCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAGTCGGTAGCCTTCGCCGTCCGGCTCGATGCACTGCAAGGTCGTGCGCAGGCt > 5:80148/1‑149 (MQ=255) cGGCTTCCAGCGCCAGCTCAAGGTTGGGGCGCAAGCCCACTGCACTGAGCACCAGGTCTGCACCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAGTCGGTAGCCTTCGCCGTCCGGCTCGATGCACTGCAAGGTCGTGCGCAGGCTcc < 4:280151/144‑1 (MQ=255) cGGCTTCCAGCGCCAGCTCAAGGTTGGGGCGCAAGCCCACTGCACTGAGCACCAGGTCTGCACCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAGTCGGTAGCCTTCGCCGTCCGGCTCGATGCACTGCAAGGTCGTGCGCAGGCTcc > 3:280151/1‑144 (MQ=255) ttCCAGCGCCAGCTCAAGGTTGGGGCGCAAGCCCACTGCACTGAGCACCAGGTCTGCACCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAGTCGGTAGCCTTCGCCGTCCGGCTCGATGCACTGCAAGGTCGTGCGCAGGCTCCATTGCAccc > 6:156596/1‑149 (MQ=255) cAGCGCCAGCTCAAGGTTGGGGCGCAAGCCCACTGCACTGAGCACCAGGTCAGCACCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAGTCGGTAGCCTTCGCCGTCCGGCTCGATGCACTGCAAGGTCGAGCGCAGGCACCATTGCAccccc > 6:425044/1‑148 (MQ=255) aGCGCCAGCTCAAGGTTCGGGCGCAAGCCCACTGCACTGAGCACCAGGTCTGCACCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAGTCGGTAGCCTTCGCCGTCCGGCTCGATGCACTGCAAGGTCGTGCGCAGGCTCCATTGCACCCCCaa > 7:38379/1‑149 (MQ=255) gcCAGCTCAAGGTTGGGGCGCAAGCCCACTGCACTGAGCACCAGGTCTGCACCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAGTCGGTAGCCTTCGCCGTCCGGCTCGATGCACTGCAAGGTCGTGCGCAGGCTCCATTGCACCCCCAAccc < 5:54914/149‑1 (MQ=255) cTCAAGGTTGGGGCGCAAGCCCACTGCACTGAGCACCAGGTCTGCACCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAGTCGGTAGCCTTCGCCGTCCGGCTCGATGCACTGCAAGGTCGTGCGCAGGCTCCATTGCACCCCCAACCCCGATa < 7:262240/149‑1 (MQ=255) aaGGTTGGGGCGCAAGCCCACTGCACTGAGCACCAGGTCTGCACCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAGTCGGTAGCCTTCGCCGTCCGGCTCGATGCACTGCAAGGTCGTGCGCAGGCTCCATTGCACCCCCAACCCCGATAgcg > 1:110209/1‑149 (MQ=255) aaGGTTGGGGCGCAAGCCCACTGCACTGAGCACCAGGTCTGCACCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAGTCGGTAGCCTTCGCCGTCCGGCTCGATGCACTGCAAGGTCGTGCGCAGGCTCCATTGCACCCCCAACCCCGATAgc < 2:229812/148‑1 (MQ=255) aGGTTGGGGCGCAAGCCCACTGCACTGAGCACCAGGTCTGCACAGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAGTCGGTAGCCTTCGCCGTCCGGCTGGATGCACTGCAAGGTCGTGCGCAGGCTCCATTGCACCCCCAACCCCGATAgcgc < 6:243572/149‑1 (MQ=255) ggTTGGGGCGCAAGCCCACTGCACTGAGCACCAGGTCTGCACCGACtgacccttgccgacggtcaggtcgtcggtgca < 1:310062‑M1/78‑33 (MQ=255) ggTTGGGGCGCAAGCCCACTGCACTGAGCACCAGGTCTGCACCGACtgacccttgccgacggtcaggtcgtcggtgca > 2:310062‑M1/1‑46 (MQ=255) gcAAGCCCACTGCACTGAGCACCAGGTCTGCACCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAGTCGGTAGCCTTCGCCGTCCGGCTCGATGCACTGCAAGGTCGTGCGCAGGCTCCATTGCACCCCCAACCCCGATAGCGCTTGCTGCAAg < 2:110209/149‑1 (MQ=255) gcAAGCCCACTGCACTGAGCACCAGGTCTGCACCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAGTCGGTAGCCTTCGCCGTCCGGCTCGATGCACTGCAAGGTCGTGCGCAGGCTCCATTGCACCCCCAACCCCGATAGCGCTTGCTGCAAg < 5:228083/149‑1 (MQ=255) cactgcactgAGCACCAGGTCTGCACCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAGTCGGTAGCCTTCGCCGTCCGGCTCGATGCACTGCAAGGTCGTGCGCAGGCTCCATTGCACCCCCAACCCCGATAGCGCTTGCTGCAAGTGCTGGc > 2:111592/1‑149 (MQ=255) actgcactgAGCACCAGGTCTGCACCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAGTCGGTAGCCTTCGCCGTCCGGCTCGATGCACTGCAAGGTCGTGCGCAGGCTCCATTGCACCCCCAACCCCGATAGCGCTTGCTGCAAGTGCTGGcc > 2:393274/1‑149 (MQ=255) tgcactgAGCACCAGGTCTGCACCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAGTCGGTAGCCTTCGCCGTCCGGCTCGATGCACTGCAAGGTCGTGCGCAGGCTCCATTGCACCCCCAACCCCGATAGCGCTtgctg > 7:253342/1‑135 (MQ=255) tgcactgAGCACCAGGTCTGCACCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAGTCGGTAGCCTTCGCCGTCCGGCTCGATGCACTGCAAGGTCGTGCGCAGGCTCCATTGCACCCCCAACCCCGATAGCGCTtgctg < 8:253342/135‑1 (MQ=255) cACCAGGTCTGCACCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAGTCGGTAGCCTTCGCCGTCCGGCTCGATGCACTGCAAGGTCGTGCGCAGGCTCCATTGCACCCCCAACCCCGATAgcgc > 7:89267/1‑120 (MQ=255) cACCAGGTCTGCACCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAGTCGGTAGCCTTCGCCGTCCGGCTCGATGCACTGCAAGGTCGTGCGCAGGCTCCATTGCACCCCCAACCCCGATAgcgc < 8:89267/120‑1 (MQ=255) cACCAGGTCTGCACCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAGTCGGTAGCCTTCGCCGTCCGGCTCGATGCACTGCAAGGTCGTGCGCAGGCTCCATTGCACCCCCAACCCCGATAGCGCTTGCTGCAAGTGCTGGCCTGCCGCCTCgg > 8:109892/1‑149 (MQ=255) tGCACCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAgtcggtgcagacctggtgctcagtgcagtgggcttgcgccccaacc > 2:310062‑M2/1‑32 (MQ=255) tGCACCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAgtcggtgcagacctggtgctcagtgcagtgggcttgcgccccaacc < 1:310062‑M2/78‑47 (MQ=255) cACCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAgtcggtgcagacctggtgctcagtgcagtgggcttgcgccccacccttgagctggcgctggaagccggcctggactgtggccgcgggatcaaggtcgacgcacaactacagacctcac < 3:224000‑M2/148‑119 (MQ=255) cACCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAGTCGGTAGCCTTCGCCGTCCGGCTCGATGCACTGCAAGGTCGTGCGCAGGCTCCATTGCACCCCCAACCCCGATAGCGCTTGCTGCAAGTGCTGGCCt < 7:311439/128‑1 (MQ=255) cACCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAGTCGGTAGCCTTCGCCGTCCGGCTCGATGCACTGCAAGGTCGTGCGCAGGCTCCATTGCACCCCCAACCCCGATAGCGCTTGCTGCAAGTGCTGGCCt > 8:311439/1‑128 (MQ=255) cACCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAGTCGGTAGCCTTCGCCGTCCGGCTCGATGCACTGCAAGGTCGTGCGCAGGCTCCATTGCACCCCCAACCCCGATAGCGCTTGCTGCAAGTGCTGGCCTGCCGCCTCGGGCAGCCGGCGt > 6:330457/1‑149 (MQ=255) aCCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAGTCGGTAGCCTTCGCCGTCCGGCTCGATGCACTGCAAGGTCGTGCGCAGGCTCCATTGCACCCCCAACCCCGATAGCGCTtgctgc > 6:73686/1‑115 (MQ=255) aCCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAGTCGGTAGCCTTCGCCGTCCGGCTCGATGCACTGCAAGGTCGTGCGCAGGCTCCATTGCACCCCCAACCCCGATAGCGCTtgctgc < 5:73686/115‑1 (MQ=255) cgacgaCCTGACCGTCGGCAAGGGTCAGTCGGTAGCCTTCGGCGTCCGGCTCGATGCACTGCAAGGTCGTGCGCAGGCTCCATTGCACCCCCAACCCCGATAGCGCTTGCTGCAAGTGCTGGCCTGCCGCCTCGGGCAGCAGGCGTTcc < 5:361385/149‑1 (MQ=255) ctgacccttgccgacggtcaggtcgtcggtgcagacctggtgctcagtgcagtgggcttgcgccccaaccttgagctggcgctggaagccggcctggactgtggccgcgggatcaaggtcgacgcacaactacagacctcacaaccggg < 8:262240‑M1/149‑149 (MQ=255) | GCCCAAGGCATAGATGCCCGGTTGTGAGGTCTGTAGTTGTGCGTCGACCTTGATCCCGCGGCCACAGTCCAGGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCAAGGTTGGGGCGCAAGCCCACTGCACTGAGCACCAGGTCTGCACCGACGACCTGACCGTCGGCAAGGGTCAGTCGGTAGCCTTCGCCGTCCGGCTCGATGCACTGCAAGGTCGTGCGCAGGCTCCATTGCACCCCCAACCCCGATAGCGCTTGCTGCAAGTGCTGGCCTGCCGCCTCGGGCAGCAGGCGTTCCATG > NC_002947/6121103‑6121391 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |