New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 86750 = | 53 (0.830) | 6 (0.110) | 6/222 | NT | 10.9% | intergenic (‑33/+112) | PP_0075/PP_0076 | choline sulfate transporter/choline betaine‑binding protein |
? | NC_002947 | 86841 = | 52 (0.930) | intergenic (‑124/+21) | PP_0075/PP_0076 | choline sulfate transporter/choline betaine‑binding protein |
CAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGCCGCTTCATCGAAGC > NC_002947/86697‑86983 | cagTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGgt < 2:131204/149‑1 (MQ=255) atgccctggaggccgtcaaagccaaactgtaatctcacaaagcaacacaccaaCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGgt > 5:381344‑M1/54‑149 (MQ=255) tAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGgtgtg > 5:137459/1‑149 (MQ=255) agGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCttt < 2:63840/149‑1 (MQ=255) gCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTtgt < 8:193339/149‑1 (MQ=255) gATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTga < 6:137459/149‑1 (MQ=255) gATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGCGTCGCCAAGCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTga < 6:253481/149‑1 (MQ=255) cATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGAt < 7:268393/148‑1 (MQ=255) aTGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑a > 5:308469/1‑149 (MQ=255) tCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTg < 2:387191/148‑1 (MQ=255) acaATCCTTACGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCttt < 3:186767/129‑1 (MQ=255) acaATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCtt > 1:134766/1‑149 (MQ=255) acaATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCtt > 2:296695/1‑149 (MQ=255) aaTCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGAtt < 1:40403/135‑1 (MQ=255) aaTCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGAtt > 2:40403/1‑135 (MQ=255) tCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGGCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGAc > 1:101285/1‑149 (MQ=255) ccTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACg > 2:17864/1‑149 (MQ=255) ttAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTg > 3:70887/1‑110 (MQ=255) ttAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTg < 4:70887/110‑1 (MQ=255) aaGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGgtgtgt > 1:364776/1‑114 (MQ=255) aaGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGgtgtgt < 2:364776/114‑1 (MQ=255) aaGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCt > 2:87672/1‑149 (MQ=255) ggTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAg > 3:48287/1‑149 (MQ=255) gCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCa > 1:241486/1‑149 (MQ=255) gCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCAAAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTCACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAggg < 1:17864/148‑1 (MQ=255) ccAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTgg < 4:62068/128‑1 (MQ=255) ccAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTgg > 3:62068/1‑128 (MQ=255) accaaccctgtgggagcgggcgcgcccgcgaacaccggcaaagccggtgccaagcaacgcgttggctttttcgcgggcatgcccgctcccacagggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCAt > 5:381344‑M2/97‑149 (MQ=255) GGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGcc < 3:179139‑M1/149‑1 (MQ=255) GGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGcc < 3:185361‑M1/149‑1 (MQ=255) GGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTtggtg > 4:185361‑M1/1‑149 (MQ=255) GGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTtggtg > 4:179139‑M1/1‑149 (MQ=255) GGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTtggtg > 6:308469‑M1/1‑149 (MQ=255) GGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTtggtg > 2:101285‑M1/1‑149 (MQ=255) GGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTtggtg > 3:42295‑M1/1‑149 (MQ=255) GGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCGTTGCCGGTGTTCGCGCGCCCGCCCGCTCCAACAGGGGTGGTCTGTTGCTTCGTGAGATT‑ACAGTTTCGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTttgtg < 3:254586‑M1/149‑1 (MQ=255) ggcgcgcccgcgaacaccggcaaagccggtgccaagcaacgcgttggctttttcgcgggcatgcccgctcccacagggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTtggtgg > 6:311659‑M2/79‑149 (MQ=255) GCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTtggtgg < 5:337056‑M1/148‑1 (MQ=255) GCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTggtggt > 4:48287‑M1/1‑149 (MQ=255) gCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAgg < 5:409975/122‑1 (MQ=255) gCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAgg > 6:409975/1‑122 (MQ=255) ccgcgaacaccggcaaagccggtgccaagcaacgcgttggctttttcgcgggcatgcccgctcccacagggcTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTc > 3:102342‑M2/73‑149 (MQ=255) ccGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATccc > 2:85149/1‑127 (MQ=255) ccGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTcc > 8:23562/1‑149 (MQ=255) ccGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGATTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATccc < 1:85149/127‑1 (MQ=255) cgcgaacaccggcaaagccggtgccaagcaacgcgttggctttttcgcgggcatgcccgctcccacagggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCg > 8:345758‑M2/71‑149 (MQ=255) aaaaGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCaa < 1:87672/149‑1 (MQ=255) aaaaGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCaa > 2:404749/1‑149 (MQ=255) gCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAaccac > 4:123837/1‑149 (MQ=255) ccttcgcgTTGGTTGGCTCGTGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCAGAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTGCGGCCAaccacc < 4:254586/145‑1 (MQ=39) ccAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAaccacc < 2:134766/149‑1 (MQ=255) cAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑a > 5:276114/1‑83 (MQ=255) cAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑a < 6:276114/83‑1 (MQ=255) aaCGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTGTTTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑AAAGTTTGGATTTTACGGCCTCCAGGGCATCACAATCGGACTTGGGGGTAACTACGGCCAAACAccc > 8:35974/1‑148 (MQ=25) ttGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAAc > 5:193933/1‑149 (MQ=255) cTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCgg < 5:201311/111‑1 (MQ=255) cTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCgg > 6:201311/1‑111 (MQ=255) ggCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGtt > 4:37190/1‑147 (MQ=255) caagcaacgcgttggctttttcgcgggcatgcccgctcccacagggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCa < 6:381344‑M2/103‑1 (MQ=255) gCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGGTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGGACCTCCGGCCCACCACCCATCCAACCGTTCAGGATgcg > 3:309143/1‑149 (MQ=255) tttGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGtt < 1:110788/138‑1 (MQ=255) tttGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGtt > 2:110788/1‑138 (MQ=255) gtgtTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAaccac < 1:401768/118‑1 (MQ=255) gtTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAg > 4:14064/1‑149 (MQ=255) cgcgGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGcc > 6:309538/1‑149 (MQ=255) gcgggcatgcccgctcccacagggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCt > 6:12057‑M2/25‑149 (MQ=255) gcgGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCt > 2:349628/1‑149 (MQ=255) gcgGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGAAGGCATCCAGTGCATCCCCATCGGCCTtgg < 5:198036/92‑1 (MQ=255) cgGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCtt < 6:193933/149‑1 (MQ=255) cgGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCtt < 3:14064/149‑1 (MQ=255) gggCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTg < 2:241486/149‑1 (MQ=255) gggCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTg > 1:397767/1‑149 (MQ=255) ggcatgcccgctcccacagggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTgg < 5:311659‑M2/128‑1 (MQ=255) gcccgctcccacagggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGCCGCt > 5:230358‑M2/17‑149 (MQ=255) cccgctcccacagggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGCCGCtt < 7:23562‑M2/134‑1 (MQ=255) cgctcccacagggcTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGCCGCTTc < 4:102342‑M2/135‑1 (MQ=255) ccacagggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGCCGCTTCATCGaa < 1:404749‑M2/141‑1 (MQ=255) ccacagggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGCCGCTTCATCGaa < 1:349628‑M2/141‑1 (MQ=255) acagggTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGCCGCTTCATCGAAGc > 8:85908‑M2/7‑149 (MQ=255) | CAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATT‑ACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGTAACTCCGGCCAACCACCCATCCAACCGTTCAGGATGCGCTTTCACCCAGGCCTTGGCCGCTTCATCGAAGC > NC_002947/86697‑86983 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |