New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2129565 = | 73 (1.140) | 5 (0.080) | 4/252 | NT | 6.0% | coding (82/1095 nt) | PP_1888 | fimbrial protein |
? | NC_002947 | 2129602 = | 83 (1.310) | coding (45/1095 nt) | PP_1888 | fimbrial protein |
CGTTGTGCCGATCCGCGCATCGCGTGGCACATAAAGGGTGTTCAGGTCGCGGACATGGACCTTGAGGTTTGCGCTGGTCAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGAAAGACGCGGTACGGCCGTGGGTAAGGCTGCACCGCGTGAAGGTTGCTAGATACAGGTCAGGGTTTGCTGGCGATAGCCGTCGACGACGG > NC_002947/2129455‑2129746 | ctgtatctagcaaccttcacgcggtgcagccttacccacggccgtaccgcgtctttcaggacccccatgaaaaacatcaacaagacccttttccaggcgctgctcgccactCTGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCaga > 7:258060‑M1/112‑149 (MQ=255) ttGTGCCGATCCGCGCATCGCGTGGCACATAAAGGGTGTTCAGGTCGCGGACATGGACCTTGAGGTTTGCGCTGGTCAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTg < 4:247164/149‑1 (MQ=255) tgCCGATCCGCGCATCGCGTGGCACATAAAGGGTGGTCAGGTCGCGGACATGGACCTTGAGGTTGGCGCTGGTCAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGc < 5:66119/148‑1 (MQ=255) gcaaccttcacgcggtgcagccttacccacggccgtaccgcgtctttcaggacccccatgaaaaacatcaacaagacccttttccaggcgctgctcgccactCCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGa > 1:389964‑M1/103‑147 (MQ=255) gcATCGCGTGGCACATAAAGGGTGTTCAGGTCGCGGACATGGACCTTGAGGTTTGCGCTGGTCAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTg < 6:420813/149‑1 (MQ=255) acaTAAAGGGTGTTCAGGTCGCGGACATGGACCTTGAGGTTTGCGCTGGTCAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCCTGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCtg > 8:135475/1‑148 (MQ=255) acaTAAAGGGTGTTCAGGTCGCGGACATGGACCTTGAGGTTTGCGCTGGTCAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCtt > 6:169910/1‑149 (MQ=255) aTAAAGGGTGTTCAGGTCGCGGACATGGACCTTGAGGTTTGCGCTGGTCAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCg < 4:288333/124‑1 (MQ=255) aTAAAGGGTGTTCAGGTCGCGGACATGGACCTTGAGGTTTGCGCTGGTCAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCg > 3:288333/1‑124 (MQ=255) aTAAAGGGTGTTCAGGTCGCGGACATGGACCTTGAGGTTTGCGCTGGTCAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCttgt < 5:33550/149‑1 (MQ=255) aTAAAGGGTGTTCAGGTCGCGGACATGGACCTTGAGGTTTGCGCTGGTCAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCttgt > 7:179434/1‑149 (MQ=255) tAAAGGGTGTTCAGGTCGCGGACATGGACCTTGAGGTTTGCGCTGGTCAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCttgtt > 4:181514/1‑149 (MQ=255) aaaGGGTGTTCAGGTCGCGGACATGGACCTTGAGGTTTGCGCTGGTCAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGa < 5:355611/135‑1 (MQ=255) aaaGGGTGTTCAGGTCGCGGACATGGACCTTGAGGTTTGCGCTGGTCAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGa > 6:355611/1‑135 (MQ=255) aGGGTGTGCAGGTCGCGGACATGGACCTTTAGGTTTTCGCTGGTCAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGTCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGTGTCTTGTTGAt < 8:258771/149‑1 (MQ=255) gggTGTTCAGGTCGCGGACATGGACCTTGAGGTTTGCGCTGGTCAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATg > 8:250469/1‑149 (MQ=255) ggTGTTCAGGTCGCGGACATGGACCTTGAGGTTTGCGCTGGTCAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGt < 5:402046/149‑1 (MQ=255) aGGTCGCGGACATGGACCTTGAGGTTTGCGCTGGTCAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCAt < 8:70069/149‑1 (MQ=255) ggTCGCGGACATGGACCTTGAGGTTTGCGCTGGTCAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATg < 3:181514/149‑1 (MQ=255) gTCGCGGACATGGACCTTGAGGTTTGCGCTGGTCAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATgg > 6:250319/1‑149 (MQ=255) aTGGACCTTGAGGTTTGCGCTGGTCAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTg > 8:231983/1‑148 (MQ=255) aTGGACCTTGAGGTTTGCGCTGGTCAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGa < 7:250469/149‑1 (MQ=255) tGGACCTTGAGGTTTGCGCTGGTCAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGaa < 2:254897/149‑1 (MQ=255) aggACCGTGAGGTTGGCGCTGGTCAGCTGGTCGAACTCGCCGCGGGTCTGGGC‑TACCGGCATCGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCGGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGaa < 6:330932/148‑1 (MQ=255) ggACCTTGAGGTTTGCGCTGGTCAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGa > 7:265802/1‑147 (MQ=255) gACCTTGAGGTTTGCGCTGGTCAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGa > 5:378096/1‑146 (MQ=255) cTTGAGGTTTGCGCTGGTCAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTCTTACCGCCATGGCCATGGCGTTTCCAGCCGCCAATCCAAGAGTGCCGAGCACCGCATGTAAAAGGGAATTGTTCATTTTTTAAATGGGGGTCGTGAAacac > 1:95788/1‑149 (MQ=255) cTTGAGGTTTGCGCTGGTCAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCttg < 6:214318/118‑1 (MQ=255) cTTGAGGTTTGCGCTGGTCAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCttg > 5:214318/1‑118 (MQ=255) ttGAGGTTTGCGCTGGTCAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATTCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATgggg > 6:316663/1‑135 (MQ=255) ttGAGGTTTGCGCTGGTCAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATgggg < 5:316663/135‑1 (MQ=255) gAGGTTTGCGCTGGTCAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGAAAGAcgc < 5:169910/147‑1 (MQ=255) gAGGTTTGCGCTGGTCAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGGC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGAAAGAcgc < 1:128067/147‑1 (MQ=255) ccatgaaaaacatcaacaagacccttttccaggcgctgctcgccactCCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCaga < 3:108336‑M1/38‑1 (MQ=255) ccatgaaaaacatcaacaagacccttttccaggcgctgctcgccactCCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCaga > 4:108336‑M1/48‑85 (MQ=255) ggTTTGCGCTGGTCAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGAAAGACGCGGt < 3:402875/148‑1 (MQ=255) gTCAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGAAAGACGCGGTACGGCCGTggg > 4:304738/1‑148 (MQ=255) tCAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATgg > 2:79205/1‑117 (MQ=255) tCAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATgg < 1:79205/117‑1 (MQ=255) tCAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGAAAGACGCGGTACGGCCGTGGGt > 4:299073/1‑148 (MQ=255) cAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAgg < 4:109263/94‑1 (MQ=255) cAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAgg > 3:109263/1‑94 (MQ=255) cAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGAAAGACGCGGTACGGCCGTGGGt > 1:372754/1‑147 (MQ=255) cAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGAAAGACGCGGTACGGCCGTGGGt > 8:80238/1‑147 (MQ=255) aGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGttttt > 6:88785/1‑110 (MQ=255) aGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGttttt < 5:88785/110‑1 (MQ=255) gCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGAAAGACGCGGTACGGCCGTGGGTAAgg > 3:29994/1‑149 (MQ=255) ttCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGAAAGACGCGGTACGGCCGTGGGTAAGGCTg > 7:240421/1‑148 (MQ=255) 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tCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGAAAGACGCGGTACGGCCGTGGGTAAGGCTGCACCGCGt > 4:107673/1‑149 (MQ=255) cAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGAAAGACGCGGTACGGCCGTGGGTAAGGCTGCACCGCGTGaa < 7:231983/149‑1 (MQ=255) aGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGAAAGACGCGGTACGGCCGTGGGTAAGGCTGCACCGCGTGAAg < 8:240421/149‑1 (MQ=255) aGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGCGGGTCCTGAAAGACGCGGTACGGCCGTCGGTAAGGCTGCACCGCTAGAAg > 4:284441/1‑149 (MQ=255) gCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGAAAGACGCGGTACGGCCGTGGGTAAGGCTGCAcc < 1:111121/140‑1 (MQ=255) gCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGAAAGACGCGGTACGGCCGTGGGTAAGGCTGCAcc > 2:111121/1‑140 (MQ=255) gggTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGAAAGACGCGGTACGGCCGTGGGTAAGGCTGCACCGCGTGAAGGtt < 3:284441/149‑1 (MQ=255) tctggtc‑tACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGAAAGACGCGGTACGGCCGTGGGTAAGGCTGCACCGCGTGAAGGTTGCt < 8:179434/149‑1 (MQ=255) tctggtc‑tACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGCGTCCTGAAAGACGCGGTACGGCCGTGGGTAAGGCTGCACCGCGTGAAGTTTGCt < 6:355754/149‑1 (MQ=255) tcgccactctggcatggccggctgcaaacgccatggccatgccggAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGAAAGACGCGGTACGGCCGTGGGTAAGGCTGCACCGCGTGAAGGTTGc > 1:389964‑M2/46‑147 (MQ=255) 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tctggcatggccggctgcaaacgccatggccatgccggAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATgg < 3:108336‑M2/47‑1 (MQ=255) tctggcatggccggctgcaaacgccatggccatgccagAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGAAAGACGCGGTACGGCCGTGGGTAAGGCTGCACCGCGTGAAGGTTGCTAGATACAg > 7:258060‑M2/39‑149 (MQ=255) aCCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGATGATTTTTTTCTTGGGGGTCCTGAAAGACGCGGTACCGCCGTGGGTAAGGCTGCACCGCTTGAAGGTTGCTAGATACAg > 8:261783/1‑149 (MQ=255) CCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGAAAGACGCGGTACGGCCGTGGGTAAGGCTGCACCGCGTGAAGGTTGCTAGATACAgg < 1:220309‑M1/149‑1 (MQ=255) cGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGAAAGACGCGGTACGGCCGTGGGTAAGGCTg > 6:329943/1‑121 (MQ=255) cGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGAAAGACGCGGTACGGCCGTGGGTAAGGCTg < 5:329943/121‑1 (MQ=255) 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ccatggcGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGAAAGACGCGGTACGGCCGTGGGTAAGGCTGCACCGCGTGAAg < 1:372154/125‑1 (MQ=255) ccatggcGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGAAAGACGCGGTACGGCCGTGGGTAAGGCTGCACCGCGTGAAg > 2:372154/1‑125 (MQ=255) catggcGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGAAAGACGCGGTACGGCCGTGGGTAAGGCTGCACCGCGTGAAGGTTGCTAGATACAGGTCAGGGTTTg > 8:346231/1‑149 (MQ=255) tGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGAAAGACGCGGTACGGCCGTGGGTAAGGCTGCa > 6:68657/1‑105 (MQ=255) tGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGAAAGACGCGGTACGGCCGTGGGTAAGGCTGCa < 5:68657/105‑1 (MQ=255) tGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGAAAGACGCGGTACGGCCGTGGGTAAGGCTGCACCGCGTGAAGGTTGCt < 4:233659/121‑1 (MQ=255) tGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGAAAGACGCGGTACGGCCGTGGGTAAGGCTGCACCGCGTGAAGGTTGCt > 3:233659/1‑121 (MQ=255) gCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGATCATCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGAAAGACGCGGTACGGCCGTGGGTAAGGCTGCACCGCGTGAAGGTTGCTAGATACAGGTCAGGGTTTGCTGGCtata < 7:135475/148‑1 (MQ=255) aGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGAAAGACGCGGTACGGCCGTGGGTAAGGCTGCACCGCGTGAAGGTTGCTAGATACAGGTCAGGGTTTGCTGGCGATAGcc < 2:26972/149‑1 (MQ=255) ccGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGAAAGACGCGGTACGGCCGTGGGTAAGGCTGCACCGCGTGAAGGTTGCTAGATACAGGTCAGGGTTTGCt > 1:192212/1‑137 (MQ=255) ccGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGAAAGACGCGGTACGGCCGTGGGTAAGGCTGCACCGCGTGAAGGTTGCTAGATACAGGTCAGGGTTTGCt < 2:192212/137‑1 (MQ=255) cGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGAAAGACGCGGTACGGCCGTGGGTAAGGCTGCACCGCGTGAAGGTTGCTAGATACAGGTCAGGGTTTGCTGGCGATAGCCGTc < 6:398394/149‑1 (MQ=255) ccATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGAAAGACGCGGTACGGCCGTGGGTAAGGCTGCACCGCGTGAAGGTTGCTAGATACAGGTCAGGGTTTGCTGGCGATAGCCGTcgac > 7:152814/1‑149 (MQ=255) ccAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGAAAGACGCGGTATGGCCGTGGGTAAGGCTGCACCGCGTGAAGGTTGCTAGATACAGGTCAGGGTTTGCTGGCGATAGCCGTCGacgacg < 7:528/148‑1 (MQ=255) ccAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGAAAGACGCGGTACGGCCGTGGGTAAGGCTGCACCGCGTGAAGGTTGCTAGATACAGGTCAGGGTTTGCTGGCGATAGCCGTCGacgacg < 8:152814/148‑1 (MQ=255) ccAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGAAAGACGCGGTACGGCCGTGGGTAAGGCTGCACCGCGTGAAGGTTGCTAGATACAGGTCAGGGTTTGCTGGCGATAGCCGTCGACGACgg < 3:107673/149‑1 (MQ=255) ccAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGAAAGACGCGGTACGGCCGTGGGTAAGGCTGCACCGCGTGAAGGTTGCTAGATACAGGTCAGGGTTTGCTGGCGATAGCCGTCGACGACgg < 3:304738/149‑1 (MQ=255) | CGTTGTGCCGATCCGCGCATCGCGTGGCACATAAAGGGTGTTCAGGTCGCGGACATGGACCTTGAGGTTTGCGCTGGTCAGCTGTTCGAACTCGCAGCGGGTCTGGTC‑TACCGGCATGGCCATGGCGTTTGCAGCCGGCCATGCCAGAGTGGCGAGCAGCGCCTGGAAAAGGGTCTTGTTGATGTTTTTCATGGGGGTCCTGAAAGACGCGGTACGGCCGTGGGTAAGGCTGCACCGCGTGAAGGTTGCTAGATACAGGTCAGGGTTTGCTGGCGATAGCCGTCGACGACGG > NC_002947/2129455‑2129746 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |