New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2856680 = | 51 (0.800) | 3 (0.050) | 3/238 | NT | 6.0% | coding (52/165 nt) | PP_2509 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 2856723 = | 46 (0.770) | coding (9/165 nt) | PP_2509 | hypothetical protein |
CTAGGTCGCCTTGGCGGCTCTCCTCACTGACCGGTTTAATCAGTTCTGGCCCTTGGTTACGCACGTTGCCGACTGCTTTACCTACGGAGAACCAGCGAAAACCCAGAGCGGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGCTAACGGCTGTGCGCTACTTATTCCAAAGCCAGATTCGGCTCATACAGTTGACTCGTAGGCATCGAACGACTAAAGTCCGGATGCGTCATGATAATCACTCGCAATAAATAAAA > NC_002947/2856575‑2856868 | ctAGGTCGCCTTGGCGGCTCTCCTCACTGACCGGTTTAATCAGTTCTGGCCCTTGGTTACGCACGTTGCCGACTGCTTTACCTACGGAGAACCAGCGAAAACCCAGAGCGGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCa < 5:90471/149‑1 (MQ=255) gtcgttcgatgcctacgagtcaactgtatgagccgaatctggctttggaataagtagcgcacagccggtagccggttatgagttaccacacaccatggcgcctGAGCGGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAgg > 5:76166‑M1/104‑149 (MQ=255) ccTTGGCGGCTCTCCTCACTGACCGGTTTAATCAGTTCTGGCCCTTGGTTACGCACGTCGCCGACTGCTTTACCTACGGAGAACCAGCGAAAACCCAGAGCGGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCAt > 4:303849/1‑149 (MQ=255) ggcggcTCTCCTCACTGACCGGTTTAATCAGTTCTGGCCCTTGGTTACGCACGTTGCCGACTGCTTTACCTACGGAGAACCAGCGAAAACCCAGAGCGGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGgt < 8:297405/148‑1 (MQ=255) gcggcTCTCCTCACTGACCGGTTTAATCAGTTCTGGCCCTTGGTTACGCACGTTGCCGACTGCTTTACCTACGGAGAACCAGCGAAAACCCAGAGCGGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGgtgt > 7:105008/1‑149 (MQ=255) gcggcTCTCCTCACTGACCGGTTTAATCAGTTCTGGCCCTTGGTTACGCACGTTGCCGACTGCTTTACCTACGGAGAACCAGCGAAAACCCAGAGCGGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGgtgt < 3:235596/149‑1 (MQ=255) ggcaatcctcACTGACCGGTTTAATCAGTTCTGGCCCTTGGTTACGCACGTTGCCGACTGCTTTACCTACGGAGAACCAGCGAAAACCCAGAGCGGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGgtgtgt < 1:144632/144‑1 (MQ=255) tcctcACTGACCGGTTTAATCAGTTCTGGCCCTTGGTTACGCACGTTGCCGACTGCTTTACCTACGGAGAACCAGCGAAAACCCAGAGCGGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCa > 1:9153/1‑136 (MQ=255) tcctcACTGACCGGTTTAATCAGTTCTGGCCCTTGGTTACGCACGTTGCCGACTGCTTTACCTACGGAGAACCAGCGAAAACCCAGAGCGGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCa < 2:9153/136‑1 (MQ=255) cctcACTGACCGGTTTAATCAGTTCTGGCCCTTGGTTACGCACGTTGCCGACTGCTTTACCTACGGAGAACCAGCGAAAACCCAGAGCGGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATg < 3:141770/137‑1 (MQ=255) cctcACTGACCGGTTTAATCAGTTCTGGCCCTTGGTTACGCACGTTGCCGACTGCTTTACCTACGGAGAACCAGCGAAAACCCAGAGCGGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATg > 4:141770/1‑137 (MQ=255) tcACTGACCGGTTTAATCAGTTCTGGCCCTTGGTTACGCACGTTGCCGACTGCTTTACCTACGGAGAACCAGCGAAAACCCAGAGCGGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCAt < 7:223229/134‑1 (MQ=255) tcACTGACCGGTTTAATCAGTTCTGGCCCTTGGTTACGCACGTTGACGACTGCTTTACCTACGGAGAACCAGCGAAAACCCAGAGCGGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCAt > 8:223229/1‑134 (MQ=255) taaCTGATCGGTTTAATCAGTTCTGGCCCTTGGTTACGCACGTTGCCGACTGCTTTACCTACGGAGAACCAGCGAAAACCCAGAGCGGGCCTGCATCCAGCCTTGACGATCTCCTCCTCCCGCTCAGGAGCCATGGTGTGTGGTAACt > 4:309248/3‑148 (MQ=255) cGGTTTAATCAGTTCTGGCCCTTGGTTACGCACGTTGCCGACTGCTTTACCTACGGAGAACCAGCGAAAACCCAGAGCGGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCgg > 6:332448/1‑149 (MQ=255) ggTTTAATCAGTTCTGGCCCTTGGTTACGCACGTTGCCGACTGCTTTACCTACGGAGAACCAGCGAAAACCCAGAGCGGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGc < 5:332448/149‑1 (MQ=255) tAATCAGTTCTGGCCCTTGGTTACGCACGTTGCCGACTGCTTTACCTACGGAGAACCAGCGAAAACCCAGAGCGGGCAGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGCTAAc > 5:399488/1‑149 (MQ=255) aTCAGTTCTGGCCCTTGGTTACGCACGTTGCCGACTGCTTTACCTACGGAGAACCAGCGAAAACCCAGAGCGGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGCTAACgg > 4:103680/1‑149 (MQ=255) aTCAGTTCTGGCCCTTGGTTACGCACGTTGCCGACTGCTTTACCTACGGAGAACCAGCGAAAACCCAGAGCGGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGCTAACgg < 8:251112/149‑1 (MQ=255) tCAGTTCTGGCCCTTGGTTACGCACGTTGCCGACTGCTTTACCTACGGAGAACCAGCGAAAACCCAGAGCGGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGCTAACGGc > 6:183032/1‑149 (MQ=255) aGTTCTGGCCCTTGGTTACGCACGTTGCCGACTGCTTTACCTACGGAGAACCAGCGAAAACCCAGAGCGGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGCTAACGGCtg > 4:190038/1‑149 (MQ=255) gTTACGCACGTTGCCGACTGCTTTACCTACGGAGAACCAGCGAAAACCCAGAGCGGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGCTAACGGCTGTGCGCTACTTATTc < 5:183032/149‑1 (MQ=255) cGCACGTTGCCGACTGCTTTACCTACGGAGAACCAGCGAAAACCCAGAGCGGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGCTAACGGCTGTGCGCTACTTATTCCaaa < 4:303398/149‑1 (MQ=255) gCACGTTGCCGACTGCTTTACCTACGGAGAACCAGCGAAAACCCAGAGCGGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGCTAACGGCTGTGCGCTACTTATTCCAAAg > 3:404002/1‑149 (MQ=255) aCGTTGCCGACTGCTTTACCTACGGAGAACCAGCGAAAACCCAGAGCGGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGCTAACGGCTGTGCGCTACTTATTCCAAAGc > 6:16702/1‑148 (MQ=255) tGCTTTACCTACGGAGAACCAGCGAAAACCCAGAGCGGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGCTAACGGCTGTGCGCTACTTATTCCAAAGCCAGATTCg < 4:127851/145‑1 (MQ=255) tGCTTTACCTACGGAGAACCAGCGAAAACCCAGAGCGGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGCTAACGGCTGTGCGCTACTTATTCCAAAGCCAGATTCg > 3:127851/1‑145 (MQ=255) ccTACGGAGAACCAGCGAAAACCCAGAGCGGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGCTAACGGCTGTGCGCTACTTATTCCAAAGCCAGATTCGGCTCATACAGt < 3:303849/149‑1 (MQ=255) aCGGAGAACCAGCGAAAACCCAGAGCGGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGCTAACGGCTGTGCGCTACTTATTCCAAAGCCAGATTCGGc > 2:247545/1‑137 (MQ=255) aCGGAGAACCAGCGAAAACCCAGAGCGGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGCTAACGGCTGTGCGCTACTTATTCCAAAGCCAGATTCGGc < 1:247545/137‑1 (MQ=255) aaCCAGCGAAAACCCAGAGCGGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGCTAACGGCTGTGCGCTACTTATTCCAAAGCCAGATTCGGCTCATACAGTTGACTCg > 4:201553/1‑147 (MQ=255) aCCAGCGAAAACCCAGAGCGGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGCTAACGGCTGTGCGCTACTTATTCCAAAGCCAGATTCGGCTCATACAGTTGACTCGTa < 5:16702/148‑1 (MQ=255) aCCAGCGAAAACCCAGAGCGGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGCTAACGGCTGTGCGCTACTTATTCCAAAGCCAGATTCGGCTCATACAGTTGACTCGTAg < 4:404002/149‑1 (MQ=255) ccAGCGAAAACCCAGAGCGGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGCTAACGGCTGTGCGCTACTTATTc < 5:422313/113‑1 (MQ=255) ccAGCGAAAACCCAGAGCGGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGCTAACGGCTGTGCGCTACTTATTc > 6:422313/1‑113 (MQ=255) cAGCGAAAACCCAGAGCGGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGCTAACGGCTGTGCGCTACTTATTCCAAAGCCAGATTCGGCTCATACAGTTGACTCGTAgg > 3:357188/1‑148 (MQ=255) gCGAAAACCCAGAGCGGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGCTAACGGCTGTGCGCTACTTATTCCAAAGCCAGATTCGGCTCATACAGTTGACTCGTAGGCAt > 7:100838/1‑149 (MQ=255) gAAAACCCAGAGCGGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGCTAACGGCTGTGCGCTACTTATTCCAAAGCCAGATTCGGCTCATACAGTTGACTCGTAGGCATc > 3:319333/1‑148 (MQ=255) aCCCAGAGCGGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGCTAACGGCTGTGCGCTACTTATTCCAAAGCCAGATTCGGCTCATACAGTTGACTCGTAGGCATCGAAc > 6:19082/1‑148 (MQ=255) cccAGAGCGGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGCTAACGGCTGTGCGCTACTTATTCCAAAGCCAGATTCGGCTCATACAGTTGACTCGTAGGCATCGAACGa < 6:399488/149‑1 (MQ=255) cctgagcgggcggcggagatcgtcaaggctggatgccggcccgctcAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGCTACCGGCTGTGCGCTACTTATTCCAAAGCCAGATTCGGCTCATACAGTTGACTCGTAGGCATCGAACGAc > 5:76166‑M2/47‑149 (MQ=255) gagcgggcggcggagatcgtcaaggctggatgccggcccgctcAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGCTAACGGCTGTGCGCTACTTATTCCAAAGCCAGATTCGGCTCATACAGTTGACTCGTAGGCATCGAACGACTa > 7:191925‑M2/44‑148 (MQ=255) gcgggcggcggagatcgtcaaggctggatgccggcccgctcAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGCTAACGGCTGTGCGCTACTTATTCCAAAGCCAGATTCGGCTCATACAGTTGACTCGTAGGCATCGAACGACTaaa < 6:76166‑M2/107‑1 (MQ=255) GGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGCTAACGGCTGTGCGCTACTTATTCCAAAGCCAGATTCGGCTCATACAGTTGACTCGTAGGCATCGAACGACTAAAGTc > 3:103680‑M1/1‑149 (MQ=255) cctgCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGTCTAACGGCTGTGCGCTACTTATTCCAAAGCCAGATTCGGCTCATACAGTTGACTCGTAGGCATCGAACGACTAAAGTCCgg < 3:309248/146‑1 (MQ=255) cAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGCTAACGGCTGTGCGCTACTTATTCCAAAGCCAGATTCGGCTCATACAGTTGACTCGTAGGCATCGAACGACTAAAGTCCGGa > 5:263603/1‑142 (MQ=255) cAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGCTAACGGCTGTGCGCTACTTATTCCAAAGCCAGATTCGGCTCATACAGTTGACTCGTAGGCATCGAACGACTAAAGTCCGGa < 6:263603/142‑1 (MQ=255) ccTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGCTAACGGCTGTGCGCTACTTATTCCAAAGCCAGATTCGGCTCATACAGTTGACTCGTAGGCATCGAACGACTa < 1:145038/130‑1 (MQ=255) ccTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGCTAACGGCTGTGCGCTACTTATTCCAAAGCCAGATTCGGCTCATACAGTTGACTCGTAGGCATCGAACGACTa > 2:145038/1‑130 (MQ=255) gACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGCTAACGGCTGTGCGCTACTTATTCCAAAGCCAGATTCGGCTCATACAGTTGACTCGTAGGCATCGAACGACTAAAGTCCGGATGCGTCAtcaatat > 8:387942/1‑143 (MQ=255) aCGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGCTAACGGCTGTGCGCTACTTATTCCAAAGCCAGATTCGGCTCATACAGTTGACTCGTAGGc > 4:330116/1‑113 (MQ=255) aCGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGCTAACGGCTGTGCGCTACTTATTCCAAAGCCAGATTCGGCTCATACAGTTGACTCGTAGGc < 3:330116/113‑1 (MQ=255) cgccgcCCGCTCAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGCTAACGGCTGTGCGCTACTTATTCCAAAGCCAGATTCGGCTCATACAGTTGACTCGTAGGCATCGAACGACTAAAGTCCGGATGCGTCATGATAATCACTCGCaa > 7:223227/1‑149 (MQ=255) ctcAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGCTAACGGCTGTGCGCTACTTATTCCAAAGCCAGATTCGGCTCATACAGTTGACTCGTAGGCATCGAACGACTAAAGTCCGGATGCGTCATGATAATCACTCGCAATAAATaaaa < 8:191925‑M2/146‑1 (MQ=255) ctcAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGCTAACGGCTGTGCGCTACTTATTCCAAAGCCAGATTCGGCTCATACAGTTGACTCGTAGGCATCGAACGACTAAAGTCCGGATGCGTCATGATAATCACTCGCAATAAATaaaa < 3:201553‑M2/146‑1 (MQ=255) | CTAGGTCGCCTTGGCGGCTCTCCTCACTGACCGGTTTAATCAGTTCTGGCCCTTGGTTACGCACGTTGCCGACTGCTTTACCTACGGAGAACCAGCGAAAACCCAGAGCGGGCCGGCATCCAGCCTTGACGATCTCCGCCGCCCGCTCAGGCGCCATGGTGTGTGGTAACTCATAACCGGCTAACGGCTGTGCGCTACTTATTCCAAAGCCAGATTCGGCTCATACAGTTGACTCGTAGGCATCGAACGACTAAAGTCCGGATGCGTCATGATAATCACTCGCAATAAATAAAA > NC_002947/2856575‑2856868 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |