New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3759787 = | 47 (0.730) | 4 (0.070) | 4/242 | NT | 7.9% | coding (420/975 nt) | folEB | GTP cyclohydrolase I |
? | NC_002947 | 3759828 = | 49 (0.800) | coding (461/975 nt) | folEB | GTP cyclohydrolase I |
TCAGGATTGCGAAAGCCGCAGTGCCAGGGTGCGCCTGGATTTCGACTTGCTGGTTCGCCGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTCAAGGACCAGCCACTGCTCGAAGTCAGCGCCGTCGCGCAGTGGCTGC > NC_002947/3759682‑3759968 | tCAGGATTGCGAAAGCCGCAGTGCCAGGGTGCGCCTGGATTTCGACTTGCTGGTTCGCCGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGa < 6:95307/149‑1 (MQ=255) gtccttgaaggttcgcaggaagccgtcctcaatcaactgccgggagagagcggccgagcacgggcaggtcgaggagtagccgatcctgacctcgatactcaGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTg > 4:108295‑M1/102‑144 (MQ=255) gtccttgaaggttcgcaggaagccgtcctcaatcaactgccgggagagagcggccgagcacgggcaggtcgaggagtagccgatcctgacctcgatactcaGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTg < 3:108295‑M1/43‑1 (MQ=255) cGAAAGCCGCAGTGCCAGGGTGCGCCTGGATTTCGACTTGCTGGTTCGCCGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAg < 6:249244/148‑1 (MQ=255) gAAAGCCGCAGTGCCAGGGTGCGCCTGGATTTCGACTTGCTGGTTCGCCGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGt > 5:107952/1‑149 (MQ=255) gAAAGCCGCAGTGCCAGGGTGCGCCTGGATTTCGACTTGCTGGTTCGCAGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCCGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAgg > 8:310822/1‑148 (MQ=255) aaGCCGCAGTGCCAGGGTGCGCCTGGATTTCGACTTGCTGGTTCGCCGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGt > 3:173556/1‑147 (MQ=255) aaGCCGCAGTGCCAGGGTGCGCCTGGATTTCGACTTGCTGGTTCGCCGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCa < 4:173556/149‑1 (MQ=255) aGTGCCAGGGTGCGCCTGGATTTCGACTTGCTGGTTCGCCGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCgg > 8:269054/1‑149 (MQ=255) gTGCCAGGGTGCGCCTGGATTTCGACTTGCTGGTTCGCCGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGc < 6:59487/149‑1 (MQ=255) ccagcctGCGCCTGGAATTCGACTTGAAGGTTCGCCGCCCTGCACTCGTGACCCACGGCCTCACTGGCTGGAAGTCGTAACCGGTTCACGTGCAAGCCACGAACGACGGCGGCGCCCTGAACCTGAGTATCGACGTCAGGATCGGCTa > 2:146496/7‑148 (MQ=255) cTGGATTTCGACTTGCTGGTTCGCCGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCATCGACCTg > 3:59548/1‑149 (MQ=255) ggATTTCGACTTGCTGGTTCGCCGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGa > 1:51423/1‑120 (MQ=255) ggATTTCGACTTGCTGGTTCGCCGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGa < 2:51423/120‑1 (MQ=255) aTTTCGTCTTGCTTGTTCGCCGGCCTTGACTGGTGACCGATGTCCTCTCTGGCTGGTAGTCGTACGCGGTTCACGTGCTAGCCACGAAGGTGGGCGGGTCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTTccc < 4:59548/148‑1 (MQ=255) ttCGACTTGCTGGTTCGCCGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGcc > 5:25264/1‑145 (MQ=255) ttCGACTTGCTGGTTCGCCGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGcc < 6:25264/145‑1 (MQ=255) aCTTGCTGGTTCGCCGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCg > 6:331807/1‑149 (MQ=255) ttCGCCGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCa > 4:183180/1‑108 (MQ=255) ttCGCCGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCa < 3:183180/108‑1 (MQ=255) ttCGCCGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGctctc > 2:158074/1‑149 (MQ=255) gccgccCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTcc > 3:24801/1‑149 (MQ=255) gccgccCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTcc > 5:351117/1‑149 (MQ=255) tGACCGAGGGGCTGTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGGCACGAAGGTCGGCGGGGAGCTGAACCTGAGTTTCGTGGTCTGGATCGGCTTGTCCTCGACCTTCCCGTGCTCGGCCTCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAg < 1:146496/149‑1 (MQ=255) aGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGc < 1:158074/149‑1 (MQ=255) ggCCTCTCTGACTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCtt > 6:426257/1‑149 (MQ=255) ctctctGGGTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCt < 7:310822/149‑1 (MQ=255) ctctctGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCt > 3:351448/1‑149 (MQ=255) ctctctGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCt > 7:122571/1‑149 (MQ=255) tctGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTg < 7:269054/147‑1 (MQ=255) gctggAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGaa < 8:122571/147‑1 (MQ=255) gAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTc > 2:301231/1‑148 (MQ=255) aaGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTCaa < 6:107952/149‑1 (MQ=255) taaccGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGATGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCTACCTGCCCGTGATCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGAGTGAGGACGGCGTCCTGCGAACCGTCATGGAc > 6:415844/4‑147 (MQ=255) caggttcagcgccccgccgaccttcgtggcgagcacgtgaaccTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTCAAGGAc > 4:108295‑M2/44‑144 (MQ=255) caggttcagcgccccgccgaccttcgtggcgagcacgtgaaccTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTCAAGGAc < 3:108295‑M2/101‑1 (MQ=255) cGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGc < 2:240533/94‑1 (MQ=255) cGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGc > 1:240533/1‑94 (MQ=255) agcgccccgccgaccttcgtggcgagcacgtgaaccTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTCaa > 4:19595‑M2/37‑133 (MQ=255) agcgccccgccgaccttcgtggcgagcacgtgaaccTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTCaa < 3:19595‑M2/97‑1 (MQ=255) ACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGc < 4:102371‑M1/80‑1 (MQ=255) ACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGc > 3:102371‑M1/1‑80 (MQ=255) gTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTCAAGGACCAGCCACTGCTCg > 7:17645/1‑148 (MQ=255) tGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTCAAGGACCAGCCACTGCTCGaa < 4:351448/149‑1 (MQ=255) tCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTCAAGGACCAGCCACTGCTCGaa < 4:122665/146‑1 (MQ=255) tCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTCAAGGACCAGCCACTGCTCGaa > 3:122665/1‑146 (MQ=255) tCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTCAAGGACCAGCCACTGCTCGAAGt > 6:154062/1‑148 (MQ=255) gCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTCAAGGACCAGCCACTGCTCGAAGTCAg > 7:335289/1‑149 (MQ=255) gCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTCAAGGACCAGCCACTGCTCGAAGTCAg > 7:329372/1‑149 (MQ=255) cACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGct > 6:295574/1‑79 (MQ=255) cACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGct < 5:295574/79‑1 (MQ=255) cACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTCAAGGACCAGCCACTGCTCGAAGTCAgcg > 2:246401/1‑149 (MQ=255) aCGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTCAAGGACCAGCCACTGCTCGAAGTCAgcgc > 7:387367/1‑149 (MQ=255) gTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAAc < 7:316305/110‑1 (MQ=255) gTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAAc > 8:316305/1‑110 (MQ=255) tCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTCAAGGACCAGCCACTGCTCGAAGTCAGCGCCGTcgcg < 8:387367/149‑1 (MQ=255) cggcggGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAgg > 2:46102/1‑92 (MQ=255) cggcggGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAgg < 1:46102/92‑1 (MQ=255) gcTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTCAAGGACCAGCCACTGCTCGAAGTCAGCGCCGTCGCGCAGTGGCTgc < 1:301231/149‑1 (MQ=255) gcTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTCAAGGACCAGCCACTGCTCGAAGTCAGCGCCGTCGCGCAGTGGCTgc < 1:246401/149‑1 (MQ=255) cTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTCAAGGACCa < 1:79917‑M2/103‑1 (MQ=255) cTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTCAAGGACCa > 2:79917‑M2/2‑104 (MQ=255) tGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTCAAGGACCAGCCACTGCTCGAAGTCAGCGCCGTCGCGCAGTGGCTgc > 7:41093/1‑141 (MQ=255) tGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTCAAGGACCAGCCACTGCTCGAAGTCAGCGCCGTCGCGCAGTGGCTgc < 8:41093/141‑1 (MQ=255) | TCAGGATTGCGAAAGCCGCAGTGCCAGGGTGCGCCTGGATTTCGACTTGCTGGTTCGCCGCCCTGCACTGGTGACCGAGGGCCTCTCTGGCTGGAAGTCGTACCCGGTTCACGTGCTCGCCACGAAGGTCGGCGGGGCGCTGAACCTGAGTATCGAGGTCAGGATCGGCTACTCCTCGACCTGCCCGTGCTCGGCCGCTCTCTCCCGGCAGTTGATTGAGGACGGCTTCCTGCGAACCTTCAAGGACCAGCCACTGCTCGAAGTCAGCGCCGTCGCGCAGTGGCTGC > NC_002947/3759682‑3759968 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |