New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5164442 | 78 (1.220) | 4 (0.070) | 4/244 | NT | 5.2% | coding (3438/3906 nt) | hrpA | ATP‑dependent helicase HrpA |
? | NC_002947 | = 5164477 | 71 (1.160) | coding (3403/3906 nt) | hrpA | ATP‑dependent helicase HrpA |
AGTGCCACCGCTTGGCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAGCAGGCCCAGCTCGGTCAGCCCCGGCAGCTTGCCGCG > NC_002947/5164332‑5164624 | aGTGCCACCGCTTGGCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAggc < 7:298707‑M2/149‑4 (MQ=255) ccACCGCTTGGCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGc < 3:376991/148‑1 (MQ=255) ccACCGCTTGGCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCa > 4:25566/1‑149 (MQ=255) ccACCGCTTGGCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTATCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCGCTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGTCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGCG‑‑CAAggccccg < 4:268537‑M2/149‑8 (MQ=255) aCCGCTTGGCTCAGGTCGATCATGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCAcc > 3:337598/1‑149 (MQ=255) gCTTGGCTCAGGTCGATCATGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTc < 4:337598/149‑1 (MQ=255) gCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGt < 8:124145/148‑1 (MQ=255) cTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCAGTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCAGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑AAAGGCCGCACCTTCACGTgg > 5:125880/1‑149 (MQ=255) cTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTgg < 8:298707/149‑1 (MQ=255) gTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACg > 8:153528/1‑149 (MQ=255) gTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACg > 5:318254/1‑149 (MQ=255) aTCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGgttg < 6:229468/149‑1 (MQ=255) gCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCTTGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAggc > 1:335012‑M2/1‑117 (MQ=255) gCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAggc < 2:335012‑M2/120‑4 (MQ=255) gCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTc < 7:153528/147‑1 (MQ=255) gCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTc < 2:398651/147‑1 (MQ=255) gCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGc > 1:191603/1‑149 (MQ=255) ccTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCa > 6:218443/1‑128 (MQ=255) ccTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCt > 4:122151/1‑149 (MQ=255) gAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTc > 6:185471/1‑147 (MQ=255) aaGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCaa < 2:166715/148‑1 (MQ=255) gCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGa > 4:175578/1‑149 (MQ=255) tttCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATg > 7:315851/1‑148 (MQ=255) cTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCaa < 3:25566/148‑1 (MQ=255) cAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTg < 3:244671/116‑1 (MQ=255) cAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTg > 4:244671/1‑116 (MQ=255) cAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGt < 2:362933/149‑1 (MQ=255) cATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAgg > 5:208844/1‑149 (MQ=255) aTGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTc < 5:307058/144‑1 (MQ=255) aTGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTc > 6:307058/1‑144 (MQ=255) gCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTAGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTg > 5:318603/1‑149 (MQ=255) cacaGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACt < 4:296623/137‑1 (MQ=255) cacaGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACt > 3:296623/1‑137 (MQ=255) cacaGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGc > 5:127516/1‑149 (MQ=255) cacaGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGc < 8:104101/149‑1 (MQ=255) cacaGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGc < 8:315851/149‑1 (MQ=255) acaGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGgtt < 7:124755/114‑1 (MQ=255) acaGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGgtt > 8:124755/1‑114 (MQ=255) acaGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGc > 4:336740/1‑148 (MQ=255) cTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCcag > 4:134925/1‑147 (MQ=255) tCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCcagcag > 5:36363/1‑148 (MQ=255) cAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGaa > 2:92526/1‑149 (MQ=255) aGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAAt < 6:127516/149‑1 (MQ=255) aGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAAt < 5:185471/149‑1 (MQ=255) gCACTTCCACGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATg > 5:92159/1‑149 (MQ=255) ttCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCtt > 8:224250/1‑149 (MQ=255) ccAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTc < 3:134925/148‑1 (MQ=255) ccAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTc < 3:336740/148‑1 (MQ=255) aGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAgg < 1:336233/126‑1 (MQ=255) aGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAgg > 2:336233/1‑126 (MQ=255) aGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGAc < 7:32310/149‑1 (MQ=255) aGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGAc < 6:318254/149‑1 (MQ=255) gCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCATAATGTCt < 2:213054/137‑1 (MQ=255) gCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCt > 1:213054/1‑137 (MQ=255) ccTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCtt > 2:331890/1‑149 (MQ=255) ttGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTc > 7:275687/1‑148 (MQ=255) gCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCt < 6:36363/147‑1 (MQ=255) aGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAAt > 2:408920/1‑125 (MQ=255) aGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAAt < 1:408920/125‑1 (MQ=255) ggCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCAttt < 6:208844/149‑1 (MQ=255) ggCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCAtt > 6:50964/1‑148 (MQ=255) ggCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGATTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGTCTGGCCAGCAGAATGTCTTCTACCAGCGCTTCTACCCGCCCCAt < 6:125880/147‑1 (MQ=255) gCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAggccgagcatgccgagcgcctggcaaggcagaccctggaagtgctgaagctgtggcatggtctgcagaaacgcttcaagggcaagatcgacctgagccaagc < 7:15431‑M2/149‑103 (MQ=255) gCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTc < 5:50964/149‑1 (MQ=255) gCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTc < 3:122151/149‑1 (MQ=255) cATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCa < 7:291991/149‑1 (MQ=255) aTGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAggccgagcatgccgagcgcctggcaaggcagaccctggaagtgctgaagctgtggcatggtctgcagaaacgcttcaagggcaagatcgacctgagccaagcgg > 8:15431‑M2/1‑45 (MQ=255) aTGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCAc < 2:191603/149‑1 (MQ=255) tGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACg < 7:224250/149‑1 (MQ=255) gCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAggccgagcatgccgagcgcctggcaaggcagaccctggaagtgctgaagctgtggcatggtctgcagaaacgcttcaagggcaagatcgacctgagccaagcggtg < 6:178313‑M2/149‑107 (MQ=255) ccAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTAcag > 1:59287/1‑147 (MQ=255) gCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCt < 3:191720/106‑1 (MQ=255) gCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCt > 4:191720/1‑106 (MQ=255) cTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAGCAGGcc < 2:59287/149‑1 (MQ=255) ccGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGCAGCTGggccgagcatgccgagcgcctggcaaggcagaccctggaagtgctgaagctgtggcatggtctgcagaaacgcttcaagggcaaga > 6:104628‑M2/1‑31 (MQ=255) cgcTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAGCAGGCCCAGCTc > 5:423117/1‑149 (MQ=255) ttGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAAt < 2:214265/92‑1 (MQ=255) ttGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAAt > 1:214265/1‑92 (MQ=255) gTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAGCAGGCCCAGCTCGGTCAGc > 5:161455/1‑149 (MQ=255) agccagcGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCATTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAGCAGGCCCAGCTCGGTCAGCCCCg < 6:92159/149‑1 (MQ=255) gccagcGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAGCAGGCCCAGCTCGGTCAGCCCCgg > 3:373891/1‑149 (MQ=255) cagcGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAGCAGGCCCAGCTCGGTCAGCCCCgg > 7:2010/1‑147 (MQ=255) aaGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAGCAGGCCCAGCTCGGTCAGCCCCGGCAGCTTGCcgcg > 1:354639/1‑149 (MQ=255) | AGTGCCACCGCTTGGCTCAGGTCGATCTTGCCCTTGAAGCGTTTCTGCAGACCATGCCACAGCTTCAGCACTTCCAGGGTCTGCCTTGCCAGGCGCTCGGCATGCTCGGCCCAGCTGCCGCGCTTGCGTTCAGCCAGCGCGGC‑‑CAAGGCCGCACCTTCACGTGGCAACGGTTGTTCGCCTTCAAGGATGCAACTGTCCAGGCTGGCCAGCAGAATGTCTTCGACCAGCGCTTCTACCCGCCCCATTTCACGGTACAGCAGGCCCAGCTCGGTCAGCCCCGGCAGCTTGCCGCG > NC_002947/5164332‑5164624 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |