Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,286,678 | G→C | 8.9% | A353G (GCC→GGC) | PP_3758 ← | two component system response regulator/sensor histidine kinase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,286,678 | 0 | G | C | 8.9% | 207.2 / 5.9 | 67 | A353G (GCC→GGC) | PP_3758 | two component system response regulator/sensor histidine kinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (29/32); new base C (2/4); total (31/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.78e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GTTTTGTTCTTTGAATGTTGCCAGCGGCAATTGCAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTGCTCGAACACCCGCACCTGCACCGGATTGCGCTCGCCGTAAC > NC_002947/4286536‑4286825 | gTTTTGTTCTTTGAATGTTGCCAGCGGCAATTGCAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCctgct < 3:292637/149‑1 (MQ=255) ttttGTTCTTTGAATGTTGCCAGCGGCAATTGCAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCctgctg < 7:131503/149‑1 (MQ=255) tttGTTCTTTGAATGTTGCCAGCGGCAATTGCAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGAATCGGGTGACGGAGATGAACAGCCCCAAGCCCACACCACCGCTGGCctgc > 1:342128/1‑149 (MQ=255) tCTTTGAATGTTGCCAGCGGCAATTGCAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGCCCAGCAGGCCAGc > 2:70721/1‑149 (MQ=255) cTTTGAATGTTGCCAGCGGCAATTGCAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGCCCAGCAGGCCAGc < 7:101058/148‑1 (MQ=255) tttGAATGTTGCCAGCGGCAATTGCAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGCCCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGa > 8:59360/1‑149 (MQ=255) tttGAATGTTGCCAGCGGCAATTGCAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGa > 3:313179/1‑149 (MQ=255) tGAATGTTGCCAGCGGCAATTGCAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGCCCAGCAGGCCAGCggag > 2:226411/1‑146 (MQ=255) tGAATGTTGCCAGCGGCAATTGCAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGCCCAGCAGGCCAGCgg < 1:70721/147‑2 (MQ=255) gAATGTTGCCAGCGGCAATTGCAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGCCCAGCAGGCCAGCggag < 1:226411/148‑4 (MQ=255) gAATGTTGCCAGCGGCAATTGCAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGCCCAGCAGGCCAGCggag < 5:139839/148‑4 (MQ=255) gTTGCCAGCGGCAATTGCAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTc > 3:257629/1‑149 (MQ=255) ccAGCGGCAATTGCAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGAc < 1:319608/139‑1 (MQ=255) ccAGCGGCAATTGCAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGAc > 2:319608/1‑139 (MQ=255) cAGCGGCAATTGCAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTggg < 8:71152/131‑1 (MQ=255) aGCGGCAATTGCAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCAACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAActg > 4:374093/1‑149 (MQ=255) gCGGCAATTGCAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTCCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAActgc > 6:47228/1‑149 (MQ=255) cgtattttGCTGGGTTATTGTCCCACTCTTGCCCTCCTCTCTATCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAActgct < 1:136502/143‑1 (MQ=255) ggCAATTGCAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAActgctg < 4:81970/149‑1 (MQ=255) cAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATcc > 5:108114/1‑149 (MQ=255) cAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATcc > 6:363389/1‑149 (MQ=255) cACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTggcg < 3:374093/149‑1 (MQ=255) cTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGgcgc < 2:282314/149‑1 (MQ=255) gCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCt < 3:154401/147‑1 (MQ=255) cccTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTgat < 7:119838/149‑1 (MQ=255) cctcctCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTgata > 7:320342/1‑149 (MQ=255) ctcctcGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTgatac < 4:257629/149‑1 (MQ=255) tcctcGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGAAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTgatag > 5:267058/1‑147 (MQ=255) tcctcGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGAAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTga < 6:267058/145‑1 (MQ=255) tcctcGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCAAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTCCTGGGCACCGACCCGCACGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCCATgatacc > 6:35229/1‑149 (MQ=255) ctcGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTgataccga < 6:108114/149‑1 (MQ=255) tcGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGa < 6:289874/115‑1 (MQ=255) tcGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGa > 5:289874/1‑115 (MQ=255) gCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTgataccgatac > 7:128945/1‑149 (MQ=255) tttCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTc < 6:210508/100‑1 (MQ=255) tttCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTc > 5:210508/1‑100 (MQ=255) tttCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGataccgataccg > 3:123921/1‑149 (MQ=255) tCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGataccgataccg < 5:363389/147‑1 (MQ=255) cAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTg < 7:214021/148‑1 (MQ=255) aaCCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGAt > 3:357906/1‑149 (MQ=255) cTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATcct > 2:370921/1‑149 (MQ=255) tATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATGTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATcctgca < 6:40439/149‑1 (MQ=255) cGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAg < 1:370921/149‑1 (MQ=255) cGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAg < 7:59360/149‑1 (MQ=255) cGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAg < 4:123921/149‑1 (MQ=255) cTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATgc < 4:313179/149‑1 (MQ=255) aCG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATcc > 3:34917/1‑85 (MQ=255) actaTCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATcc < 4:34917/82‑1 (MQ=255) g‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCCTGCCGCCCt > 8:218831/1‑149 (MQ=255) g‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCt > 7:16126/1‑149 (MQ=255) cT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCAt > 5:155535/1‑135 (MQ=255) cT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCAt < 6:155535/135‑1 (MQ=255) cT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTg < 8:128945/144‑1 (MQ=255) cT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTGCt < 2:342128/146‑1 (MQ=255) t‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTGCTCGaa > 5:157038/1‑149 (MQ=255) aTGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATgccgcc > 2:336700/1‑134 (MQ=255) aTGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATgccgcc < 1:336700/134‑1 (MQ=255) aCAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATc > 1:180139/1‑103 (MQ=255) aCAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATc < 2:180139/103‑1 (MQ=255) aCAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTGCTc > 3:241093/1‑136 (MQ=255) aCAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTGCTc < 4:241093/136‑1 (MQ=255) cAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTGCTCGAACACCCGCACCt > 4:359228/1‑149 (MQ=255) ccccAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATcctg > 2:139829/1‑102 (MQ=255) ccccAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATcctg < 1:139829/102‑1 (MQ=255) cccAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTGCTCGAACACCCGCACCTGCACCGGAtt < 5:47228/149‑1 (MQ=255) aCCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTGCTCGAACACCCGCACCTGCACCGGATTGCGCt > 5:358401/1‑149 (MQ=255) ccTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAATATGCTGTGATGTTTGGCGGCGCTGATACAGATACAGTGATGCTGGTACTGCTACCAGGCCTTGCAGCCCTTCTCGAACTCCTGCACGTGCACCGGATTGctctt < 8:320342/149‑2 (MQ=255) gCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTGCTCGAACACCCGCACCTGCACCGGATTGCGCTCGCCGTAAc < 8:16126/148‑1 (MQ=255) | GTTTTGTTCTTTGAATGTTGCCAGCGGCAATTGCAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACG‑ATCTGCT‑‑CGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTGCTCGAACACCCGCACCTGCACCGGATTGCGCTCGCCGTAAC > NC_002947/4286536‑4286825 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |