Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,286,687 | G→C | 9.1% | A350G (GCC→GGC) | PP_3758 ← | two component system response regulator/sensor histidine kinase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,286,687 | 0 | G | C | 9.1% | 197.4 / 8.5 | 66 | A350G (GCC→GGC) | PP_3758 | two component system response regulator/sensor histidine kinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (29/31); new base C (2/4); total (31/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.76e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.99e-01 |
TCTTTGAATGTTGCCAGCGGCAATTGCAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTGCTCGAACACCCGCACCTGCACCGGATTGCGCTCGCCGTAACGCATT > NC_002947/4286543‑4286830 | tCTTTGAATGTTGCCAGCGGCAATTGCAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGCCCAGCAGGCCAGc > 2:70721/1‑149 (MQ=255) cTTTGAATGTTGCCAGCGGCAATTGCAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGCCCAGCAGGCCAGc < 7:101058/148‑1 (MQ=255) tttGAATGTTGCCAGCGGCAATTGCAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGCCCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGa > 8:59360/1‑149 (MQ=255) tttGAATGTTGCCAGCGGCAATTGCAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGa > 3:313179/1‑149 (MQ=255) tGAATGTTGCCAGCGGCAATTGCAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGCCCAGCAGGCCAGCggag > 2:226411/1‑146 (MQ=255) tGAATGTTGCCAGCGGCAATTGCAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGCCCAGCAGGCCAGCgg < 1:70721/147‑2 (MQ=255) gAATGTTGCCAGCGGCAATTGCAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGCCCAGCAGGCCAGCggag < 1:226411/148‑4 (MQ=255) gAATGTTGCCAGCGGCAATTGCAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGCCCAGCAGGCCAGCggag < 5:139839/148‑4 (MQ=255) gTTGCCAGCGGCAATTGCAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTc > 3:257629/1‑149 (MQ=255) ccAGCGGCAATTGCAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGAc > 2:319608/1‑139 (MQ=255) ccAGCGGCAATTGCAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGAc < 1:319608/139‑1 (MQ=255) cAGCGGCAATTGCAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTggg < 8:71152/131‑1 (MQ=255) aGCGGCAATTGCAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCAACCGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAActg > 4:374093/1‑149 (MQ=255) gCGGCAATTGCAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATCTCCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAActgc > 6:47228/1‑149 (MQ=255) cgtattttGCTGGGTTATTGTCCCACTCTTGCCCTCCTCTCTATCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAActgct < 1:136502/143‑1 (MQ=255) ggCAATTGCAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAActgctg < 4:81970/149‑1 (MQ=255) cAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATcc > 6:363389/1‑149 (MQ=255) cAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATcc > 5:108114/1‑149 (MQ=255) cACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTggcg < 3:374093/149‑1 (MQ=255) cTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGgcgc < 2:282314/149‑1 (MQ=255) gCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCt < 3:154401/147‑1 (MQ=255) cccTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTgat < 7:119838/149‑1 (MQ=255) cctcctCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTgata > 7:320342/1‑149 (MQ=255) ctcctcGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTgatac < 4:257629/149‑1 (MQ=255) tcctcGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGAAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTgatag > 5:267058/1‑147 (MQ=255) tcctcGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGAAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTga < 6:267058/145‑1 (MQ=255) tcctcGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCAAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTCCTGGGCACCGACCCGCACGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCCATgatacc > 6:35229/1‑149 (MQ=255) ctcGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTgataccga < 6:108114/149‑1 (MQ=255) tcGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGa > 5:289874/1‑115 (MQ=255) tcGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGa < 6:289874/115‑1 (MQ=255) gCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTgataccgatac > 7:128945/1‑149 (MQ=255) tttCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTc < 6:210508/100‑1 (MQ=255) tttCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTc > 5:210508/1‑100 (MQ=255) tttCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGataccgataccg > 3:123921/1‑149 (MQ=255) tCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGataccgataccg < 5:363389/147‑1 (MQ=255) cAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTg < 7:214021/148‑1 (MQ=255) aaCCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGAt > 3:357906/1‑149 (MQ=255) cTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATcct > 2:370921/1‑149 (MQ=255) tATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATGTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATcctgca < 6:40439/149‑1 (MQ=255) cGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAg < 1:370921/149‑1 (MQ=255) cGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAg < 7:59360/149‑1 (MQ=255) cGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAg < 4:123921/149‑1 (MQ=255) cTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATgc < 4:313179/149‑1 (MQ=255) actaTCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATcc < 4:34917/82‑1 (MQ=255) aCGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATcc > 3:34917/1‑85 (MQ=255) gATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCCTGCCGCCCt > 8:218831/1‑149 (MQ=255) gATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCt > 7:16126/1‑149 (MQ=255) cTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCAt < 6:155535/135‑1 (MQ=255) cTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCAt > 5:155535/1‑135 (MQ=255) cTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTg < 8:128945/144‑1 (MQ=255) cTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTGCt < 2:342128/146‑1 (MQ=255) tCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTGCTCGaa > 5:157038/1‑149 (MQ=255) aTGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATgccgcc < 1:336700/134‑1 (MQ=255) aTGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATgccgcc > 2:336700/1‑134 (MQ=255) aCAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATc > 1:180139/1‑103 (MQ=255) aCAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATc < 2:180139/103‑1 (MQ=255) aCAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTGCTc < 4:241093/136‑1 (MQ=255) aCAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTGCTc > 3:241093/1‑136 (MQ=255) cAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTGCTCGAACACCCGCACCt > 4:359228/1‑149 (MQ=255) ccccAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATcctg < 1:139829/102‑1 (MQ=255) ccccAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATcctg > 2:139829/1‑102 (MQ=255) cccAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTGCTCGAACACCCGCACCTGCACCGGAtt < 5:47228/149‑1 (MQ=255) aCCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTGCTCGAACACCCGCACCTGCACCGGATTGCGCt > 5:358401/1‑149 (MQ=255) ccTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAATATGCTGTGATGTTTGGCGGCGCTGATACAGATACAGTGATGCTGGTACTGCTACCAGGCCTTGCAGCCCTTCTCGAACTCCTGCACGTGCACCGGATTGctctt < 8:320342/149‑2 (MQ=255) gCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTGCTCGAACACCCGCACCTGCACCGGATTGCGCTCGCCGTAAc < 8:16126/148‑1 (MQ=255) ctgctgGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTGCTCGAACACCCGCACCTg > 6:375868/1‑123 (MQ=255) ctgGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTGCTCGAACACCCGCACCTGCACCGGATTGCGCTCGCCGTAACgcatt < 6:157038/148‑1 (MQ=255) | TCTTTGAATGTTGCCAGCGGCAATTGCAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTGCTCGAACACCCGCACCTGCACCGGATTGCGCTCGCCGTAACGCATT > NC_002947/4286543‑4286830 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |