| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,331,667 | G→A | 5.2% | G123S (GGC→AGC) | PP_3803 → | cation ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,331,667 | 0 | G | A | 5.2% | 298.3 / 3.2 | 95 | G123S (GGC→AGC) | PP_3803 | cation ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (41/49); new base A (3/2); total (44/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.60e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.25e-01 | |||||||||||
TGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCTTACGGCAGCCTGTTCGGCTACTGCCTGCTGTTCGGCATCCTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTGTTCGGTTCGGTGCTGACCGTTAGTGCCCAGGACTTGCTGGTACTGGGCATCGTCGCGGTGCTGGTGCTTGCCTTGGCGCTGCCGCT > NC_002947/4331521‑4331815 | tgctgGGTGAGCCCTATACCGGCCCTTACGGCAGCCTGTTCGGCTACTGCCTGCTGTTCGGCATCCTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCCGTGTCGCTGGCGCTTGgc > 3:348979/1‑149 (MQ=255) gTGAGCCCCATACCGGCCCTTACGGCAGCCTGTTCGGCTACTGCCTGCTGTTCGGCATCCTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGc < 5:351969/149‑1 (MQ=255) cccTATACCGGCCCTTACGGCAGCCTGTTCGGCTACTGCCTGCTGTTCGGCATCCTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCctgct > 6:76499/1‑149 (MQ=255) cccTATACCGGCCCTTACGGCAGCCTGTTCGGCTACTGCCTGCTGTTCGGCATCCTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCctgct > 5:81993/1‑149 (MQ=255) ggCCCTTACGGCAGCCTGTTCGGCTACTGCCTGCTGTTCGGCATCCTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCt < 6:81993/149‑1 (MQ=255) gCCCTTACGGCAGCCTGTTCGGCTACTGCCTGCTGTTCGGCATCCTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTg < 5:76499/149‑1 (MQ=255) gCCCTTACGGCAGCCTGTTCGGCTACTGCCTGCTGTTCGGCATCCTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTg < 1:99252/149‑1 (MQ=255) cTTACGGCAGCCTGTTCGGCTACTGCCTGCTGTTCGGCATCCTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTTGCGTGTTACTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTggca > 6:316941/1‑149 (MQ=255) ttACGGCAGCCTGTTCGGCTACTGCCTGCTGTTCGGCATCCTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTggcag > 8:289988/1‑149 (MQ=255) aCGGCAGCCTGTTCGGCTACTGCCTGCTGTTCGGCATCCTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTggcag < 1:108181/147‑1 (MQ=255) ggCAGCCTGTTCGGCTACTGCCTGCTGTTCGTCATCCTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCaa < 5:387373/149‑1 (MQ=255) ggCAGCCTGTTCGGCTACTGCCTGCTGTTCGGCATCCTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTggcaggc > 6:382460/1‑147 (MQ=255) ggagacTGTTTCGCTACTGCCTGCTGTTCGGCATACTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGTTACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCaa < 4:302895/143‑1 (MQ=255) aGCCTGTTCGGCTACTGCCTGCTGTTCGGCATCCTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGa > 3:291943/1‑148 (MQ=255) ccTGTTCGGCTACTGCCTGCTGTTCGGCATCCTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATc > 4:320398/1‑148 (MQ=255) ggCTACTGCCTGCTGTTCGGCATCCTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGc < 4:291943/148‑1 (MQ=255) gCTACTGCCTGCTGTTCGGCATCCTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGca > 8:218984/1‑148 (MQ=255) tACTGCCTGCTGTTCGGCATCCTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACAt > 5:337599/1‑149 (MQ=255) tACTGCCTGCTGTTCGGCATCCTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCAGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGcacc > 4:234095/1‑147 (MQ=255) ctgcctgcTGTTCGGCATCCTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATcc > 2:64086/1‑149 (MQ=255) ctgcctgcTGTTCGGCATCCTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATc < 3:320398/148‑1 (MQ=255) cctgcTGTTCGGCATCCTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTc < 3:125318/148‑1 (MQ=255) tgctgTTCGGCATCCTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTc > 2:192735/1‑146 (MQ=255) ggCATCCTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGcaca < 1:174282/133‑1 (MQ=255) ggCATCCTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGcaca > 2:174282/1‑133 (MQ=255) ggCATCCTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCt > 3:187257/1‑149 (MQ=255) gCATCCTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTg < 3:99171/149‑1 (MQ=255) cATCCTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTgt > 3:387303/1‑149 (MQ=255) aTCCTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTAGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTgtt > 8:151468/1‑149 (MQ=255) tCCTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTgttc > 3:123005/1‑149 (MQ=255) cTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTgttcgg < 4:187257/149‑1 (MQ=255) cTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTgttcg < 1:227662/148‑1 (MQ=255) cTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTgttcg < 7:289988/148‑1 (MQ=255) cTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTAGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTgttcg < 7:151468/148‑1 (MQ=255) tGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTgttcggt > 6:70910/1‑149 (MQ=255) cTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTgttc > 7:153854/1‑144 (MQ=255) cTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTgttc < 8:153854/144‑1 (MQ=255) tCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTgttcggttcg > 2:339554/1‑149 (MQ=255) aaCTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTGttcggttcgg < 6:337599/148‑1 (MQ=255) aCTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTGTTCGGTTCGGTg < 1:64086/149‑1 (MQ=255) gcgcAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTGTTCGGTTCGGTGCTGACCg > 5:409990/1‑149 (MQ=255) gcgcAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTGTTCGGTTCGGTGCTGACCg > 5:44210/1‑149 (MQ=255) cgcAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTGTTCGGTTCGGTGCTGACCGt < 6:1345/149‑1 (MQ=255) cAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTGTTCGGTTCGGTGCTGACCGTTa < 6:44210/149‑1 (MQ=255) aaCCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTggcag > 4:143876/1‑91 (MQ=255) aaCCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTggcag < 3:143876/91‑1 (MQ=255) aCCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTGTTCGGTTCGGTGCTGACCGTTAGt < 3:240766/149‑1 (MQ=255) aCCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTGTTCGGTTCGGTGCTGACCGTTAGt < 1:136921/149‑1 (MQ=255) ccGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCCAAGCGCCa > 7:38718/1‑68 (MQ=255) ccGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCCAAGCGCCa < 8:38718/68‑1 (MQ=255) tACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTGTTCGGTTCGGTGCTGACCGTTAGTGccc < 7:218984/149‑1 (MQ=255) tACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTGTTCGGTTCGGTGCTGACCGTTAGTGccc < 5:144251/149‑1 (MQ=255) ccGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTGTTCGGTTCGGTGCTGACCGTTAGTGCCCa < 4:123005/148‑1 (MQ=255) cGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTGTTCGGTTCGGTGCTGACCGTTAGTGCCCAg > 4:365713/1‑148 (MQ=255) gggCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTGTTCGGTTCGGTGCTGACCGTTAGTGCCCAGGa < 5:70910/149‑1 (MQ=255) tCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGGTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTGTTCGGTTCGGTGCTGACCGTTAGTGCCCAGGACTTGc < 4:348979/148‑1 (MQ=255) gCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTGTTCGGTTCGGTGCTGACCGTTAGTGCCCAGGACTTGCTgg > 6:117608/1‑149 (MQ=255) 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cTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTGTTCGGTTCGGTGCTGACCGTTAGTGCCCAGGACTTGCTGGTACTGGGCAtcgtc > 8:198108/1‑138 (MQ=255) cTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTGTTCGGTTCGGTGCTGACCGTTAGTGCCCAGGACTTGCTGGTACTGGGCATCGTCGCggtgctggt > 4:223425/1‑149 (MQ=255) tCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGTTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTGTTCGGTTCGGTGCTGACCGTTAGTGCCCAGGACTTGCTGGTACTGGGCATCGTCGCggtgctggtgct > 1:148119/1‑149 (MQ=255) tCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTGTTCGGTTCGGTGCTGACCGTTAGTGCCCAGGACTTGCTGGTACTGGGCATCGTCGCggtgctggtg < 2:143170/147‑1 (MQ=255) ggTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTGTTCGGTTCGTTGCTGACCGTTAGTGCCCAGGACTTGCTGGTACTGGGCATCGTCGCGGTGCTGGTGCtt < 5:382460/148‑1 (MQ=255) ggTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTGTTCGGTTCGGTGCTGACCGTTAGTGCCCAGGACTTGCTGGTACTGGGCATCGTCGCGGTGCTGGTGCtt < 6:409990/148‑1 (MQ=255) gtgtCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTGTTCGGTTCGGTGCTGACCGTTAGTGccc < 6:381009/106‑1 (MQ=255) gtgtCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTGTTCGGTTCGGTGCTGACCGTTAGTGccc > 5:381009/1‑106 (MQ=255) gtCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTGTTCGGTTCGGTGCTGACCGTTAGTGCCCAGGACTTGCTGGTACTGGGCATCGTCGCGGTGCTGGTGCTTGc > 5:238732/1‑147 (MQ=255) gtCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTGTTCGGTTCGGTGCTGACCGTTAGTGCCCAGGACTTGCTGGTACTGGGCATCGTCGCGGTGCTGGTGCTTGc < 6:238732/147‑1 (MQ=255) gCTGGCGCCAAGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTGTTCGGTTCGGTGCTGACCGTTAGTGCCCAGGACTTGCTGGTACTGGGCATCGTCGCggtgc < 3:275226/134‑1 (MQ=255) gCTGGCGCCAAGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTGTTCGGTTCGGTGCTGACCGTTAGTGCCCAGGACTTGCTGGTACTGGGCATCGTCGCggtgc > 4:275226/1‑134 (MQ=255) gCTGGCGCCAAGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTGTTCGGTTCGGTGCTGACCGTTAGTGCCCAGGACTTGCTGGTACTGGGCATCGTCGCGGTGCTGGTGCTTGCCTTgg > 2:75425/1‑149 (MQ=255) cTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTGTTCGGTTCGGTGCTGACCGTTAGTGCCCAGGACTTGCTGGTACTGGGCATCGTCGCGGTGCTGGTGCTTGCCTTGgc < 1:339554/149‑1 (MQ=255) gcTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTGTTCGTTTCGGTGCTGACCGTTAGTGCCCAGGACTTGCTGGTACTGGGCATCGTCGCGGTGCTGGTGCTTGCCTTGGCGCTGc > 8:180247/1‑149 (MQ=255) gcTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTGTTCGGTTCGGTGCTGACCGTTAGTGCCCAGGACTTGCTGGTACTGGGCATCGTCGCGGTGCTGGTGCTTGCCTTGGCGCTGc > 1:358168/1‑149 (MQ=255) ttGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATc < 5:143390/50‑1 (MQ=255) ttGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATc > 6:143390/1‑50 (MQ=255) tGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTGTTCGGTTCGGTGCTGACCGTTAGTGCCCAGGACTTGCTGGTACTGGGCAtcgtc > 7:342348/1‑118 (MQ=255) tGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTGTTCGGTTCGGTGCTGACCGTTAGTGCCCAGGACTTGCTGGTACTGGGCAtcgtc < 8:342348/118‑1 (MQ=255) ggCGCCAGCCTGTTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTGTTCGGTTCGGTGCTGACCGTTAGTGCCCAGGACTTGCTGGTACTGGGCATCGTCGCGGTGCTGGTGCTTGCCTTGGCGCTGCCg < 2:148119/147‑1 (MQ=255) ggCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTGTTCGGTTCGGTGCTGACCGTTAGTGCCCAGGACTTGCTGGTACTGGGCATCGTCGCGGTGCTGGTGCTTGCCTTGGCGCTGCCGCt > 2:397314/1‑149 (MQ=255) | TGCTGGGTGAGCCCTATACCGGCCCTTACGGCAGCCTGTTCGGCTACTGCCTGCTGTTCGGCATCCTGCTCAACTTCCTGCGCAACCGTACCGGGCTGTCGCCGGATACACTGATTGGCGTGTTCCTGTCGGTGTCGCTGGCGCTTGGCGCCAGCCTGCTGCTGATGCTGGCAGGCAAGATCAACGTGCACATCCTCGAGAACGTGCTGTTCGGTTCGGTGCTGACCGTTAGTGCCCAGGACTTGCTGGTACTGGGCATCGTCGCGGTGCTGGTGCTTGCCTTGGCGCTGCCGCT > NC_002947/4331521‑4331815 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |