| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,348,705 | A→G | 47.0% | intergenic (‑70/+404) | PP_3820 ← / ← galU | group II intron‑encoding maturase/UTP‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,348,705 | 0 | A | G | 47.0% | 26.8 / 108.8 | 83 | intergenic (‑70/+404) | PP_3820/galU | group II intron‑encoding maturase/UTP‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (20/24); new base G (19/20); total (39/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.28e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.55e-01 | |||||||||||
CATTACGGTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTTGTGCCACCTCACC > NC_002947/4348594‑4348853 | cATTACGGTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGc < 5:178317/147‑1 (MQ=17) cGGTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGt < 6:402846/148‑1 (MQ=21) ggTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTAc < 5:217907/149‑1 (MQ=21) ggTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTa > 1:371072/1‑148 (MQ=34) ggTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTAc < 5:181995/149‑1 (MQ=34) ggtACCACCGAGACGGCGACGCCTACTGGAGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACa < 4:322687/147‑1 (MQ=19) gTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACa < 7:301346/149‑1 (MQ=21) gTTACCAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACa < 2:371072/149‑1 (MQ=34) ccAACGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGAt < 6:40188/148‑1 (MQ=21) aCGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCTGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTcc > 2:395735/1‑149 (MQ=21) cGAGACGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGGCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTccc < 7:273867/149‑1 (MQ=21) tagaCGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCa < 7:165500/148‑1 (MQ=21) gagaCGGCGACGCCTCCTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTcc > 5:334643/1‑147 (MQ=21) gaCGGCGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCa > 8:165500/1‑147 (MQ=21) cGACGCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAACCCTCCCCCACTTTACATGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAggg < 1:131947/149‑1 (MQ=11) gCCTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTcgc > 6:234168/1‑149 (MQ=21) cTACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTcgcgc > 5:40929/1‑149 (MQ=34) tACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTcgcgc > 7:313648/1‑148 (MQ=21) tACTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTcgcgc > 5:394824/1‑148 (MQ=34) aCTGGCGGCATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGa > 5:249014/1‑149 (MQ=34) gcggcATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTcc < 4:294231/128‑1 (MQ=25) gcggcATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTcc > 3:294231/1‑128 (MQ=25) gcATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTACACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCt > 3:14179/1‑149 (MQ=21) cATAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTg < 5:347700/149‑1 (MQ=34) tAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAgg > 7:245272/1‑126 (MQ=25) tAACCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAgg < 8:245272/126‑1 (MQ=25) aaCCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTcgcgc > 2:154125/1‑136 (MQ=21) aaCCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTcgcgc < 1:154125/136‑1 (MQ=21) aaCCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCt > 7:45657/1‑148 (MQ=34) aCCTGTTCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTa < 5:234168/149‑1 (MQ=21) ttCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGc < 3:324094/147‑1 (MQ=21) ttCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGc < 6:249014/147‑1 (MQ=34) ttCGGCCCTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCACCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGc < 3:46592/147‑1 (MQ=21) gCCCTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCg > 7:263875/1‑149 (MQ=21) gCCCTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGTCGGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTc < 1:111835/149‑1 (MQ=21) ccTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTcgcgc < 3:38584/124‑1 (MQ=25) ccTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTcgcgc > 4:38584/1‑124 (MQ=25) ccTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGa < 1:407810/149‑1 (MQ=21) ccTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGa < 2:28150/149‑1 (MQ=21) ccTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGa > 6:199823/1‑149 (MQ=34) cTTGGTGGCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGAt < 8:45657/149‑1 (MQ=34) gtggCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTAc < 1:28925/149‑1 (MQ=34) tggCGCGGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTACACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACg < 4:14179/149‑1 (MQ=21) gcgGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTca > 2:398448/1‑148 (MQ=21) cgGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTAt > 8:388698/1‑128 (MQ=35) cgGTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTAt < 7:388698/128‑1 (MQ=35) ggTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAg < 6:40929/149‑1 (MQ=34) ggTTAA‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAg > 2:151671/1‑149 (MQ=34) aa‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGtt > 1:24919/1‑149 (MQ=21) a‑‑‑‑CCGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTc > 2:55008/1‑149 (MQ=34) ccGCCACTTACTACGGCTTCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGt > 5:330498/1‑72 (MQ=32) 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ttCGGCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCtt > 8:150250/1‑149 (MQ=34) ggCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTgg < 6:205614/149‑1 (MQ=34) gCTGACTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGc < 8:313648/149‑1 (MQ=21) gCTGACTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGc > 3:245559/1‑149 (MQ=34) aCTTCTGCACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGAt < 6:227393/148‑1 (MQ=21) aCTTCTGCACGCTCATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGt < 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cACGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTTGTGCCa > 5:398187/1‑149 (MQ=21) aCGCTCGTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTTGTGCCAc > 6:332545/1‑149 (MQ=21) aCGCTCATCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGATTTGTGCCAc < 2:369776/149‑1 (MQ=34) gCTCGTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGAttt > 7:821/1‑140 (MQ=21) gCTCGTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGAttt < 8:821/140‑1 (MQ=21) gCTCGTCCCGTCGCCTTTCGACGCGCGGTAGCACAGT‑GGCAAGCGTACAGATCTCCCAGGGTAATTCGCGCGACCTTCCTGCTTATGCCTGTCGGATCTACGTCACAGCGTTCCGTGCAAGTATTGGGCTTTGGCGAt > 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NC_002947/4348594‑4348853 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |