Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,534,016 | C→T | 5.5% | G95G (GGC→GGT) | cpo → | non‑heme chloroperoxidase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,534,016 | 0 | C | T | 5.5% | 221.5 / 2.1 | 72 | G95G (GGC→GGT) | cpo | non‑heme chloroperoxidase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (34/34); new base T (2/2); total (36/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.60e-01 |
GCTGAAGGCTACCGCGTGGTCGCCCACGACCGGCGGGGCCATGGCCGCTCCAGCCAGGTATGGAACGGCCACGACATGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCTGAAGACAAGGTGGCCAAGGCCGTGTTGATCGCGGCCGTCCCCCCCTTGATGGTACAAACCCCCGGCAACCCCGGTGGCCTGCCCAAGTCGGTATTCGACG > NC_002947/4533870‑4534164 | gCTGAAGGCTACCGCGTGGTCGCCCACGACCGGCGGGGCCATGGCCGCTCCAGCCAGGTATGGAACGGCCACGACATGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCa > 7:219735/1‑149 (MQ=255) cTGAAGGCTACCGCGTGGTCGCCCACGACCGGCGGGGCCATGGCCGCTCCAGCCAGGTATGGAACGGCCACGACATGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCa > 4:23062/1‑148 (MQ=255) cTGAAGGCTACCGCGTGGTCGCCCACGACCGGCGGGGCCATGGCCGCTCCAGCCAGGTATGGAACGGCCACGACATGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCAc < 8:256894/149‑1 (MQ=255) tGAAGGCTACCGCGTGGTCGCCCACGACCGGCGGGGCCATGGCCGCTCCAGCCACGTATGGAACGGCCACGACATGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACt > 4:233362/1‑149 (MQ=255) aGGCTACCGCGTGGTCGCCCACGACCGGCGGGGCCATGGCCGCTCCAGCCAGGTATGGAACGGCCACGACATGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCGGTGCATGTCGGCCACTCGa > 6:133805/1‑149 (MQ=255) gCTACCGCGTGGTCGCCCACGACCGGCGGGGCCATGGCCGCTCCAGCCAGGTATGGAACGGCCACGACATGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGTCACTCGAcc > 3:27030/1‑149 (MQ=255) cTACCGCGTGGTCGCCCACGACCGGCGGGGCCATGGCCGCTCCAGCCAGGTATGGAACGGCCACGACATGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACcg > 5:209692/1‑149 (MQ=255) gTGGTCGCCCACGACCGGCGGGGCCATGGCCGCTCCAGCCAGGTATGGAACGGCCACGACATGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACcggcggcgg > 3:144614/1‑149 (MQ=255) tGGTCGCCCACGACCGGCGGGGCCATGGCCGCTCCAGCCAGGTATGGAACGGCCACGACATGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCggcggcggc < 6:248965/149‑1 (MQ=255) cccACGACCGGCGGGGCCATGGCCGCTCCAGCCAGGTATGGAACGGCCACGACATGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAggtg < 6:209692/149‑1 (MQ=255) ccACGACCGGCGGGGCCATGGCCGCTCCAGCCAGGTATGGAACGGCCACGACATGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAg > 7:338675/1‑145 (MQ=255) ccACGACCGGCGGGGCCATGGCCGCTCCAGCCAGGTATGGAACGGCCACGACATGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAg < 8:338675/145‑1 (MQ=255) cACGACCGGCGGGGCCATGGCCGCTCCAGCCAGGTATGGAACGGCCACGACATGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAggtggt < 4:144614/149‑1 (MQ=255) aCGACCGGCGGGGCCATGGCCGCTCCAGCCAGGTATGGAACGGCCACGACATGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGgtggtg < 5:264491/149‑1 (MQ=255) ggggCCATGGCCGCTCCAGCCAGGTATGGAACGGCCACGACATGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCTTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATg < 1:96476/149‑1 (MQ=255) ggggCCATGGCCGCTCCAGCCAGGTATGGAACGGCCACGACATGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATg < 1:90943/149‑1 (MQ=255) gggCCATGGCCGCTCCAGCCAGGTATGGAACGGCCACGACATGGACCACTATGCCGACGCCGTAGCCGCCGTGGTCGCACACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGAACGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATgg > 3:110912/1‑149 (MQ=255) ccATGGCCGCTCCAGCCAGGTATGGAACGGCCACGACATGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGccc < 6:200330/149‑1 (MQ=255) cATGGCCGCTCCAGCCAGGTATGGAACGGCCACGACATGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCg > 1:400375/1‑149 (MQ=255) gCCGCTCCAGCCAGGTATGGAACGGCCACGACATGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTAc < 3:187665/149‑1 (MQ=255) ccGCTCCAGCCAGGTATGGAACGGCCACGACATGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTAcc < 3:23062/149‑1 (MQ=255) cGCTCCAGCCAGGTATGGAACGGCCACGACATGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTAccc < 3:233362/149‑1 (MQ=255) gCTCCAGCCAGGTATGGAACGGCCACGACATGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTAc < 2:346446/134‑1 (MQ=255) gccagGTATGGAACGGCCACGACATGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCATGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCTGAAGa > 7:375190/1‑148 (MQ=255) cagGTATGGAACGGCCACGACATGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCTGAAGACaa < 3:247162/149‑1 (MQ=255) agGTATGGAACGGCCACGACATGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGGCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCTGAAGACAAg < 2:53429/149‑1 (MQ=255) tATGGAACGGCCACGACATGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCTGAAGACAAGGTg > 7:69783/1‑149 (MQ=255) aTGGAACGGCCACGACATGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCTGAAGACAAGGTgg > 7:116570/1‑149 (MQ=255) gAACGGCCACGACATGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGTCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCTGAAGACAAGGTGGCCa < 4:27030/149‑1 (MQ=255) gAACGGCCACGACATGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCTGAAGACAAGGTGGcc > 8:387663/1‑148 (MQ=255) aaCGGCCACGACATGGAACACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCACACCTGGACACCCAGGGTGCCGAGCATGTCGGCCACTCGACAGGCGGCCCCCAGGACGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCTGAAGACAAGGTGGCCaa > 4:394733/1‑149 (MQ=255) aCGGCCACGACATGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACAGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATCGCCCGGTACCCTGAAGACAAGGTGGCCAAg > 5:393100/1‑149 (MQ=255) cGGCCACGACATGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCTGAAGACAAGGTGGCCAAgg < 8:219735/149‑1 (MQ=255) cGGCCACGACATGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCTGAAGACAAGGTGGCCAAgg < 8:69783/149‑1 (MQ=255) aCGACATTGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCTGAAGACAAGGTGGCCAAGGCCgtg < 8:116570/149‑1 (MQ=255) aCGACATGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGTCCCGGTACCCTGAAGACAAGGTGGCCAAggacctg > 8:154759/1‑144 (MQ=255) cGACATGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCTGAAGACAAGGTGGCCAAGGCCgtgt < 2:7285/149‑1 (MQ=255) gACATGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAggtggt < 4:226965/101‑1 (MQ=255) gACATGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAggtggt > 3:226965/1‑101 (MQ=255) aCATGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCTGAAGACAAGGTGGCCAAGGCCgtg > 5:209050/1‑146 (MQ=255) tGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGTCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATg > 4:240929/1‑107 (MQ=255) tGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGTCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATg < 3:240929/107‑1 (MQ=255) tGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGACTTGGTCGCCGTCCTGGGCACCGTGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGGGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCTGATGACAAGGTGGGCAAGGCCGTGTTGATc < 4:110912/149‑1 (MQ=255) gACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCTGAAGACAAGGTGGCCAAGGCCgtgt > 4:4593/1‑142 (MQ=255) gACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCTGAAGACAAGGTGGCCAAGGCCgtgt < 3:4593/142‑1 (MQ=255) gACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCTGAAGACAAGGTGGCCAAGGCCGTGTTGATcgc > 6:153530/1‑149 (MQ=255) cACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCt < 8:68324/114‑1 (MQ=255) cACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCt > 7:68324/1‑114 (MQ=255) aCTTTGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGACACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCTGAAGACAAGGTGGCCAAGGCCGTGTTGATCGCGGcc < 3:394733/149‑1 (MQ=255) tATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGgtggtg < 6:157801/90‑1 (MQ=255) tATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGgtggtg > 5:157801/1‑90 (MQ=255) aTGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCTGAAGACAAGGTGGCCAAGGCCGTGTTGATCGCGGCCGTc > 2:157409/1‑149 (MQ=255) gCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCTGAAGACAAGGTGGCCAAGGCCGTGTTGATCGCgg < 3:49153/142‑1 (MQ=255) gCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCTGAAGACAAGGTGGCCAAGGCCGTGTTGATCGCgg > 4:49153/1‑142 (MQ=255) cgacgaCGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCTGAAGACAAGGTGGCCAAGGCCGTGTTGATCGCGGCCGTccccc > 8:93368/1‑149 (MQ=255) gCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCATGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCTGAAGACAAGGTGGCCAAGGCCGTGTTGATCGCGGCCGTCCCCCCCTTGATGGTACAAACCCCCgg < 8:375190/149‑1 (MQ=255) cACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCTGAAGACAAGGTGGCCAAGGCCGTGTTGATCGCGGCCGTCCCCCCCTTGATGGTACAAACCCCCGGCaa > 2:368170/1‑149 (MQ=255) aCCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACCTGGCCCGGTACCCTGAAGACAACGTGGCCCAGGCCGTGGTGATCGCGGCCCGGCCCCCCGTGGTGGGGCAAACCCCCgggccc > 1:302860/1‑145 (MQ=255) tGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCTGAAGACAAGGTGGCCAAGGCCGTGTTGATCGCGGCCGTCCCCCCCTTGATGGTACAAACCCCCGGCAAcccc > 2:351660/1‑149 (MQ=255) ccAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCTGAAGACAAGGTGGCCAAGGCCGTGTTGATCGCGGCCGTCGCCCCGGTGATGGTACAAACCCCCGGCAACCCCGGTGGcc > 1:245487/1‑149 (MQ=255) aGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCTGAAGACAAGGTGGCCAAGGCCGTGTTGATCGCGGCCGTCCCCCCCTTGATGGTACAAACCCCCGGCAACCCCGGTGGCCTg < 1:157409/149‑1 (MQ=255) gggTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCTGAAGACAAGGTGGCCAAGGCCGTGTTGATCGCGGCCGTCCCCCCCTTGATGGTACAAACCCCCGGCAACCCCGGTGGCCTGc > 6:144206/1‑149 (MQ=255) ggTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCTGAAGACAAGGTGGCCAAGGCCGTGTTGATCGCGGCCGTCCCCCCCTTGATGGTACAAACCCCCGGCAACCCCGGTGGCCTGcc < 5:144206/149‑1 (MQ=255) cGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCTGAAGACAAGGTGGCCAAGGCCGTGTTGATCGCGGCCGTCCCCCCCTTGATGGTACAAACCCCCGGCAACCCCGGTGGCCTGCCCAAGt > 1:197565/1‑149 (MQ=255) gTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCTGAAGACAAGGTGGCCAAGGCCGTGTTGATCGCGGCCGTCCCCCCCTTGATGGTACAAACCCCCGGCAACCCCGGTGGCCTGCCCAAGTc > 6:282347/1‑149 (MQ=255) cATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCTGAAGACAAGGTGGCCAAGGCCGTGTTGATCGCGGCCGTCCCCCCCTTGATGGTACAAACCCCCGGCAACCCCGGTGGCCTGCCCAAGTCgg < 7:93368/148‑1 (MQ=255) cATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCTGAAGACAAGGTGGCCAAGGCCGTGTTGATCGCGGCCGTCCCCCCCTTGATGGTACAAACCCCCGGCAACCCCGGTGGCCTGCCCAAGTCGGt < 5:153530/149‑1 (MQ=255) gTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTCCGCTACATCGCCCGGTACCCTGAAGACAACGTGGCCAAGGCAGTGTTGATCGCGGCCGACCCCAACATGATGGTACAAACACCCGGCAACCCCCGTGGCCTCCCAAAGTCTGTAtt > 6:277415/1‑149 (MQ=255) tgggCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCGTGAAGACAAGGTGGCGAAGGCCGTGTTGATCGCGGCCGTCCCCCCCTTGATGGTACAAACCCCCGGCAACCCCGGTGGCCTGCCCAAGTCGGTATTc < 6:393100/147‑1 (MQ=255) ggCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCTGAAGACAAGGTGGCCAAGGCCGTGTTGATCGCGGCCGTCCCCCCCTTGATGGTACAAACCCCCGGCAACCCCGGTGGCCTGCCCAAGTCgg > 8:162395/1‑142 (MQ=255) ggCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCTGAAGACAAGGTGGCCAAGGCCGTGTTGATCGCGGCCGTCCCCCCCTTGATGGTACAAACCCCCGGCAACCCCGGTGGCCTGCCCAAGTCgg < 7:162395/142‑1 (MQ=255) gCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCTGAAGACAAGGTGGCCAAGGCCGTGTTGATCGCGGCCGTCCCCCCCTTGATGGTACAAACCCCCGGCAACCCCGGTGGCCTGCCCAAGTCGGTATTCGAc < 1:351660/149‑1 (MQ=255) ccACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCTGAAGACAAGGTGGCCAAGGCCGTGTTGATCGCGGCCGTCCCCCCCTTGATGGTACAAACCCCCGGCAACCCCGGTGGCCTGCCCAAGTCGGTATTCGACg < 5:282347/149‑1 (MQ=255) | GCTGAAGGCTACCGCGTGGTCGCCCACGACCGGCGGGGCCATGGCCGCTCCAGCCAGGTATGGAACGGCCACGACATGGACCACTATGCCGACGACGTAGCCGCCGTGGTCGCCCACCTGGGCACCCAGGGTGCCGTGCATGTCGGCCACTCGACCGGCGGCGGCGAGGTGGTGCGCTACATGGCCCGGTACCCTGAAGACAAGGTGGCCAAGGCCGTGTTGATCGCGGCCGTCCCCCCCTTGATGGTACAAACCCCCGGCAACCCCGGTGGCCTGCCCAAGTCGGTATTCGACG > NC_002947/4533870‑4534164 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |