Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,557,034 | A→C | 6.8% | L148R (CTG→CGG) | gntZ ← | 6‑phosphogluconate dehydrogenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,557,034 | 0 | A | C | 6.8% | 213.2 / 4.8 | 70 | L148R (CTG→CGG) | gntZ | 6‑phosphogluconate dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (33/32); new base C (2/3); total (35/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CTCGATGCCGTTATGCACCATTTTCACGTAGTGCCCGGCGCCCGGTGGACCGGCATGGATGTAGCCGTGCTCGGCACGCTGGTGCTCGCCGCTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTCCAGGCCCCACACGCCGCCGGAAGTCCCGACGTCCAGATAATGCAGGCCGCGCTTGGCCAGTTCTGCAGCGCGGCGCATGTCGTCCTT > NC_002947/4556889‑4557182 | cTCGATGCCGTTATGCACCATTTTCACGTAGTGCCCGGCGCCCGGTGGACCGGCATGGATGTAGCCGTGCTCGGCACGCTGGTGCTCGCCGCTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCg < 8:317856/149‑1 (MQ=255) tCGATGCCGTTATGCACCATTTTCACGTAGTGCCCGGCGCCCGGTGGACCGGCATGGATGTAGCCGTGCTCGGCACGCTGGTGCTCGCCGCTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCgg > 6:296201/1‑149 (MQ=255) gATGCCGTTATGCACCATTTTCACGTAGTGCCCGGCGCCCGGTGGACCGGCATGGATGTAGCCGTGCTCGGCACGCTGGTGCTCGCCGCTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTGGAACCGctg < 7:302804/147‑3 (MQ=255) aTGCCGTTATGCAACATTTTCACGTTCTGCCCGGCGCCCGGTGGACCGGCATGGATGTAGCCGTGCTCGGCACGCTGGTGCTCGCCGCTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTc < 7:80117/149‑1 (MQ=255) cGTTATGCACCATTTTCACGTAGTGCCCGGCGCCCGGTGGACCGGCATGGATGTAGCCGTGCTCGGCACGCTGGTGCTCGCCGCTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGAGCCTTGAACAGAGCTTCCAgg > 1:274036/1‑149 (MQ=255) gTTATGCACCATTTTCACGTAGTGCCCGGCGCCCGGTGGACCGGCATGGATGTAGCCGTGCTCGGCACGCTGGTGCTCGCCGCTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTGGAACCGCTGTTCAAGgc < 5:241948/149‑1 (MQ=255) tGCACCATTTTCACGTAGTGCCCGGCGCCCGGTGGACCGGCATGGATGTAGCCGTGCTCGGCACGCTGGTGCTCGCCGCTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTc < 7:103121/149‑1 (MQ=255) cACCATTTTCACGTAGTGCCCGGCGCCCGGTGGACCGGCATGGATGTAGCCGTGCTCGGCACGCTGGTGCTCGCCGCTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCgg > 7:119185/1‑135 (MQ=255) cACCATTTTCACGTAGTGCCCGGCGCCCGGTGGACCGGCATGGATGTAGCCGTGCTCGGCACGCTGGTGCTCGCCGCTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCgg < 8:119185/135‑1 (MQ=255) aCCATTTTCACGTAGGGCCCGGCGCCCGGTGGACCGGCATGGATGTAGCCGTGCTCGGCACGCTGGTGCTCGCCGCTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGaa < 4:248236/149‑1 (MQ=255) ccATTTTCACGTAGTGCCCGGCGCCCGGTGGACCGGCATGGATGTAGCCGTGCTCGGCACGCTGGTGCTCGCCGCTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCCAAGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGaa < 1:41761/149‑1 (MQ=255) aTTTTCACGTAGTGCCCGGCGCCCGGTGGACCGGCATGGATGTAGCCGTGCTCGGCACGCTGGTGCTCGCCGCTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAacac < 1:5707/149‑1 (MQ=255) ttttCACGTAGTGCCCGGCGCCCGGTGGACCGGCATGGATGTAGCCGTGCTCGGCACGCTGGTGCTCGCCGCTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGTCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTcc > 3:270825/1‑134 (MQ=255) ttttCACGTAGTGCCCGGCGCCCGGTGGACCGGCATGGATGTAGCCGTGCTCGGCACGCTGGTGCTCGCCGCTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTcc < 4:270825/134‑1 (MQ=255) gTAGTGCCCGGCGCCCGGTGGACCGGCATGGATGTAGCCGTGCTCGGCACGCTGGTGCTCGCCGCTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCtttt > 8:313079/1‑149 (MQ=255) gTGCCCGGCGCCCGGTGGACCGGCATGGATGTAGCCGTGCTCGGCACGCTGGTGCTCGCCGCTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTcg < 2:274036/148‑1 (MQ=255) cccGGCGCCCGGTGGACCGGCATGGATGTAGCCGTGCTCGGCACGCTGGTGCTCGCCGCTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTc < 8:28034/120‑1 (MQ=255) cccGGCGCCCGGTGGACCGGCATGGATGTAGCCGTGCTCGGCACGCTGGTGCTCGCCGCTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTc > 7:28034/1‑120 (MQ=255) cGGCGCCCGGTGGACCGGCATGGATGTAGCCGTGCTCGGCACGCTGGTGCTCGCCGCTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGt > 5:81642/1‑135 (MQ=255) cGGCGCCCGGTGGACCGGCATGGATGTAGCCGTGCTCGGCACGCTGGTGCTCGCCGCTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGt < 6:81642/135‑1 (MQ=255) ggACCGGCATGGATGTAGCCGTGCTCGGCACGCGGGTGCTCGCCGCTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCa < 5:274214/149‑1 (MQ=255) cGGCATGGATGTAGCCGTGCTCGGCACGCTGGTGCTCGCCGCTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAg > 2:369599/1‑149 (MQ=255) cGGCATGGATGTAGCCGTGCTCGGCACGCTGGTGCTCGCCGCTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAg > 2:90514/1‑149 (MQ=255) aTGTAGCCGTGCTCGGCACGCTGGTGCTCGCCGCTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTc > 5:245008/1‑149 (MQ=255) gTAGCCGTGCTCGGCACGCTGGTGCTCGCCGCTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTc > 8:217574/1‑147 (MQ=255) tAGCCGTGCTCGGCACGCTGGTGCTCGCCGCTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCCGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGAAGCCGCGGTCCAg > 5:20926/1‑149 (MQ=255) gaGCCGTGCTCGGCACGCTGGTGCTCGCCGCTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTCCa < 7:291699/147‑1 (MQ=255) aGCCGTGCTCGGCACGCTGGTGCTCGCCGCTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCCGGCGCTCGAACAGGTCGGTTTCGCCGCCGCTCATCATGCAGTAGCCGCGGTCCAgg > 8:365406/1‑149 (MQ=255) ccGTGCTCGGCACGCTGGTGCTCGCCGCTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTCCAGGc < 8:212292/148‑1 (MQ=255) cGGCACGCTGGTGCTCGCCGCTGCGGCCATGCGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTCCAGGCCCCACAcg > 8:284008/1‑149 (MQ=255) ggCACGCTGGTGCTCGCCGCTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCgccgcc > 6:165036/1‑111 (MQ=255) ggCACGCTGGTGCTCGCCGCTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCgccgcc < 5:165036/111‑1 (MQ=255) ggCACGCTGGTGCTCGCCGCTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTCCAGGCCCCACAcgc > 8:110472/1‑149 (MQ=255) gTGCTCGCCGCTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTCCAGGCCCCACACGCCGCCGGaa < 7:313079/148‑1 (MQ=255) tGCTCGCCGCTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACa > 4:143764/1‑64 (MQ=255) tGCTCGCCGCTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACa < 3:143764/64‑1 (MQ=255) cTCGCCGCTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTcc > 2:44830/1‑124 (MQ=255) cTCGCCGCTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTcc < 1:44830/124‑1 (MQ=255) tCGCCGCTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGTCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTCCAGGCCCCACACGCCGCCGGAAGTccc > 5:182882/1‑149 (MQ=255) gccgcTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTCCAGGCCCCACACGCCGCCGGAAGTCCCGa > 1:168986/1‑149 (MQ=255) cTGCGGCCATGGGTACGCGGGAGGGGGCCCAGGCCCGGCGCC‑AGCGCGTTCAACAGCGGTTCCAGGCGCTCTAACACGTCCTTTTCGCCGCCTATCATCATGTAGTAGCCGCGGTCCAGGCCCCACACGCCGCCGGAAGTCCCGACGTc < 1:90514/149‑1 (MQ=255) gCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCTCGGTCCAGGCCCCACACGCCGCCgg < 4:320206/131‑1 (MQ=255) gCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTCCAGGCCCCACACGCCGCCgg > 3:320206/1‑131 (MQ=255) aTGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTCCAGGCCCCACACGCCGCCGGAAGTCCCGACGTCCAGATAAt > 3:209667/1‑149 (MQ=255) ggTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTCCAGGCCCCACACGGCGCCGGAAGTCCCGACGTCCAGATAATGc < 7:284008/148‑1 (MQ=255) gTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTCCAGGCCCCACACGCCGCCGGAAGTCCCGACGTCCAGATAATGCAg > 2:301056/1‑149 (MQ=255) tACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTCCAGGCCCCACACGCCGCCGGAAGTCCCGACGTCCAGATAATGCAgg < 4:209667/149‑1 (MQ=255) cgGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTCCAGGCCCCACACGCCGCCGGAAGTCCCGACGTCCAGATAATGCa > 2:214757/1‑143 (MQ=255) cgGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTCCAGGCCCCACACGCCGCCGGAAGTCCCGACGTCCAGATAATGCa < 1:214757/143‑1 (MQ=255) aTGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGTCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTCCAGGCCCCACACGCCGCCGGAAGTCCCGACGTCCAGATAATGCAGGCCGCGCtt < 6:182882/149‑1 (MQ=255) gTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTCCAGGCCCCACACGCCGCCGGAAGTCCCGACGTCCa > 3:188079/1‑128 (MQ=255) gTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTCCAGGCCCCACACGCCGCCGGAAGTCCCGACGTCCa < 4:188079/128‑1 (MQ=255) gCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTCCAGGCCCCACAcgc > 4:203431/1‑104 (MQ=255) gCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTCCAGGCCCCACAcgc < 3:203431/104‑1 (MQ=255) gCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTCCAGGCCCCACACGCCGCCGGAAGTCCCGACGTCCAGATAATGCAGGCCGCGCTTGGcc < 3:215913/148‑1 (MQ=255) gCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTCCAGGCCCCACACGCCGCCGGAAGTCCCGACGTCCAGATAATGCAGGCCGCGCTTGGcc < 1:143035/148‑1 (MQ=255) gCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTCCAGGCCCCACACGCCGCCGGAAGTCCCGACGTCCAGATAATGCAGGCCGCGCTTGGc > 3:265067/1‑147 (MQ=255) cccACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTCCAGGCCCCACACACCGCCGGAAGTCCCGACGTCCAGATAATGCAGGCCGCGCTTGGCCAg > 2:166490/1‑149 (MQ=255) cACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTCCAGGCCCCACACgccgcc > 6:37515/1‑105 (MQ=255) cACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTCCAGGCCCCACACgccgcc < 5:37515/105‑1 (MQ=255) gCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTCCAGGCCCCACACGCCGCCGGAAGTCCCGACGTCCAGATAATGCAGGCCGCGCTTGGCCAGTTCTg > 7:231084/1‑149 (MQ=255) gCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTCCAGGCCCCACACGCCGCCGGAAGTCCCGACGTCCAGATAATGCAGGCCGCGCTTGGCCAGTTCTg < 8:231084/149‑1 (MQ=255) ccGGCGCC‑AGCGCCTTGAACCGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTCCAGGCCCCACACGCCGCCGGAAGTCCCGACGTCCAGATAATGCAGGCCGCGCTTGGCCAGTTCTg > 6:244050/1‑147 (MQ=255) ccGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTCCAGGCCCCACACGCCGCCGGAAGTCCCGACGTCCAGATAATGCAGGCCGCGCTTGGCCAGTTCTGCa < 1:369599/149‑1 (MQ=255) gaGCGCCTGGAACCGCTGTTCAAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTCCAGGCCCCACACGCCGCCGGAAGTCCCGACGTCCAGATAATGCAGGCCGCGCTTGGCCAGTTCTGCAGCgcggc > 5:2071/2‑149 (MQ=255) aGCGCCTGGAACCGCTGTTCAAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTCCAGGCCCCACACGCCGCCGGAAGTCCCGACGTCCAGATAATGCAGGCCGCGCTTGGCCAGTTCTGCa < 3:78256/141‑1 (MQ=255) gcCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTCCAGGCCCCACACGCCGCCGGAAGTCCCGACGTCCAGATAATGCAGGCCGCGCTTGGCCAGTTCTGCAGCGCGGCGCAt > 3:193453/1‑149 (MQ=255) cTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTCCAGGCCCCACACGCCGCCGGAAGTCCCGACGTCCAGATAATGCAGGCCGCGCTTGGCCAGTTCTg < 6:352917/134‑1 (MQ=255) cTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTCCAGGCCCCACACGCCGCCGGAAGTCCCGACGTCCAGATAATGCAGGCCGCGCTTGGCCAGTTCTg > 5:352917/1‑134 (MQ=255) tGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTCCAGGCCCCACACGCCGCCGGAAGTCCCGACGTCCAGATAATGCAGGCCGCGCTTGGCCAGTTCTGCAGCGCGGCGCATgtcg > 2:331086/1‑149 (MQ=255) aaCAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTCCAGGCCCCACACGCCGCCGGAAGTCCCGACGTCCAGATAATGCAGGCCGCGCTTGGCCAGTTCTGCAGCGCGGCGCATgtcgtc > 6:142602/1‑149 (MQ=255) aCAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTCCAGGCCCCACACGCCGCCGGAAGTCCCGACGTCCAGATAATGCAGGCCGCGCTTGGCCAGTTCTGCAGCGCGGCGCATGTCGTcc < 4:265067/149‑1 (MQ=255) aGCGGTTCCAGGCGCTAGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGAGGTCCAGGCCCCACACGCCGCCGGAAGTCCCGACGTCCAGATAATGCAGGCCTCGCTAGGACAGTTCTGCAGCGCGGCGCATGTCGTCCtt > 7:329267/1‑149 (MQ=255) | CTCGATGCCGTTATGCACCATTTTCACGTAGTGCCCGGCGCCCGGTGGACCGGCATGGATGTAGCCGTGCTCGGCACGCTGGTGCTCGCCGCTGCGGCCATGGGTACGCGGGATGTCGCCCACGCCCGGCGCC‑AGCGCCTTGAACAGCGGTTCCAGGCGCTCGAACACGTCCTTTTCGCCGCCGATCATCATGCAGTAGCCGCGGTCCAGGCCCCACACGCCGCCGGAAGTCCCGACGTCCAGATAATGCAGGCCGCGCTTGGCCAGTTCTGCAGCGCGGCGCATGTCGTCCTT > NC_002947/4556889‑4557182 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |