| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,734,028 | T→G | 5.1% | E536A (GAG→GCG) | sucA ← | 2‑oxoglutarate dehydrogenase subunit E1 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,734,028 | 0 | T | G | 5.1% | 251.8 / 4.2 | 78 | E536A (GAG→GCG) | sucA | 2‑oxoglutarate dehydrogenase subunit E1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (39/35); new base G (2/2); total (41/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.19e-01 | |||||||||||
CTTCGACACCTGACGCTGGACCACGAAACCTTCCGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGA‑CAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGATGCGACCGGCCTGGATCAGCTGCTCGGCATACAGCTCACGGGTAGTGC > NC_002947/4733883‑4734175 | cTTCGACACCTGACGCTGGACCACGAAACCTTCCGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGA‑CAGATCCTGCAGGGTCGTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTcgc > 3:101371/1‑149 (MQ=255) ttCGACACCTGACGCTGGACCACGGAACCTTCCGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGA‑CAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTcgcg > 8:167454/1‑149 (MQ=255) tCGACACCTGACGCTGGACCACGAAACCTTCCGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGA‑CAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCgg > 7:204847/1‑149 (MQ=255) acacCTGACGCTGGACCACGAAACCTTCCGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGA‑CAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTc < 2:289083/149‑1 (MQ=255) ccTGACGCTGGACCACGAAACCTTCCGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGA‑CAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGc < 6:164364/149‑1 (MQ=255) cGCTGGACCACGAAACCTTCCGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGA‑CAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCtt < 7:88844/149‑1 (MQ=255) gCTGGACCACGAAACCTTCCGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGA‑CAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCtt > 1:170213/1‑148 (MQ=255) gCTGGACCACGAAACCTTCCGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGA‑CAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCtt > 7:17803/1‑148 (MQ=255) gACCACGGAACCTTCCGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGA‑CAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGAc < 7:167454/147‑1 (MQ=255) ccACGAAACCTTCCGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGA‑CAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACCGCGAGCTGTTCgc < 1:103842/136‑2 (MQ=255) ccACGAAACCTTCCGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGA‑CAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACCGCGAGCTGTTCgc > 2:103842/1‑135 (MQ=255) ccACGAAACCTTCCGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGA‑CAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAgg > 3:66210/1‑149 (MQ=255) cACGAAACCTTCCGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGA‑CAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTcgc > 8:141296/1‑128 (MQ=255) aCGAAACCTTCCGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGA‑CAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCt > 3:56108/1‑149 (MQ=255) cGAAACCTTCCGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGA‑CAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCtt > 5:413002/1‑149 (MQ=255) cTTCCGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGAGCAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTAc > 1:24083/1‑149 (MQ=255) ccGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGA‑CAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCAc < 2:170213/148‑1 (MQ=255) ccGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGA‑CAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCAc < 8:17803/148‑1 (MQ=255) cGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGA‑CAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGt > 1:321149/1‑149 (MQ=255) cTCGAGCAGCTTGGCCGA‑CAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTcg > 2:160644/1‑109 (MQ=255) cTCGAGCAGCTTGGCCGA‑CAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTcg < 1:160644/109‑1 (MQ=255) gcagcTTGGCCGA‑CAGATCCTGCAGGGTCTGGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTg < 4:138399/149‑1 (MQ=255) agcTTGGCCGA‑CAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTc < 4:65392/149‑1 (MQ=255) agcTTGGCCGA‑CAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTc < 8:92842/149‑1 (MQ=255) gcTTGGCCGA‑CAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTc < 3:95033/148‑1 (MQ=255) cTTGGCCGA‑CAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTc > 4:95033/1‑147 (MQ=255) ccGA‑CAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGcgcg > 5:53418/1‑149 (MQ=255) cGA‑CAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGAc < 3:178546/111‑1 (MQ=255) cGA‑CAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGAc > 4:178546/1‑111 (MQ=255) cGA‑CAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGt > 5:187946/1‑149 (MQ=255) gA‑CAGATGATGCAGTGTCTTGTGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGACAGTCGACGAAAAGCTCGCGGTTCGGCTACTTTACCAGGCTTTTTACCAGGTGCAGGCCTTTGTCCAGAGCGtt < 4:101371/149‑1 (MQ=255) gA‑CAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGtt < 2:24083/149‑1 (MQ=255) ataTCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTc < 8:362203/94‑1 (MQ=255) aGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCg > 4:299882/1‑149 (MQ=255) aTCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCgg > 7:131098/1‑148 (MQ=255) cTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACt > 2:21281/1‑149 (MQ=255) cAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACtcgt < 6:53418/149‑1 (MQ=255) cAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACtcgt < 7:209099/149‑1 (MQ=255) cAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACtcgt < 4:56108/149‑1 (MQ=255) cAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACtcgt < 6:187946/149‑1 (MQ=255) gggTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACtcgtcg < 8:131098/149‑1 (MQ=255) gTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGAt < 8:204847/149‑1 (MQ=255) tCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTAACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCTGTACTCGTCGAt > 4:16195/1‑148 (MQ=255) ggTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGcc > 3:310596/1‑149 (MQ=255) ggTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGc < 3:299882/148‑1 (MQ=255) ggTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCAAGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCAATGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGTcc > 3:305057/1‑149 (MQ=255) gTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCt > 6:199087/1‑149 (MQ=255) cGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCt > 1:294840/1‑147 (MQ=255) aaCGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTAc > 3:252391/1‑128 (MQ=255) aaCGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTAc < 4:252391/128‑1 (MQ=255) gtCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCgg < 4:66210/149‑1 (MQ=255) gTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCCGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGAGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGAGCTCTCGGCGt > 8:294986/1‑149 (MQ=255) gTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGAAGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTAATCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGt > 7:72359/1‑149 (MQ=255) cgcgcgGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGAt < 8:302502/149‑1 (MQ=255) gcgcgGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACtcgt > 4:342862/1‑117 (MQ=255) gcgcgGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGATg > 1:266554/1‑149 (MQ=255) cgcgGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGATGc < 6:413002/149‑1 (MQ=255) tCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCGATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGAGCGCTCGGCGTCGATGCGACCg > 5:301773/1‑149 (MQ=255) aGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGATGCGACCGGcc < 5:199087/149‑1 (MQ=255) cccAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGATGCGACCGGCCTGGATCAg > 1:371361/1‑149 (MQ=255) cccAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGATGCGACCGGCCTGGATCAg < 2:321149/149‑1 (MQ=255) ccAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGATGCGACCGGCCTGGATCAgc > 6:420018/1‑149 (MQ=255) aGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCt > 1:78092/1‑109 (MQ=255) aGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCt < 2:78092/109‑1 (MQ=255) ggACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGc < 3:15015/101‑1 (MQ=255) ggACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGc > 4:15015/1‑101 (MQ=255) ggACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGATGCGACCGGCCTGGATCAGCTGCTCGGc < 7:252609/149‑1 (MQ=255) gccgaACCGCGAGCTGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGATGCGACCGGCCTGGATCAGCTGCTCGGCATACAGCt > 1:374351/3‑146 (MQ=255) gccgaACCGCGAGCTGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGATGCGACCGGCCTGGATCAGCTGCTCGGCATACAGCt < 2:374351/144‑1 (MQ=255) cgaACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGATGCGACCGGCCTGGATCAGCTGCTCGGCATACAGCTCACgg < 2:266554/149‑1 (MQ=255) cgaACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGATGCGACCGGCCTGGATCAGCTGCTCGGCATACAGCTCACgg < 2:371361/149‑1 (MQ=255) gaACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGATGCGACCGGCCt < 6:127735/119‑1 (MQ=255) gaACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGATGCGACCGGCCt > 5:127735/1‑119 (MQ=255) gaACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGATGCGACCGGCCTGGATCAGCTGCTCGGCATAc < 6:377562/139‑1 (MQ=255) gaACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGATGCGACCGGCCTGGATCAGCTGCTCGGCATAc > 5:377562/1‑139 (MQ=255) gaACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGATGCGACCGGCCTGGATCAGCTGCTAGGCATACAGCTCACgg > 3:48983/1‑148 (MQ=255) cAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGATGCGACCGGCCTGGATCAGCTGCTCGGCATACAGCTCACGGGTAg > 1:234036/1‑149 (MQ=255) cTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGATGCGACCGGCCTGGATCAGCTGCTCGGCATACAGCTCACGGGTAGTgc > 7:167772/1‑149 (MQ=255) tCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCa < 4:310529/52‑1 (MQ=255) tCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCa > 3:310529/1‑52 (MQ=255) | CTTCGACACCTGACGCTGGACCACGAAACCTTCCGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGA‑CAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGATGCGACCGGCCTGGATCAGCTGCTCGGCATACAGCTCACGGGTAGTGC > NC_002947/4733883‑4734175 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |