| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,788,247 | G→C | 5.7% | L1865V (CTA→GTA) | pvdI ← | non‑ribosomal peptide synthetase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,788,247 | 0 | G | C | 5.7% | 226.3 / 3.1 | 70 | L1865V (CTA→GTA) | pvdI | non‑ribosomal peptide synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (38/27); new base C (2/2); total (40/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.56e-01 | |||||||||||
CTGGCGAGCAGTTCGCCGCCGATCATCAGTTCGCCGACCGCGCCATTGAGCACAGCACCGCCGCTGTTATCCAGCAGGTGGATGCTGCGCCCGGCCAGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTATTGAGCAGCGTTACATGGCCAAGGCCCGCCGCCTGCCAGGCGAGCAAGCCCTCCGGCGGCATGGCTTCGCCGCCGGCGTGAAACTGGTGC > NC_002947/4788099‑4788395 | cTGGCGAGCAGTTCGCCGCCGATCATCAGTTCGCCGACCGCGCCATTGAGCACAGCACCGCCGCTGTTATCCAGCAGGTGGATGCTGCGCCCGGCCAGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAg < 7:69160/149‑1 (MQ=255)attacGAGCAGTTCGCCGCCGATCATCAGTTCGCCGACCGCGCCATTGAGCACAGCACCGCCGCTGTTATCCAGCAGGTGGATGCTGCGCCCGGCCAGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAg < 7:127670/145‑1 (MQ=255) gCGAGCAGTTCGCCGCCGATCATCAGTTCGCCGACCGCGCCATTGAGCACAGCACCGCCGCTGTTATCCAGCAGGTGGATGCTGCGCCCGGCCAGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTa < 8:140996/149‑1 (MQ=255) ttCGCCGCCGATCATCAGTTCGCCGACCGCGCCATTGAGCACAGCACCGCCGCTGTTATCCAGCAGGTGGATGCTGCGCCCGGCCAGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGgcgcg > 7:106279/1‑148 (MQ=255) cgccgcCGATCATCAGTTCGCCGACCGCGCCATTGAGCACAGCACCGCCGCTGTTATCCAGCAGGTGGATGCTGCGCCCGGCCAGCACCAGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAg > 5:110729/1‑149 (MQ=255) ccgccgATCATCAGTTCGCCGACCGCGCCATTGAGCACAGCACCGCCGCTGTTATCCAGCAGGTGGATGCTGCGCCCGGCCAGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTc < 5:152586/149‑1 (MQ=255) cgccgATCATCAGTTCGCCGACCGCGCCATTGAGCACAGCACCGCCGCTGTTATCCAGCAGGTGGATGCTGCGCCCGGCCAGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTc < 8:228971/148‑1 (MQ=255) cgccgATCATCAGTTCGCCGACCGCGCCATTGAGCACAGCACCGCCGCTGTTATCCAGCAGGTGGATGCTGCGCCCGGCCAGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTc > 7:228971/1‑148 (MQ=255) gccgATCATCAGTTCGCCGACCGCGCCATTGAGCACAGCACCGCCGCTGTTATCCAGCAGGTGGATGCTGCGCCCGGCCAGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGt < 7:37404/149‑1 (MQ=255) atcaGTTCGCCGACCGCGCCATTGAGCACAGCACCGCCGCTGTTATCCAGCAGGTGGATGCTGCGCCCGGCCAGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCa < 5:207997/137‑1 (MQ=255) atcaGTTCGCCGACCGCGCCATTGAGCACAGCACCGCCGCTGTTATCCAGCAGGTGGATGCTGCGCCCGGCCAGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCa > 6:207997/1‑137 (MQ=255) gTTCGCCGACCGCGCCATTGAGCACAGCACCGCCGCTGTTATCCAGCAGGTGGATGCTGCGCCCGGCCAGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAAcc > 5:270656/1‑149 (MQ=255) gTTCGCAGACCTAGCCATAGAGCACAGCACCGCCGCAGTTATCCAGCAGGTGGATGCTGCGCCCGGCCAGCACCCGCCCGATCGGCATCACCGTTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACATAGGTAAGGCTCGCAGTAGACGGCTGTAAcc > 8:105351/1‑149 (MQ=255) gCCGACCGCGCCATTGAGCACAGCACCGCCGCTGTTATCCAGCAGGTGGATGCTGCGCCCGGCCAGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGa > 6:382970/1‑149 (MQ=255) cGACCGCGCCATTGAGCACAGCACCGCCGCTGTTATCCAGCAGGTGGATGCTGCGCCCGGCCAGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACg < 6:409174/149‑1 (MQ=255) gcCATTGAGCACAGCACCGCCGCTGTTATCCAGCAGGTGGATGCTGCGCCCGGCCAGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTACGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCt > 1:387471/1‑149 (MQ=255) gcCATTGAGCACAGCACCGCCGCTGTTATCCAGCAGGTGGATGCTGCGCCCGGCCAGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTACGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCt > 1:393795/1‑149 (MQ=255) cATTGAGCACAGCACCGCCGCTGTTATCCAGCAGGTGGATGCTGCGCCCGGCCAGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCt > 6:170289/1‑147 (MQ=255) cATTGAGCACAGCACCGCCGCTGTTATCCAGCAGGTGGATGCTGCGCCCGGCCAGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCt > 3:233194/1‑147 (MQ=255) aTTGAGCACAGCACCGCCGCTGTTATCCAGCAGGTGGATGCTGCGCCCGGCCAGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTggg > 4:71751/1‑125 (MQ=255) aTTGAGCACAGCACCGCCGCTGTTATCCAGCAGGTGGATGCTGCGCCCGGCCAGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTggg < 3:71751/125‑1 (MQ=255) gAGCACAGCACCGCCGCTGTTATCCAGCAGGTGGATGCTGCGCCCGGCCAGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCg > 3:157785/1‑149 (MQ=255) agcacCGCCGCTGTTATCCAGCAGGTGGATGCTGCGCCCGGCCAGCACACGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTATGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGTCC‑‑‑‑Gt < 7:42147/149‑1 (MQ=255) gccgcTGTTATCCAGCAGGTGGATGCTGCGCCCGGCCAGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAg < 4:237921/145‑1 (MQ=255) gccgcTGTTATCCAGCAGGTGGATGCTGCGCCCGGCCAGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAg > 3:237921/1‑145 (MQ=255) ttATCCAGCAGGTGGATGCTGCGCCCGGCCAGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGCCGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTATTGagcag > 8:166714/1‑149 (MQ=255) aTCCAGCAGGTGGATGCTGCGCCCGGCCAGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTATTGAGCAGCg > 6:364029/1‑149 (MQ=255) aTCCAGCAGGTGGATGCTGCGCCCGGCCAGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTATTGAGCAGCg > 4:45453/1‑149 (MQ=255) tCCAGCAGGTGGATGCTGCGCCCGGCCAGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTATTGAGCAGCGt > 3:310787/1‑149 (MQ=255) agcagGTGGATGCTGCGCCCGGCCAGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTATTGAGCAGCGTTa > 4:169734/1‑148 (MQ=255) agcagGTGGATGCTGCGCCCGGCCAGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTATTGAGCAGCGTTAc < 4:233194/149‑1 (MQ=255) agGTGGATGCTGCGCCCGGCCAGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTATTGAGCAGCGTTACATg < 5:382970/149‑1 (MQ=255) gTGGATGCTGCGCCCGGCCAGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCGCCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGAATTGAGCAGTGTTACATGGc > 2:251435/1‑149 (MQ=255) tGGATGCTGCGCCCGGCCAGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTa < 2:355646/125‑1 (MQ=255) tGGATGCTGCGCCCGGCCAGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTa > 1:355646/1‑125 (MQ=255) tGGATGCTGCGCCCGGCCAGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTATTGAGCAGCGTTACATGGc > 8:323888/1‑148 (MQ=255) ccGGCCAGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCCCCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTATTGAGCAGCGTTACATGGCCAAGGCCcgccgc > 5:134558/1‑149 (MQ=255) cGGCCAGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTATTGAGCAGCGTTACATGGCCAAGGCCCgccgcc > 1:322362/1‑149 (MQ=255) gCCAGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTATTGAGCAGCGTTAc < 8:108926/128‑1 (MQ=255) gCCAGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTATTGAGCAGCGTTAc > 7:108926/1‑128 (MQ=255) cAGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTATTGAGCAGCGTTACATGGCCAAGGCCCGCCGCCTGc > 2:337348/1‑148 (MQ=255) aGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCt > 3:291383/1‑94 (MQ=255) aGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCt < 4:291383/94‑1 (MQ=255) gCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTATTGAGCAGCGTTACATGGCCAAGGCCCGCCGCCTGCCAg < 6:270656/149‑1 (MQ=255) ccaggCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTATTGAGCAGCGTTACATGGCCAAGGCCCGCCGCCTGCCAGGCg < 6:110729/146‑1 (MQ=255) cGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTATTGAGCAGCGTTACATGGCCAAGGCCCGCCGCCTGCCAGGCGAGCAAg < 4:157785/149‑1 (MQ=255) gATCGGCATCACCGGTGGCAGCAACTGCGCCGTGGCACATAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTATTGAGCAGCGTTACATGGCCAAGGCCCGCCGCCTGCCAGGCGAGCAAGc > 7:259819/1‑149 (MQ=255) aTCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTATTGAGCAGCGTTACATGGCCAAGGCCCGCCGCCTGCCa > 8:29474/1‑137 (MQ=255) aTCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTATTGAGCAGCGTTACATGGCCAAGGCCCGCCGCCTGCCa < 7:29474/137‑1 (MQ=255) cATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTATTGAGCAGCGTTACATGGCCAAGGCCCGCCGCCTGCCAGGc < 8:149951/135‑1 (MQ=255) cATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTATTGAGCAGCGTTACATGGCCAAGGCCCGCCGCCTGCCAGGc > 7:149951/1‑135 (MQ=255) tCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTATTGAGCAGCGTTACATGGCCAAGGCCCGCCGCCTGCCAGGCGAGCAAGCCCTCcggc < 8:106279/149‑1 (MQ=255) aCCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTATTGAGCAGCGTTACATGGCCAAGGCCCGCCGCCTGCCAGGCGAGCAAGCCCTCcggcgg > 8:122788/1‑149 (MQ=255) aCCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGCGCC‑‑‑‑GGAGGTATTCAGGAGCGTTACATGGCCAAGGCCCGCCGCCTGCCAGGCGAGCAAGCCCTCcggcgg > 1:338229/1‑149 (MQ=255) ccGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTATTGAGCAGCGTTACATGGCCAAGGCCCGCCGCCTGCCAGGCGAGCAAGCCCTCCggcggc < 7:323888/149‑1 (MQ=255) cAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTATTGagcagc < 4:268891/91‑1 (MQ=255) cAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTATTGagcagc > 3:268891/1‑91 (MQ=255) aGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTATTGAGCAGCGTTACATGGCCAAGGCCCGCCGCCTGCCAGGCGAGCAAGCCCTCCGGCGGCATGGCTTc > 8:203243/1‑149 (MQ=255) gcgcCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCCGGAGGTAGGTATTCTCGAGCGTTACATGGCCAAGGCCCCCCGCCTGCCCGGCGCGCAAGCCCTCCGCCGGCATgct > 1:333022/1‑147 (MQ=255) gcgcCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTATTGAGCAGCGTTACATGGCCAAGGCCCGCCGCCTGCCAGGCGAGCAAGCCCTCCGGCGGCATGGCTTcg > 7:383812/1‑149 (MQ=255) cgcCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTATTGAGCAGCGTTACATGGCCAAGGCCCGCCGCCTGCCAGGCGAGCAAGCCCTCCGGCGGCATGGCTTcgc < 8:383812/149‑1 (MQ=255) gcCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTc > 8:310245/1‑66 (MQ=255) gcCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTc < 7:310245/66‑1 (MQ=255) gcCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTATTGAGCAGCGTTACATGGCCAAGGCCCGCCGCCTGCCAGGCGAGCAAGCCCTCCGGCGGCATGGCTTcgcc > 3:117826/1‑149 (MQ=255) cgcCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTATTGAGCAGCGTTACATGGCCAAGGCCCGCCGCCTGCCAGGCGAGCAAGCCCTCCGGCGGCATGGCTTCGccgccg < 4:117826/148‑1 (MQ=255) gcCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTATTGAGCAGCGTTACATGGCCAAGGCCCGCCGCCTGCCAGGCGAGCAAGCCCTCCGGCGGCATGGCTTCGCCGCCGGc < 3:45453/149‑1 (MQ=255) cGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTATTGAGCAGCGTTACATGGCCAAGGCCCGCCGCCTGCCAGGCGAGCAAGCCCTCCGGCGGCATGGCTTCGCCGCCGGCGt < 7:122788/149‑1 (MQ=255) tGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTATTGAGCAGCGTTACATGGCCAAGGCCCGCCGCCTGCCAGGCGAGCAAGCCCTCCGGCGGCATGGCTTCGCCGCCGGCGTg > 2:13686/1‑148 (MQ=255) gCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTATTGAGCAGCGTTACATGGCCAAGGCCCGCCGCCTGCCAGGCGAGCAAGCCCTCCGGCGGCATGGCTTCGCCGCCGGCGTGaaa < 5:158950/149‑1 (MQ=255) gCACCTACGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTATTGAGCAGCGTTACATGGCCAAGGCCCGCCGCCTGCCAGGCGAGCAAGCCCTCCGGCGGCATGGCTTCGCCGCCGGCGTGaaa < 2:387471/149‑1 (MQ=255) gCACCTACGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTAGTGAGCAGCGTTACATGGCCAAGGCCCGCCGCCTGCCAGGCGAGCAAGCCCTCCGGCGGCATGGCTTCGCCGCCGGCGTGaaa < 2:393795/149‑1 (MQ=255) aGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTATTGGGCAGCGTTACATGGCCAAGGCCCGCCGCCTGCCAGGCGAGCAAGCCCTCCGGCGGCATGGCTTCGCCGCCGGCGTGAAACTGGTg > 2:201270/1‑149 (MQ=255) ggTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTATTGCGCAGCGTTACATGGCCAAGGCCCGCCGCCTGCCAGGCGAGCAAGCCCTCCGGCGGCATGGCTTCGCCGCCGGCGTGAAACTGGTGc < 1:201270/149‑1 (MQ=255) | CTGGCGAGCAGTTCGCCGCCGATCATCAGTTCGCCGACCGCGCCATTGAGCACAGCACCGCCGCTGTTATCCAGCAGGTGGATGCTGCGCCCGGCCAGCACCCGGCCGATCGGCATCACCGGTGGCAGCGCCTGCGCCGTGGCACCTAGGTAAGGCGCGCAGTCGTGGGCGGTAACCGTGACGGTCGCCTCAGTCGGGCC‑‑‑‑GTAGGTATTGAGCAGCGTTACATGGCCAAGGCCCGCCGCCTGCCAGGCGAGCAAGCCCTCCGGCGGCATGGCTTCGCCGCCGGCGTGAAACTGGTGC > NC_002947/4788099‑4788395 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |