| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,804,866 | A→G | 5.2% | C68R (TGC→CGC) | PP_4233 ← | oxidoreductase small subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,804,866 | 0 | A | G | 5.2% | 232.9 / 2.1 | 77 | C68R (TGC→CGC) | PP_4233 | oxidoreductase small subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (36/37); new base G (2/2); total (38/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.50e-01 | |||||||||||
GTGCGCAGTAGCTGCACTGGAAGGCGAACAGGTCGACGAACTTCTGCTGGATCGGGTTGAGCGTCAGGTTGCCGGCCTCGTCTTTCTTGGCATGGCCTTCGATGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTGGCCGCAACCCAGGCGCGAGCCGGTGAGGTTCTGGTGTTCGTGCAGGTAGTCGATCATCGCCAGGTCCGCGGGAACCTCG > NC_002947/4804719‑4805014 | gTGCGCAGTAGCTGCACTGGAAGGCGAACAGGTCGACGAACTTCTGCTGGATCGGGTTGAGCGTCAGGTTGCCGGCCTCGTCTTTCTTGGCATGGCCTTCGATGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAg < 6:42872/149‑1 (MQ=255) tAGCTGCACTGGAAGGCGAACAGGTCGACGAACTTCTGCTGGATCGGGTTGAGCGTCAGGTTGCCGGCCTCGTCTTTCTTGTCATGGCCTTCGATGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCAc < 6:219809/149‑1 (MQ=255) cACTGGAAGGCGAACAGGTCGACAAACTTCTGCTGGATCGGGTTGAGCGTCAGGTTGCCGGCCTCGTCTTTCTTGGCATGGCCTTCGATGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACttcttc > 8:33141/1‑149 (MQ=255) ggCGAACAGGTCGACGAACTTCTGCTGGATCGGGTTGAGCGTCAGGTTGCCGGCCTCGTCTTTCTTGGCATGGCCTTCGATGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGt > 5:153296/1‑129 (MQ=255) ggCGAACAGGTCGACGAACTTCTGCTGGATCGGGTTGAGCGTCAGGTTGCCGGCCTCGTCTTTCTTGGCATGGCCTTCGATGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGt < 6:153296/129‑1 (MQ=255) aCAGGTCGACGAACTTCTGCTGGATCGGGTTGAGCGTCAGGTTGCCGGCCTCTTCTTTCTTGGCATGGCCTTCGATGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCg > 3:46343/1‑149 (MQ=255) ggTCGACGAACTTCTGCTGGATCGGGTTGAGCGTCAGGTTGCCGGCCTCGTCTTTCTTGGCATGGCCTTCGATGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCgggg < 5:398739/149‑1 (MQ=255) gTCGACGAACTTCTGCTGGATCGGGTTGAGCGTCAGGTTGCCGGCCTCGTCTTTCTTGGCATGGCCTTCGATGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGt > 4:56559/1‑149 (MQ=255) tCGACGAACTTCTGCTGGATCGGGTTGAGCGTCAGGTTGCCGGCCTCGTCTTTCTTGGCATGGCCTTCGATGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGtt > 7:304055/1‑149 (MQ=255) tCGACGAACTTCTGCTGGATCGGGTTGAGCGTCAGGTTGCCGGCCTCGTCTTTCTTGGCATGGCCTTCGATGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGtt > 3:160496/1‑149 (MQ=255) acgaACTTCTGCTGGATCGGGTTGAGCGTCAGGTTGCCGGCCTCGTCTTTCTTGGCATGGCCTTCGATGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTc < 8:304055/149‑1 (MQ=255) gaACTTCTGCTAGATCGGGTTGAGCGTCAGGTTGCCGGCCTCGTCTTTCTTGGCATGGCCTTCGATGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTcga > 1:75308/1‑149 (MQ=255) aCTTCTGCTGGATCGGCTTGAGCGTCAGGTTGCCGGCCTCGTCTTTCTTGGCATGGCCTTCGATGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTcgacg < 3:55932/149‑1 (MQ=255) ctgctgGATCGGGTTGAGCGTCAGGTTGCCGGCCTCGTCTTTCTTGGCATGGCCTTCGATGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGAt < 8:311477/147‑1 (MQ=255) tgctgGATCGGGTTGAGCGTCAGGTTGCCGGCCTCGTCTTTCTTGGCATGGCCTTCGATGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTg > 4:288758/1‑126 (MQ=255) tgctgGATCGGGTTGAGCGTCAGGTTGCCGGCCTCGTCTTTCTTGGCATGGCCTTCGATGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTg < 3:288758/126‑1 (MQ=255) gATCGGGTTGAGCGTCAGGTTGCCGGCCTCGTCTTTCTTGGCATGGCCTTCGATGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACg > 1:410874/1‑148 (MQ=255) tggggTTGAGGGTCAGGTTGCCGGCCTCGTGTTTCTTGGCATGGCCTTCGATTGTGAGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATTCAGGTg < 4:342328/99‑1 (MQ=255) tCGGGTTGAGCGTCAGGTTGCCGGCCTCGTCTTTCTTGGCATGGCCTTCGATGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTg > 3:342328/1‑101 (MQ=255) cGGGTTGAGCGTCAGGTTGCCGGCCTCGTCTTTCTTGGCATGGCCTTCGATGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGAt > 3:175329/1‑138 (MQ=255) cGGGTTGAGCGTCAGGTTGCCGGCCTCGTCTTTCTTGGCATGGCCTTCGATGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGAt < 4:175329/138‑1 (MQ=255) ggTTGAGCGTCAGGTTGCCGGCCTCGTCTTTCTTGGCATGGCCTTCGATGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCg > 4:104844/1‑149 (MQ=255) gTTGAGCGTCAGGTTGCCGGCCTCGTCTTTCTTGGCATGGCCTTCGATGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACttcttc < 8:264428/108‑1 (MQ=255) gTTGAGCGTCAGGTTGCCGGCCTCGTCTTTCTTGGCATGGCCTTCGATGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACttcttc > 7:264428/1‑108 (MQ=255) ttGAGCGTCAGGTTGCCGGCCTCGTCTTTCTTGGCATGGCCTTCGATGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTg < 4:46343/149‑1 (MQ=255) ttGAGCGTCAGGTTGCCGGCCTCGTCTTTCTTGGCATGGCCTTCGATGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGACGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTg > 5:35794/1‑149 (MQ=255) gCGTCAGGTTGCCGGCCTCGTCTTTCTTGGCATGGCCTTCGATGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTgg > 5:28073/1‑146 (MQ=255) tCAGGTTGCCGGCCTCGTCTTTCTTGGCATGGCCTTCGATGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATg > 5:304736/1‑149 (MQ=255) gCCGGCCTCGTCTTTCTTGGCATGGCCTTCGATGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTgg < 1:233255/148‑1 (MQ=255) gCCGGCCTCGTCTTTCTTGGCATGGCCTTCGATGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTgg < 5:254712/148‑1 (MQ=255) gCCGGCCTCGTCTTTCTTGGCATGGCCTTCGATGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTgg < 7:47648/148‑1 (MQ=255) 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ccGGCCTCGTCTTTCTTGGCATGGCCTTCGATGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTGGc < 3:56559/148‑1 (MQ=255) gTCTTTCTTGGCATGGCCTTCGATGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTGGCCGCAAcc < 3:368143/147‑1 (MQ=255) tttcttGGCATGGCCTTCGATGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTGGCCGCAACCCAg < 8:231049/147‑1 (MQ=255) tttcttGGCATGGCCTTCGATGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTGGCCGCAACCCAg > 7:231049/1‑147 (MQ=255) ctGGCATGGCCTTCTATGTCGCGCACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTGGCCGCAACCCAGGCGCGa < 6:289018/148‑1 (MQ=255) ggCATGGCCTTCGATGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTGGCCGCAACCCAGGCGCGa < 3:104844/147‑1 (MQ=255) aTGGCCTTCGATGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTGGCCGCAACCCAGGCGCGAGCCgg < 6:304736/149‑1 (MQ=255) tGGCCTTCGATGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTGGCCGCAACCCAGGCGCGAGCCGGt < 7:53253/149‑1 (MQ=255) gCCTTCGATGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTGGCCGCAACCCAGGCGCGAGCCGGt > 3:66578/1‑147 (MQ=255) aTGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTGGCCGCAACCCAGGCGCGAGCCGGTGAGGTTCTg < 4:160496/149‑1 (MQ=255) tGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTGGCCGCAACCCAGGCGCGAGCCGGTGAGGTTCTgg > 2:371923/1‑149 (MQ=255) cGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCGGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTGGCCGCAACCCAGGCGCGAGCCGGTGAGGTTCTGGTGTTc > 3:278239/1‑149 (MQ=255) cGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTGGCCGCAACCCAGGCGCGAGCCGGTGAGGTTCTGGTGTTc > 2:97714/1‑149 (MQ=255) aaCCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGt > 2:336594/1‑60 (MQ=255) aaCCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGt > 2:332069/1‑60 (MQ=255) aaCCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTg > 4:10886/1‑96 (MQ=255) aaCCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTg < 3:10886/96‑1 (MQ=255) aCCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTGGCCGCAACCCAGGCGCGAGCCGGTGAGGTTCTGGTGTTCGt < 2:75308/148‑1 (MQ=255) ccTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTGGCCGCAACCCAGGCGCGAGCCGGTGAGGTTCTGGTGTTCGTg > 1:253745/1‑148 (MQ=255) cttcttGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTGGCCGCAACCCAGGCGCGAGCCGGTGAGGTTCTGGTGTTCGTg > 4:262704/1‑147 (MQ=255) cttGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTGGCCGCAACCCAGGCGCGAGCCGGTGAGGTTCTGGTGTTCGTGCAgg < 6:28073/148‑1 (MQ=255) cttGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTGGCCGCAACCCAGGCGCGAGCCGGTGAGGTTCTGGTGTTCGTGCAg < 6:194083/147‑1 (MQ=255) gCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATg > 4:311099/1‑94 (MQ=255) gCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATg < 3:311099/94‑1 (MQ=255) ccTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCGGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTGGCCGCAACCCAGGCGCGAGCCGGTGAGGTTCTGGTGTTCGTGCAGGTAGt < 4:278239/148‑1 (MQ=255) ccTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTGGCCGCAACCCAGGCGCGAGCCGGTGAGGTTCTGGTGTTCGTGCAGGTAGTc > 1:382124/1‑149 (MQ=255) ccTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTGGCCGCAACCCAGGCGCGAGCCGGTGAGGTTCTGGTGTTCGTGCAGGTAGTc > 1:388287/1‑149 (MQ=255) cTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCAACACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTGGCCGCAACCCAGGCGCGAGCCGGTGAGGTTCTGGTGTTCGTGCAGGTAGTc > 3:32986/1‑148 (MQ=255) ttCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTGGCCGCAACCCAGGCGCGAGCCGGTGAGGTTCTGGTGTTCGTGCAGGTAGTCGa > 3:309635/1‑149 (MQ=255) aaGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTGGCTGCAACCCAGGCGCGAGCCGGTGAGGTTCTGGTGTTCGTGCAGGTAGTCGatcat > 2:108088/1‑149 (MQ=255) aGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTGGCCGCAACCCAGGCGCGAGCCGGTGAGGTTCTGGTGTTCGTGCAGGTAGTCGatcatc < 4:66578/149‑1 (MQ=255) aaTGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTGGCCGCAACCCAGGCGCGAGCCGGTGAGGTTCTGGTGTTCGTGCAGGTAGTCGATCATCGcc > 8:141204/1‑149 (MQ=255) tGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTGGCCGCAACCCAGGCGCGAGCCGGTGAGGTTCTGGTGTTCGTGCAGGTAGTCGATCATCGCCAg < 2:215435/149‑1 (MQ=255) gcACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTgg < 6:347840/84‑1 (MQ=255) gcACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTGGCCGCAACCCAGGCGCGAGCCGGTGAGGTTCTg < 8:62667/116‑1 (MQ=255) gcACCGGTGATGCAGGTGCGCAATTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTGGCCGCAACCCAGGCGCGAGCCGGTGAGGTTCTg > 7:62667/1‑116 (MQ=255) aCCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTGGCCGCAACCCAGGCGCGAGCCGGTGAGGTTCTGGTGTTCGt < 2:378620/122‑1 (MQ=255) aCCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTGGCCGCAACCCAGGCGCGAGCCGGTGAGGTTCTGGTGTTCGTGCAGGTAGTCGATCATCGCCAGGTCcg > 4:70359/1‑149 (MQ=255) gTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTGGCCGCAACCCAGGCGCGAGCCGGTGAGGTTCTGGTGTTCGTGCAGGTAGTCGATCATCGCCAGGTCCGCgg > 2:75098/1‑148 (MQ=255) gCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTGGCCGCAACCCAGGCGCGAGCCGGTGAGGTTCTGGTGTTCGTGCAgg < 3:94790/118‑1 (MQ=255) gCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTGGCCGCAACCCAGGCGCGAGCCGGTGAGGTTCTGGTGTTCGTGCAgg > 4:94790/1‑118 (MQ=255) aGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTGGCCGCAACCCAGGCGCGAGCCGGTGAGGTTCTGGTGTTCGTGCAGGTAGTCGATCATCGCCAGGTCCGCGGGAACCTCg < 3:70359/149‑1 (MQ=255) | GTGCGCAGTAGCTGCACTGGAAGGCGAACAGGTCGACGAACTTCTGCTGGATCGGGTTGAGCGTCAGGTTGCCGGCCTCGTCTTTCTTGGCATGGCCTTCGATGGTGCGAACCTTCTTGCCTTCGAAGTAATGCGCACCGGTGATGCAGGTGCGCACTTCTTCGCTGGTGCCGTCGGGGTTGTCGACGATCACCACGCAGGCGTGGCAGATGCCCTGGCCGCAACCCAGGCGCGAGCCGGTGAGGTTCTGGTGTTCGTGCAGGTAGTCGATCATCGCCAGGTCCGCGGGAACCTCG > NC_002947/4804719‑4805014 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |