Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,975,208 | C→T | 6.7% | L132L (CTG→CTA) | flgK ← | flagellar hook‑associated protein FlgK |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,975,208 | 0 | C | T | 6.7% | 173.8 / 2.3 | 60 | L132L (CTG→CTA) | flgK | flagellar hook‑associated protein FlgK |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (27/28); new base T (2/2); total (30/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.54e-01 |
TCGGCAATGTTGGCTGTGAGCTTGTTCACCTGGCCGGCCATGGTGTCGAGCTGGGAGTTGATCGTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGACCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGTGATCTGATCCTGGAACGTCAC > NC_002947/4975071‑4975348 | tCGGCAATGTTGGCTGTGAGCTTGTTCACCTGGCCGGCCATGGTGTCGAGCTGGGAGTTGATCGTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGgcgc > 1:61634/1‑147 (MQ=255) ggCAATGTTGGCTGTGAGCTTGTTCACCTGGCCGGCCATGGTGTCGAGCTGGGAGTTGATCGTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGa < 7:45470/147‑1 (MQ=255) ggCAATGTTGGCTGTGAGCTTGTTCACCTGGCCGGCCATGGTGTCGAGCTGGGAGTTGATCGTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGa < 2:320855/147‑1 (MQ=255) ggCAATGTTGGCTGTGAGCTTGTTCACCTGGCCGGCCATGGTGTCGAGCTGGGAGTTGATCGTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAgg > 7:83752/1‑149 (MQ=255) ggCAATGTTGGCTGTGAGCTTGTTCACCTGGCCGGCCATGGTGTCGAGCTGGGAGTTGATCGTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAg < 6:373539/148‑1 (MQ=255) gtgAGCTTGTTCACCTGGCCGGCCATGGTGTCGAGCTGGGAGTTGATCGTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCgg > 7:386133/1‑149 (MQ=255) ttGTTCACCTGGCCGGCCATGGTGTCGAGCTGGGAGTTGATCGTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTcgc > 7:55783/1‑149 (MQ=255) ccTGGCCGGCCATGGTGTCGAGCTGGGAGTTGATCGTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCa < 2:61634/149‑1 (MQ=255) cTGGCCGGCCATGGTGTCGAGCTGGGAGTTGATCGTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAg > 1:42850/1‑149 (MQ=255) ccggccATGGTGTCGAGCTGGGAGTTGATCGTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGGCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTg < 8:386133/149‑1 (MQ=255) ggccATGGTGTCGAGCTGGGAGTTGATCGTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCtt > 1:167771/1‑132 (MQ=255) ggccATGGTGTCGAGCTGGGAGTTGATCGTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCtt < 2:167771/132‑1 (MQ=255) cATGGTGTCGAGCTGGGAGTTGATCGTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGTAGCTGGCGAGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAgcg > 1:119854/1‑149 (MQ=255) cATGGTGTCGAGCTGGGAGTTGATCGTGGCGTTCTCCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGTAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAgcg > 1:115015/1‑149 (MQ=255) ggTGTCGAGCTGGGAGTTGATCGTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGcc > 5:388701/1‑148 (MQ=255) gtCGAGCTGGGAGTTGATCGTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCgag > 7:204766/1‑148 (MQ=255) gtCGAGCTGGGAGTTGATCGTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCgag > 7:210578/1‑148 (MQ=255) tCGAGCTTGGAGTTGATCGTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGagaa < 8:210578/149‑1 (MQ=255) tCGAGCTGGGAGTTGATCGTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGagaa < 8:55783/149‑1 (MQ=255) tCGAGCTGGGAGTTGATCGTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGagaa < 8:204766/149‑1 (MQ=255) gAGCTGGGAGTTGATCGTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGcc < 6:166322/142‑1 (MQ=255) gAGCTGGGAGTTGATCGTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGcc > 5:166322/1‑142 (MQ=255) aGCTGGGAGTTGATCGTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAgaagaa < 6:388701/149‑1 (MQ=255) gCTGGGAGTTGATCGTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGcc < 1:260408/140‑1 (MQ=255) gCTGGGAGTTGATCGTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGcc > 2:260408/1‑140 (MQ=255) gTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAgg < 8:354527/136‑1 (MQ=255) gTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAgg > 7:354527/1‑136 (MQ=255) tGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGACGAGAAGAAGGCGGTAAGGACCGAg > 5:238444/1‑149 (MQ=255) tGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCAGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGACCGAg > 5:244316/1‑149 (MQ=255) tgctgctgGGTCAGCTGGGGGCTCACCGCGGTGAAACGGTTGCTCCGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGACCGAGCTGAt < 8:340802/147‑1 (MQ=255) gctCAGCTCGGTGCTCACCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGGCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGACCGAGCTGATGCCGgtgt < 4:4909/147‑1 (MQ=255) tCAGCTGGGTGCTCACCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGACCGAGCTGATGCCGGTGTCa > 5:135499/1‑149 (MQ=255) gatGGGTGCTCACCGCGTTGAAACGGTTTCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGAAGCTGGCGCGAGGAAACGTCACCCGGCTTCGCCCCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGACAGAGCTGATGACGGTGTCACg > 1:344280/3‑148 (MQ=255) gCTGTGTGCTCACCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGTGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGTACCGAGCTGATGCCGGTGTCACg < 2:344280/148‑1 (MQ=255) gCTGGGTGCTCACCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGACCGAGCTGATGCCGGTGTCACgg > 7:315442/1‑149 (MQ=255) ggTGCTCACCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGCTAAGAACCGAACTGATGCCGGTGTCACGGTCgg > 8:367360/1‑149 (MQ=255) ctctCCGCGTTTAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCATGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCTCCCGGCTTCGGCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGTAGAAGGCGGTAAGGACCGAGCTGATGCCGGTGTCAGGGTCGGCca < 7:367360/148‑1 (MQ=255) cTCACCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTcgccg > 1:339367/1‑82 (MQ=255) cTCACCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTcgccg < 2:339367/82‑1 (MQ=255) cTCACCGCGTGGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGACCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCca < 8:83752/148‑1 (MQ=255) aCCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGTAGCTGGGGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGGCGTGATGAAGGCGGTAAGGACCGAGCTGATGGCGGTGTCAGGGTCGGCcagc < 2:115015/147‑1 (MQ=255) aCCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGTAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGACCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCcagc < 2:119854/147‑1 (MQ=255) aCCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGACCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCcagcag > 6:56714/1‑149 (MQ=255) cgcgTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGACCGAGCTGATGCCGgtgt < 7:197772/131‑1 (MQ=255) cgcgTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGACCGAGCTGATGCCGgtgt > 8:197772/1‑131 (MQ=255) cgTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGACCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGc < 6:374479/139‑1 (MQ=255) cgTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGACCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGc > 5:374479/1‑139 (MQ=255) tCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGTAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGACCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGtgatc > 3:269576/1‑149 (MQ=255) aGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGACCGAGCTGATGCCGGTGTCACg < 3:407251/116‑1 (MQ=255) aGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGACCGAGCTGATGCCGGTGTCACg > 4:407251/1‑116 (MQ=255) aGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGACCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGtgatc < 2:42850/147‑1 (MQ=255) gggTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGACCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGtgatctga < 8:315442/149‑1 (MQ=255) ggTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGACCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGtgatctgat < 1:29081/149‑1 (MQ=255) tttGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGACCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTgg < 7:234971/138‑1 (MQ=255) tttGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGACCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTgg > 8:234971/1‑138 (MQ=255) gcCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGACCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGTGATCTGATCCTGGaa > 6:279082/1‑149 (MQ=255) gggTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGACCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGTGATCTGATCCTGGAACGt > 2:364544/1‑148 (MQ=255) gTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGACCGAGCTTATGCCGTTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGTGATCTGATCCTGGAACGTCAc < 6:135499/149‑1 (MQ=255) tCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGACCGAGCTGa < 2:59/87‑1 (MQ=255) tCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGACCGAGCTGa > 1:59/1‑87 (MQ=255) | TCGGCAATGTTGGCTGTGAGCTTGTTCACCTGGCCGGCCATGGTGTCGAGCTGGGAGTTGATCGTGGCGTTCTGCTGGGTCAGCTGGGTGCTCACCGCGTTGAAACGGTTGCTCAGGGTTTGCGCCTGGGTCAGCAGCAGCTGGCGCGAGGCAACGTCACCCGGCTTCGCCGCCGCAGTCTGCAGCGCCGAGAAGAAGGCGGTAAGGACCGAGCTGATGCCGGTGTCACGGTCGGCCAGCAGTTTGTCGACGCTGGTGATCTGATCCTGGAACGTCAC > NC_002947/4975071‑4975348 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |