Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,986,048 | C→G | 7.3% | P97R (CCG→CGG) | flgA → | flagella basal body P‑ring formation protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,986,048 | 0 | C | G | 7.3% | 219.4 / 7.2 | 68 | P97R (CCG→CGG) | flgA | flagella basal body P‑ring formation protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (31/32); new base G (2/3); total (33/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.92e-01 |
GGGTTTCTTGAATTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGG‑TGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAGCGCGACAACACGGTCGGCGAAGGTGACGT > NC_002947/4985900‑4986192 | gggTTTCTTGAATTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGcc > 4:356457/1‑149 (MQ=255) tCTTGAATTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTg < 2:286877/148‑1 (MQ=255) gAATTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTggg < 1:198945/146‑1 (MQ=255) gAATTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGc < 6:414111/147‑1 (MQ=255) ttCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCGGCTGGGCCgggc < 2:271964/149‑4 (MQ=255) ttCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCgtgt > 6:124532/1‑149 (MQ=255) ttCACCGTTGAAGAATATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCgtgt < 3:211883/149‑1 (MQ=255) ccGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACg < 5:180130/149‑1 (MQ=255) ttGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTa > 7:44956/1‑149 (MQ=255) aaGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACg < 2:227350/148‑1 (MQ=255) aaGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACg > 1:227350/1‑148 (MQ=255) aTCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCGGCTGGGCCgg > 6:63154/1‑130 (MQ=255) aTCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCGGCTGGGCCgg < 5:63154/131‑2 (MQ=255) tCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTg < 8:365735/124‑1 (MQ=255) tCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTg > 7:365735/1‑124 (MQ=255) caccacCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACg > 4:100519/1‑149 (MQ=255) ccaccCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTACGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGgc < 3:68027/149‑1 (MQ=255) caccCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGgcg < 5:124532/149‑1 (MQ=255) accCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGgcgc < 8:153488/149‑1 (MQ=255) ccAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCgcag > 2:212843/1‑149 (MQ=255) aGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGcc < 6:1388/106‑1 (MQ=255) aGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGcc > 5:1388/1‑106 (MQ=255) cTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCg < 5:93894/149‑1 (MQ=255) cTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCg < 5:88016/149‑1 (MQ=255) gccgCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACg > 5:62680/1‑149 (MQ=255) ccgCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACTGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACgg > 7:246924/1‑149 (MQ=255) cgCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGt < 4:83387/149‑1 (MQ=255) gCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTa > 8:251809/1‑149 (MQ=255) tATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTAt > 8:264529/1‑148 (MQ=255) tGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTc < 3:100519/148‑1 (MQ=255) tGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTc < 6:62680/148‑1 (MQ=255) tGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCg > 4:92886/1‑149 (MQ=255) tGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCg > 3:33802/1‑149 (MQ=255) aaaTCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTg > 3:9912/1‑149 (MQ=255) aGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCAGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGcc > 6:424607/1‑149 (MQ=255) tCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTg > 5:302974/1‑140 (MQ=255) tCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTg < 6:302974/140‑1 (MQ=255) cAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCg > 2:247687/1‑149 (MQ=255) aaCCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGt > 4:95765/1‑149 (MQ=255) aaCCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGt > 4:90247/1‑149 (MQ=255) ccGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGCGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGc < 1:106990/149‑1 (MQ=255) ccGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCg < 7:14270/120‑1 (MQ=255) ccGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCg > 8:14270/1‑120 (MQ=255) gCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGAc > 4:160958/1‑149 (MQ=255) cTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACt < 3:356457/149‑1 (MQ=255) cccACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTcc < 8:44956/149‑1 (MQ=255) ccACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCcg > 1:165140/1‑149 (MQ=255) ccACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCcg < 7:251809/149‑1 (MQ=255) aCGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGCCTTTTCcgcg > 1:149605/1‑149 (MQ=255) aCGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCAAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGAGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCcgc > 4:270867/1‑148 (MQ=255) gcATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACgtgg‑tg < 3:92886/149‑1 (MQ=255) tGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACgtgg‑tggtg < 1:247687/149‑1 (MQ=255) ccGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACgtgg‑tggtggt < 7:264529/149‑1 (MQ=255) ccGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACgtgg‑tggtgg < 2:165140/148‑1 (MQ=255) agcagcTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGG‑TGGTGGTGACCCGCCCGCt > 5:278073/1‑148 (MQ=255) cTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTgg > 7:223557/1‑81 (MQ=255) cTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTgg < 8:223557/81‑1 (MQ=255) gACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTTGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAgcgc < 1:212843/148‑1 (MQ=255) gACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGG‑TGGTGGTGAcccgcc < 6:394582/136‑1 (MQ=255) gACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGG‑TGGTGGTGAcccgcc > 5:394582/1‑136 (MQ=255) gACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGG‑TGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAgcgc < 1:362546/147‑1 (MQ=255) cTCACTTGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTTCG‑GATACGATGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCAACCTTGCGACTGTTCAGCGCAGTTG‑TGGGGGTGACCCGCCCGCGCAAGCCCGacaaca > 5:293777/1‑149 (MQ=255) tCACTGGAAAGTCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGG‑TGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAGCGCGACAacac > 6:259621/1‑149 (MQ=255) tCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGG‑TGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAGCGCGACAacac > 7:149885/1‑149 (MQ=255) cACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGG‑TGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAGCGCGACAACACg > 4:395909/1‑149 (MQ=255) aCTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGG‑TGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAGCGCGACAACACg < 4:9912/148‑1 (MQ=255) gAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGG‑TGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAGCGCGACAACACGGTTgg > 1:214397/1‑149 (MQ=255) tcacacGGCCCAGCGGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGG‑TGGTGGTGAcccgcc > 5:2716/6‑122 (MQ=255) tcacacGGCCCAGCGGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGG‑TGGTGGTGAcccgcc < 6:2716/117‑1 (MQ=255) gCCCGGCCCAGCCGGTGGGCCGTGGGCCGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCCTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGG‑TGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAGCGCGACAACACGGTCGGCGaa < 4:33802/149‑1 (MQ=255) cAGCCGCTGGGCGGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGG‑TGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAGCGCGACAACACGGTCGGCGAAGGTGACGt < 5:424607/149‑1 (MQ=255) | GGGTTTCTTGAATTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGACGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACG‑GATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGG‑TGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAGCGCGACAACACGGTCGGCGAAGGTGACGT > NC_002947/4985900‑4986192 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |