| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,088,892 | G→C | 5.4% | P316R (CCG→CGG) | astA‑I ← | arginine N‑succinyltransferase subunit beta |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,088,892 | 0 | G | C | 5.4% | 246.2 / 4.6 | 74 | P316R (CCG→CGG) | astA‑I | arginine N‑succinyltransferase subunit beta |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/35); new base C (2/2); total (37/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.27e-01 | |||||||||||
GTTGAGCGACTGCAGGGTTTCGCCCTGGCCGGCCTGCCAATTGCCTGCGATGTAATGCGTGGTCATTTAATGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTAC > NC_002947/5088744‑5089037 | gTTGAGCGACTGCAGGGTTTCGCCCTGGCCGGCCTGCCAATTGCCTGCGATGTAATGCGTGGTCATTTAATGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACg < 6:244973/149‑1 (MQ=255)gTTGAGCGACTGCAGGGTTTCGCCCTGGCCGGCCTGCCAATTGCCTGCGATGTAATGCGTGGTCATTTAATGGGCCTCCCGGCTGGACGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACg > 8:78195/1‑149 (MQ=255) ttGAGCGACTGCAGGGTTTCGCCCTGGCCGGCCTGCCAATTGCCTGCGATGTAATGCGTGGTCATTTAATGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACgg > 5:31522/1‑149 (MQ=255) gACTGCAGGGTTTCGCCCTGGCCGGCCTGCCAATTGCCTGCGATGTAATGCGTGGTCATTTAATGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGac > 3:133367/1‑149 (MQ=255) aCTGCAGGGTTTCGCCCTGGCCGGCCTGCCAATTGCCTGCGATGTAATGCGTGGTCATTTAATGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGCTGCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGac < 1:24946/149‑1 (MQ=255) cAGGGTTTCGCCCTGGCCGGCCTGCCAATTGCCTGCGATGTAATGCGTGGTCATTTAATGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGaccac < 8:28982/147‑1 (MQ=255) cGCCCTGGCCGGCCTGCCAATTGCCTGCGATGTAATGCGTGGTCATTTAATGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAgg > 2:224624/1‑143 (MQ=255) cGCCCTGGCCGGCCTGCCAATTGCCTGCGATGTAATGCGTGGTCATTTAATGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAgg < 1:224624/143‑1 (MQ=255) ccTGGCCGGCCTGCCAATTGCCTGCGATGTAATGCGTGGTCATTTAATGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCcggcg > 1:154435/1‑149 (MQ=255) cTGGCCGGCCTGCCAATTGCCTGCGATGTAATGCGTGGTCATTTAATGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCcggcgg < 5:138923/149‑1 (MQ=255) tGGCCGGCCTGCCAATTGCCTGCGATGTAATGCGTGGTCATTTAATGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGa > 3:168159/1‑130 (MQ=255) tGGCCGGCCTGCCAATTGCCTGCGATGTAATGCGTGGTCATTTAATGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGa < 4:168159/130‑1 (MQ=255) tGCCAATTGCCTGCGATGTAATGCGTGGTCATTTAATGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTg > 4:181522/1‑148 (MQ=255) aaTTGCCTGCGATGTAATGCGTGGTCATTTAATGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGt > 7:168762/1‑149 (MQ=255) ttGCCTGCGATGTAATGCGTGGTCATTTAATGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGc < 6:31522/149‑1 (MQ=255) ttGCCTGCGATGTAATGCGTGGTCATTTAATGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGc < 2:239264/149‑1 (MQ=255) ccTGCGATGTAATGCGTGGTCATTTAATGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCgg > 2:175222/1‑148 (MQ=255) ccTGCGATGTAATGCGTGGTCATTTAATGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCgg > 2:181318/1‑148 (MQ=255) cTGCGATGTAATGCGTGGTCATTTAATGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCa < 3:36907/149‑1 (MQ=255) tGCGATGTAATGCGTGGTCATTTAATGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAg > 2:45243/1‑149 (MQ=255) gATGTAATGCGTGGTCATTTAATGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGa > 2:22843/1‑149 (MQ=255) aTGTAATGCGTGGTCATTTAATGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGAt < 1:45243/149‑1 (MQ=255) tAATGCGTGGTCATTTAATGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCTACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGc < 1:22843/148‑1 (MQ=255) aTGCGTGGTCATTTAATGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGc < 7:96844/129‑1 (MQ=255) aTGCGTGGTCATTTAATGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGc > 8:96844/1‑129 (MQ=255) aTGCGTGGTCATTTAATGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGa > 6:364479/1‑148 (MQ=255) aTGCGTGGTCATTTAATGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGa < 1:268186/148‑1 (MQ=255) aTTTAATGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGac > 7:382499/1‑92 (MQ=255) aTTTAATGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGac < 8:382499/92‑1 (MQ=255) aTTTAATGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCa < 7:352010/129‑1 (MQ=255) aTTTAATGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCa > 8:352010/1‑129 (MQ=255) tttAATGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCgcgc < 2:154435/149‑1 (MQ=255) tttAATGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCgcgc > 6:356745/1‑149 (MQ=255) ttAATGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTTGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCa > 6:361350/1‑127 (MQ=255) ttAATGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTTGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCa < 5:361350/127‑1 (MQ=255) tAATGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACa < 6:231852/137‑1 (MQ=255) tAATGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACa > 5:231852/1‑137 (MQ=255) aaTGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACCGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCgcgc < 8:32574/146‑1 (MQ=255) aaTGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACCGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCtag > 7:32574/1‑147 (MQ=255) aTGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGc > 8:116393/1‑149 (MQ=255) gggCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCgg > 6:110198/1‑149 (MQ=255) gCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGtt > 2:335999/1‑149 (MQ=255) cTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTtgt < 4:133367/149‑1 (MQ=255) tCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCCACGGGTCGCCCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGACGTCGCGCTAGCGGTtgag > 3:96296/1‑147 (MQ=255) cccGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGc > 7:61230/1‑123 (MQ=255) cccGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGc < 8:61230/123‑1 (MQ=255) ccGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGga < 8:168762/149‑1 (MQ=255) ccGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGga < 1:28911/149‑1 (MQ=255) cGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGgat < 7:78195/149‑1 (MQ=255) gCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTTCGGTTGTGgatga < 5:356745/149‑1 (MQ=255) gCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGaa < 7:116393/149‑1 (MQ=255) cGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAg < 3:181522/149‑1 (MQ=255) cAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTtgtg < 1:355428/135‑1 (MQ=255) cAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTtgtg > 2:355428/1‑135 (MQ=255) gCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTc < 1:181318/149‑1 (MQ=255) gCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTc < 1:175222/149‑1 (MQ=255) aCATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTgg > 2:374070/1‑149 (MQ=255) gTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGta < 5:364479/148‑1 (MQ=255) ccAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGtacctac > 5:86790/1‑149 (MQ=255) cAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTg > 1:304562/1‑101 (MQ=255) cAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTg < 2:304562/101‑1 (MQ=255) gCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCa < 1:374070/149‑1 (MQ=255) cccATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAg < 6:86790/149‑1 (MQ=255) ccATGC‑GCAGGCGTTTGGTGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAg > 4:112880/1‑148 (MQ=255) aTGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCAc > 6:19967/1‑149 (MQ=255) c‑gcAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCa < 5:110198/148‑1 (MQ=255) gCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCt > 4:218642/1‑149 (MQ=255) gCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCt > 2:372019/1‑149 (MQ=255) gTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTgg < 1:372019/149‑1 (MQ=255) cctggtggTCGACCCGTTGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGc < 4:319896/114‑1 (MQ=255) cctggtggTCGACCCGTTGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGc > 3:319896/3‑116 (MQ=255) gCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTc < 8:244537/107‑1 (MQ=255) gCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTc > 7:244537/1‑107 (MQ=255) ggTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTcgc > 8:381989/1‑149 (MQ=255) gTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTcgcg > 7:263494/1‑149 (MQ=255) tCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTcgcg > 6:250928/1‑148 (MQ=255) aaCGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTAc > 6:424472/1‑149 (MQ=255) | GTTGAGCGACTGCAGGGTTTCGCCCTGGCCGGCCTGCCAATTGCCTGCGATGTAATGCGTGGTCATTTAATGGGCCTCCCGGCTGGCCGACAGCGGCACCGCGCGGACATTGTCGCCAACGCCCATGC‑GCAGGCGTTTGGCGGTCAACGGGTCGACCACCAGGGTGCCGGCGGCCAACCGTGCAGGTGCGGCAGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTAC > NC_002947/5088744‑5089037 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |