| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,301,752 | T→C | 5.1% | Q674R (CAG→CGG) ‡ | recB ← | Chi activated ATP‑dependent DNA helicase/dsDNA/ssDNA exonuclease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,301,752 | 0 | T | C | 5.1% | 235.0 / 2.0 | 78 | Q674R (CAG→CGG) ‡ | recB | Chi activated ATP‑dependent DNA helicase/dsDNA/ssDNA exonuclease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (38/36); new base C (2/2); total (40/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.66e-01 | |||||||||||
CAGTTCGCCGGCGGCCTGCTGCAGCAGCTCGGCCAGGTGCAGCAGGTTGGTCAGCACCCGCTCGCCATCACTGCGGCGGATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCG > NC_002947/5301607‑5301898 | cAGTTCGCCGGCGGCCTGCTGCAGCAGCTCGGCCAGGTGCAGCAGGTTGGTCAGCACCCGCTCGCCATCACTGCGGCGGATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGcc < 5:153597/149‑1 (MQ=255) gTTCGCCGGCGGCCTGCTGCAGCAGCTCGGCCAGGTGCAGCAGGTTGGTCAGCACCCGCTCGCCATCACTGCGGCGGATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAg < 3:78140/149‑1 (MQ=255) gcggcCTGCTGCAGCAGCTCGGCCAGGTGCAGCAGGTTGGTCAGCACCCGCTCGCCATCACTGCGGCGGATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTcgcg < 5:181424/149‑1 (MQ=255) gcCTGCTGCAGCAGCTCGGCCAGGTGCAGCAGGTTGGTCAGCACCCGCTCGCCATCACTGCGGCGGATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTa < 2:111827/149‑1 (MQ=255) ctgcAGCAGCTCGGCCAGGTGCAGCAGGTTGGTCAGCACCCGCTCGCCATCACTGCGGCGGATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCAGCGCCAgggggt < 6:395401/138‑5 (MQ=255) ctgcAGCAGCTCGGCCAGGTGCAGCAGGTTGGTCAGCACCCGCTCGCCATCACTGCGGCGGATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCAGCGCCAgggggt > 5:395401/1‑134 (MQ=255) ctgcAGCAGCTCGGCCAGGGGCAGCAGGTTGGTCAGCACCCGCTCGCCATCACTGCGGCGGATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAACTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAgg < 4:28880/148‑1 (MQ=255) agcTCGGCCAGGTGCAGCAGGTTGGTCAGCACCCGCTCGCCATCACTGCGGCGGATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACg > 8:192601/1‑149 (MQ=255) cTCGGCCAGGTGCAGCAGGTTGGTCAGCACCCGCTCGCCATCACTGCGGCGGATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACa > 4:8016/1‑137 (MQ=255) cTCGGCCAGGTGCAGCAGGTTGGTCAGCACCCGCTCGCCATCACTGCGGCGGATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACa < 3:8016/137‑1 (MQ=255) cTCGGCCAGGTGCAGCAGGTTGGTCAGCACCCGCTCGCCATCACTGCGGCGGATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCa > 2:144495/1‑149 (MQ=255) cTCGGCCAGGTGCAGCAGGTTGGTCAGCACCCGCTCGCCATCACTGCGGCGGATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCa < 4:268787/149‑1 (MQ=255) tCGGCCAGGTGCAGCAGGTTGGTCAGCACCCGCTCGCCATCACTGCGGCGGATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCAt > 8:94546/1‑149 (MQ=255) gcGGCCAGGGGCAGCAGGTTGGGCAGCACCCGCTCGCCAGCACTGCGGCGGATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCTTGCTGCAGGTGGCGCAACAGCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCTAGGTGTCGCGTTACAGGCCAAAACGCac < 4:211684/148‑2 (MQ=255) ggCCAGGTGCAGCAGGTTGGTCAGCACCCGCTCGCCATCACTGCGGCGGATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCa > 8:373825/1‑149 (MQ=255) ggCCAGGTGCAGCAGGTTGGTCAGCACCCGCTCGCCATCACTGCGGCGGATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCa < 2:184061/149‑1 (MQ=255) ggTGCAGCAGGTTGGTCAGCACCCGCTCGCCATCACTGCGGCGGATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAg < 7:192601/149‑1 (MQ=255) cagcagGTTGGTCAGCACCCGCTCGCCATCACTGCGGCGGATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGctct < 7:284784/149‑1 (MQ=255) gcagGTTGGTCAGCACCCGCTCGCCATCACTGCGGCGGATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCAt > 2:195896/1‑136 (MQ=255) gcagGTTGGTCAGCACCCGCTCGCCATCACTGCGGCGGATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCAt < 1:195896/136‑1 (MQ=255) ggTTGGTCAGCACCCGCTCGCCATCACTGCGGCGGATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTcc > 4:247714/1‑146 (MQ=255) gTTGGTCAGCACCCGCTCGCCATCACTGCGGCGGATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAACCGCATCGCCCAGCTCTCCCAgc > 8:137102/1‑148 (MQ=255) tCAGCACCCGCTCGCCATCACTGCGGCGGATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCAGCGCCAgggg < 5:371334/104‑3 (MQ=255) tCAGCACCCGCTCGCCATCACTGCGGCGGATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCAGCGCCAgggg > 6:371334/1‑102 (MQ=255) aGCACCCGCTCGCCATCACTGCGGCGGATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTcc > 3:189280/1‑138 (MQ=255) aGCACCCGCTCGCCATCACTGCGGCGGATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTcc < 4:189280/138‑1 (MQ=255) aCCCGCTCGCCATCACTGCGGCGGATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCTTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTc < 8:57905/149‑1 (MQ=255) aCCCGCTCGCCATCACTGCGGCGGATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTc < 3:247714/149‑1 (MQ=255) cccGCTCGCCATCACTGCGGCGGATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTcc < 3:187292/149‑1 (MQ=255) ccGCTCGCCATCACTGCGGCGGATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGc > 3:399129/1‑142 (MQ=255) ccGCTCGCCATCACTGCGGCGGATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGc < 4:399129/142‑1 (MQ=255) gCTCGCCATCACTGCGGCGGATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTgg < 1:57610/149‑1 (MQ=255) gCCATCACTGCGGCGGATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTaa < 7:373825/149‑1 (MQ=255) agaTCACTGCGGCGGATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAg < 1:144495/147‑1 (MQ=255) cTGCGGCGGATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCgg < 7:243735/147‑1 (MQ=255) cTGCGGCGGATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCgg > 8:243735/1‑147 (MQ=255) tGCGGCGGATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTc > 3:106816/1‑148 (MQ=255) cggcggATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAg > 7:57730/1‑149 (MQ=255) gggggATCAGTGTGCGCGGTTGCTGGTAGTGATGCAGGAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCTCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAgc < 8:57730/146‑1 (MQ=255) ggcgtATCTGTGTTCGCGGTAGCTGGAAGTGATTAAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTTGCGCTGCCATGTGTCGCGGTACAGTCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGAACCTCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAg < 6:267383/148‑1 (MQ=255) ggcggATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAgc < 8:211556/149‑1 (MQ=255) ggcggATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAgc < 1:7821/149‑1 (MQ=255) gcggATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCAAgcg > 8:192013/1‑149 (MQ=255) gATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGcag > 8:253102/1‑149 (MQ=255) gtgtGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCACGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGcagccagc > 2:166782/1‑149 (MQ=255) gtgCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGa > 3:110791/1‑149 (MQ=255) gcgcGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGcagcca > 3:115322/1‑143 (MQ=255) gcgcGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGcagcca < 4:115322/143‑1 (MQ=255) gcgGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCACGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAgg < 1:166782/149‑1 (MQ=255) cTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAgtg < 7:162699/149‑1 (MQ=255) gTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGc > 6:144200/1‑149 (MQ=255) tCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGcagccagc < 1:195013/129‑1 (MQ=255) tCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGcagccagc > 2:195013/1‑129 (MQ=255) aTGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAg < 1:92193/117‑1 (MQ=255) aTGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAg > 2:92193/1‑117 (MQ=255) aTGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTg > 4:356559/1‑149 (MQ=255) tGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGc < 5:144200/149‑1 (MQ=255) tGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGc > 4:186339/1‑149 (MQ=255) tGCAGCAGGGGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGc < 7:94546/149‑1 (MQ=255) gcagGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCa > 4:180794/1‑147 (MQ=255) gcAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCgg < 6:32617/98‑1 (MQ=255) gcAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCgg > 5:32617/1‑98 (MQ=255) gcAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCtt > 6:166139/1‑148 (MQ=255) gcAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCtt > 2:80737/1‑148 (MQ=255) aTCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAg < 7:253102/149‑1 (MQ=255) tCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCtt > 3:299791/1‑142 (MQ=255) tCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCtt < 4:299791/142‑1 (MQ=255) gCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGAGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCACACCCGCTCGTACTGGTTAAGCAGGTCCAGCGCAGCCCGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTTCAAGAGCAGCCTTGAGCAcgcg > 2:190723/1‑148 (MQ=255) aaCACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTc > 6:384149/1‑149 (MQ=255) cccccTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCCGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAg > 8:147157/1‑149 (MQ=255) ccccTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCCGCCCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGCCCGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCCGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGt > 5:412337/1‑149 (MQ=255) ccccTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTc > 6:298324/1‑84 (MQ=255) ccccTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTc < 5:298324/84‑1 (MQ=255) ccccTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGt > 7:71187/1‑149 (MQ=255) ccccTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGt > 2:157437/1‑149 (MQ=255) ccccTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGt > 4:252568/1‑149 (MQ=255) gcgcTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTCCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCt > 8:365347/1‑149 (MQ=255) gcTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCg > 8:130110/1‑149 (MQ=255) | CAGTTCGCCGGCGGCCTGCTGCAGCAGCTCGGCCAGGTGCAGCAGGTTGGTCAGCACCCGCTCGCCATCACTGCGGCGGATCAGTGTGCGCGGTAGCTGGAAGTCATGCAGCAGGTGGCGCAACATCGGCAACACCCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCG > NC_002947/5301607‑5301898 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |