Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,516,304 | A→G | 5.0% | I39V (ATC→GTC) | PP_4849 → | molecular chaperone DnaK |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,516,304 | 0 | A | G | 5.0% | 238.6 / 2.4 | 79 | I39V (ATC→GTC) | PP_4849 | molecular chaperone DnaK |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (39/36); new base G (2/2); total (41/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.79e-01 |
CGGCCGTTTTGCCTCCGGAAGCCCATTTCCCATGTCTGACGTATCCCCGGCCCGCGCCCTGGGCATCGACTTTGGCACCTCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCTGCACGAGTACCTGGAAGGCTACGAAGGCCGCCTGATGCGCTCGCTGAAAAGCCTGCTGGGCTCGAAGCTGATCAAG > NC_002947/5516159‑5516447 | cgGCCGTTTTGCCTCCGGAAGCCCATTTCCCATGTCTGACGTATCCCCGGCCCGCGCCCTGGGCATCGACTTTGGCACCTCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCa < 8:35371/149‑1 (MQ=255) cGTTTTGCCTCCGGAAGCCCATTTCCCATGTCTGACGTATCCCCGGCCCGCGCCCTGGGCATCGACTTTGGCACCTCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCtt < 3:17963/149‑1 (MQ=255) gCCTCCGGAAGCCCATTTCCCATGTCTGACGTATCCCCGGCCCGCGCCCTGGGCATCGACTTTGGCACCTCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCt < 2:40876/148‑1 (MQ=255) gCCTCCGGAAGCCCATTTCCCATGTCTGACGTATCCCCGGCCCGCGCCCTGGGCATCGACTTTGGCACCTCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGACCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCt < 5:111510/148‑1 (MQ=255) ccTCCGGAAGCCCATTTCCCATGTCTGGCGTATCCCCGGCCCGCGCCCTGGGCATCGACTTTGGCACCTCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCg < 2:229175/149‑1 (MQ=255) gCCCATTTCCCATGTCTGACGTATCCCCGGCCCGCGCCCTGGGCATCGACTTTGGCACCTCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGttc > 5:303046/1‑149 (MQ=255) cccATTTCCCATGTCTGACGTATCCCCGGCCCGCGCCCTGGGCATCGACTTTGGCACCTCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGttct > 3:70176/1‑149 (MQ=255) ccATTTCCCATGTCTGACGTATCCCCGGCCCGCGCCCTGGGCATCGACTTTGGCACCTCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGttctt < 5:128544/149‑1 (MQ=255) aTTTCCCATGTCTGACGTATCCCCGGCCCGCGCCCTGGGCATCGACTTTGGCACCTCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGttcttc > 5:144405/1‑148 (MQ=255) tttCCCATGTCTGACGTATCCCCGGCCCGCGCCCTGGGCATCGACTTTGGCACCTCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCaa < 5:256070/149‑1 (MQ=255) tGTCTGACGTATCCCCGGCCCGCGCCCTGGGCATCGACTTTGGCACCTCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGaa < 2:114369/149‑1 (MQ=255) gTCTGACGTATCCCCGGCCCGCGCCCTGGGCATCGACTTTGGCACCTCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCg > 7:7202/1‑146 (MQ=255) tGACGTATCCCCGGCCCGCGCCCTGGGCATCGACTTTGGCACCTCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCtt < 3:236831/117‑1 (MQ=255) tGACGTATCCCCGGCCCGCGCCCTGGGCATCGACTTTGGCACCTCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCtt > 4:236831/1‑117 (MQ=255) aCGTATCCCCGGCCCGCGCCCTGGGCATCGACTTTGGCACCTCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAgcg < 3:349501/148‑1 (MQ=255) cGTCTCCCCGGCCCGCGCCCTGGGCAGCGACTTTGGCACCTCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCGATATTGAagaacacc < 8:163048/149‑6 (MQ=255) tATCCCCGGCCCGCGCCCTGGGCATCGACTTTGGCACCTCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCggtg > 8:113478/1‑122 (MQ=255) tATCCCCGGCCCGCGCCCTGGGCATCGACTTTGGCACCTCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCggtg < 7:113478/122‑1 (MQ=255) tCCCCGGCCCGCGCCCTGGGCATCGACTTTGGCACCTCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCggtgg < 5:363430/121‑1 (MQ=255) tCCCCGGCCCGCGCCCTGGGCATCGACTTTGGCACCTCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCggtgg > 6:363430/1‑121 (MQ=255) tCCCCGGCCCGCGCCCTGGGCATCGACTTTGGCACCTCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGccc > 3:402189/1‑149 (MQ=255) cccGGCCCGCGCCCTGGGCATCGACTTTGGCACCTCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCgg > 7:385340/1‑149 (MQ=255) cccGGCCCGCGCCCTGGGCATCGACTTTGGCACCTCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCg < 4:402189/148‑1 (MQ=255) ccGGCCCGCGCCCTGGGCATCGACTTTGGCACCTCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGgt < 1:45079/149‑1 (MQ=255) cccGCGCCCTGGGCATCGACTTTGGCACCTCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTAt < 8:385340/149‑1 (MQ=255) ccGCGCCCTGGGCATCGACTTTGGCACCTCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATg > 8:214546/1‑149 (MQ=255) cTGGGCATCGACTTTGGCACCTCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATgg > 3:278595/1‑143 (MQ=255) cTGGGCATCGACTTTGGCACCTCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATgg < 4:278595/143‑1 (MQ=255) aTCGACTTTGGCACCTCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCt > 5:175630/1‑149 (MQ=255) cGACTTTGGCACCTCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGttctt > 7:343969/1‑105 (MQ=255) cGACTTTGGCACCTCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGttctt < 8:343969/105‑1 (MQ=255) gACTTTGGCACCTCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCtac < 6:144405/148‑3 (MQ=255) aCTTTGGCACCTCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTATTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCTGCAc > 8:154863/1‑149 (MQ=255) tGGCACCTCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCTGCACGa < 6:175630/147‑1 (MQ=255) gCACCTCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAgcggcg > 3:82160/1‑115 (MQ=255) gCACCTCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAgcggcg < 4:82160/115‑1 (MQ=255) cACCTCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCTGCACGAGTAcc < 7:214546/149‑1 (MQ=255) aCCTCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCTGCACGAGTACCt < 2:376134/149‑1 (MQ=255) tCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGGTGATCTTGCCGTctt > 6:252465/1‑80 (MQ=38) tCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGGTGATCTTGCCGTctt < 5:252465/82‑3 (MQ=38) tCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGGTGATCTTGCCGTct > 2:102850/1‑80 (MQ=255) tCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGGTGATCTTGCCGTct < 1:102850/81‑2 (MQ=255) cAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCTGCACGAGTACCTGGAAg > 7:289393/1‑149 (MQ=255) cacaGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCTGCACGAGTACCTGGAAGGCTAc > 4:233043/1‑148 (MQ=255) acaGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCTGCACGAGTACCTGGAAGGCTACg > 6:145582/1‑148 (MQ=255) aGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTTTGGCCGCCTGGCGCTGCACGAGTACCTGGAAGGCTACGAAg > 5:357382/1‑149 (MQ=255) aGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCTGCACGAGTACCTGGAAGGCTACGAAg > 4:216617/1‑149 (MQ=255) ttGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCTGCACGAGTACCTGGAAGGCTACGAAGgccgcc < 6:303046/149‑1 (MQ=255) tGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCTGCACGAGTACCTGGAAGGCTACGAAGGCCGCCt > 1:204426/1‑149 (MQ=255) cATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCTGCACGAGTACCTGGAAGGCTACGAAGGCCGCCTGAt < 5:145582/149‑1 (MQ=255) ggCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCTGCACGAGTACCTGGAAGGGTACGAAGGCCGCCTGATgcgc > 1:219667/1‑149 (MQ=255) ggCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCTGCACGAGAACCTGGAAGGCTACGAAGGCCGCCTGATgcgc > 4:54450/1‑149 (MQ=255) tGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCTGCACGAGTACCTGGAAGGCTACGAAGGCCGCCTGATGcgctcgc > 5:884/1‑149 (MQ=255) gCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCTGCACGAGAACCTGGAAGGCTACGAAGGCCGCCTGATGcgctcgc < 3:54450/147‑1 (MQ=255) gAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGGCGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCTGCACGAGTACCTGGAAGGCTACGAAGGCCGCCTGATGCGCTCGCTGAAAAg > 7:62552/1‑149 (MQ=255) gATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCTGCACGAGTACCTGGAAGGCTACGAAGGCCGCCTGATGCGCTCGCTg < 6:195653/136‑1 (MQ=255) gATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCTGCACGAGTACCTGGAAGGCTACGAAGGCCGCCTGATGCGCTCGCTg > 5:195653/1‑136 (MQ=255) aTTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCTGCACGAGTACCTGGAAGGCTACGAAGGCCGCCTGATGCGCTCGCTGAAAAGCCTGCTggg < 4:70176/149‑1 (MQ=255) gCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCTGCACGAGTACCTGGAAGGCTACGAAGGCCGCCTGATGCGCTCGCTGAAAAGCCTGCTGGGCTc > 8:382549/1‑149 (MQ=255) cTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCTGCACGAGTACCTGGAAGGCTACGAAGGCCGCCTGATGCGCTCGCTGAAAAGCCTGCTGGGCTCg > 2:367017/1‑147 (MQ=255) tGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCTGCACTAGTACCTGGAAGGCTAc < 7:141233/104‑1 (MQ=255) tGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCTGCACGAGTACCTGGAAGGCTAc > 8:141233/1‑104 (MQ=255) tGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCTGCACGAGTACCTGGAAGGCTACGAAGGCCGCCTGATGCGCTCGCTGAAAAGCCTGCTGGGCTCg > 4:363892/1‑146 (MQ=255) ggAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCTGCACGAGTACCTGGAAGGCTACGAAGGCCGCCTGATGCGCTCGCTGAAAAGCCTGCTGGGCTCGAAGc > 6:385711/1‑149 (MQ=255) gAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCTGCACGAGTACCTGGAAGGCTACGAAGgcc < 1:46843/109‑1 (MQ=255) gAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCTGCACGAGTACCTGGAAGGCTACGAAGgcc > 2:46843/1‑109 (MQ=255) gAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCTGCACGAGTACCTGGAAGGCTACGAAGGCCGCCTGATGCGCTCGCTGAAAAGCCTGCTGGGCTCGaa < 3:363892/146‑1 (MQ=255) gAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCTGCACGAGTACCTGGAAGGCTACGAAGGCCGCCTGATGCGCTCGCTGAAAAGCCTGCTGGGCTCGAAg < 2:204426/147‑1 (MQ=255) gAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCTGCACGAGTACCTGGAAGGCTACGAAGGCCGCCTGATGCGCTCGCTGAAAAGCCTGCTGGGCTCGAAGc < 3:233043/148‑1 (MQ=255) ggCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGgt > 6:15669/1‑56 (MQ=255) ggCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGgt < 5:15669/56‑1 (MQ=255) ggCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCTGCACGAGTACCTGGAAGGCTACGAAGGCCGCCTGATGcgct < 8:133250/115‑1 (MQ=255) ggCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCTGCACGAGTACCTGGAAGGCTACGAAGGCCGCCTGATGcgct > 7:133250/1‑115 (MQ=255) ggCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCTGCACGAGTACCTGGAAGGCTACGAAGGCCGCCTGATGCGCTCGCTGAAAAGCCTGCTGGGCTCGAAGCTGATc > 6:197882/1‑147 (MQ=255) ggCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCTGCACGAGTACCTGGAAGGCTACGAAGGCCGCCTGATGCGCTCGCTGAAAAGCCTGCTGGGCTCGAAGCTGATCaa > 6:145687/1‑149 (MQ=255) ggCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCTGCACGAGTACCTGGAAGGCTACGAAGGCCGCCTGATGCGCTCGCTGAAAAGCCTGCTGGGCTCGAAGCTGATCaa > 2:272688/1‑149 (MQ=255) ggCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCTGCACGACTACCTGGAAGGCTACGAAGGCCGCCTGATGCGCTCGCTGAAAAGCCTGCTGGGCTCGAAGCTGATCaa < 8:7202/149‑1 (MQ=255) cAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCTGCACGAGTACCTGGAAGGCTACGAAGGCCGCCTGATGCGCTCGCTGAAAAGCCTGCTGGGCTCGAAGCTGATCAAg > 1:359238/1‑148 (MQ=255) cAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCTGCACGAGTACCTGGAAGGCTACGAAGGCCGCCTGATGCGCTCGCTGAAAAGCCTGCTGGGCTCGAAGCTGATCAAg > 5:362625/1‑148 (MQ=255) | CGGCCGTTTTGCCTCCGGAAGCCCATTTCCCATGTCTGACGTATCCCCGGCCCGCGCCCTGGGCATCGACTTTGGCACCTCCAACTCCACAGTCGGTTGGCATCGGCCTGGCGTCGAGTCGCTGATTGCCCTGGAAGACGGCAAGATCACCTTGCCCTCGGTGGTGTTCTTCAATATCGAAGAGCGGCGCCCGGTGTATGGCCGCCTGGCGCTGCACGAGTACCTGGAAGGCTACGAAGGCCGCCTGATGCGCTCGCTGAAAAGCCTGCTGGGCTCGAAGCTGATCAAG > NC_002947/5516159‑5516447 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |