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cGACAGCTCGCCGGCCAGGCGGTTGGCGCAATCGACCAGGTCCACTACTTCCAGCCAGTAGAAGGCGTGGTCCAGCGAATCGCTTTCGGCCTTGCGGTAGGCCTTGG‑TGTTGAGCACCCCGTCCAGCAAGTTGCGGTTGACCCACAtgt < 7:61406/149‑1 (MQ=255) gACAGCTCGCCGGCCAGGCGGTTGGCGCAATCGACCAGGTCCACTACTTCCAGCCAGTAGAAGGCGTGGTCCAGCGCATCGCTTTCGGCCTTGCGGTAGGCCTTGG‑TGTTGAGCACCCCGGCCAGCAAGTTGCGGTTGACCCACAtgtg > 2:107072/1‑149 (MQ=255) cAGCTCGCCGGCCAGGCGGTTGGCGCAATCGACCAGGTCCACTACTTCCAGCCAGTAGAAGGCGTGGTCCAGCGCATCGCTTTCGGCCTTGCGGTAGGCCTTGG‑TGTTGAGCACCCCGGCCAGCAAGTTGCGGTTGACCCACATGTGCt > 3:171587/1‑149 (MQ=255) gCTCGCCGGCCAGGCGGTTGGCGCAATCGACCAGGTCCACTACTTCCAGCCAGTAGAAGGCGTg > 1:361115/1‑64 (MQ=255) gCTCGCCGGCCAGGCGGTTGGCGCAATCGACCAGGTCCACTACTTCCAGCCAGTAGAAGGCGTg < 2:361115/64‑1 (MQ=255) tCGCCGGCCAGGCGGTTGGCGCAATCGACCAGGTCCACTACTTCCAGCCAGTAGAAGGCGTGGTCCAGCGCATCGCTTTCGGCCTTGCGGTAGGCCTTGG‑TGTTGAGCACCCCGGCCAGCAAGTTGCGGTTGACCCACATGTGCTGGGc < 8:145574/149‑1 (MQ=255) cGCCGGCCAGGCGGTTGGCGCAATCGACCAGGTCCACTACTTCCAGCCAGTAGAAGGCGTGGTCCAGCGCATCGCTTTCGGCCtt > 6:421618/1‑85 (MQ=255) cGCCGGCCAGGCGGTTGGCGCAATCGACCAGGTCCACTACTTCCAGCCAGTAGAAGGCGTGGTCCAGCGCATCGCTTTCGGCCtt < 5:421618/85‑1 (MQ=255) cGCCGGCCAGGCGGTTGGCGCAATCGACCAGGTCCACTACTTCCAGCCAGTAGAAGGCGTGGTCCAGCGCATCGCTTTCGGCCTTGCGGTAGGCCTTGG‑TGTTGAGCACCCCGGCCAGCAAGTTGCGGTTGACCCACATGTGCTGGGcc < 5:210394/149‑1 (MQ=255) gCCGGCCAGGCGGTTGGCGCAATCGACCAGGTCCACTACTTCCAGCCAGTAGAAGGCGTGGTCCAGCGCATCGCTTTCGGCCTTGCGGTAGGCCTTGG‑TGTTGAGCACCCCGGCCAGCAAGTTGCGGTTGACCCACATGTGCTgg > 2:142162/1‑145 (MQ=255) gCCGGCCAGGCGGTTGGCGCAATCGACCAGGTCCACTACTTCCAGCCAGTAGAAGGCGTGGTCCAGCGCATCGCTTTCGGCCTTGCGGTAGGCCTTGG‑TGTTGAGCACCCCGGCCAGCAAGTTGCGGTTGACCCACATGTGCTgg < 1:142162/145‑1 (MQ=255) gCCGACCAGGCGGTTGGCGCAATCGACCAGGTCCACTACTTCCAGCCAGTAGAAGGCGTGGTCCAGCGCATCGCTTTCGGCCTTGCGGTAGGCCTTGG‑TGTTGAGCACCCCGGCCAGCAAGTTGCGGTTGACCCACATGTGCTGGGc < 8:313930/147‑1 (MQ=255) gCCAGGCGGTTGGCGCAATCGACCAGGTCCACTACTTCCAGCCAGTAGAAGGCGTGGTCCAGCGCATCGCTTTCGGCCTTGCGGTAGGCCTTGG‑TGTTGAGCACCCCGGCCAGCAAGTTGCGGTTGACCCACATGTGCTGGGCCACcag < 7:274594/149‑1 (MQ=255) | AGCACACGGATCATGCGGCTGAGTGCCTCGGTTTCCTGCGGGTTAAGGCCTGCCGCCGGTTCGTCCAGGCAGATGA‑‑TCTT‑‑‑CGGCCGCGTGCACATGGCCCGGGCGATTTCCAGACGCCGCTGCTGGCCGTACGACAGCTCGCCGGCCAGGCGGTTGGCGCAATCGACCAGGTCCACTACTTCCAGCCAGTAGAAGGCGTGGTCCAGCGCATCGCTTTCGGCCTTGCGGTAGGCCTTGG‑TGTTGAGCACCCCGGCCAGCAAGTTGCGGTTGACCCACATGTGCTGGGCCACCAG > NC_002947/5530280‑5530572 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |