Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,584,541 | G→A | 7.1% | I397I (ATC→ATT) ‡ | parC ← | DNA topoisomerase IV subunit A |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,584,541 | 0 | G | A | 7.1% | 207.5 / 3.8 | 72 | I397I (ATC→ATT) ‡ | parC | DNA topoisomerase IV subunit A |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (24/41); new base A (2/3); total (26/46) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.26e-01 |
ACTCATCCTGCTCACCGCGGATCTTCATCTCTTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAG‑‑TCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCGACCTTATCCAGACGATGCTGCAGGCGGCGACGAACGGTATTGGTGCGGAACTCCAGCCACTCCACCAATAGGGTTCGCAGGTTT > NC_002947/5584393‑5584688 | aCTCATCCTGCTCACCGCGGATCTTCATCTCTTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAG‑‑TCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTgg < 8:143762/149‑1 (MQ=255) tCCTGCTCACCGCGGATCTTCATCTCTTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAG‑‑TCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCAc < 8:34521/149‑1 (MQ=255) cTGCTCACCGCGGATTTTCTTTTCTTCCAGTCGCGCCAATTGCCGATGGTGGGTTTTGTGTATTTAGCCTCNGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCAc < 1:131064/149‑1 (MQ=255) cTGCTCACCGCGGATCTTCATCTCTTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAG‑‑TCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGGCGATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACt < 1:257192/149‑1 (MQ=255) cACCGCGGATCTTCATCTCTTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAG‑‑GCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGAAGTGATCCACATCATcc < 1:152285/149‑1 (MQ=255) aCCGCGGATCTTCATCTCTTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAG‑‑TCGGCCTGTATCTCGGACAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATc > 1:75901/1‑147 (MQ=255) ccGCGGATCTTCATCTCTTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAG‑‑TCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATACTCCTCGGTACGGATGAAGTGATCCACATCATccgt < 8:2798/149‑3 (MQ=255) tCTTCATCTCTTCCAGGCGCGCAAACTGCCGGAGGCGGGTCTCGAGGATGTAG‑‑TCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAg < 8:278547/148‑1 (MQ=255) ttCATCTCTTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAG‑‑TCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTc < 6:157867/134‑1 (MQ=255) ttCATCTCTTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAG‑‑TCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTc > 5:157867/1‑134 (MQ=255) tCATCTCTTCCAGGCGCGCCAACTCCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAG‑‑TCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTAAGGATGATGTGGAGCACTTCATCCAGGTGGAGGAAt > 8:309963/1‑149 (MQ=255) cATCTCTTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAG‑‑TCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAgg < 4:154770/145‑1 (MQ=255) cATCTCTTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAG‑‑TCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAg < 3:58780/144‑1 (MQ=255) cATCTCTTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAG‑‑TCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATg > 3:387480/1‑149 (MQ=255) cATCTCTTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAG‑‑GCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAAt < 8:261943/148‑1 (MQ=255) atatctTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGGCTCGAGGATTTAG‑‑TCTGACTGTATCTCGGTCAGCCCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATACCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATg < 4:76728/145‑1 (MQ=255) ctctTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAG‑‑TCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGAAGTGATCCACATCATccgtac < 1:301471/137‑5 (MQ=255) ctctTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAG‑‑TCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGAAGTGATCCACATCATccgtac > 2:301471/1‑133 (MQ=255) tctTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAG‑‑TCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGt > 7:76008/1‑149 (MQ=255) ttgcAGGCGCGGCTACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGCTGTAG‑‑GCGTCTTGTTTGTCTGTCATCTCGATACGTTCGATGAGGGCCTGCTTTG‑GATATTGCTCGGTACGGATGATGTGGTTCACTTGATCCAGGTTGAGGCATGCAg < 8:316808/143‑1 (MQ=255) ttCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAG‑‑TCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCa < 1:2051/145‑1 (MQ=255) ttCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAG‑‑TCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGt < 8:76008/147‑1 (MQ=255) ttCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAG‑‑TCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGt > 3:170341/1‑147 (MQ=255) tCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAG‑‑TCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAg > 4:131382/1‑149 (MQ=255) ccAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAG‑‑TCGGCCTGTATCTCGGACAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAg < 2:75901/148‑1 (MQ=255) cgcgcCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAG‑‑TCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAAcc < 3:385751/149‑1 (MQ=255) gcgcCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAG‑‑TCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATc > 7:105471/1‑121 (MQ=255) gcgcCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAG‑‑TCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATc < 8:105471/121‑1 (MQ=255) gcgcCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAG‑‑TCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCg < 2:219230/149‑1 (MQ=255) gcgcCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAG‑‑TCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAAAGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATACAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAAcct > 8:354045/1‑148 (MQ=255) gcCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAG‑‑TCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCAc > 7:53134/1‑113 (MQ=255) gcCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAG‑‑TCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCAc < 8:53134/113‑1 (MQ=255) gcCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAG‑‑TCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTc < 1:33729/149‑1 (MQ=255) cTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAG‑‑TCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACa < 2:320616/149‑1 (MQ=255) cGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTTG‑‑TCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGTTGTGGATCACTTGATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTg < 3:56420/149‑1 (MQ=255) cGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAG‑‑TCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTg > 6:393806/1‑149 (MQ=255) gCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAG‑‑TCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGc < 2:238117/149‑1 (MQ=255) gAGGATGTAG‑‑TCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCa < 6:173164/112‑1 (MQ=255) aGGATGTAG‑‑TCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCGAc < 2:229388/149‑1 (MQ=255) ggATGTAG‑‑TCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCGAcc < 4:170341/149‑1 (MQ=255) tGTAG‑‑TCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCGACCTTa < 5:393806/149‑1 (MQ=255) cGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCGACCTTATCCAGa < 3:131382/149‑1 (MQ=255) ggCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCGACCTTATCCAGa < 2:193374/148‑1 (MQ=255) tctcGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTc > 4:24226/1‑106 (MQ=255) tctcGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTc < 3:24226/106‑1 (MQ=255) ctcGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCGACCTTATCCAGACGAtgctg > 4:383778/1‑147 (MQ=255) tcGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCaaa > 5:349453/1‑99 (MQ=255) tcGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGAGGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCaaa < 6:349453/99‑1 (MQ=255) ggTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCGACCTTATCCAGACGATGCTGCa < 5:55903/146‑1 (MQ=255) gTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCGACCTTATCAAGACGATGCTGCAggcg > 3:49452/1‑149 (MQ=255) tggAAACGTTCGATCTGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATTATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGt < 2:367057/81‑1 (MQ=255) gAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACGGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCGACCTTATCCAGACGATGCTGCAGGCGGcgacg < 7:309963/147‑1 (MQ=255) gAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCGACCTTATCCAGACGATGCTGCAGGCGGCGACGaa > 4:51398/1‑149 (MQ=255) cGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCGACCTTATCCAGACGATGCTGCAGGCGGCGACGAACGGt < 3:383778/149‑1 (MQ=255) ttCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGTATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCGACCTTATCCAGACGATGCTGCAGGCGGCGACGAACGGTAt < 5:132496/149‑1 (MQ=255) gATCAGGGCCTTCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATTCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCGACCTTATCCAGACGATGCTGCAGGCGGCGACGAACGGTATTg < 7:354045/148‑1 (MQ=255) aTCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCGACCTTATCCAGACGATGCTGCAGGCGGCGACGAACGGTATTGGt < 3:51398/149‑1 (MQ=255) gggCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCGACCTTATCCAGACGAtgctg < 8:291532/121‑1 (MQ=255) gggCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCGACCTTATCCAGACGAtgctg > 7:291532/1‑121 (MQ=255) gggCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCGACCTTATCCAGACGATGCTGCAGGCGGCGACGAACGGTATTGGTGCg > 1:57974/1‑148 (MQ=255) tGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCGACCTTATCCAGACGATGCTGCAGGCGGCGACGAACGGTATTGGTGCGGAACTc > 4:188548/1‑149 (MQ=255) gCTTTG‑GATATTGCTCTGTACTGATGATGTTTTTCACTTCATCCAGGTTGTGGAATGCATTTTGCAAACCGTCCAACTGGTGCAGACGCTTCTCGACCTTATCCAGACTATGCTGCAGGCGGCGACGAACGGTATTGTTGCGGAACt < 2:368539/147‑1 (MQ=255) cTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCGACCTTATCCAGACGATGCTGCAGGCGGCGACGAACGGTATTGGTGCGGAACTc < 4:387480/147‑1 (MQ=255) gg‑gATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCGACCTTATCCAGACGATGCTGCAGGCGGTGACGAACGGTATTGGTGCGGAACTCCAGc > 2:52707/1‑148 (MQ=255) gATATTCCTCGGTACGGATGATGTTGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACGGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCGACCTTATCCAGACGATGCTGCAGGCGGCGACGAACGGTATTGGTGCGGAACt < 5:252326/141‑1 (MQ=255) gATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCGACCTTATCCAGACGATGCTGCAGGCGGTGACGAACGGTATTGGTGCGGAACTCCAGCCAc < 1:52707/149‑1 (MQ=255) gATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCGACCTTATCCAGACGAAGCTGAAGGCGGCGACGAACGGTATTCGTGCGGAACt > 6:252326/1‑141 (MQ=255) ttCCTCGGTACGGATGAAGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTATCGCCCTTATCCAGACGATGCTGCAGGCGACGACCAAAGGTATTGCTGAGGAACTCCAGCCACTcca > 5:827/1‑149 (MQ=255) tCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAAc < 4:2696/66‑1 (MQ=255) tCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAAc > 3:2696/1‑66 (MQ=255) tACGTATTATGAGTATCACTTCATCCAGTTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCGAAAAGTTGCAGACGCTTCTGGACCTTATCCAGACGATGCTGCAGGCGGCGACGAACGGTATTTGTGCGGAACTCCAGCCACTGCACCAATAgg < 6:827/149‑1 (MQ=255) ctggATGAAGTGATCCACATCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCGACCTTATCCAGACGATGCTGCAGGCGGCGACGAACGGTATTGGTGCGGAACTCCAGCCACTCCACCAATAggg > 2:187681/3‑149 (MQ=255) gtgGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCGACCTTATCCAGACGATGCTGCAGGCGGCGACGAACGGTATTGGTGCGGAACTCCAGCCACTCCACCAATAGGGTTCGCAGGt > 3:156357/1‑149 (MQ=255) ggATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCGACCTTATCCAGACGATGCTGCAGGCGGCGACGAACGGTATTGGAGCGGAACTCCAGCCACTCCACCAATAGGGTTCGCAGGttt > 5:255008/1‑149 (MQ=255) ggATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGAGCAGACGCTTCTCGACCTTATCCAGACGATGCTGCAGGCGGCGACGAACGGTATTGGTGCGGAACTCCAGCCACTCCACCAATAGGGTTCGCAGGttt > 1:308911/1‑149 (MQ=255) gATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCGACCTTATCCAGACGATGCTGCAGGCGGCGACGAACGGTATTGGTGCGGAACTCCAGCCAc > 4:196941/1‑124 (MQ=255) gATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCGACCTTATCCAGACGATGCTGCAGGCGGCGACGAACGGTATTGGTGCGGAACTCCAGCCAc < 3:196941/124‑1 (MQ=255) | ACTCATCCTGCTCACCGCGGATCTTCATCTCTTCCAGGCGCGCCAACTGCCGCAGGCGGGTCTCGAGGATGTAG‑‑TCGGCCTGTATCTCGGTCAGCTCGAAACGTTCGATCAGGGCCTGCTTGG‑GATATTCCTCGGTACGGATGATGTGGATCACTTCATCCAGGTTGAGGAATGCAGTGAGCAAACCGTCCAACAGGTGCAGACGCTTCTCGACCTTATCCAGACGATGCTGCAGGCGGCGACGAACGGTATTGGTGCGGAACTCCAGCCACTCCACCAATAGGGTTCGCAGGTTT > NC_002947/5584393‑5584688 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |