| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,667,258 | G→T | 6.3% | intergenic (+36/+35) | nhaP → / ← PP_4975 | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter/acyl‑CoA thioesterase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,667,258 | 0 | G | T | 6.3% | 240.4 / 5.5 | 79 | intergenic (+36/+35) | nhaP/PP_4975 | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter/acyl‑CoA thioesterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/40); new base T (3/2); total (37/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.61e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.37e-01 | |||||||||||
GGAACGGGACCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGC‑TGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGACGAACACCATCTTGTCGA > NC_002947/5667114‑5667402 | ggAACGGGACCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑Acc > 3:54650/1‑149 (MQ=255) aaCGGGACCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCcg > 6:352910/1‑149 (MQ=255) ggACCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGaa < 7:94346/149‑1 (MQ=255) ggACCTGCGGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGGTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGGTGATCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGaa < 8:76432/149‑1 (MQ=255) ctgctgctgTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGTGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAgg > 8:98089/1‑149 (MQ=255) ctgTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGca > 1:219686/1‑149 (MQ=255) ctgTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGca < 1:221236/149‑1 (MQ=255) gTCGATCACCTACATAGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGAGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGca > 5:274848/1‑147 (MQ=255) tCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGcac < 5:5932/147‑1 (MQ=255) gATCACCTACTTGGGGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGc < 6:402542/139‑1 (MQ=255) gATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGc > 5:402542/1‑139 (MQ=255) gATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAgg > 6:57159/1‑148 (MQ=255) gATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAgg > 2:100759/1‑148 (MQ=255) gATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGc < 5:5023/149‑1 (MQ=255) aCCTAGATCGTGGTGTTGTCGTGGATTCTGGTGCAGGGGTTGTGCATTGGGCGGGTGGAGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCGGGGGCAGCTTTGTGGCCCATTCGCGGGTGA‑AGCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAAc < 1:86088/148‑1 (MQ=255) ccTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGc > 3:254452/1‑134 (MQ=255) ccTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGc < 4:254452/134‑1 (MQ=255) cTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAagag > 2:368323/1‑131 (MQ=255) cTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAagag < 1:368323/131‑1 (MQ=255) tACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAgg < 4:54650/149‑1 (MQ=255) cATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAgg < 5:236177/147‑1 (MQ=255) tCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTc > 3:127782/1‑148 (MQ=255) tgttgtCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGa < 5:6191/149‑1 (MQ=255) tcgtcgATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGcc < 5:352910/149‑1 (MQ=255) tcgtcgATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGcc > 1:222053/1‑149 (MQ=255) tcgtcgATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCGTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGATACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGc < 1:291156/149‑1 (MQ=255) gATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTTC‑ACCCGCGaatgg < 3:105059/110‑4 (MQ=255) gATTCTGGTGAAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTTCGGCCCATTAGCCGGTTC‑ACCCGCGaaagg > 4:105059/1‑107 (MQ=255) tCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCTCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCg < 4:304966/148‑1 (MQ=255) cTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCACAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCgg < 4:127782/148‑1 (MQ=255) gCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTg > 6:155373/1‑149 (MQ=255) gggTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTcc > 1:252208/1‑149 (MQ=255) ttGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGc < 5:155373/149‑1 (MQ=255) aGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCAc < 6:274848/148‑1 (MQ=255) aGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACg > 4:115340/1‑149 (MQ=255) gCATTGGGCGGGTGGGGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGt < 5:333210/149‑1 (MQ=255) cATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGcc < 8:252114/123‑1 (MQ=255) cATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGcc > 7:252114/1‑123 (MQ=255) cGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCTGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGAtc < 1:100759/149‑1 (MQ=255) gggTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTTC‑ACCCGCGaatgg < 2:293147/81‑4 (MQ=37) gggTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGAATGCCGAATACCGGAACAGGTcc > 6:69949/1‑133 (MQ=255) gggTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCCCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTTC‑ACCCGCGaatgg > 1:293147/1‑78 (MQ=37) tggtgCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCgg < 2:222053/149‑1 (MQ=255) cgcAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTgcgc < 3:131262/149‑1 (MQ=255) gTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATgg > 6:366861/1‑149 (MQ=255) gTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATgg < 2:219686/149‑1 (MQ=255) gTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATgg < 5:57159/149‑1 (MQ=255) tCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATggg > 4:365128/1‑149 (MQ=255) cccAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGC‑TGCCg > 8:19720/1‑149 (MQ=255) ccAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGC‑TGCCgg > 4:131963/1‑149 (MQ=255) cAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTc < 2:345553/109‑1 (MQ=255) cAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTc > 1:345553/1‑109 (MQ=255) cAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGC‑TGCCgg > 7:300255/1‑148 (MQ=255) ccTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGC‑TGCCGGCAAg > 1:15039/1‑149 (MQ=255) gagaATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTc > 8:171551/1‑102 (MQ=255) gagaATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTc < 7:171551/102‑1 (MQ=255) agaATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGC‑TGCCGGCAAGCCAt < 3:131963/148‑1 (MQ=255) tGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAg > 3:222121/1‑56 (MQ=255) tGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAg < 4:222121/56‑1 (MQ=255) tGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTTGCCGGCAGCCCAtgggc < 5:276766/149‑5 (MQ=39) tGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGC‑TGCCGGCAAGCCATCCTCg > 4:371598/1‑149 (MQ=255) tGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGC‑TGCCGGCAAGCCATCCTCg > 7:281938/1‑149 (MQ=255) gCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGCAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGC‑TGCCGGCAAGCCATCCTCGc > 6:368327/1‑149 (MQ=255) gCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGC‑TGCCGGCAAGCCATCCTCGc > 5:192086/1‑149 (MQ=255) ccGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGC‑TGCCGGCAAGCCATCCTCGcc > 1:327036/1‑149 (MQ=255) gCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGC‑TGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGt < 3:365128/149‑1 (MQ=255) ccGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGC‑TGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGtt < 7:98089/149‑1 (MQ=255) cTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACTTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGC‑TGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGAc < 3:371598/149‑1 (MQ=255) cTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGC‑TGCCGGCAAGCCAt > 3:238828/1‑133 (MQ=255) cTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGC‑TGCCGGCAAGCCAt < 4:238828/133‑1 (MQ=255) tttGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGCCTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGC‑TCCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGAc > 4:64591/1‑148 (MQ=255) tttGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGC‑TGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAg > 7:73268/1‑142 (MQ=255) tttGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGC‑TGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAg < 8:73268/142‑1 (MQ=255) ggCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGC‑TGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGACGAacac < 8:281938/149‑1 (MQ=255) ggCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGC‑TGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGACGAacac < 5:366861/149‑1 (MQ=255) ctcttCGCGGGTTC‑ACCCGCGAATGGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGC‑TGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGACGAACACCAt > 1:412933/4‑149 (MQ=255) gcgGGTGA‑ACCCGCGTAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGC‑TGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGACGAACACCATCTTGTc < 5:368327/149‑1 (MQ=255) gcgGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGC‑TGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGACGAACACCATCTTGt < 6:192086/148‑1 (MQ=255) gggTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGC‑TGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGACGAACACCATCTTGTCGa < 2:15039/149‑1 (MQ=255) | GGAACGGGACCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTGA‑ACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGC‑TGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGACGAACACCATCTTGTCGA > NC_002947/5667114‑5667402 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |