| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,753,486 | C→A | 6.6% | intergenic (+47/‑319) | glnA → / → glnL | glutamine synthetase/two‑component system sensor histidine kinase/phosphatase GlnL/GlnG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,753,486 | 0 | C | A | 6.6% | 283.9 / 7.9 | 93 | intergenic (+47/‑319) | glnA/glnL | glutamine synthetase/two‑component system sensor histidine kinase/phosphatase GlnL/GlnG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (44/40); new base A (3/3); total (48/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.97e-01 | |||||||||||
GACTTCATCGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGTTTCACCAAGACTTTC > NC_002947/5753341‑5753631 | gacTTCATCGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCgg > 1:208793/1‑148 (MQ=255) aTCGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCg > 1:324588/1‑149 (MQ=255) tCGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGt > 1:147332/1‑149 (MQ=255) gATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGtt < 2:220813/148‑1 (MQ=255) gCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTg > 5:260154/1‑149 (MQ=255) ccTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGt < 4:206117/149‑1 (MQ=255) ccTTCATCGAGCTGAAGACCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTTGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAACACGGCCTCCCTCGCGAGGCCGTTTTTGt < 7:393041/149‑1 (MQ=255) cATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGttt < 2:147332/147‑1 (MQ=255) aTCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCt < 6:366329/148‑1 (MQ=255) tCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTgc > 6:172825/1‑149 (MQ=255) gAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCtt > 6:178589/1‑149 (MQ=255) agCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCGAGGGAGGCCGttttgat > 8:21256/1‑129 (MQ=255) agCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCGAGGGAGGCCGttttgat < 7:21256/132‑4 (MQ=255) aagaagaaATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAgc > 6:287338/1‑149 (MQ=255) aagaagaaATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAgc > 4:2040/1‑149 (MQ=255) tgaagaaATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAgc < 1:51050/147‑1 (MQ=255) agaagaaATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAgc < 2:208793/148‑1 (MQ=255) agaaATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGcgccg < 6:260154/149‑1 (MQ=255) gaaATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTTGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGcgccgc > 7:61109/1‑149 (MQ=255) aTCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCtt < 4:351629/133‑1 (MQ=255) aTCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCtt > 3:351629/1‑133 (MQ=255) aaGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTc > 8:295804/1‑149 (MQ=255) tCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCt > 2:200950/1‑149 (MQ=255) aCCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTgcg < 6:9664/115‑1 (MQ=255) aCCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTgcg > 5:9664/1‑115 (MQ=255) ccTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACg < 8:110859/149‑1 (MQ=255) 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ccGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCAc < 8:6933/106‑1 (MQ=255) cagCTGGAATACGACCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTTGCGACTCGCGCCCATGACATGATAAAAACGGCCTCAATCTGGAGGCCTTTTTTTTTTCTGCGCACATTGCAGAAAATCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTa > 2:253416/3‑148 (MQ=255) ggAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCAc > 2:106491/1‑132 (MQ=255) ggAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTg < 7:189979/148‑1 (MQ=255) ggAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTg > 8:189979/1‑148 (MQ=255) ggAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAAGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCAc < 1:106491/132‑1 (MQ=255) cagcaGCTGTAGTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTa < 6:77298/135‑1 (MQ=255) cagcaGCTGTAGTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTa > 5:77298/5‑139 (MQ=255) cGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAGACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCAt < 3:217997/148‑1 (MQ=255) gAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCAtt > 5:59749/1‑148 (MQ=255) aGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTaa > 8:343031/1‑149 (MQ=255) aGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTaa < 6:396176/149‑1 (MQ=255) tactacAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGACACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTca < 5:287338/148‑1 (MQ=255) tacAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAAtt < 8:127383/143‑1 (MQ=255) tacAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAAtt > 7:127383/1‑143 (MQ=255) tacAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCacac > 7:187452/1‑148 (MQ=255) cAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTTTCTTGGTGCATTAATTCACACCAt > 8:6326/1‑149 (MQ=255) aGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATg > 2:319627/1‑149 (MQ=255) ctgatctgatTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCt > 2:390283/1‑148 (MQ=255) atctgatTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTTGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCaa < 8:61109/148‑1 (MQ=255) atctgatTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTg > 6:220543/1‑121 (MQ=255) atctgatTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTg < 5:220543/121‑1 (MQ=255) ctgatTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTg > 2:86326/1‑149 (MQ=255) atTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTg < 5:178589/146‑1 (MQ=255) atTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCt < 5:172825/148‑1 (MQ=255) ttGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGctct < 8:1098/109‑1 (MQ=255) ttGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGctct > 7:1098/1‑109 (MQ=255) ttGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTcc < 8:187452/149‑1 (MQ=255) 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gATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAAc < 2:192146/147‑1 (MQ=255) gATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGt > 4:142900/1‑149 (MQ=255) gATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTACCCAATCTGGTTCAGGTTAAAc > 1:192146/1‑147 (MQ=255) aTCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCCCGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTgg > 5:425071/1‑134 (MQ=255) aTCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTgg < 6:425071/134‑1 (MQ=255) tCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCt > 8:322122/1‑122 (MQ=255) tCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCt < 7:322122/122‑1 (MQ=255) aaaaaCGGCCTCCCGAGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGttt > 4:320190/2‑148 (MQ=255) aaaaaCGGCCTCCCGAGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGTTTc < 3:320190/148‑1 (MQ=255) aaaCGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGTTTcgc > 8:77188/1‑147 (MQ=255) tccctcGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGTTTCACCAAGACtt > 1:410634/1‑149 (MQ=255) cctcGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGTTTCACCAAGACTTTc < 3:142900/149‑1 (MQ=255) cctcGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCCATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGTTTCACCAAGACTTTc < 7:146844/149‑1 (MQ=255) atcGGTAGGCATTTTTTTTTTCTGCGCTCCTTGCATAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACTCTATGCTCTATCTTGTTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCGCATTCTGGTTCAGGTTAAACGTTTCACCAAGACTTTc < 1:253416/147‑1 (MQ=255) | GACTTCATCGATGCCTTCATCGAGCTGAAGAGCGAAGAAGAAATCAAGGTCCGTACCTTCGTACACCCGCTGGAATACGAGCTGTACTACAGCTGCTGATCTGATTGGCGCCTCGCGCCGATGACATGATCAAAACGGCCTCCCTCGGGAGGCCGTTTTTGTTTCTGCGCACCTTGCAGAAGCGCCGCTGATTCGCCTGTCACGCTATGCTCTATCTTGGTGCATTAATTCACACCATGCCCTCAATTGCTCCCCAATCTGGTTCAGGTTAAACGTTTCACCAAGACTTTC > NC_002947/5753341‑5753631 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |