Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 583,798 | T→C | 7.1% | L555P (CTG→CCG) | selB → | selenocysteyl‑tRNA‑specific translation elongation factor |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 583,798 | 0 | T | C | 7.1% | 200.5 / 3.8 | 70 | L555P (CTG→CCG) | selB | selenocysteyl‑tRNA‑specific translation elongation factor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (40/25); new base C (2/3); total (42/28) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.83e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.80e-01 |
AGCGAAGCCGACAGTGCATTGTGGGCACGTCTGCAGCCGAAGTTGATCGCAGGGC‑AATTTGACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACTTGTTCTACCCCGAGGCGACGCTGCAGCGCATGGCAGCGTTGATGCTGGGGCAGGCCAGCGAAACGCAGATAGTGCAGGTTGCCGCGTTTCGCGATATGTTGGGCATCGGTCGCAAGC > NC_002947/583653‑583944 | aGCGAAGCCGACAGTGCATTGTGGGCACGTCTGCAGCCGAAGTTGATCGCAGGGC‑AATTTGACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTgg < 3:215168/148‑1 (MQ=255) gAAGCCGACAGTGCATTGTGGGCACGTCTGCAGCCGAAGTTGATCGCAGGGC‑AATTTGACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCt > 8:229768/1‑149 (MQ=255) aaGCCGACAGTGCATTGTGGGCACGTCTGCAGCCGAAGTTGATCGCAGGGC‑AATTTGACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTg > 4:178625/1‑149 (MQ=255) aaGCCGACAGTGCATTGTGGGCACGTCTGCAGCCGAAGTTGATCGCAGGGC‑AATTTGACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTg < 6:210517/149‑1 (MQ=255) aGCCGACAGTGCATTGTGGGCACGTCTGCAGCCGAAGTTGATCGCAGGGC‑AATTTGACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCAGCCGGGccaac < 5:19077/149‑4 (MQ=255) gCCGACAGTGCATTGTGGGCACGTCTGCAGCCGAAGTTGATCGCAGGGC‑AATTTGACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGt < 3:178625/149‑1 (MQ=255) ccGACAGTGCATTGTGGGCACGTCTGCAGCCGAAGTTGATCGCAGGGCAAATTTGACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGt > 1:96904/1‑149 (MQ=255) cAGTGCATTGTGGGCACGTCTGCAGCCGAAGTTGATCGCAGGGC‑AATTTGACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATc < 5:115306/149‑1 (MQ=255) gTGCATTGTGGGCACGTCTGCAGCCGAAGTTGATCGCAGGGC‑AATTTGACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCCAGAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCa < 1:112016/149‑1 (MQ=255) gCATTGTGGGCACGTCTGCAGCCGAAGTTGATCGCAGGGC‑AATTTGACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAggt > 7:119572/1‑149 (MQ=255) aTTGTGGGCACGTCTGCAGCCGAAGTTGATCGCAGGGC‑AATTTGACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAggtgg > 3:325197/1‑149 (MQ=255) aTTGTGGGCACGTCTGCAGCCGAAGTTGATCGCAGGGC‑AATTTGACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCAGCCGGGccaactt < 3:36333/139‑6 (MQ=255) aTTGTGGGCACGTCTGCAGCCGAAGTTGATCGCAGGGC‑AATTTGACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCAGCCGGGccaactt > 4:36333/1‑134 (MQ=255) tgGGCACGTCTGCAGCCGAAGTTGATCGCAGGGC‑AATTTGACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTgc < 7:229768/148‑1 (MQ=255) gCACGTCTGCAGCCGAAGTTGATCGCAGGGC‑AATTTGACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAggtg > 7:169056/1‑141 (MQ=255) gCACGTCTGCAGCCGAAGTTGATCGCAGGGC‑AATTTGACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAggtg < 8:169056/141‑1 (MQ=255) cACGTCTGCAGCCGAAGTTGATCGCAGGGC‑AATTTGACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGAc < 8:119572/149‑1 (MQ=255) cGTCTGCAGCCGAAGTTGATCGCAGGGC‑AATTTGACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACtt < 1:369837/149‑1 (MQ=255) tGCAGCCGAAGTTGATCGCAGGGC‑AATTTGACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACTTGTTc > 7:124031/1‑149 (MQ=255) gCCGAAGTTGATCGCAGGGC‑AATTTGACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACTTGtt > 4:312040/1‑144 (MQ=255) gCCGAAGTTGATCGCAGGGC‑AATTTGACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACTTGtt < 3:312040/144‑1 (MQ=255) gAAGTTGATCGCAGGGC‑AATTTGACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACTTGTTCTAcccc > 1:226127/1‑148 (MQ=255) aaGTTGATCGCAGGGC‑AATTTGACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACtt < 4:301897/137‑1 (MQ=255) aaGTTGATCGCAGGGC‑AATTTGACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACtt > 3:301897/1‑137 (MQ=255) gTTGATCGCAGGGC‑AATTTGACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTgg < 2:237708/107‑1 (MQ=255) gTTGATCGCAGGGC‑AATTTGACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTgg > 1:237708/1‑107 (MQ=255) gATCGCAGGGC‑AATTTGACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACTTGTTCTACCCCGAGGCGa > 1:159708/1‑149 (MQ=255) aTCGCAGGGC‑AATTTGACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACTTGTTCTACCCCGAGGCGAc > 3:51275/1‑149 (MQ=255) aGGGC‑AATTTGACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACTTGTTCTACCCCGAGGCGACGCTg > 3:181396/1‑148 (MQ=255) ggC‑AATTTGACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAggt < 8:358841/112‑1 (MQ=255) ggC‑AATTTGACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAggt > 7:358841/1‑112 (MQ=255) ggC‑AATTTGACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACTTGTTCTACCCCGAGGCGAc > 6:232678/1‑142 (MQ=255) ggC‑AATTTGACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACTTGTTCTACCCCGAGGCGAc < 5:232678/142‑1 (MQ=255) c‑AATTTGACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACTTGTTCTACCCCGAGGCGACGCTGCAgcg > 7:155900/1‑149 (MQ=255) tttGACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACTTGTTCTACCCCGAGGCGACGCTGCAGCGCAt > 2:123890/1‑149 (MQ=255) tGACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGACTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACTTGTTCTACCCCGAGGCGACGCTGCAGCGCATg < 4:325197/148‑1 (MQ=255) gACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACt < 8:347504/115‑1 (MQ=255) gACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACt > 7:347504/1‑115 (MQ=255) gACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACTTGTTCTACCCCGAGGCGACGCTGCAGCGCATgg < 3:381518/148‑1 (MQ=255) gACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACTTGTTCTACCCCGAGGCGACGCTGCAGCGCATgg > 1:158852/1‑148 (MQ=255) cccacccTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGAC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACTTGTTCTACCCCGAGGCGACGCTGCAGCGCATGGCAg > 7:80432/1‑149 (MQ=255) acccTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACTTGTTCTACCCCGAGGCGACGCTGCAGCGCATGGCAGCGt > 8:254553/1‑149 (MQ=255) ggCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACTTGTTCTACCCCGAGGCGACGCTGCAGCGCATGGCAGCGTTGATGCTGGGGCAGGc > 4:378675/1‑147 (MQ=255) gAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACTTGTTCTACCCCGAGGCGACGCTGCAGCGCATGGCAGCGTTGATGCTGGGGCAGGCCAGCg < 2:96904/149‑1 (MQ=255) gTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACTTGTTCTACCCCGAGGCGACGCTGCAGCGCATGGCAGCGTTGATGCTGGGGCAGGCCAGCGa > 8:226656/1‑148 (MQ=255) aggagAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACTTGTTCTACCCCGAGGCGACGCTGCAGCGCATGGCAGCGTTGATGCTGGGGCAGGCCAGCGAAACg > 8:2516/1‑149 (MQ=255) gagaACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGGGCGCGACTTGTTCTACCCCGAGGCGACGCTGCAGCGCATGGCAGCGTTGATGCTGGGGCAGGCCAGCGAAACGCa < 2:317795/149‑1 (MQ=255) aaCTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACTTGTTCTACCCCGAGGCGACGCTGCAGCGCATGGCAGCGTTGATGCTGGGGCAGGCCAGCGAAACGCAGa > 4:368325/1‑148 (MQ=255) tgCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACTTGTTCTACCCCGAGGCGACGCTGCAGCGCATGGCAGCGTTGATGCTGGGGCAGGCCAGCGAAACGCAGATAGt < 7:2516/147‑1 (MQ=255) tgCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACTTGTTCTACCCCGAGGCGACGCTGCAGCGCATGGCAGCGTTGATGCTGGGGCAGGCCAGCGAAACGCAGATAGTg > 2:208622/1‑148 (MQ=255) gCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACTTGTTCTACCCCGAGGCGACGCTGCAGCGCATGGCAGCGTTGATGCTGGGGCAGGCCAGCGAAACGCAGATAGTg > 1:133961/1‑147 (MQ=255) cc‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACTTGTTCTACCCCGAGGCGACGCTGCAGCGCATGGCAGCGTTGATGCTGGGGCAGGCCAGCGAAACGCAGATAGTGCAg > 6:386006/1‑149 (MQ=255) cc‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACTTGTTCTACCCCGAGGCGACGCTGCAGCGCATGGCAGCGTTGATGCTGGGGCAGGCCAGCGAAACGCAGATAGTGCAg < 3:378675/149‑1 (MQ=255) cc‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACTTGTTCTACCCCGAGGCGACGCTGCAGCGCATGGCAGCGTTGATGCTGGGGCAGGCCAGCGAAACGCAGATAGTGCAg > 4:250433/1‑149 (MQ=255) gCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACTTGTTCTACCCCGAGGCGACGCTGCAGCGCATGGCAGCGTTGATGCTGGGGCAGGCCAGCGAAACGCAGATAGTGCAGGTTGc < 1:123890/149‑1 (MQ=255) gATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACTTGTTCTACCCCGAGGCGACGCTGCAGCGCATGGCAGCGTTGATGCTGGGGCAGGCCAGCGAAACGCAGATAGTGCAGGTTGCcgc > 8:143164/1‑149 (MQ=255) 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tGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACTTGTTCTACCCCGAGGCGACGCTGCAGCGCATGGCAGCGTTGATGCTGGGGCAGGCCAGCGAAACGCAGATAGTGCAGGTTGCcgc < 7:124237/133‑1 (MQ=255) tGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACTTGTTCTACCCCGAGGCGACGCTGCAGCGCATGGCAGCGTTGATGCTGGGGCAGGCCAGCGAAACGCAGATAGTGCAGGTTGCcgc > 8:124237/1‑133 (MQ=255) gcgcAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACTTGTTCTACCCCGAGGCGACGCTGCAGCGCATGGCAGCGTTGATGCTGGGGCAGGCCAGCGAAACGCAGATAGTGCAGGTTGCCGCGTTTCGCGATATGTTgg > 2:259218/1‑149 (MQ=255) gcAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACTTGTTCTACCCCGAGGCGACGCTGCAGCGCATGGCAGCGTTGATGCTGGGGCAGGCCAGCGAAACGCAGATAGTGCAGGTTGCCGCGTTTCGCGATATGTTggg > 4:205931/1‑148 (MQ=255) aaGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACTTGTTCTACCCCGAGGCGACGCTGCAGCGCATGGCAGCGTTGATGCTGGGGCAGGCCAGCGAAACGCAGATAGTGCAGGTTGCCGCGTTTCGCGATATGTTGGGCAt > 5:232657/1‑149 (MQ=255) accaggCCCAGCCGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACTTGTTCTACCCCGAGGCGACGCTGCAGCGCATGGCAGCGTTGATGCTGGGGCAGGCCAGCGAAACGCAGATAGTGCAGGTTGCCGCGTTTCGCGATATGTTgg < 1:235834/140‑1 (MQ=255) accaggCCCAGCCGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACTTGTTCTACCCCGAGGCGACGCTGCAGCGCATGGCAGCGTTGATGCTGGGGCAGGCCAGCGAAACGCAGATAGTGCAGGTTGCCGCGTTTCGCGATATGTTgg > 2:235834/5‑144 (MQ=255) gCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACTTGTTCTACCCCGAGGCGACGCTGCAGCGCATGGCAGCGTTGATGCTGGGGCAGGCCAGCGAAACGCAGATAGTGCAGGTTGCCGCGTTTCGCGATATGTTGGGCATCGGTCg > 6:267396/1‑149 (MQ=255) gCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACTTGTTCTACCCCGAGGCGACGCTGCAGCGCATGGCAGCGTTGATGCTGGGGCAGGCCAGCGAAACGCAGATAGTGCAGGTTGCCGCGTTTCGCGATATGTTGGGCATCGGTCGCAAgc > 4:158292/1‑149 (MQ=255) | AGCGAAGCCGACAGTGCATTGTGGGCACGTCTGCAGCCGAAGTTGATCGCAGGGC‑AATTTGACCCACCCTGGGTCAGGACGCTGGCGAGTGAGGAGAACTGTGCC‑GAAGCCGATGTGCGCCTGTTACTGCGCAAGTTGGCCCGGCTGGGCCTGGTGCATCAGGTGGTGCGCGACTTGTTCTACCCCGAGGCGACGCTGCAGCGCATGGCAGCGTTGATGCTGGGGCAGGCCAGCGAAACGCAGATAGTGCAGGTTGCCGCGTTTCGCGATATGTTGGGCATCGGTCGCAAGC > NC_002947/583653‑583944 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |