Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,987,522 | G→T | 100% | G202C (GGT→TGT) | kefB‑III → | glutathione‑regulated potassium/H+ antiporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,987,522 | 0 | G | T | 100.0% | 249.4 / NA | 73 | G202C (GGT→TGT) | kefB‑III | glutathione‑regulated potassium/H+ antiporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (41/32); total (41/32) | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
CCATCCTGTTGTTCCAGGACATCGCCGCGATCCCGCTGATCGCCTTGGTACCGCTGCTGGCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGGAAGAAGCGGGTATCTCCATGGCCCTTGGCGC > NC_002947/5987376‑5987661 | ccATCCTGTTGTTCCAGGACATCGCCGCGATCCCGCTGATCGCCTTGGTACCGCTGCTGGCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGt < 7:329848/149‑1 (MQ=255) gttgttCCAGGACATCGCCGCGATCCCGCTGATCGCCTTGGTACCGCTGCTGGCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTAcc > 4:379361/1‑149 (MQ=255) gttCCAGGACATCGCCGCGATCCCGCTGATCGCCTTGGTACCGCTGCTGGCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTg < 8:19866/148‑1 (MQ=255) ttCCAGGACATCGCCGCGATCCCGCTGATCGCCTTGGTACCGCTGCTGGCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGtt < 5:169804/149‑1 (MQ=255) ttCCAGGACATCGCCGCGATCCCGCTGATCGCCTTGGTACCGCTGCTGGCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGtt > 5:37533/1‑149 (MQ=255) cAGGACATCGCCGCGATCCCGCTGATCGCCTTGGTACCGCTGCTGGCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTgcg > 7:117170/1‑149 (MQ=255) cAGGACATCGCCGCGATCCCGCTGATCGCCTTGGTACCGCTGCTGGCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTgc < 6:253477/148‑1 (MQ=255) gACATCGCCGCGATCCCGCTGATCGCCTTGGTACCGCTGCTGGCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGccc > 5:248363/1‑149 (MQ=255) cATCGCCGCGATCCCGCTGATCGCCTTGGTACCGCTGCTGGCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCg‑g < 1:107955/149‑1 (MQ=255) aTCGCCGCGATCCCGCTGATCGCCTTGGTACCGCTGCTGGCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑gt < 1:264652/149‑1 (MQ=255) tCGCCGCGATCCCGCTGATCGCCTTGGTACCGCTGCTGGCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑gtg > 5:338336/1‑149 (MQ=255) gccgcGATCCCGCTGATCGCCTTGGTACCGCTGCTGGCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGtt > 8:271106/1‑149 (MQ=255) gCCTTGGTACCGCTGCTGGCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑gt > 5:22390/1‑128 (MQ=255) gCCTTGGTACCGCTGCTGGCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑gt < 6:22390/128‑1 (MQ=255) gCCTTGGTACCGCTGCTGGCCGCCAGTCGCACAGACAACAGCCAAGCCGAAAGCCTGCAACAAGGCCTGAAGGTATTAGCAATCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGATAACTTTTTCTCACG‑GTGTTCAGCACCG‑TGGCCCGcgc > 4:255480/1‑147 (MQ=255) ttGGTACCGCTGCTGGCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTg > 5:151851/1‑114 (MQ=255) ttGGTACCGCTGCTGGCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTg < 6:151851/114‑1 (MQ=255) ggTACCGCTGCTGGCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGc < 8:117170/148‑1 (MQ=255) gTACCGCTGCTGGCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGtt < 5:129522/113‑1 (MQ=255) gTACCGCTGCTGGCCGCCAGAGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGtt > 6:129522/1‑113 (MQ=255) ccGCTGCTGGCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGTGCGGGccacg < 1:264180/148‑4 (MQ=255) ccGCTGCTGGCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGcc > 3:65420/1‑149 (MQ=255) ccGCTGCTGGCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGcc > 1:195411/1‑149 (MQ=255) tgctgGCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCgg > 4:228099/1‑147 (MQ=255) ctgGCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGaa < 7:392472/147‑1 (MQ=255) ctgGCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAgt < 4:65420/149‑1 (MQ=255) tgGCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑gt > 6:131677/1‑112 (MQ=255) tgGCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑gt < 5:131677/112‑1 (MQ=255) cgccAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTa < 7:271106/149‑1 (MQ=255) cgccAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTa > 7:208678/1‑149 (MQ=255) gccAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTAc > 2:257735/1‑149 (MQ=255) tGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCa < 6:248363/149‑1 (MQ=255) gCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCAcc > 2:336899/1‑149 (MQ=255) ccAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCg > 4:57886/1‑148 (MQ=255) ccAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCg > 4:339857/1‑148 (MQ=255) cAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCa > 6:373022/1‑149 (MQ=255) acCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCActgct > 5:344188/1‑149 (MQ=255) acCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCActgct > 6:82374/1‑149 (MQ=255) cAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCATGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCTCACTGCTgg > 8:369517/1‑149 (MQ=255) cAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTgg < 8:331225/149‑1 (MQ=255) ccAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTgg > 7:245841/1‑146 (MQ=255) ccAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTgg < 8:245841/146‑1 (MQ=255) ccAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAg > 6:174746/1‑149 (MQ=255) cAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGt < 5:165535/149‑1 (MQ=255) aaGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGAGATCATCGGCTGGCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGCTAGt > 5:292347/1‑148 (MQ=255) gCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCgtgc < 4:773/103‑4 (MQ=255) gCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCgtgc > 3:773/1‑100 (MQ=255) ccTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCg > 2:250275/1‑149 (MQ=255) tGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGc < 1:364253/88‑1 (MQ=255) tGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGc > 2:364253/1‑88 (MQ=255) tGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGcc > 3:250866/1‑149 (MQ=255) tGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATAATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGACCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGcc > 4:44138/1‑149 (MQ=255) gCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAg > 4:108910/1‑134 (MQ=255) gCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAg < 3:108910/134‑1 (MQ=255) cAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGcc < 3:228099/147‑1 (MQ=255) aaCACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTgg < 5:373022/149‑1 (MQ=255) cGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGa > 5:317856/1‑149 (MQ=255) gCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATg < 2:69840/149‑1 (MQ=255) ccTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATgg < 4:250866/149‑1 (MQ=255) aaGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGgaag > 1:130067/1‑148 (MQ=255) aGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTTTTCATCGGCTGGCGCTACCTGTTGCCGCCG‑GTTTCCCCCACCGCTTTCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGgaag < 1:336899/148‑1 (MQ=255) aGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGgaagaa < 6:344188/149‑1 (MQ=255) gTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGa > 2:231942/1‑121 (MQ=255) tATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCg > 6:411318/1‑123 (MQ=255) tATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCg < 5:411318/123‑1 (MQ=255) aTTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCGAGTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGGAAGAAGCg > 1:313938/1‑149 (MQ=255) ttCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCATGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGGAAGAAGCgg < 7:369517/148‑1 (MQ=255) ttCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGGAAGAAGCgg < 2:195411/148‑1 (MQ=255) ttCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGACCGGCACCGCCTGGCTGATGGAAGAAGCggg > 1:86676/1‑149 (MQ=255) cAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGGAAGAAGCGGGTAtct > 3:252921/1‑149 (MQ=255) aTCGCCGTGGTGATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGGAAGAAGCGGGTATCTCCAt < 6:338336/149‑1 (MQ=255) tgATCATCGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGGAAGAAGCGGGTATCTCCATGGCCCTTGgc > 7:147984/1‑149 (MQ=255) atcatcGGCTGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGGAAGAAGCGGGTATCTCCATGGCCCTTGgcgc > 8:11283/1‑149 (MQ=255) | CCATCCTGTTGTTCCAGGACATCGCCGCGATCCCGCTGATCGCCTTGGTACCGCTGCTGGCCGCCAGTGGCCCAGACACCAGCCAAGGCGACAGCCTGCAACACGGCCTGAAGGTATTCGCCAGCATCGCCGTGGTGATCATCGGCGGTCGCTACCTGTTGCGCCCG‑GTGTTCCGCACCG‑TGGCCCGCACGGGCCTGCCGGAAGTGTCTACTGCCACCGCACTGCTGGTAGTGATCGGCACCGCCTGGCTGATGGAAGAAGCGGGTATCTCCATGGCCCTTGGCGC > NC_002947/5987376‑5987661 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |