| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,024,044 | A→G | 5.0% | D156G (GAC→GGC) | yjiR → | transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,024,044 | 0 | A | G | 5.0% | 238.2 / 2.1 | 79 | D156G (GAC→GGC) | yjiR | transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (35/40); new base G (2/2); total (37/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.14e-01 | |||||||||||
GACATCTCGCAGTGGGAACAGGTGCTGGAGCTGGTGCGCAGTACGCCGCGCCAGGATGTGGTGCAACTCGGCCGCGGCATGCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCTGATGCTCGACTCCGGCTGCCGCCTGGGGCCGGCCGACCTGGTGATTACCACCGGCTGCCATGAGGCGCTGTCATGCAGCA > NC_002947/6023896‑6024190 | gACATCTCGCAGTGGGAACAGGTGCTGGAGCTGGTGCGCAGTACGCCGCGCCAGGATGTGGTGCAACTCGGCCGCGGCATGCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGa < 4:155474/149‑1 (MQ=255) tcGCAGTGGGAACAGGTGCTGGAGCTGGTGCGCAGTACGCCGCGCCAGGATGTGGTGCAACTCGGCCGCGGCATGCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATgc > 2:281510/1‑148 (MQ=255) gCAGTGGGAACAGGTGCTGGAGCTGGTGCGCAGTACGCCGCGCCAGGATGTGGTGCAACTCGGCCGCGGCATGCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATgcctg < 6:221887/149‑1 (MQ=255) gCAGTGGGAACAGGTGCTGGAGCTGGTGCGCAGTACGCCGCGCCAGGATGTGGTGCAACTCGGCCGCGGCATGCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATgc < 1:281510/146‑1 (MQ=255) gggAACAGGTGCTGGAGCTGGTGCGCAGTACGCCGCGCCAGGATGTGGTGCAACTCGGCCGCGGCATGCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATgcctggcctg < 4:213237/149‑1 (MQ=255) ggAACAGGTGCTGGAGCTGGTGCGCAGTACGCCGCGCCAGGATGTGGTGCAACTCGGCCGCGGCATGCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGt < 6:343312/149‑1 (MQ=255) aGGTGCTGGAGCTGGTGCGCAGTACGCCGCGCCAGGATGTGGTGCAACTCGGCCGCGGCATGCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGtactac < 7:308184/149‑1 (MQ=255) tGCTGGCGCTGGTGCGCAGTACGCCGCGCCAGGATGTGGTGCAACTCCGCCGCGGCATGCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCATCCTTTCCCAGTTGAGCCGGCGCCATGACATGCCTGGCCTGTACTACGac < 7:256868/149‑1 (MQ=255) gCTGGAGCTGGTGCGCAGTACGCCGCGCCAGGATGTGGTGCAACTCGGCCGCGGCATGCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGac > 4:263052/1‑148 (MQ=255) tGGAGCTGGTGCGCAGTACGCCGCGCCAGGATGTGGTGCAACTCGGCCGCGGCCTGCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGacaa > 5:208105/1‑148 (MQ=255) tGGAGCTGGTGCGCAGTACGCCGCGCCAGGATGTGGTGCAACTCGGCCGCGGCATGCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGacaa > 3:390086/1‑148 (MQ=255) cTGGTGCGCAGTACGCCGCGCCAGGATGTGGTGCAACTCGGCCGCGGCATGCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCa > 8:169434/1‑149 (MQ=255) ggTGCGCAGTACGCCGCGCCAGGATGTGGTGCAACTCGGCCGCGGCATGCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACg > 6:376538/1‑149 (MQ=255) ggTGCGCAGTACGCCGCGCCAGGATGTGGTGCAACTCGGCCGCGGCATGCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACg > 3:226575/1‑149 (MQ=255) tGCGCAGTACGCCGCGCCAGGATGTGGTGCAACTCGGCCGCGGCATGCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATgcctggcc < 7:167579/126‑1 (MQ=255) tGCGCAGTACGCCGCGCCAGGATGTGGTGCAACTCGGCCGCGGCATGCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATgcctggcc > 8:167579/1‑126 (MQ=255) aGTACGCCGCGCCAGGATGTGGTGCAACTCGGCCGCGGCATGCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCt < 3:343074/149‑1 (MQ=255) tACGCCGCGCCAGGATGTGGTGCAACTCGGCCGCGGCATGCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGa < 5:254311/129‑1 (MQ=255) tACGCCGCGCCAGGATGTGGTGCAACTCGGCCGCGGCATGCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGa > 6:254311/1‑129 (MQ=255) cgcgCCAGGATGTGGTGCAACTCGGCCGCGGCATGCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTg > 8:253722/1‑149 (MQ=255) gcCAGGATGTGGTGCAACTCGGCCGCGGCATGCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATc < 2:280845/128‑1 (MQ=255) gcCAGGATGTGGTGCAACTCGGCCGCGGCATGCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATc > 1:280845/1‑128 (MQ=255) ccAGGATGTGGTGCAACTCGGCCGCGGCATGCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGcgcg < 7:169434/149‑1 (MQ=255) cAGGATGTGGTGCAACTCGGCCGCGGCATGCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGGCATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGcgcg > 5:396998/1‑148 (MQ=255) aGGATGTGGTGCAACTCGGCCGCGGCATGCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGaa < 7:253722/149‑1 (MQ=255) aTGTGGTGCAACTCGGCCGCGGCATGCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAg < 2:337799/149‑1 (MQ=255) tgtgGTGCAACTCGGCCGCGGCATGCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGGCATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAgg > 7:365844/1‑149 (MQ=255) tggtgCAACTCGGCCGCGGCATGCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGt < 6:358896/148‑1 (MQ=255) aCTCGGCCGCGGCATGCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGGCATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGc < 6:396998/149‑1 (MQ=255) aCTCGGCCGCGGCATGCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGc < 4:390086/149‑1 (MQ=255) cTCGGCCGCGGCATGCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGGTCGAACAGGTGGCCCGGCt < 4:356219/149‑1 (MQ=255) tCGGCCGCGGCATGCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCt > 7:386704/1‑148 (MQ=255) gCCGCGGCATGCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGGCATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCTGATg < 8:365844/149‑1 (MQ=255) ccGCGGCATGCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAgg > 4:71983/1‑134 (MQ=255) ccGCGGCATGCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAgg < 3:71983/134‑1 (MQ=255) aTGCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTg > 4:198204/1‑129 (MQ=255) aTGCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTg < 3:198204/129‑1 (MQ=255) gCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGc < 8:277661/134‑1 (MQ=255) gCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGc > 7:277661/1‑134 (MQ=255) cccGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCTGATGCTCGACTCCgg < 4:50042/149‑1 (MQ=255) tCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTgcgc > 6:88381/1‑110 (MQ=255) tCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTgcgc < 5:88381/110‑1 (MQ=255) gACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCTGATGCTCGACTCCGGCTGCCGCCt > 2:293430/1‑149 (MQ=255) aCAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCTGATGCTCGACTCCGGCTGCCGCCTg < 3:263052/149‑1 (MQ=255) cAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCTGATGCTCGACTCCGGCTGCCGCCTgg < 4:203121/149‑1 (MQ=255) cccTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCTGATGCTc > 5:406626/1‑127 (MQ=255) cccTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCTGATGCTc < 6:406626/127‑1 (MQ=255) cccTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCTGATGCTCGACTCCGGCTGCCGCCTGGggc > 2:283067/1‑149 (MQ=255) ccTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCTGATGCTCGACTCCGGCTGCCGCCTGGggcc > 7:231531/1‑149 (MQ=255) cTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCTGATGCTCGACTCCGGCTGCCGCCTGGggccg < 5:376538/149‑1 (MQ=255) cTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCTGATGCTCGACTCCGGCTGCCGCCTGGggccg > 7:387011/1‑149 (MQ=255) tACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCTGATGCTCGACTCCGGCTGCCGCCTGGggccgg > 4:273370/1‑149 (MQ=255) cccTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCTGATGCTCGACTCCGGCTGCCGCCTGGggccgg < 2:78456/147‑1 (MQ=255) ccTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCTGATGCTCGACTCCGGCTGCCGCCTGGggccggcc > 5:386991/1‑148 (MQ=255) gAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTCGAGCCGGCGCCAGGACAt > 4:106404/1‑48 (MQ=255) gAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTCGAGCCGGCGCCAGGACAt < 3:106404/48‑1 (MQ=255) aaGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCTGATGCTCGACTCCGGCTGCCGCCTGGGGCCGGCCGACCt < 4:226575/149‑1 (MQ=255) ccGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCTGATGCTCGACTCCGGCTGCCGCCTGGGGCCGGCCGACCTGGt > 2:96634/1‑149 (MQ=255) gctgctGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCTGATGCTCGACTCCGGCTGCCGCCTGGGGCCGGCCGACCTGGTGa < 6:208105/149‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCTTGCCCAGGTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCTGATGCTCGACTCCGGCTGCCGCCTGGGGCCGGCCGACCTGGTGAtt < 3:273370/149‑1 (MQ=255) ccTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCTGATGCTCGACTCCGGCTGCCGCCTGGGGCCGGCCGACCTGGTGATTACCACCGGCt > 5:154814/1‑149 (MQ=255) ccTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCTGATGCTCGACTCCGGCTGCCGCCTGGGGCCGGCCGACCTGGTGATTACCACCGGCt > 2:197264/1‑149 (MQ=255) ttGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCTGATGCTCGACTCCGGCTGCCGCCTGGGGCCGGCCGACCTGGTGATTACCACCGGCTGc > 8:174024/1‑149 (MQ=255) ccAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCTGATGCTCGACTCCGGCTGCCGCCTGGGGCCGGCCGACCTGGTGATTACCACCGGCTGCCAt > 2:148748/1‑148 (MQ=255) ccAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCTGATGCTCGACTCCGGCTGCCGCCTGGGGCCGGCCGACCTGGTGATTACCACCGGCTGCCAt > 7:286074/1‑148 (MQ=255) cAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCTGATGCTCGACTCCGGCTGCCGCCTGGGGCCGGCCGACCTGGTGATTACCACCGGCTGCCAt > 2:328302/1‑147 (MQ=255) aGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCTGATGCTCGACTCCGGCTgccgcc > 6:389650/1‑103 (MQ=255) aGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCTGATGCTCGACTCCGGCTgccgcc < 5:389650/103‑1 (MQ=255) ccGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCTGATGCTCGACTCCGGCTGCCGCCTGGGGCCGGCCGACCTGGTGATTACCACCGGCTg < 4:36052/135‑1 (MQ=255) ccGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCTGATGCTCGACTCCGGCTGCCGCCTGGGGCCGGCCGACCTGGTGATTACCACCGGCTg > 3:36052/1‑135 (MQ=255) gcgcCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCTGATGCTCGACTCCGGCTGCCGCCTGGGGCCGGCCGACCTGGTGATTACCACCGGCTGCCATGAGGCGCTGTCAt < 1:197264/149‑1 (MQ=255) gcCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCTGATGCTCGACTCCGGCTGCCGCCTGGGGTCGGCCGACCTGGTGATTACCACCGGCTGCCATGAGGCGCTGTCATgc < 6:362954/149‑1 (MQ=255) gcCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCTGATGCTCGACTCCGGCTGCCGCCTGGGGCCGGCCGACCTGGTGATTACCACCGGCTGcc < 6:83811/132‑1 (MQ=255) gcCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCTGATGCTCGACTCCGGCTGCCGCCTGGGGCCGGCCGACCTGGTGATTACCACCGGCTGcc > 5:83811/1‑132 (MQ=255) gcCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCTGATGCTCGACTCCGGCTGCCGCCTGGGGCCGGCCGACCTGGTGATTACCACCGGCTGCCATGAGGCGCTGTCATgc < 1:96634/149‑1 (MQ=255) gcCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCTGATGCTCGACTCCGGCTGCCGCCTGGGGCCGGCCGACCTGGTGATTACCACCGGCTGCCATGAGGCGCTGTCATg > 5:47089/1‑148 (MQ=255) ccAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCTGATGCTCGACTCCGGCTGCCGCCTGGGGCCGGCCGACCTGGTGATTACCACCGGCTGCCATGAGGCGCTGTCATgca < 7:174024/149‑1 (MQ=255) ccAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCTGATGCTCGACTCCGGCTGCCGCCTGGGGCCGGCCGACCTGGTGATTACCACCGGCTGCCATGAGGCGCTGTCATgca < 1:148748/149‑1 (MQ=255) ccAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCTGATGCTCGACTCCGGCTGCCGCCTGGGGCCGGCCGACCTGGTGATTACCACCGGCTGCCATGAGGCGCTGTCATgca < 8:387011/149‑1 (MQ=255) ggACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCTGATGCTCGACTCCGGCTGCCGCCTGGGGCCGGCCGACCTGGTGATTACCACCGGCTGCCATGAGGCGCTGTCATgcagca < 3:259457/149‑1 (MQ=255) | GACATCTCGCAGTGGGAACAGGTGCTGGAGCTGGTGCGCAGTACGCCGCGCCAGGATGTGGTGCAACTCGGCCGCGGCATGCCCGACATCGACAGCCCTACCCTGAAGCCGCTGCTGCGCAGCCTTGCCCAGTTGAGCCGGCGCCAGGACATGCCTGGCCTGTACTACGACAACATCCACGGTAACCTGGCCCTGCGCGAACAGGTGGCCCGGCTGATGCTCGACTCCGGCTGCCGCCTGGGGCCGGCCGACCTGGTGATTACCACCGGCTGCCATGAGGCGCTGTCATGCAGCA > NC_002947/6023896‑6024190 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |