| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,130,113 | G→C | 7.2% | A107G (GCC→GGC) | PP_5378 ← | metal‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,130,113 | 0 | G | C | 7.2% | 295.6 / 6.6 | 93 | A107G (GCC→GGC) | PP_5378 | metal‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (44/41); new base C (3/4); total (47/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.11e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TGCGGCATTTGCTCAAGGAAAGCGACAATACCCCAGATGTACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGTTTCATCCTTTAGGTTCGGAACCTCGATGTC > NC_002947/6129969‑6130261 | tGCGGCATTTGCTCAAGGAAAGCGACAATACCCCAGATGTACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGc > 3:375827/1‑146 (MQ=255)tGCGGCATTTGCTCAAGGAAAGCGACAATACCCCAGATGTACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGc > 3:390007/1‑146 (MQ=255) cTCAAGGAAAGCGACAATACCCCAGATGTACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTTCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGCCAAGATTggtttaa < 1:80732/148‑6 (MQ=255) tCAAGGAAAGCGACAATACCCCAGATGTACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGa > 5:143216/1‑138 (MQ=255) tCAAGGAAAGCGACAATACCCCAGATGTACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGa < 6:143216/138‑1 (MQ=255) tCAAGGAAAGCGACAATACCCCAGATGTACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGc > 1:172378/1‑149 (MQ=255) aaGGAAAGCGACAATACCCCAGATGTACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTggg < 8:79295/141‑1 (MQ=255) aaGGAAAGCGACAATACCCCAGATGTACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTggg > 7:79295/1‑141 (MQ=255) ggAAAGCGACAATACCCCAGATGTACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGAGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGa > 4:369916/1‑149 (MQ=255) aaaGCGACAATACCCCAGATGTACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATa < 4:390007/149‑1 (MQ=255) aGCGACAATACCCCAGATGTACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATaaa < 2:172378/149‑1 (MQ=255) aCAATACCCCAGATGTACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAgc‑gc > 2:261178/1‑149 (MQ=255) aaTACCCCAGATGTACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCtt < 7:237045/149‑1 (MQ=255) ccAGATGTACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCt > 3:394110/1‑147 (MQ=255) ccAGATGTACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCTGa < 8:329030/149‑1 (MQ=255) aTGTACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCt > 6:322685/1‑143 (MQ=255) aTGTACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCt < 5:322685/143‑1 (MQ=255) tGTACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCTGAGCTCg < 5:23540/149‑1 (MQ=255) cTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCTGAGCTCGGtt < 1:175557/148‑1 (MQ=255) tGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAgc < 7:334280/129‑1 (MQ=255) tGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAgc > 8:334280/1‑129 (MQ=255) tGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCTGAGCTCGGttt > 1:11846/1‑148 (MQ=255) tCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCTGAGCTCGGtttt > 2:169351/1‑146 (MQ=255) tCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCTGAGCTCGGtttt < 1:169351/146‑1 (MQ=255) cATACTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCAccc > 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ccAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCTGa < 4:122832/119‑1 (MQ=255) ccAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCTGa > 3:122832/1‑119 (MQ=255) cAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCt > 7:222022/1‑116 (MQ=255) cAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCt < 8:222022/116‑1 (MQ=255) cAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTCATACCGTGTTTAATCGTCCAGAACCCAGCTGCGGGGTCATCGCATAA‑ACCAATCTAGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCTGAGCTCGCTTTTATCCACCCCAGGGGCGAGGTg > 5:106351/1‑149 (MQ=255) gCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTgg > 5:157444/1‑147 (MQ=255) gggCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGc < 6:157444/149‑1 (MQ=255) ggCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCTGTGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGc > 8:379527/1‑148 (MQ=255) ggCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGGGCCGGATAAAGCAGCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGc < 1:296384/149‑1 (MQ=255) cATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGCCAAGATTggtt > 3:190594/1‑83 (MQ=255) cATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGCCAAGATTggtt > 3:184348/1‑83 (MQ=255) cATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGCCAAGATTggtt < 4:190594/85‑3 (MQ=255) cATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGCCAAGATTggtt < 4:184348/85‑3 (MQ=255) aTACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAAt > 4:197954/1‑149 (MQ=255) aCCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATg > 6:48148/1‑148 (MQ=255) ggTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGcaca > 5:31032/1‑149 (MQ=255) ggTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGGCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGcaca < 3:252892/149‑1 (MQ=255) gTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGc > 5:46481/1‑145 (MQ=255) 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cAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCGGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCTAATGCACATAGCATTGTAGTTACcggcaccggcac < 1:268874/148‑1 (MQ=255) aGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTaccg > 8:126002/1‑137 (MQ=255) aGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTaccg < 7:126002/137‑1 (MQ=255) aaCGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGAt < 6:374119/149‑1 (MQ=255) cGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGAt > 5:379918/1‑147 (MQ=255) aGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAggg > 2:1149/1‑149 (MQ=255) cTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCTGTGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGtt < 7:379527/149‑1 (MQ=255) cTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGtt < 6:329120/149‑1 (MQ=255) cGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGTTTCa < 8:139880/149‑1 (MQ=255) cGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGTTTCa < 3:197954/149‑1 (MQ=255) cATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGAAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGTTTCATCCttt > 7:382015/1‑149 (MQ=255) tCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGAACCGGCACTGATAAGGGTTTCATCATTTat > 6:409815/1‑148 (MQ=255) aa‑aCCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGAACCGGCACGGATAAGGGTTTCATCCTTTAGGTTCg > 8:142670/1‑148 (MQ=255) aa‑aCCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCCGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGTTTCATCCTTTAGGTTc < 3:90982/147‑1 (MQ=255) gcccAATCTTGCCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAgg > 7:7013/3‑128 (MQ=255) gcccAATCTTGCCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAgg < 8:7013/126‑1 (MQ=255) aCCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGTTTCATCCTTTAGGTTCGGaa > 2:408222/1‑149 (MQ=255) gCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCATTGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGTTTCATCCTTTAGGTTCGGAACCTCGATGTc > 8:155638/1‑149 (MQ=255) gCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACcggcaccggcac < 3:196117/109‑1 (MQ=255) gCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACcggcaccggcac > 4:196117/1‑109 (MQ=255) | TGCGGCATTTGCTCAAGGAAAGCGACAATACCCCAGATGTACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAA‑ACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGC‑GCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGTTTCATCCTTTAGGTTCGGAACCTCGATGTC > NC_002947/6129969‑6130261 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |